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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 172l | ||||||
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タイトル | PROTEIN FLEXIBILITY AND ADAPTABILITY SEEN IN 25 CRYSTAL FORMS OF T4 LYSOZYME | ||||||
要素 | T4 LYSOZYME | ||||||
キーワード | HYDROLASE (O-GLYCOSYL) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 viral release from host cell by cytolysis / peptidoglycan catabolic process / cell wall macromolecule catabolic process / リゾチーム / lysozyme activity / host cell cytoplasm / defense response to bacterium 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Enterobacteria phage T4 (ファージ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.9 Å | ||||||
データ登録者 | Weaver, L.H. / Zhang, X.-J. / Matthews, B.W. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1995 タイトル: Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme. 著者: Zhang, X.J. / Wozniak, J.A. / Matthews, B.W. #1: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1987 タイトル: Structure of Bacteriophage T4 Lysozyme Refined at 1.7 Angstroms Resolution 著者: Weaver, L.H. / Matthews, B.W. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 172l.cif.gz | 41.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb172l.ent.gz | 32 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 172l.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/72/172l ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/72/172l | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18652.451 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Enterobacteria phage T4 (ファージ) 属: T4-like viruses / 生物種: Enterobacteria phage T4 sensu lato / プラスミド: M13 / 参照: UniProt: P00720, リゾチーム |
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#2: 化合物 | ChemComp-BME / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.11 Å3/Da / 溶媒含有率: 41.75 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 47 % | ||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 6.7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
-解析
ソフトウェア | 名称: TNT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.9→20 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→20 Å
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拘束条件 |
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