ChemComp-HYG: HYGROMYCIN B

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: HYG
• 名称: 名称: hygromycin B; 別称: HYGROMIX; ANTIHELMYCIN; HYDROMYCIN B; DESTOMYSIN; ANTIBIOTIC A-396-II
• ウィキペディア: ウィキペディア - ハイグロマイシンB: ハイグロマイシンB (Hygromycin B) は、ストレプトマイセス属の細菌 Streptomyces hygroscopicus によって産生される抗生物質である。アミノグリコシド系の抗生物質であり、タンパク質合成を阻害することで、細菌、菌類、高等真核生物の細胞に作用する...
• コメント: 抗生剤*YM

Chemical information

組成

組成式: C₂₀H₃₇N₃O₁₃ / 原子数: 73 / 化学式量: 527.52 / 形式電荷: 0

その他

1hnz

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: HYG / モデル座標のPDB-ID: 1HNZ

履歴

作成	2000年12月15日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年5月27日

• 外部リンク: UniChem / PubChem / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O1C4C(OC12OC(C(O)C(O)C2O)C(N)CO)C(O)C(OC4OC3C(O)C(N)CC(NC)C3O)CO
• CACTVS 3.341: CN[CH]1C[CH](N)[CH](O)[CH](O[CH]2O[CH](CO)[CH](O)[CH]3O[C]4(O[CH]([CH](N)CO)[CH](O)[CH](O)[CH]4O)O[CH]23)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CNC1CC(C(C(C1O)OC2C3C(C(C(O2)CO)O)OC4(O3)C(C(C(C(O4)C(CO)N)O)O)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: CN[C@H]1C[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]3O[C@@]4(O[C@@H]([C@@H](N)CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]4O)O[C@@H]23)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CN[C@H]1C[C@H]([C@@H]([C@H]([C@@H]1O)O[C@H]2[C@H]3[C@H](C([C@H](O2)CO)O)O[C@@]4(O3)[C@@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O4)[C@H](CO)N)O)O)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C20H37N3O13/c1-23-7-2-5(21)9(26)15(10(7)27)33-19-17-16(11(28)8(4-25)32-19)35-20(36-17)18(31)13(30)12(29)14(34-20)6(22)3-24/h5-19,23-31H,2-4,21-22H2,1H3/t5-,6+,7+,8-,9+,10-,11+,12-,13-,14+,15-,16+,17-,18-,19+,20-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: GRRNUXAQVGOGFE-WRWUMOMGSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (2R,3'R,3aR,4S,4'R,5'R,6R,6'S,7S,7aS)-4-{[(1R,2S,3R,5S,6R)-3-amino-2,6-dihydroxy-5-(methylamino)cyclohexyl]oxy}-6'-[(1S)-1-amino-2-hydroxyethyl]-6-(hydroxymethyl)octahydro-4H-spiro[1,3-dioxolo[4,5-c]pyran-2,2'-pyran]-3',4',5',7-tetrol (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2R,3'R,3aR,4S,4'R,5'R,6R,6'S,7aS)-4-[(1R,2S,3R,5S,6R)-3-amino-2,6-dihydroxy-5-methylamino-cyclohexyl]oxy-6'-[(1S)-1-amino-2-hydroxy-ethyl]-6-(hydroxymethyl)spiro[4,6,7,7a-tetrahydro-3aH-[1,3]dioxolo[4,5-d]pyran-2,2'-oxane]-3',4',5',7-tetrol

PDBエントリ

全5件を表示しています

PDB-1hnz:
STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH HYGROMYCIN B

PDB-4lf5:
Crystal Structure of 30S ribosomal subunit from Thermus thermophilus

PDB-4lfa:
Crystal Structure of 30S ribosomal subunit from Thermus thermophilus

PDB-4v64:
Crystal structure of the bacterial ribosome from Escherichia coli in complex with hygromycin B.

PDB-6qzp:
High-resolution cryo-EM structure of the human 80S ribosome