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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1htt | ||||||
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タイトル | HISTIDYL-TRNA SYNTHETASE | ||||||
![]() | HISTIDYL-TRNA SYNTHETASE![]() | ||||||
![]() | COMPLEX (TRNA SYNTHETASE/HIS-ADENYLATE) / COMPLEX (TRNA SYNTHETASE-HIS-ADENYLATE) / AMINOACYL-TRNA SYNTHASE / ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Arnez, J.G. / Harris, D.C. / Mitschler, A. / Rees, B. / Francklyn, C.S. / Moras, D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of histidyl-tRNA synthetase from Escherichia coli complexed with histidyl-adenylate. 著者: Arnez, J.G. / Harris, D.C. / Mitschler, A. / Rees, B. / Francklyn, C.S. / Moras, D. #1: ![]() タイトル: Crystallization of Histidyl-tRNA Synthetase from Escherichia Coli 著者: Francklyn, C. / Harris, D. / Moras, D. #2: ![]() タイトル: Primary Structure of Histidine-tRNA Synthetase and Characterization of Hiss Transcripts 著者: Freedman, R. / Gibson, B. / Donovan, D. / Biemann, K. / Eisenbeis, S. / Parker, J. / Schimmel, P. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 295.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 235 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper:
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 46954.121 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: P04804, UniProt: P60906*PLUS, ![]() #2: 化合物 | ChemComp-HIS / ![]() #3: 化合物 | ChemComp-AMP / ![]() #4: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.49 Å3/Da / 溶媒含有率: 68 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | pH: 7.4 / 詳細: pH 7.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 275 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MAR scanner 300 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1994年2月9日 |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE HUBER FLAT #151 / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.6→26 Å / Num. obs: 54820 / % possible obs: 69.4 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 1.7 % / Rmerge(I) obs: 0.057 / Net I/σ(I): 10.1 |
反射 シェル | 解像度: 2.6→2.74 Å / 冗長度: 1.5 % / Rmerge(I) obs: 0.231 / Mean I/σ(I) obs: 2.8 / % possible all: 55.7 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 解像度: 2.6→8 Å / σ(F): 2
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原子変位パラメータ | Biso mean: 33 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.4 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.6→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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