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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Caspase-1 complex with interleukin-18 | |||||||||
![]() | caspase-1 in complex with interleukin-18![]() | |||||||||
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![]() | Innate immune / ![]() ![]() ![]() | |||||||||
機能・相同性 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Dong Y / Pascal D / Jon K / Wu H | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Caspase-1 complex with interleukin-18 著者: Pascal D / Dong Y / Wu H / Jon K | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 68.3 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 15.2 KB 15.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 37.5 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 68.4 MB 68.4 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8sv1MC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | caspase-1 in complex with interleukin-18 | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.83 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: caspase-1 in complex with interleukin-18 half map A
ファイル | emd_40781_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | caspase-1 in complex with interleukin-18 half map A | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: caspase-1 in complex with interleukin-18 half map B
ファイル | emd_40781_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | caspase-1 in complex with interleukin-18 half map B | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : protein complex with interleukin
全体 | 名称: protein complex with interleukin |
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要素 |
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-超分子 #1: protein complex with interleukin
超分子 | 名称: protein complex with interleukin / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 100 MDa |
-分子 #1: Caspase-1
分子 | 名称: Caspase-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 16.607154 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
配列 | 文字列: AEIYPIMDKS SRTRLALIIC NEEFDSIPRR TGAEVDITGM TMLLQNLGYS VDVKKNLTAS DMTTELEAFA HRPEHKTSDS TFLVFMSHG IREGICGKKH SEQVPDILQL NAIFNMLNTK NCPSLKDKPK VIIIQACRGD SPGVVWFKD UniProtKB: ![]() |
-分子 #2: Caspase-1
分子 | 名称: Caspase-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ![]() |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 10.258755 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
配列 | 文字列: AIKKAHIEKD FIAFCSSTPD NVSWRHPTMG SVFIGRLIEH MQEYACSCDV EEIFRKVRFS FEQPDGRAQM PTTERVTLTR CFYLFPGH UniProtKB: ![]() |
-分子 #3: Interleukin-18
分子 | 名称: Interleukin-18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 21.850641 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: VEDNCINFVA MKFIDNTLYF IAEDDENLES DYFGKLESKL SVIRNLNDQV LFIDQGNRPL FEDMTDSDCR DNAPRTIFII SMYKDSQPR GMAVTISVKC EKISTLSCEN KIISFKEMNP PDNIKDTKSD IIFFQRSVPG HDNKMQFESS SYEGYFLACE K ERDLFKLI LKKEDELGDR SIMFTVQNED UniProtKB: ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 55.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: PDB ENTRY PDBモデル - PDB ID: |
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初期 角度割当 | タイプ: NOT APPLICABLE |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.5 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 260549 |