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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1a1x | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF MTCP-1 INVOLVED IN T CELL MALIGNANCIES | ||||||
![]() | HMTCP-1 | ||||||
![]() | ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() protein serine/threonine kinase activator activity / positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation / intracellular signal transduction / ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Fu, Z.Q. / Dubois, G.C. / Song, S.P. / Kulikovskaya, I. / Virgilio, L. / Rothstein, J. / Croce, C.M. / Weber, I.T. / Harrison, R.W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of MTCP-1: implications for role of TCL-1 and MTCP-1 in T cell malignancies. 著者: Fu, Z.Q. / Du Bois, G.C. / Song, S.P. / Kulikovskaya, I. / Virgilio, L. / Rothstein, J.L. / Croce, C.M. / Weber, I.T. / Harrison, R.W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 32.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 22.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12627.200 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2 Å3/Da / 溶媒含有率: 37 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | pH: 7.8 詳細: PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.5M AMS WITH TRIZMA BUFFER AT PH 7.8 | ||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1997年9月1日 |
放射 | モノクロメーター: NI FILTER / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2→21 Å / Num. obs: 7194 / % possible obs: 99.7 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 5.9 % / Rsym value: 0.047 / Net I/σ(I): 15.1 |
反射 シェル | 解像度: 2→2.07 Å / 冗長度: 5.4 % / Mean I/σ(I) obs: 7.6 / Rsym value: 0.147 / % possible all: 99.3 |
反射 | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.047 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 99.3 % / Rmerge(I) obs: 0.147 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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原子変位パラメータ | Biso mean: 22.01 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→6.5 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2→2.09 Å / Rfactor Rfree error: 0.031 / Total num. of bins used: 8
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Xplor file |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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LS精密化 シェル | *PLUS Rfactor obs: 0.255 |