+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Cryo-EM structure of apo state mTRPV4 | |||||||||
![]() | ||||||||||
![]() |
| |||||||||
![]() | mTRPV4 / ![]() ![]() | |||||||||
機能・相同性 | ![]() blood vessel endothelial cell delamination / osmosensor activity / vasopressin secretion / stretch-activated, monoatomic cation-selective, calcium channel activity / positive regulation of striated muscle contraction / calcium ion import into cytosol / positive regulation of macrophage inflammatory protein 1 alpha production / negative regulation of brown fat cell differentiation / positive regulation of microtubule depolymerization / hyperosmotic salinity response ...blood vessel endothelial cell delamination / osmosensor activity / vasopressin secretion / stretch-activated, monoatomic cation-selective, calcium channel activity / positive regulation of striated muscle contraction / calcium ion import into cytosol / positive regulation of macrophage inflammatory protein 1 alpha production / negative regulation of brown fat cell differentiation / positive regulation of microtubule depolymerization / hyperosmotic salinity response / hypotonic response / cortical microtubule organization / positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 1 production / positive regulation of chemokine (C-C motif) ligand 5 production / cartilage development involved in endochondral bone morphogenesis / cellular hypotonic response / regulation of response to osmotic stress / cellular hypotonic salinity response / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Zhen WX / Yang F | |||||||||
資金援助 | ![]()
| |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural basis of ligand activation and inhibition in a mammalian TRPV4 ion channel. 著者: Wenxuan Zhen / Zhijun Zhao / Shenghai Chang / Xiaoying Chen / Yangzhuoqun Wan / Fan Yang / ![]() | |||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
添付画像 |
---|
-
ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 51.4 MB | ![]() | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 13.3 KB 13.3 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 37.2 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.3 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 95.1 MB 95.1 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
---|---|
「今月の分子」の関連する項目 |
-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.93 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
|
-添付データ
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_35919_half_map_1.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_35919_half_map_2.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-
試料の構成要素
-全体 : apo state of mTRPV4
全体 | 名称: apo state of mTRPV4 |
---|---|
要素 |
|
-超分子 #1: apo state of mTRPV4
超分子 | 名称: apo state of mTRPV4 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
-分子 #1: Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4
分子 | 名称: Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4 タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 75.666594 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: APAPQPPPIL KVFNRPILFD IVSRGSTADL DGLLSFLLTH KKRLTDEEFR EPSTGKTCLP KALLNLSNGR NDTIPVLLDI AERTGNMRE FINSPFRDIY YRGQTSLHIA IERRCKHYVE LLVAQGADVH AQARGRFFQP KDEGGYFYFG ELPLSLAACT N QPHIVNYL ...文字列: APAPQPPPIL KVFNRPILFD IVSRGSTADL DGLLSFLLTH KKRLTDEEFR EPSTGKTCLP KALLNLSNGR NDTIPVLLDI AERTGNMRE FINSPFRDIY YRGQTSLHIA IERRCKHYVE LLVAQGADVH AQARGRFFQP KDEGGYFYFG ELPLSLAACT N QPHIVNYL TENPHKKADM RRQDSRGNTV LHALVAIADN TRENTKFVTK MYDLLLLKCS RLFPDSNLET VLNNDGLSPL MM AAKTGKI GVFQHIIRRE VTDEDTRHLS RKFKDWAYGP VYSSLYDLSS LDTCGEEVSV LEILVYNSKI ENRHEMLAVE PIN ELLRDK WRKFGAVSFY INVVSYLCAM VIFTLTAYYQ PLEGTPPYPY RTTVDYLRLA GEVITLFTGV LFFFTSIKDL FTKK CPGVN SLFVDGSFQL LYFIYSVLVV VSAALYLAGI EAYLAVMVFA LVLGWMNALY FTRGLKLTGT YSIMIQKILF KDLFR FLLV YLLFMIGYAS ALVTLLNPCT NMKVCDEDQS NCTVPTYPAC RDSETFSAFL LDLFKLTIGM GDLEMLSSAK YPVVFI LLL VTYIILTFVL LLNMLIALMG ETVGQVSKES KHIWKLQWAT TILDIERSFP VFLRKAFRSG EMVTVGKSSD GTPDRRW CF RVDEVNWSHW NQNLGIINED PGK UniProtKB: Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4 |
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
---|---|
![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
濃度 | 5 mg/mL |
---|---|
緩衝液 | pH: 8 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 平均電子線量: 52.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-
画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: OTHER |
---|---|
初期 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.59 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 201371 |