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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1cgz | ||||||
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タイトル | CHALCONE SYNTHASE FROM ALFALFA COMPLEXED WITH RESVERATROL | ||||||
![]() | PROTEIN (CHALCONE SYNTHASE) | ||||||
![]() | ![]() ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() chalcone biosynthetic process / ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Ferrer, J.-L. / Jez, J. / Bowman, M.E. / Dixon, R. / Noel, J.P. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of chalcone synthase and the molecular basis of plant polyketide biosynthesis. 著者: Ferrer, J.L. / Jez, J.M. / Bowman, M.E. / Dixon, R.A. / Noel, J.P. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 97.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 73.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 42755.281 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() 組織: 21 DAY OLD ROOT NODULE / プラスミド: PET28B / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-STL / ![]() |
#3: 水 | ChemComp-HOH / ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.07 Å3/Da / 溶媒含有率: 42 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | pH: 6.5 / 詳細: pH 6.50 | ||||||||||||||||||||
結晶 | *PLUS | ||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 6.5 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 105 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MAC Science DIP-2000 / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1998年6月1日 |
放射 | モノクロメーター: NI FILTER / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 1.7→84.5 Å / Num. obs: 34919 / % possible obs: 87.6 % / 冗長度: 1.35 % / Rsym value: 0.048 / Net I/σ(I): 13 |
反射 シェル | 解像度: 1.7→1.74 Å / 冗長度: 0.3 % / Mean I/σ(I) obs: 12.4 / Rsym value: 0.189 / % possible all: 36.2 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / 最低解像度: 84.5 Å / % possible obs: 87.6 % / 冗長度: 1.35 % / Rmerge(I) obs: 0.048 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / 最低解像度: 1.74 Å / 冗長度: 0.3 % / Mean I/σ(I) obs: 12.4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1BI5 解像度: 1.7→85 Å / σ(F): 0
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→85 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: REFMAC / 分類: refinement | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / 最低解像度: 85 Å / Rfactor obs: 0.157 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |