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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1e2b | ||||||
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タイトル | NMR STRUCTURE OF THE C10S MUTANT OF ENZYME IIB CELLOBIOSE OF THE PHOSPHOENOL-PYRUVATE DEPENDENT PHOSPHOTRANSFERASE SYSTEM OF ESCHERICHIA COLI, 17 STRUCTURES | ||||||
要素 | ENZYME IIB-CELLOBIOSE | ||||||
キーワード | TRANSFERASE (転移酵素) / ENZYME IIB-CELLOBIOSE / PHOSPHOTRANSFERASE SYSTEM / SUGAR TRANSPORT / PHOSPHORYLATION (リン酸化) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 protein-Npi-phosphohistidine-N,N'-diacetylchitobiose phosphotransferase / protein-phosphocysteine-N,N'-diacetylchitobiose phosphotransferase system transporter activity / N,N'-diacetylchitobiose import / protein-N(PI)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase activity / phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system / transmembrane transporter complex / kinase activity / リン酸化 / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / DISTANCE GEOMETRY, RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS, SIMULATED ANNEALING | ||||||
データ登録者 | Ab, E. / Schuurman-Wolters, G. / Reizer, J. / Saier, M.H. / Dijkstra, K. / Scheek, R.M. / Robillard, G.T. | ||||||
引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 1997 タイトル: The NMR side-chain assignments and solution structure of enzyme IIBcellobiose of the phosphoenolpyruvate-dependent phosphotransferase system of Escherichia coli. 著者: Ab, E. / Schuurman-Wolters, G. / Reizer, J. / Saier, M.H. / Dijkstra, K. / Scheek, R.M. / Robillard, G.T. #1: ジャーナル: Protein Sci. / 年: 1994 タイトル: Enzyme Iibcellobiose of the Phosphoenol-Pyruvate-Dependent Phosphotransferase System of Escherichia Coli: Backbone Assignment and Secondary Structure Determined by Three-Dimensional NMR Spectroscopy 著者: Ab, E. / Schuurman-Wolters, G.K. / Saier, M.H. / Reizer, J. / Jacuinod, M. / Roepstorff, P. / Dijkstra, K. / Scheek, R.M. / Robillard, G.T. #2: ジャーナル: Genetics / 年: 1990 タイトル: Characterization and Nucleotide Sequence of the Cryptic Cel Operon of Escherichia Coli K12 著者: Parker, L.L. / Hall, B.G. #3: ジャーナル: Res.Microbiol. / 年: 1990 タイトル: The Cellobiose Permease of Escherichia Coli Consists of Three Proteins and is Homologous to the Lactose Permease of Staphylococcus Aureus 著者: Reizer, J. / Reizer, A. / Saier Junior, M.H. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1e2b.cif.gz | 548.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1e2b.ent.gz | 454 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1e2b.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e2/1e2b ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e2/1e2b | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11423.449 Da / 分子数: 1 / 変異: C10S / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 株: K12 / 細胞内の位置: CYTOPLASM細胞質 / 遺伝子: CELA / プラスミド: PJR-IIBC10S / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 細胞内の位置 (発現宿主): CYTOPLASM 発現宿主: Escherichia coli str. K12 substr. W3110 (大腸菌) 株 (発現宿主): W3110 参照: UniProt: P69795, protein-Npi-phosphohistidine-sugar phosphotransferase |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: NOESY |
-試料調製
試料状態 | pH: 6.18 / 温度: 293 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: DISTANCE GEOMETRY, RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS, SIMULATED ANNEALING ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: TARGET FUNCTION, NUMBER OF VIOLATIONS 計算したコンフォーマーの数: 32 / 登録したコンフォーマーの数: 17 |