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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fte | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE ACYL CARRIER PROTEIN SYNTHASE (NATIVE 1) | ||||||
![]() | ACYL CARRIER PROTEIN SYNTHASE![]() | ||||||
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機能・相同性 | ![]() holo-[acyl-carrier-protein] synthase / holo-[acyl-carrier-protein] synthase activity / fatty acid biosynthetic process / magnesium ion binding / ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Chirgadze, N. / Briggs, S. / McAllister, K. / Fischl, A. / Zhao, G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of Streptococcus pneumoniae acyl carrier protein synthase: an essential enzyme in bacterial fatty acid biosynthesis. 著者: Chirgadze, N.Y. / Briggs, S.L. / McAllister, K.A. / Fischl, A.S. / Zhao, G. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 79.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 60 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 13678.506 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: P0A2W6, holo-[acyl-carrier-protein] synthase #2: 化合物 | ![]() #3: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.06 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.2 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | *PLUS 温度: 294 K / pH: 7.1 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD / 日付: 1999年4月29日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.4→20 Å / Num. all: 14842 / Num. obs: 14842 / % possible obs: 96 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 4 % / Rmerge(I) obs: 0.049 / Net I/σ(I): 25.6 |
反射 シェル | 解像度: 2.4→2.49 Å / % possible obs: 84 % / Rmerge(I) obs: 0.23 / Mean I/σ(I) obs: 4.5 / % possible all: 84 |
反射 | *PLUS Num. all: 59335 / % possible obs: 96 % / 冗長度: 4 % / Num. measured all: 336325 |
反射 シェル | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.23 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→20 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.4→2.46 Å / Total num. of bins used: 13
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ソフトウェア | *PLUS 名称: CNX / 分類: refinement | |||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 20 Å / σ(F): 0 / % reflection Rfree: 4.9 % / Rfactor obs: 0.229 | |||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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LS精密化 シェル | *PLUS % reflection Rfree: 4.9 % / Rfactor Rwork: 0.309 |