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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | TBOA-bound GltPh RSMR mutant in OFS state | |||||||||
![]() | TBOA-bound RSMR mutant in OFS | |||||||||
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機能・相同性 | ![]() amino acid:sodium symporter activity / L-aspartate transmembrane transport / L-aspartate transmembrane transporter activity / L-aspartate import across plasma membrane / chloride transmembrane transporter activity / protein homotrimerization / chloride transmembrane transport / identical protein binding / ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Huang Y / Boudker O | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Environmentally Ultrasensitive Fluorine Probe to Resolve Protein Conformational Ensembles by 19F NMR and Cryo-EM 著者: Huang Y / Reddy KD / Bracken C / Qiu B / Zhan W / Eliezer D / Boudker O | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 108.6 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 16.4 KB 16.4 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 13.3 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 105.4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 200.2 MB 200.2 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | TBOA-bound RSMR mutant in OFS | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.852 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: Half Map 1
ファイル | emd_26489_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Half Map 1 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half Map 2
ファイル | emd_26489_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Half Map 2 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : TBOA-bound GltPh RSMR mutant in OFS state
全体 | 名称: TBOA-bound GltPh RSMR mutant in OFS state |
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要素 |
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-超分子 #1: TBOA-bound GltPh RSMR mutant in OFS state
超分子 | 名称: TBOA-bound GltPh RSMR mutant in OFS state / タイプ: complex / ID: 1 / キメラ: Yes / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
-分子 #1: Glutamate transporter homolog
分子 | 名称: Glutamate transporter homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() ![]() 株: ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3 |
分子量 | 理論値: 44.13323 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MGLYRKYIEY PVLQKILIGL ILGAIVGLIL GHYGYAHAVH TYVKPFGDLF VRLLKMLVMP IVFASLVVGA ASISPARLGR VGVKIVVYY LLTSAFAVTL GIIMARLFNP GAGIHLAVGG QQFQPHQAPP LVHILLDIVP TNPFGALANG QVLPTIFFAI I LGIAITYL ...文字列: MGLYRKYIEY PVLQKILIGL ILGAIVGLIL GHYGYAHAVH TYVKPFGDLF VRLLKMLVMP IVFASLVVGA ASISPARLGR VGVKIVVYY LLTSAFAVTL GIIMARLFNP GAGIHLAVGG QQFQPHQAPP LVHILLDIVP TNPFGALANG QVLPTIFFAI I LGIAITYL MNSENEKVRK SAETLLDAIN GLAEAMYKIV NGVMQYAPIG VFALIAHVMA HQGVHVVGEL AKVTAAVYVG LT LQILLVY FVLLKIYGID PISFIKHAKD AMLTAFVTSS SSGTLPVTMR VAKEMGISEG IYSFTLPLGA TINMDGTALY QGV ATFFIA NALGSHLTVG QQLTIVLTAV LASIGTAGVP GAGAIMLAMV LHSVGLPLTD PNVAAAYA(EFC)I LGIDAILDRG RTMVNVTGD LTGTAIVAKT EGT |
-分子 #2: (3S)-3-(BENZYLOXY)-L-ASPARTIC ACID
分子 | 名称: (3S)-3-(BENZYLOXY)-L-ASPARTIC ACID / タイプ: ligand / ID: 2 / コピー数: 1 / 式: TB1 |
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分子量 | 理論値: 239.225 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-TB1: |
-分子 #3: SODIUM ION
分子 | 名称: SODIUM ION / タイプ: ligand / ID: 3 / コピー数: 2 |
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分子量 | 理論値: 22.99 Da |
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 4.5 mg/mL |
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緩衝液 | pH: 7.4 |
グリッド | モデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: GOLD / メッシュ: 300 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 298 K |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 52.88 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |