Ribosome recycling factor / Ribosome recycling factor domain / RRF superfamily / Ribosome recycling factor / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / 28S ribosomal protein S26 / Mitochondrial ribosome subunit S26 / PPR repeat family / Cysteine alpha-hairpin motif superfamily / 28S ribosomal protein S27, mitochondrial ...Ribosome recycling factor / Ribosome recycling factor domain / RRF superfamily / Ribosome recycling factor / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / 28S ribosomal protein S26 / Mitochondrial ribosome subunit S26 / PPR repeat family / Cysteine alpha-hairpin motif superfamily / 28S ribosomal protein S27, mitochondrial / MRPS27/PTCD2 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S27 / Ribosomal protein S22, mitochondrial / Ribosomal protein S23, mitochondrial / Ribosomal protein S23/S25, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S31 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S22 / Mitochondrial ribosomal protein S23 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S31 / Ribosomal protein S29, mitochondrial / Ribosomal protein S28, mitochondrial / 28S ribosomal protein S10, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein MRP-S35 / 28S ribosomal protein S24, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3 / 28S ribosomal protein S17, mitochondrial / 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial / : / Mitochondrial ribosome subunit S24 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / Small ribosomal subunit protein uS5m, N-terminal / 28S ribosomal protein S25, mitochondrial / Pentatricopeptide repeat domain / Ribosomal protein L37, mitochondrial / Ribosomal protein L55, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L48 / 39S ribosomal protein L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L55 superfamily / Mitochondrial ribosomal protein L37 / Mitochondrial ribosomal protein L55 / Ribosomal protein S27/S33, mitochondrial / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal subunit S27 / Mitochondrial ribosomal protein L46 NUDIX / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial, conserved domain / Ribosomal protein S30, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal subunit protein / Ribosomal protein L53, mitochondrial / 39S ribosomal protein L53/MRP-L53 / 39S ribosomal protein L42, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S32 / Ribosomal protein L28/L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L37/S30 / Ribosomal protein 63, mitochondrial / Growth arrest/ DNA-damage-inducible protein-interacting protein 1 / Ribosomal protein L51, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S30 (PDCD9) / Growth arrest and DNA-damage-inducible proteins-interacting protein 1 / Mitochondrial ribosomal subunit / Mitochondrial ribosome protein 63 / Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1 domain superfamily / Ribosomal protein L35, mitochondrial / 39S ribosomal protein L52, mitochondrial / Mitoribosomal protein mL52 / MRPL44, double-stranded RNA binding domain / Tim44-like domain / Tim44-like domain / Tim44 / Pentatricopeptide (PPR) repeat profile. / Ribosomal protein S23/S29, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal death-associated protein 3 / Pentatricopeptide repeat / Ribosomal protein L49/IMG2 / Mitochondrial mRNA-processing protein COX24, C-terminal / Mitochondrial large subunit ribosomal protein (Img2) / Mitochondrial mRNA-processing protein COX24, C-terminal / Mitochondrial domain of unknown function (DUF1713) / Ribosomal protein L46, N-terminal / 39S mitochondrial ribosomal protein L46 / Ribosomal protein L50, mitochondria / Ribosomal protein L27/L41, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L27 / Ribosomal subunit 39S / 39S ribosomal protein L46, mitochondrial / Ribosomal protein L47, mitochondrial / MRP-L47 superfamily, mitochondrial / 39S ribosomal protein L43/54S ribosomal protein L51 / Mitochondrial 39-S ribosomal protein L47 (MRP-L47) / Phosphatidylethanolamine-binding protein / Phosphatidylethanolamine-binding protein / Phosphatidylethanolamine-binding protein, eukaryotic / PEBP-like superfamily / Threonyl/alanyl tRNA synthetase, class II-like, putative editing domain superfamily / TGS domain profile. / TGS / TGS-like / Peptide chain release factor class I / RF-1 domain 類似検索 - ドメイン・相同性
リボ核酸 / RNA (> 10) / RNA (> 100) / RNA (> 1000) / Small ribosomal subunit protein uS12m / Small ribosomal subunit protein uS14m / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein uL3m / Large ribosomal subunit protein bL19m / Small ribosomal subunit protein mS29 ...リボ核酸 / RNA (> 10) / RNA (> 100) / RNA (> 1000) / Small ribosomal subunit protein uS12m / Small ribosomal subunit protein uS14m / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein uL3m / Large ribosomal subunit protein bL19m / Small ribosomal subunit protein mS29 / Small ribosomal subunit protein mS22 / Small ribosomal subunit protein mS25 / Small ribosomal subunit protein uS10m / Small ribosomal subunit protein mS35 / Small ribosomal subunit protein uS5m / Small ribosomal subunit protein uS11m / Small ribosomal subunit protein uS15m / Small ribosomal subunit protein bS21m / Small ribosomal subunit protein mS34 / Small ribosomal subunit protein bS6m / Small ribosomal subunit protein uS9m / Large ribosomal subunit protein bL28m / Large ribosomal subunit protein mL49 / Large ribosomal subunit protein mL62 / Large ribosomal subunit protein uL23m / Large ribosomal subunit protein mL51 / Large ribosomal subunit protein uL2m / Large ribosomal subunit protein mL54 / Large ribosomal subunit protein uL14m / Large ribosomal subunit protein bL21m / Large ribosomal subunit protein mL55 / Large ribosomal subunit protein uL10m / Large ribosomal subunit protein mL52 / Large ribosomal subunit protein mL41 / Large ribosomal subunit protein mL50 / Large ribosomal subunit protein mL43 / Large ribosomal subunit protein mL64 / Large ribosomal subunit protein uL30m / Small ribosomal subunit protein mS27 / Small ribosomal subunit protein mS31 / Large ribosomal subunit protein uL24m / Small ribosomal subunit protein mS37 / Large ribosomal subunit protein mL38 / Ribosome-recycling factor, mitochondrial / Small ribosomal subunit protein uS3m / Large ribosomal subunit protein mL53 / Small ribosomal subunit protein mS39 / Large ribosomal subunit protein mL48 / Large ribosomal subunit protein bL34m / Large ribosomal subunit protein mL63 / Large ribosomal subunit protein mL45 / Large ribosomal subunit protein bL32m / Large ribosomal subunit protein bL20m / Large ribosomal subunit protein uL13m / Large ribosomal subunit protein bL9m / Large ribosomal subunit protein uL4m / Small ribosomal subunit protein mS26 / Large ribosomal subunit protein mL37 / Large ribosomal subunit protein uL18m / Large ribosomal subunit protein mL46 / Large ribosomal subunit protein mL44 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Large ribosomal subunit protein mL65 / Large ribosomal subunit protein mL40 / Large ribosomal subunit protein bL17m / Large ribosomal subunit protein mL66 / Small ribosomal subunit protein mS38 / Large ribosomal subunit protein uL22m / Large ribosomal subunit protein uL16m / Large ribosomal subunit protein mL39 / Large ribosomal subunit protein bL35m / Large ribosomal subunit protein uL15m / Large ribosomal subunit protein bL36m / Large ribosomal subunit protein bL27m / Small ribosomal subunit protein mS33 / Small ribosomal subunit protein bS1m / Small ribosomal subunit protein uS17m / Small ribosomal subunit protein uS7m / Small ribosomal subunit protein uS2m / Large ribosomal subunit protein uL11m / Small ribosomal subunit protein bS16m / Small ribosomal subunit protein bS18m / Small ribosomal subunit protein mS23 / Small ribosomal subunit protein mS40 / Large ribosomal subunit protein mL42 類似検索 - 構成要素
National Institutes of Health/Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health & Human Development (NIH/NICHD)
R01 GM61576
米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)
R01 GM 32734
米国
引用
ジャーナル: Proc Natl Acad Sci U S A / 年: 2019 タイトル: Structural insights into unique features of the human mitochondrial ribosome recycling. 著者: Ravi K Koripella / Manjuli R Sharma / Paul Risteff / Pooja Keshavan / Rajendra K Agrawal / 要旨: Mammalian mitochondrial ribosomes (mitoribosomes) are responsible for synthesizing proteins that are essential for oxidative phosphorylation (ATP generation). Despite their common ancestry with ...Mammalian mitochondrial ribosomes (mitoribosomes) are responsible for synthesizing proteins that are essential for oxidative phosphorylation (ATP generation). Despite their common ancestry with bacteria, the composition and structure of the human mitoribosome and its translational factors are significantly different from those of their bacterial counterparts. The mammalian mitoribosome recycling factor (RRF) carries a mito-specific N terminus extension (NTE), which is necessary for the function of RRF Here we present a 3.9-Å resolution cryo-electron microscopic (cryo-EM) structure of the human 55S mitoribosome-RRF complex, which reveals α-helix and loop structures for the NTE that makes multiple mito-specific interactions with functionally critical regions of the mitoribosome. These include ribosomal RNA segments that constitute the peptidyl transferase center (PTC) and those that connect PTC with the GTPase-associated center and with mitoribosomal proteins L16 and L27. Our structure reveals the presence of a tRNA in the pe/E position and a rotation of the small mitoribosomal subunit on RRF binding. In addition, we observe an interaction between the pe/E tRNA and a mito-specific protein, mL64. These findings help understand the unique features of mitoribosome recycling.
分子量: 472442.969 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
#2: RNA鎖
mt-tRNAVal
分子量: 17955.715 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
#54: RNA鎖
E-sitetRNA
分子量: 589.430 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
#56: RNA鎖
12SrRNA / MT-RNR1
分子量: 296318.281 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
+
39S ribosomal protein ... , 47種, 47分子 DEFHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ01234567...
#3: タンパク質
39SribosomalproteinL2, mitochondrial / リボソーム / MRP-L2 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL2m
分子量: 26258.434 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q5T653
#4: タンパク質
39SribosomalproteinL3, mitochondrial / リボソーム / MRP-L3 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL3m
分子量: 34023.105 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P09001
#5: タンパク質
39SribosomalproteinL4, mitochondrial / リボソーム / MRP-L4 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL4m
分子量: 28528.051 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYD3
#6: タンパク質
39SribosomalproteinL9, mitochondrial / リボソーム / MRP-L9 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL9m
分子量: 11127.014 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYD2
#7: タンパク質
39SribosomalproteinL10, mitochondrial / リボソーム / MRP-L10 / 39S ribosomal protein L8 / mitochondrial / MRP-L8 / Mitochondrial large ribosomal subunit ...MRP-L10 / 39S ribosomal protein L8 / mitochondrial / MRP-L8 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL10m
分子量: 19398.148 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q7Z7H8
#8: タンパク質
39SribosomalproteinL11, mitochondrial / リボソーム / MRP-L11 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL11m
分子量: 15094.771 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3B7
#9: タンパク質
39SribosomalproteinL13, mitochondrial / リボソーム / MRP-L13 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL13m
分子量: 20591.789 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYD1
#10: タンパク質
39SribosomalproteinL14, mitochondrial / リボソーム / MRP-L14 / 39S ribosomal protein L32 / mitochondrial / MRP-L32 / Mitochondrial large ribosomal ...MRP-L14 / 39S ribosomal protein L32 / mitochondrial / MRP-L32 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL14m
分子量: 12710.934 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q6P1L8
#11: タンパク質
39SribosomalproteinL15, mitochondrial / リボソーム / MRP-L15 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL15m
分子量: 32704.938 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9P015
#12: タンパク質
39SribosomalproteinL16, mitochondrial / リボソーム / MRP-L16 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL16m
分子量: 23538.449 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NX20
#13: タンパク質
39SribosomalproteinL17, mitochondrial / リボソーム / MRP-L17 / LYST-interacting protein 2 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL17m
分子量: 17761.713 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NRX2
#14: タンパク質
39SribosomalproteinL18, mitochondrial / リボソーム / MRP-L18 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL18m
分子量: 15993.326 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9H0U6
#15: タンパク質
39SribosomalproteinL19, mitochondrial / リボソーム / MRP-L19 / 39S ribosomal protein L15 / mitochondrial / MRP-L15 / Mitochondrial large ribosomal ...MRP-L19 / 39S ribosomal protein L15 / mitochondrial / MRP-L15 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL19m
分子量: 25919.100 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P49406
#16: タンパク質
39SribosomalproteinL20, mitochondrial / リボソーム / MRP-L20 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL20m
分子量: 16389.314 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYC9
#17: タンパク質
39SribosomalproteinL21, mitochondrial / リボソーム / MRP-L21 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL21m
分子量: 17794.934 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q7Z2W9
#18: タンパク質
39SribosomalproteinL22, mitochondrial / リボソーム / MRP-L22 / 39S ribosomal protein L25 / mitochondrial / MRP-L25 / Mitochondrial large ribosomal ...MRP-L22 / 39S ribosomal protein L25 / mitochondrial / MRP-L25 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL22m
分子量: 19466.799 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NWU5
#19: タンパク質
39SribosomalproteinL23, mitochondrial / リボソーム / MRP-L23 / L23 mitochondrial-related protein / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL23m / ...MRP-L23 / L23 mitochondrial-related protein / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL23m / Ribosomal protein L23-like
分子量: 13048.077 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q16540
#20: タンパク質
39SribosomalproteinL24, mitochondrial / リボソーム / MRP-L24 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL24m
分子量: 23496.045 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96A35
#21: タンパク質
39SribosomalproteinL27, mitochondrial / リボソーム / MRP-L27 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL27m
分子量: 12699.806 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9P0M9
#22: タンパク質
39SribosomalproteinL28, mitochondrial / リボソーム / MRP-L28 / Melanoma antigen p15 / Melanoma-associated antigen recognized by T-lymphocytes / ...MRP-L28 / Melanoma antigen p15 / Melanoma-associated antigen recognized by T-lymphocytes / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL28m
分子量: 28818.260 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q13084
#23: タンパク質
39SribosomalproteinL47, mitochondrial / リボソーム / MRP-L47 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL29m / Nasopharyngeal carcinoma metastasis- ...MRP-L47 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL29m / Nasopharyngeal carcinoma metastasis-related protein 1
分子量: 21508.092 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9HD33
#24: タンパク質
39SribosomalproteinL30, mitochondrial / リボソーム / MRP-L30 / 39S ribosomal protein L28 / mitochondrial / MRP-L28 / Mitochondrial large ribosomal ...MRP-L30 / 39S ribosomal protein L28 / mitochondrial / MRP-L28 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein uL30m
分子量: 13909.355 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8TCC3
#25: タンパク質
39SribosomalproteinL32, mitochondrial / リボソーム / MRP-L32 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL32m
分子量: 12606.611 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYC8
#26: タンパク質
39SribosomalproteinL33, mitochondrial / リボソーム / MRP-L33 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL33m
分子量: 6188.450 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O75394
#27: タンパク質・ペプチド
39SribosomalproteinL34, mitochondrial / リボソーム / MRP-L34 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL34m
分子量: 5368.348 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BQ48
#28: タンパク質
39SribosomalproteinL35, mitochondrial / リボソーム / MRP-L35 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL35m
分子量: 11788.066 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NZE8
#29: タンパク質・ペプチド
39SribosomalproteinL36, mitochondrial / リボソーム / MRP-L36 / BRCA1-interacting protein 1 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL36m
分子量: 4621.599 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9P0J6
#30: タンパク質
39SribosomalproteinL37, mitochondrial / リボソーム / MRP-L37 / 39S ribosomal protein L2 / mitochondrial / MRP-L2 / Mitochondrial large ribosomal subunit ...MRP-L37 / 39S ribosomal protein L2 / mitochondrial / MRP-L2 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL37
分子量: 45302.047 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BZE1
#31: タンパク質
39SribosomalproteinL38, mitochondrial / リボソーム / MRP-L38 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL38
分子量: 41690.961 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96DV4
#32: タンパク質
39SribosomalproteinL39, mitochondrial / リボソーム / MRP-L39 / 39S ribosomal protein L5 / mitochondrial / MRP-L5 / Mitochondrial large ribosomal subunit ...MRP-L39 / 39S ribosomal protein L5 / mitochondrial / MRP-L5 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL39
分子量: 33289.535 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NYK5
#33: タンパク質
39SribosomalproteinL40, mitochondrial / リボソーム / MRP-L40 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL40 / Nuclear localization signal- ...MRP-L40 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL40 / Nuclear localization signal-containing protein deleted in velocardiofacial syndrome / Up-regulated in metastasis
分子量: 11878.614 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NQ50
#34: タンパク質
39SribosomalproteinL41, mitochondrial / リボソーム / MRP-L41 / 39S ribosomal protein L27 homolog / Bcl-2-interacting mitochondrial ribosomal protein L41 ...MRP-L41 / 39S ribosomal protein L27 homolog / Bcl-2-interacting mitochondrial ribosomal protein L41 / Cell proliferation-inducing gene 3 protein / MRP-L27 homolog / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL41
分子量: 14032.986 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8IXM3
#35: タンパク質
39SribosomalproteinL42, mitochondrial / リボソーム / MRP-L42 / 39S ribosomal protein L31 / mitochondrial / MRP-L31 / Mitochondrial large ribosomal ...MRP-L42 / 39S ribosomal protein L31 / mitochondrial / MRP-L31 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL42
分子量: 12871.479 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y6G3
#36: タンパク質
39SribosomalproteinL43, mitochondrial / リボソーム / MRP-L43 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL43 / Mitochondrial ribosomal protein bMRP36a
分子量: 16741.986 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8N983
#37: タンパク質
39SribosomalproteinL44, mitochondrial / リボソーム / MRP-L44 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL44
39SribosomalproteinL45, mitochondrial / リボソーム / MRP-L45 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL45
分子量: 20094.213 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BRJ2
#39: タンパク質
39SribosomalproteinL46, mitochondrial / リボソーム / MRP-L46 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL46 / P2ECSL
分子量: 27362.070 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9H2W6
#40: タンパク質
39SribosomalproteinL48, mitochondrial / リボソーム / MRP-L48 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL48
分子量: 16476.834 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96GC5
#41: タンパク質
39SribosomalproteinL49, mitochondrial / リボソーム / MRP-L49 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL49 / Neighbor of FAU / NOF / Protein NOF1
分子量: 15087.213 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q13405
#42: タンパク質
39SribosomalproteinL50, mitochondrial / リボソーム / MRP-L50 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL50
分子量: 11963.396 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8N5N7
#43: タンパク質
39SribosomalproteinL51, mitochondrial / リボソーム / MRP-L51 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL51 / bMRP-64 / bMRP64
分子量: 11739.910 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q4U2R6
#44: タンパク質
39SribosomalproteinL52, mitochondrial / リボソーム / MRP-L52 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL52
分子量: 9730.910 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q86TS9
#45: タンパク質
39SribosomalproteinL53, mitochondrial / リボソーム / MRP-L53 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL53
分子量: 9386.758 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96EL3
#46: タンパク質・ペプチド
39SribosomalproteinL54, mitochondrial / リボソーム / MRP-L54 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL54
分子量: 3135.638 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q6P161
#47: タンパク質・ペプチド
39SribosomalproteinL55, mitochondrial / リボソーム / MRP-L55 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL31m / Mitochondrial large ribosomal ...MRP-L55 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL31m / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL55
分子量: 5321.221 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q7Z7F7
#51: タンパク質
39SribosomalproteinS18a, mitochondrial / リボソーム / S18mt-a / 39S ribosomal protein S18-3 / mitochondrial / MRP-S18-3 / Mitochondrial large ribosomal ...S18mt-a / 39S ribosomal protein S18-3 / mitochondrial / MRP-S18-3 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bS18a / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL66
分子量: 18814.961 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NVS2
#52: タンパク質
39SribosomalproteinS30, mitochondrial / リボソーム / S30mt / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL65 / Mitochondrial large ribosomal subunit ...S30mt / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL65 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mS30 / Programmed cell death protein 9
分子量: 45204.699 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NP92
-
タンパク質 , 7種, 7分子 opqzA2A3A4
#48: タンパク質
Ribosomalprotein63, mitochondrial / リボソーム / hMRP63 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL63 / Mitochondrial ribosomal protein 63 / ...hMRP63 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL63 / Mitochondrial ribosomal protein 63 / Mitochondrial ribosomal protein L57
分子量: 11316.099 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BQC6
#49: タンパク質
Peptidyl-tRNAhydrolaseICT1, mitochondrial / 39S ribosomal protein L58 / mitochondrial / MRP-L58 / Digestion substraction 1 / DS-1 / Immature ...39S ribosomal protein L58 / mitochondrial / MRP-L58 / Digestion substraction 1 / DS-1 / Immature colon carcinoma transcript 1 protein / Mitochondrial large ribosomal subunit protein mL62
分子量: 22590.197 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96E11
#84: タンパク質
Coiled-coil-helix-coiled-coil-helixdomain-containingprotein1 / 28S ribosomal protein S37 / mitochondrial / MRP-S37 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein ...28S ribosomal protein S37 / mitochondrial / MRP-S37 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS37 / Nuclear protein C2360
分子量: 13280.546 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96BP2
#85: タンパク質
AurorakinaseA-interactingprotein / AURKA-interacting protein / 28S ribosomal protein S38 / mitochondrial / MRP-S38 / Mitochondrial ...AURKA-interacting protein / 28S ribosomal protein S38 / mitochondrial / MRP-S38 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS38
分子量: 8722.630 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NWT8
#86: タンパク質
Pentatricopeptiderepeatdomain-containingprotein3, mitochondrial / 28S ribosomal protein S39 / mitochondrial / MRP-S39 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein ...28S ribosomal protein S39 / mitochondrial / MRP-S39 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS39 / Transformation-related gene 15 protein / TRG-15
分子量: 50095.523 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96EY7
-
タンパク質・ペプチド , 1種, 1分子 t
#53: タンパク質・ペプチド
Unknownprotein/proteinextension
分子量: 2400.951 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
+
28S ribosomal protein ... , 27種, 27分子 ABACADAEAFAGAHAIAJAKALAMANAOAPAQARASATAUAVAWAXAYAZA0A1
#57: タンパク質
28SribosomalproteinS2, mitochondrial / リボソーム / S2mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS2m
分子量: 25127.051 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y399
#58: タンパク質
28SribosomalproteinS24, mitochondrial / リボソーム / S24mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS3m / bMRP-47 / bMRP47
分子量: 15333.757 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96EL2
#59: タンパク質
28SribosomalproteinS5, mitochondrial / リボソーム / S5mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS5m
分子量: 38919.043 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82675
#60: タンパク質
28SribosomalproteinS6, mitochondrial / リボソーム / S6mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS6m
分子量: 13861.032 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82932
#61: タンパク質
28SribosomalproteinS7, mitochondrial / リボソーム / S7mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS7m / bMRP-27a / bMRP27a
分子量: 24569.783 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y2R9
#62: タンパク質
28SribosomalproteinS9, mitochondrial / リボソーム / S9mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS9m
分子量: 38070.695 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82933
#63: タンパク質
28SribosomalproteinS10, mitochondrial / リボソーム / S10mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS10m
分子量: 14205.417 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82664
#64: タンパク質
28SribosomalproteinS11, mitochondrial / リボソーム / S11mt / Cervical cancer proto-oncogene 2 protein / HCC-2 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS11m
分子量: 14408.737 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82912
#65: タンパク質
28SribosomalproteinS12, mitochondrial / リボソーム / S12mt / MT-RPS12 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS12m
分子量: 12013.163 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O15235
#66: タンパク質
28SribosomalproteinS14, mitochondrial / リボソーム / S14mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS14m
分子量: 12282.349 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O60783
#67: タンパク質
28SribosomalproteinS15, mitochondrial / リボソーム / S15mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS15m
分子量: 19716.396 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82914
#68: タンパク質
28SribosomalproteinS16, mitochondrial / リボソーム / S16mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS16m
分子量: 13123.434 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3D3
#69: タンパク質
28SribosomalproteinS17, mitochondrial / リボソーム / S17mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein uS17m
分子量: 12034.328 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y2R5
#70: タンパク質
28SribosomalproteinS18b, mitochondrial / リボソーム / S18mt-b / 28S ribosomal protein S18-2 / mitochondrial / MRP-S18-2 / Mitochondrial small ribosomal ...S18mt-b / 28S ribosomal protein S18-2 / mitochondrial / MRP-S18-2 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS18b / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS40
分子量: 21658.645 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y676
#71: タンパク質
28SribosomalproteinS18c, mitochondrial / リボソーム / S18mt-c / 28S ribosomal protein S18-1 / mitochondrial / MRP-S18-1 / Mitochondrial small ribosomal ...S18mt-c / 28S ribosomal protein S18-1 / mitochondrial / MRP-S18-1 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS18c / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS18m
分子量: 11101.151 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3D5
#72: タンパク質
28SribosomalproteinS21, mitochondrial / リボソーム / S21mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS21m
分子量: 10579.405 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82921
#73: タンパク質
28SribosomalproteinS22, mitochondrial / リボソーム / S22mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS22
分子量: 28555.871 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82650
#74: タンパク質
28SribosomalproteinS23, mitochondrial / リボソーム / S23mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS23
分子量: 14720.787 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3D9
#75: タンパク質
28SribosomalproteinS25, mitochondrial / リボソーム / S25mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS25
分子量: 19001.092 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82663
#76: タンパク質
28SribosomalproteinS26, mitochondrial / リボソーム / S26mt / 28S ribosomal protein S13 / mitochondrial / S13mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS26
分子量: 20800.678 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYN8
#77: タンパク質
28SribosomalproteinS27, mitochondrial / リボソーム / S27mt / Mitochondrial ribosomal protein S27 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS27
分子量: 42358.980 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q92552
#78: タンパク質
28SribosomalproteinS28, mitochondrial / リボソーム / S28mt / 28S ribosomal protein S35 / mitochondrial / S35mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein bS1m
分子量: 10933.673 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y2Q9
#79: タンパク質
28SribosomalproteinS29, mitochondrial / リボソーム / S29mt / Death-associated protein 3 / DAP-3 / Ionizing radiation resistance conferring protein / ...S29mt / Death-associated protein 3 / DAP-3 / Ionizing radiation resistance conferring protein / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS29
分子量: 39992.750 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P51398
#80: タンパク質
28SribosomalproteinS31, mitochondrial / リボソーム / S31mt / Imogen 38 / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS31
分子量: 12900.411 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q92665
#81: タンパク質
28SribosomalproteinS33, mitochondrial / リボソーム / S33mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS33
分子量: 10538.197 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y291
#82: タンパク質
28SribosomalproteinS34, mitochondrial / リボソーム / S34mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS34
分子量: 24594.143 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82930
#83: タンパク質
28SribosomalproteinS35, mitochondrial / リボソーム / S35mt / 28S ribosomal protein S28 / mitochondrial / S28mt / Mitochondrial small ribosomal subunit protein mS35
分子量: 31361.951 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82673
名称: Structural insights into unique features of the human mitochondrial ribosome bound with mtRRF -Class-1 タイプ: RIBOSOME 詳細: Structure of human mitochondrial ribosome complex with mtRRF -Class-1 Entity ID: #1-#86 / 由来: NATURAL
由来(天然)
生物種: Homo sapiens (ヒト)
緩衝液
pH: 7.6
試料
包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES
試料支持
詳細: unspecified
急速凍結
凍結剤: ETHANE
-
電子顕微鏡撮影
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company
顕微鏡
モデル: FEI TITAN KRIOS
電子銃
電子線源: その他 / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: OTHER
電子レンズ
モード: OTHER
撮影
電子線照射量: 70 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
-
解析
EMソフトウェア
ID
名称
バージョン
カテゴリ
4
RELION
2
CTF補正
7
Coot
モデルフィッティング
9
PHENIX
モデル精密化
10
RELION
2
初期オイラー角割当
11
cryoSPARC
最終オイラー角割当
12
cryoSPARC
分類
13
cryoSPARC
3次元再構成
CTF補正
タイプ: NONE
対称性
点対称性: C1 (非対称)
3次元再構成
解像度: 3.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 67116 / 対称性のタイプ: POINT