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- EMDB-4317: Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Boun... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4317
タイトルCryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome
マップデータ
試料
  • 複合体: Mammalian Oligosaccharyltransferase in complex with Sec61 and the non-programmed 80S Ribosome
    • 複合体: 60S Ribosomal Subunitリボソーム
      • タンパク質・ペプチド: x 44種
      • RNA: x 3種
    • 複合体: Sec61 protein conducting channel
      • タンパク質・ペプチド: x 3種
    • 複合体: Oligosaccharyltransferase
      • タンパク質・ペプチド: x 8種
  • リガンド: x 3種
機能・相同性
機能・相同性情報


oligosaccharyltransferase III complex / Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane / membrane docking / endoplasmic reticulum Sec complex / pronephric nephron development / oligosaccharyltransferase complex / dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase / dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase activity / protein N-linked glycosylation via asparagine / cotranslational protein targeting to membrane ...oligosaccharyltransferase III complex / Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane / membrane docking / endoplasmic reticulum Sec complex / pronephric nephron development / oligosaccharyltransferase complex / dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase / dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase activity / protein N-linked glycosylation via asparagine / cotranslational protein targeting to membrane / Ssh1 translocon complex / Sec61 translocon complex / protein targeting to ER / protein-transporting ATPase activity / protein insertion into ER membrane / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, translocation / signal sequence binding / post-translational protein targeting to membrane, translocation / protein glycosylation / protein transmembrane transporter activity / 小胞体 / post-translational protein modification / cytosolic ribosome / phospholipid binding / ribosome binding / リボソーム生合成 / 5S rRNA binding / リボソーム / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / 翻訳 (生物学) / endoplasmic reticulum membrane / 核小体 / 小胞体 / 生体膜 / metal ion binding / 細胞質基質 / 細胞質
類似検索 - 分子機能
Oligosaccharyltransferase complex subunit OSTC / Ribophorin I / Ribophorin I / Oligosaccharyl transferase complex, subunit OST3/OST6 / OST3 / OST6 family, transporter family / : / STT3/PglB/AglB core domain / : / Oligosaccharyl transferase, STT3 subunit / Oligosaccharyl transferase STT3, N-terminal ...Oligosaccharyltransferase complex subunit OSTC / Ribophorin I / Ribophorin I / Oligosaccharyl transferase complex, subunit OST3/OST6 / OST3 / OST6 family, transporter family / : / STT3/PglB/AglB core domain / : / Oligosaccharyl transferase, STT3 subunit / Oligosaccharyl transferase STT3, N-terminal / Protein transport Sec61-beta/Sbh / Protein transport protein SecG/Sec61-beta/Sbh / Sec61beta family / Protein translocase SEC61 complex, gamma subunit / Protein translocase SecE domain superfamily / Translocon Sec61/SecY, plug domain / Plug domain of Sec61p / Protein secE/sec61-gamma signature. / Protein secY signature 1. / Protein secY signature 2. / SecE/Sec61-gamma subunits of protein translocation complex / Protein translocase complex, SecE/Sec61-gamma subunit / SecY/SEC61-alpha family / SecY domain superfamily / SecY conserved site / SecY / 60S acidic ribosomal protein P0 / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / 60S ribosomal protein L10P, insertion domain / Insertion domain in 60S ribosomal protein L10P / : / Ribosomal Protein L6, KOW domain / 60S ribosomal protein L6E / Ribosomal protein L27e signature. / Ribosomal protein L44e signature. / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein L6e / Ribosomal protein L24e signature. / Ribosomal protein L34e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / Ribosomal protein L6e signature. / Ribosomal protein L36e signature. / Ribosomal protein L39e signature. / Ribosomal protein L35Ae signature. / Ribosomal protein L31e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic/L18 archaeal / Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18 / Ribosomal protein L32e signature. / Ribosomal protein L6 signature 2. / Ribosomal protein L1e signature. / Ribosomal protein L15e signature. / Ribosomal protein L21e signature. / Ribosomal protein L37e signature. / Ribosomal protein L10P / Ribosomal protein L10 / Ribosomal protein L11 signature. / Ribosomal protein L23 signature. / Ribosomal protein L30 signature. / Ribosomal protein L5 signature. / Ribosomal protein L29 signature. / Ribosomal protein L15 signature. / Ribosomal protein L14 signature. / Ribosomal protein L22 signature. / Ribosomal protein L24 signature. / Ribosomal protein L3 signature. / Translation protein SH3-like domain superfamily / Ribosomal protein L2, domain 2
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein eS32 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 / Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Large ribosomal subunit protein eL31 / Large ribosomal subunit protein eL21 / Large ribosomal subunit protein uL29 ...Small ribosomal subunit protein eS32 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 / Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Large ribosomal subunit protein eL31 / Large ribosomal subunit protein eL21 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Large ribosomal subunit protein uL11 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein eL8 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL43 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein eL42 / Large ribosomal subunit protein eL15 / Large ribosomal subunit protein uL14 / 60S ribosomal protein L6 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein eL29 / Large ribosomal subunit protein eL22 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein eL36 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein eL32 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL27 / 60S acidic ribosomal protein P0 / Large ribosomal subunit protein eL28 / Large ribosomal subunit protein eL34 / Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 / Protein transport protein Sec61 subunit gamma / Protein transport protein Sec61 subunit beta / Oligosaccharyltransferase complex subunit OSTC / Large ribosomal subunit protein eL14 / Large ribosomal subunit protein eL37
類似検索 - 構成要素
生物種Oryctolagus cuniculus (ウサギ) / Canis lupus familiaris (イヌ) / Rabbit (ウサギ) / Dog (イヌ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.7 Å
データ登録者Braunger K / Becker T / Beckmann R
資金援助 ドイツ, 5件
OrganizationGrant number国
German Research FoundationGRK1721 ドイツ
German Research FoundationSFB646 ドイツ
European Research CouncilCRYOTRANSLATION ドイツ
Boehringer-Ingelheim-FondsPhD Fellowship ドイツ
Center for Integrated Protein Science Munich ドイツ
引用ジャーナル: Science / 年: 2018
タイトル: Structural basis for coupling protein transport and N-glycosylation at the mammalian endoplasmic reticulum.
著者: Katharina Braunger / Stefan Pfeffer / Shiteshu Shrimal / Reid Gilmore / Otto Berninghausen / Elisabet C Mandon / Thomas Becker / Friedrich Förster / Roland Beckmann /
要旨: Protein synthesis, transport, and N-glycosylation are coupled at the mammalian endoplasmic reticulum by complex formation of a ribosome, the Sec61 protein-conducting channel, and ...Protein synthesis, transport, and N-glycosylation are coupled at the mammalian endoplasmic reticulum by complex formation of a ribosome, the Sec61 protein-conducting channel, and oligosaccharyltransferase (OST). Here we used different cryo-electron microscopy approaches to determine structures of native and solubilized ribosome-Sec61-OST complexes. A molecular model for the catalytic OST subunit STT3A (staurosporine and temperature sensitive 3A) revealed how it is integrated into the OST and how STT3-paralog specificity for translocon-associated OST is achieved. The OST subunit DC2 was placed at the interface between Sec61 and STT3A, where it acts as a versatile module for recruitment of STT3A-containing OST to the ribosome-Sec61 complex. This detailed structural view on the molecular architecture of the cotranslational machinery for N-glycosylation provides the basis for a mechanistic understanding of glycoprotein biogenesis at the endoplasmic reticulum.
履歴
登録2018年2月22日-
ヘッダ(付随情報) 公開2018年3月21日-
マップ公開2018年3月21日-
更新2020年7月29日-
現状2020年7月29日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.04
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 原子モデル: PDB-6ftj
  • 表面レベル: 0.04
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 単純化した表面モデル + あてはめた原子モデル
  • 原子モデルPDB-6ftj
  • Jmolによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4317.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4317.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 476.8 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.1924 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.04 / ムービー #1: 0.04
最小 - 最大-0.16851358 - 0.29078773
平均 (標準偏差)0.00009316 (±0.007921075)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ500500500
Spacing500500500
セルA=B=C: 596.2 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.19241.19241.1924
M x/y/z500500500
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z596.200596.200596.200
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS500500500
D min/max/mean-0.1690.2910.000

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_4317_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: #1

ファイルemd_4317_additional.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Mammalian Oligosaccharyltransferase in complex with Sec61 and the...

全体名称: Mammalian Oligosaccharyltransferase in complex with Sec61 and the non-programmed 80S Ribosome
要素
  • 複合体: Mammalian Oligosaccharyltransferase in complex with Sec61 and the non-programmed 80S Ribosome
    • 複合体: 60S Ribosomal Subunitリボソーム
      • タンパク質・ペプチド: uL2
      • タンパク質・ペプチド: uL3
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L460S ribosomal protein L4
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L5
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6
      • タンパク質・ペプチド: Ul30
      • タンパク質・ペプチド: uL8
      • タンパク質・ペプチド: uL6
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L10 (Predicted)リボソーム
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L11
      • タンパク質・ペプチド: eL13
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L14
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15
      • タンパク質・ペプチド: uL13
      • タンパク質・ペプチド: uL22
      • タンパク質・ペプチド: uL14
      • タンパク質・ペプチド: eL19
      • タンパク質・ペプチド: eL20
      • タンパク質・ペプチド: eL21
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L2260S ribosomal protein L22
      • タンパク質・ペプチド: uL14
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L24
      • タンパク質・ペプチド: uL23
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L26
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27
      • タンパク質・ペプチド: uL15
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L29
      • タンパク質・ペプチド: eL30
      • タンパク質・ペプチド: eL31
      • タンパク質・ペプチド: eL32CD59
      • タンパク質・ペプチド: eL33
      • タンパク質・ペプチド: eL34
      • タンパク質・ペプチド: uL29
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L37
      • タンパク質・ペプチド: eL38
      • タンパク質・ペプチド: eL39
      • タンパク質・ペプチド: eL40
      • タンパク質・ペプチド: 60s ribosomal protein l41
      • タンパク質・ペプチド: eL42
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L37aリボソーム
      • タンパク質・ペプチド: eL28
      • タンパク質・ペプチド: 60S acidic ribosomal protein P0
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L12
      • RNA: 28S rRNA28SリボソームRNA
      • RNA: 5S ribosomal RNA5SリボソームRNA
      • RNA: 5.8S ribosomal RNA5.8SリボソームRNA
    • 複合体: Sec61 protein conducting channel
      • タンパク質・ペプチド: Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1Protein targeting
      • タンパク質・ペプチド: Protein transport protein Sec61 subunit gammaProtein targeting
      • タンパク質・ペプチド: Protein transport protein Sec61 subunit betaProtein targeting
    • 複合体: Oligosaccharyltransferase
      • タンパク質・ペプチド: Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1,RPN1
      • タンパク質・ペプチド: TMEM258
      • タンパク質・ペプチド: Oligosaccharyltransferase complex subunit OSTCOligosaccharyltransferase
      • タンパク質・ペプチド: OST4Oligosaccaryltransferase
      • タンパク質・ペプチド: Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A
      • タンパク質・ペプチド: DAD1
      • タンパク質・ペプチド: OST48
      • タンパク質・ペプチド: RPN2
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid

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超分子 #1: Mammalian Oligosaccharyltransferase in complex with Sec61 and the...

超分子名称: Mammalian Oligosaccharyltransferase in complex with Sec61 and the non-programmed 80S Ribosome
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#58
詳細: Map obtained after refinement with a mask on the membrane components

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超分子 #2: 60S Ribosomal Subunit

超分子名称: 60S Ribosomal Subunit / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#47
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)

+
超分子 #3: Sec61 protein conducting channel

超分子名称: Sec61 protein conducting channel / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #48-#50
由来(天然)生物種: Canis lupus familiaris (イヌ)

+
超分子 #4: Oligosaccharyltransferase

超分子名称: Oligosaccharyltransferase / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #51-#58
由来(天然)生物種: Canis lupus familiaris (イヌ)

+
分子 #1: uL2

分子名称: uL2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.570105 KDa
配列文字列: GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV ...文字列:
GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV AGGGRIDKPI LKAGRAYHKY KAKRNCWPRV RGVAMNPVEH PFGGGNHQHI GKPSTIRRDA PAGRKVGLIA AR RTGR

+
分子 #2: uL3

分子名称: uL3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 45.119812 KDa
配列文字列: SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDD AGKRQLDKDF SSMKKYCQVI R VLAHTQMR ...文字列:
SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDD AGKRQLDKDF SSMKKYCQVI R VLAHTQMR LLPLRQKKAH LMEIQVNGGT VAEKLDWARE RLEQQVPVSQ VFGQDEMIDV IGVTKGKGYK GVTSRWHTKK LP RKTHRGL RKVACIGAWH PARVAFSVAR AGQKGYHHRT EINKKIYKIG QGYLIKDGKL IKNNASTDYD LSDKSINPLG GFV HYGEVT NDFVMLKGCV VGTKKRVLTL RKSLLVQTKR RALEKIDLKF IDTTSKFGHG RFQTVEEKKA FMGPLKKD

+
分子 #3: Ribosomal protein L4

分子名称: Ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 41.115508 KDa
配列文字列: ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVEG Y KKTKEAVL ...文字列:
ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVEG Y KKTKEAVL LLKKLKAWND IKKVYASQRM RAGKGKMRNR RRIQRRGPCV IYNEDNGIVK AFRNIPGITL LNVTKLNILK LA PGGHVGR FCIWTESAFR KLDDLYGTWR KAASLKSNYN LPMHKMLNTD LSRILKSPEI QRALRAPRKK IHRRVLKKNP LKN LRIMLK LNPYAKTMRR NTILRQARNH KLRVERAAAA LAAKKS

+
分子 #4: 60S ribosomal protein L5

分子名称: 60S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 34.006312 KDa
配列文字列: FVKVVKNKAY FKRYQVKFRR RREGKTDYYA RKRLVIQDKN KYNTPKYRMI VRVTNRDIIC QIAYARIEGD MIVCAAYAHE LPKYGVKVG LTNYAAAYCT GLLLARRLLN RFGMDKIYEG QVEVTGDEYN VESIDGQPGA FTCYLDAGLA RTTTGNKVFG A LKGAVDGG ...文字列:
FVKVVKNKAY FKRYQVKFRR RREGKTDYYA RKRLVIQDKN KYNTPKYRMI VRVTNRDIIC QIAYARIEGD MIVCAAYAHE LPKYGVKVG LTNYAAAYCT GLLLARRLLN RFGMDKIYEG QVEVTGDEYN VESIDGQPGA FTCYLDAGLA RTTTGNKVFG A LKGAVDGG LSIPHSTKRF PGYDSESKEF NAEVHRKHIM GQNVADYMRY LMEEDEDAYK KQFSQYIKNN VTPDMMEEMY KK AHAAIRE NPVYEKKPKR EVKKKRWNRP KMSLAQKKDR VAQKKASFLR AQERA

+
分子 #5: 60S ribosomal protein L6

分子名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 28.529848 KDa
配列文字列: PHCSRNPVLV RGIGRYSRSA MYSRKALYKR KYAAPKSRIE RKKKREKVLA TVTKPVGGDK NGGTRVVKLR KMPRYYPTED VPRKLLSHG RKPFSQHVRK LRASITPGTI LIILTGRHRG KRVVFLKQLS SGLLLVTGPL SLNRVPLRRT HQKFVIATST K IDISGVKI ...文字列:
PHCSRNPVLV RGIGRYSRSA MYSRKALYKR KYAAPKSRIE RKKKREKVLA TVTKPVGGDK NGGTRVVKLR KMPRYYPTED VPRKLLSHG RKPFSQHVRK LRASITPGTI LIILTGRHRG KRVVFLKQLS SGLLLVTGPL SLNRVPLRRT HQKFVIATST K IDISGVKI PKHLTDAYFK KKQLRKPRHQ EGEIFDTEKE KYEITEQRKV DQKAVDSQIL PKIKAVPQLQ GYLRSVFALT NG VYPHKLV F

+
分子 #6: Ul30

分子名称: Ul30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.662787 KDa
配列文字列: NFAELKIKRL RKKFAQKMLR KARRKLIYEK AKHYHKEYRQ MYRTEIRMAR MARKAGNFYV PAEPKLAFVI RIRGINGVSP KVRKVLQLL RLRQIFNGTF VKLNKASINM LRIVEPYIAW GYPNLKSVNE LIYKRGYGKI NKKRIALTDN ALIARSLGKY G IICMEDLI ...文字列:
NFAELKIKRL RKKFAQKMLR KARRKLIYEK AKHYHKEYRQ MYRTEIRMAR MARKAGNFYV PAEPKLAFVI RIRGINGVSP KVRKVLQLL RLRQIFNGTF VKLNKASINM LRIVEPYIAW GYPNLKSVNE LIYKRGYGKI NKKRIALTDN ALIARSLGKY G IICMEDLI HEIYTVGKRF KEANNFLWPF KLSSPRGGMK KKTTHFVEGE DAGNREDQIN RLIRRMN

+
分子 #7: uL8

分子名称: uL8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 27.480555 KDa
配列文字列: KVVNPLFEKR PKNFGIGQDI QPKRDLTRFV KWPRYIRLQR QRAILYKRLK VPPAINQFTQ VLDRQTATQL LKLAHKYRPE TKQEKKQRL LARAEKKAAG KGDVPTKRPP VLRAGVNTVT TLVENKKAQL VVIAHDVDPI ELVVFLPALC RKMGVPYCIL K GKARLGRL ...文字列:
KVVNPLFEKR PKNFGIGQDI QPKRDLTRFV KWPRYIRLQR QRAILYKRLK VPPAINQFTQ VLDRQTATQL LKLAHKYRPE TKQEKKQRL LARAEKKAAG KGDVPTKRPP VLRAGVNTVT TLVENKKAQL VVIAHDVDPI ELVVFLPALC RKMGVPYCIL K GKARLGRL VHRKTCTTVA FTQVNSEDKG ALAKLVEAIR TNYNDRYDEI RRHWGGNVLG PKSVARIAKL EKAKAKELAT KL G

+
分子 #8: uL6

分子名称: uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.627215 KDa
配列文字列: MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK ...文字列:
MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK NKDIRKFLDG IYVSEKGTVQ QA

+
分子 #9: Ribosomal protein L10 (Predicted)

分子名称: Ribosomal protein L10 (Predicted) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.511861 KDa
配列文字列: GRRPARCYRY CKNKPYPKSR FCRGVPDAKI RIFDLGRKKA KVDEFPLCGH MVSDEYEQLS SEALEAARIC ANKYMVKSCG KDGFHIRVR LHPFHVIRIN KMLSCAGADR LQTGMRGAFG KPQGTVARVH IGQVIMSIRT KLQNKEHVVE ALRRAKFKFP G RQKIHISK ...文字列:
GRRPARCYRY CKNKPYPKSR FCRGVPDAKI RIFDLGRKKA KVDEFPLCGH MVSDEYEQLS SEALEAARIC ANKYMVKSCG KDGFHIRVR LHPFHVIRIN KMLSCAGADR LQTGMRGAFG KPQGTVARVH IGQVIMSIRT KLQNKEHVVE ALRRAKFKFP G RQKIHISK KWGFTKFNAD EFEDMVAEKR LIPDGCGVKY IPNRGPLDKW RALHS

+
分子 #10: Ribosomal protein L11

分子名称: Ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 19.270318 KDa
配列文字列:
ENPMRELRIR KLCLNICVGE SGDRLTRAAK VLEQLTGQTP VFSKARYTVR SFGIRRNEKI AVHCTVRGAK AEEILEKGLK VREYELRKN NFSDTGNFGF GIQEHIDLGI KYDPSIGIYG LDFYVVLGRP GFSIADKKRR TGCIGAKHRI SKEEAMRWFQ Q KYDGIILP G

+
分子 #11: eL13

分子名称: eL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.216525 KDa
配列文字列: APSRNGMILK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA RARRIAPRPA SGPLRPIVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKSTESL QANVQRLKEY RSKLVLFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPIRNV F KKEKARVI ...文字列:
APSRNGMILK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA RARRIAPRPA SGPLRPIVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKSTESL QANVQRLKEY RSKLVLFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPIRNV F KKEKARVI TEEEKNFKAF ASLRMARANA RLFGIRAKRA KEAAEQDVEK KK

+
分子 #12: Ribosomal protein L14

分子名称: Ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.217355 KDa
配列文字列:
VFRRFVEVGR VAYVSFGPHA GKLVAIVDVI DQNRALVDGP CTRVRRQAMP FKCMQLTDFI LKFPHSARQK YVRKAWEKAD INTKWAATR WAKKIEARER KAKMTDFDRY KVMKAKKMRN RIIKNEVKKL QRAALLKAS

+
分子 #13: Ribosomal protein L15

分子名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.076088 KDa
配列文字列: GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR ...文字列:
GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR KSRGLGKGHK FHHTIGGSRR AAWRRRNTLQ LHRYR

+
分子 #14: uL13

分子名称: uL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 23.248924 KDa
配列文字列: QVLVLDGRGH LLGRLAAIVA KQVLLGRKVV VVRCEGINIS GNFYRNKLKY LAFLRKRMNT NPSRGPYHFR APSRIFWRTV RGMLPHKTK RGQAALDRLK VFDGIPPPYD KKKRMVVPAA LKVVRLKPTR KFAYLGRLAH EVGWKYQAVT ATLEEKRKEK A KIHYRKKK ...文字列:
QVLVLDGRGH LLGRLAAIVA KQVLLGRKVV VVRCEGINIS GNFYRNKLKY LAFLRKRMNT NPSRGPYHFR APSRIFWRTV RGMLPHKTK RGQAALDRLK VFDGIPPPYD KKKRMVVPAA LKVVRLKPTR KFAYLGRLAH EVGWKYQAVT ATLEEKRKEK A KIHYRKKK QLMRLRKQAE KNVEKKIDRF TEVLKTHGFL V

+
分子 #15: uL22

分子名称: uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.757627 KDa
配列文字列:
VRYSLDPENP TKSCKSRGSN LRVHFKNTRE TAQAIKGMHI RKATKYLKDV TLQKQCVPFR RYNGGVGRCA QAKQWGWTQG RWPKKSAEF LLHMLKNAES NAELKGLDVD SLVIEHIQVN KAPKMRRRTY RAHGRINPYM SSPCHIEMIL TEKE

+
分子 #16: uL14

分子名称: uL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.457391 KDa
配列文字列:
GVDIRHNKDR KVRRKEPKSQ DIYLRLLVKL YRFLARRTNS TFNQVVLKRL FMSRTNRPPL SLSRMIRKMK LPGREGKTAV VVGTITDDV RVQEVPKLKV CALRVSSRAR SRILKAGGKI LTFDQLALDS PKGCGTVLLS GPRKGREVYR HFGKAPGTPH S HTKPYVRS KGRKFERARG RRASRGYKN

+
分子 #17: eL19

分子名称: eL19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.613033 KDa
配列文字列:
SMLRLQKRLA SSVLRCGKKK VWLDPNETNE IANANSRQQI RKLIKDGLII RKPVTVHSRA RCRKNTLARR KGRHMGIGKR KGTANARMP EKVTWMRRMR ILRRLLRRYR ESKKIDRHMY HSLYLKVKGN VFKNKRILME HIHKLKADKA RKKLLADQAE A RRSKTKEA RKRREERLQA KK

+
分子 #18: eL20

分子名称: eL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 20.696363 KDa
配列文字列:
KASGTLREYK VVGRCLPTPK CRTPPLYRMR IFAPNHVVAK SRFWYFVSQL KKMKKSSGEI VYCGQVFEKS PLRVKNFGIW LRYDSRSGT HNMYREYRDL TTAGAVTQCY RDMGARHRAR AHSIQIMKVE EIAASKCRRP AVKQFHDSKI KFPLPHRVLR R QHKPRFTT KRPNTFF

+
分子 #19: eL21

分子名称: eL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 18.478791 KDa
配列文字列:
TNTKGKRRGT RYMFSRPFRK HGVVPLATYM RIYKKGDIVD IKGMGTVQKG MPHKCYHGKT GRVYNVTQHA VGIVVNKQVK GKILAKRIN VRIEHIKHSK SRDSFLKRVK ENDQKKKEAK EKGTWVQLKR QPAPPREAHF VRTNGKEPEL LEPIPYEFMA

+
分子 #20: Ribosomal protein L22

分子名称: Ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.481249 KDa
配列文字列:
QVLKFTLDCT HPVEDGIMDA ANFEQFLQER IKVNGKAGNL GGGVVTIERS KSKITVTSEV PFSKRYLKYL TKKYLKKNNL RDWLRVVAN SKESYELRYF

+
分子 #21: uL14

分子名称: uL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.972425 KDa
配列文字列:
SGAKFRISLG LPVGAVINCA DNTGAKNLYI ISVKGIKGRL NRLPAAGVGD MVMATVKKGK PELRKKVHPA VVIRQRKSYR RKDGVFLYF EDNAGVIVNN KGEMKGSAIT GPVAKECADL WPRIASNAGS IA

+
分子 #22: Ribosomal protein L24

分子名称: Ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 7.512774 KDa
配列文字列:
MKVELCSFSG YKIYPGHGRR YARTDGKVFQ FLNAKCESAF LSKRNPRQIN WTVLYRRKHK KGQ

+
分子 #23: uL23

分子名称: uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.85636 KDa
配列文字列:
KKIRTSPTFR RPKTLRLRRQ PKYPRKSAPR RNKLDHYAII KFPLTTESAM KKIEDNNTLV FIVDVKANKH QIKQAVKKLY DIDVAKVNT LIRPDGEKKA YVRLAPDYDA LDVANKIGII

+
分子 #24: Ribosomal protein L26

分子名称: Ribosomal protein L26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.891787 KDa
配列文字列:
MKFNPFVTSD RSKNRKRHFN APSHIRRKIM SSPLSKELRQ KYNVRSMPIR KDDEVQVVRG HYKGQQIGKV VQVYRKKYVI YIERVQREK ANGTTVHVGI HPSKVVITRL KLDKDRKKIL ERKAKSRQVG KEKGK

+
分子 #25: 60S ribosomal protein L27

分子名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.704635 KDa
配列文字列:
GKFMKPGKVV LVLAGRYSGR KAVIVKNIDD GTSDRPYSHA LVAGIDRYPR KVTAAMGKKK IAKRSKIKSF VKVYNYNHLM PTRYSVDIP LDKTVVNKDV FRDPALKRKA RREAKVKFEE RYKTGKNKWF FQKLRF

+
分子 #26: uL15

分子名称: uL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.489363 KDa
配列文字列:
PSRLRKTRKL RGHVSHGHGR IGKHRKHPGG RGNAGGMHHH RINFDKYHPG YFGKVGMRHY HLKRNQSFCP TVNLDKLWTL VSEQTRVNA AKNKTGAAPI IDVVRSGYYK VLGKGKLPKQ PVIVKAKFFS RRAEEKIKGV GGACVLVA

+
分子 #27: 60S ribosomal protein L29

分子名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 8.706283 KDa
配列文字列:
AKSKNHTTHN QSRKWHRNGI KKPRSQRYES LKGVDPKFLR NMRFAKKHNK KGLKKMQANN AKAMAARAEA IKALV

+
分子 #28: eL30

分子名称: eL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.496355 KDa
配列文字列:
SINSRLQLVM KSGKYVLGYK QTLKMIRQGK AKLVILANNC PALRKSEIEY YAMLAKTGVH HYSGNNIELG TACGKYYRVC TLAIIDPGD SDIIR

+
分子 #29: eL31

分子名称: eL31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.635694 KDa
配列文字列:
NEVVTREYTI NIHKRIHGVG FKKRAPRALK EIRKFAMKEM GTPDVRIDTR LNKAVWAKGI RNVPYRIRVR LSRKRNEDED SPNKLYTLV TYVPVTTFKN LQTVNVDE

+
分子 #30: eL32

分子名称: eL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.022021 KDa
配列文字列:
AALRPLVKPK IVKKRTKKFI RHQSDRYVKI KRNWRKPRGI DNRVRRRFKG QILMPNIGYG SNKKTKHMLP SGFRKFLVHN VKELEVLLM CNKSYCAEIA HNVSSKNRKA IVERAAQLAI RVTNPNARL

+
分子 #31: eL33

分子名称: eL33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.449612 KDa
配列文字列:
SGRLWCKAIF AGYKRGLRNQ REHTALLKIE GVYARDETEF YLGKRCAYVY KAKNNTVTPG GKPNKTRVIW GKVTRAHGNS GMVRAKFRS NLPAKAIGHR IRVMLYPSRI

+
分子 #32: eL34

分子名称: eL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.994621 KDa
配列文字列:
VQRLTYRRRL SYNTASNKTR LSRTPGNRIV YLYTKKVGKA PKSACGVCPG RLRGVRAVRP KVLMRLSKTK KHVSRAYGGS MCAKCVRDR IKRAFLIEEQ KIVVKVLKAQ AQSQK

+
分子 #33: uL29

分子名称: uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.435403 KDa
配列文字列:
AKIKARDLRG KKKEELLKQL DDLKVELSQL RVAKVTGGAA SKLSKIRVVR KSIARVLTVI NQTQKENLRK FYKGKKYKPL DLRPKKTRA MRRRLNKHEE SLKTKKQQRK ERLYPLRKYA VKA

+
分子 #34: 60S ribosomal protein L36

分子名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.888371 KDa
配列文字列:
ALRYPMAVGL NKGHKVTKNV SKPRHSRRRG RLTKHTKFVR DMIREVCGFA PYERRAMELL KVSKDKRALK FIKKRVGTHI RAKRKREEL SSVLAAMRKA AAK

+
分子 #35: Ribosomal protein L37

分子名称: Ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.090891 KDa
配列文字列:
TKGTSSFGKR RNKTHTLCRR CGSKAYHLQK STCGKCGYPA KRKRKYNWSA KAKRRNTTGT GRMRHLKIVY RRFRHGFREG TTPKPK

+
分子 #36: eL38

分子名称: eL38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 8.107752 KDa
配列文字列:
PRKIEEIKDF LLTARRKDAK SVKIKKNKDN VKFKVRCSRY LYTLVITDKE KAEKLKQSLP PGLAVKELK

+
分子 #37: eL39

分子名称: eL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.295562 KDa
配列文字列:
SSHKTFRIKR FLAKKQKQNR PIPQWIRMKT GNKIRYNSKR RHWRRTKLGL

+
分子 #38: eL40

分子名称: eL40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.199574 KDa
配列文字列:
IIEPSLRQLA QKYNCDKMIC RKCYARLHPR AVNCRKKKCG HTNNLRPKKK VK

+
分子 #39: 60s ribosomal protein l41

分子名称: 60s ribosomal protein l41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 3.213075 KDa
配列文字列:
RAKWRKKRMR RLKRKRRKMR QRS

+
分子 #40: eL42

分子名称: eL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.198603 KDa
配列文字列:
VNVPKTRRTF CKKCGKHQPH KVTQYKKGKD SLYAQGKRRY DRKQSGYGGQ TKPIFRKKAK TTKKIVLRLE CVEPNCRSKR MLAIKRCKH FELGGDKKRK GQVIQ

+
分子 #41: Ribosomal protein L37a

分子名称: Ribosomal protein L37a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.168153 KDa
配列文字列:
AKRTKKVGIV GKYGTRYGAS LRKMVKKIEI SQHAKYTCSF CGKTKMKRRA VGIWHCGSCM KTVAGGAWTY NTTSAVTVKS AIRRLKELK DQ

+
分子 #42: eL28

分子名称: eL28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.652419 KDa
配列文字列:
SAHLQWMVVR NCSSFLIKRN KQTYSTEPNN LKARNSFRYN GLIHRKTVGV EPAADGKGVV VVMKRRSGQR KPATSYVRTT INKNARATL SSIRHMIRKN KYHPDLRMAA IRRASAILRS QKPVMVKRKR TRPTKSS

+
分子 #43: 60S acidic ribosomal protein P0

分子名称: 60S acidic ribosomal protein P0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.747293 KDa
配列文字列: DRATWKSNYF LKIIQLLDDY PKCFIVGADN VGSKQMQQIR MSLRGKAVVL MGKNTMMRKA IRGHLENNPA LEKLLPHIRG NVGFVFTKE DLTEIRDMLL ANKVPAAARA GAIAPCEVTV PAQNTGLGPE KTSFFQALGI TTKISRGTIE ILSDVQLIKT G DKVGASEA ...文字列:
DRATWKSNYF LKIIQLLDDY PKCFIVGADN VGSKQMQQIR MSLRGKAVVL MGKNTMMRKA IRGHLENNPA LEKLLPHIRG NVGFVFTKE DLTEIRDMLL ANKVPAAARA GAIAPCEVTV PAQNTGLGPE KTSFFQALGI TTKISRGTIE ILSDVQLIKT G DKVGASEA TLLNMLNISP FSFGLIIQQV FDNGSIYNPE

+
分子 #44: Ribosomal protein L12

分子名称: Ribosomal protein L12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.689461 KDa
配列文字列:
MPPKFDPNEI KVVYLRCTGG EVGATSALAP KIGPLGLSPK KVGDDIAKAT GDWKGLRITV KLTIQNRQAQ IEVVPSASAL IIKALKEPP RDRKKQKNIK HSGNITFDEI VNIARQMRHR SLARELSGTI KEILGTAQSV GCNVDGRHPH DIIDDINSGA V ECP

+
分子 #48: Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1

分子名称: Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 47.239699 KDa
配列文字列: FLEVIKPFCV ILPEIQKPER KIQFKEKVLW TAITLFIFLV CCQIPLFGIM SSDSADPFYW MRVILASNRG TLMELGISPI VTSGLIMQL LAGAKIIEVG DTPKDRALFN GAQKLFGMII TIGQSIVYVM SGICLLITIQ LFVAGLIVLL LDELLQKGYG L GSGISLFI ...文字列:
FLEVIKPFCV ILPEIQKPER KIQFKEKVLW TAITLFIFLV CCQIPLFGIM SSDSADPFYW MRVILASNRG TLMELGISPI VTSGLIMQL LAGAKIIEVG DTPKDRALFN GAQKLFGMII TIGQSIVYVM SGICLLITIQ LFVAGLIVLL LDELLQKGYG L GSGISLFI ATNICETIVW KAFSPTTVNT GRGMEFEGAI IALFHLLATR TDKVRALREA FYRQNLPNLM NLIATIFVFA VV IYFQGFR VDLPIKSARY RGQYNTYPIK LFYTSNIPII LQSALVSNLY VISQMLSARF PVGGLCHYLS PPESFGSVLE DPV HAVVYI VFMLGSCAFF SKTWIEVSGS SAKDVAKQLK EQQMVMRGHR ETSMVHELNR YIPTAAAFGG LCIGALSVLA DFLG AIGSG TGILLAVTII YQYFEIFVKE Q

+
分子 #49: Protein transport protein Sec61 subunit gamma

分子名称: Protein transport protein Sec61 subunit gamma / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 7.019456 KDa
配列文字列:
FVEPSRQFVK DSIRLVKRCT KPDRKEFQKI AMATAIGFAI MGFIGFFVKL IHIPINNIIV GG

+
分子 #50: Protein transport protein Sec61 subunit beta

分子名称: Protein transport protein Sec61 subunit beta / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 3.265008 KDa
配列文字列:
VGPVPVLVMS LLFIASVFML HIWGKYTRS

+
分子 #51: Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase su...

分子名称: Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1,RPN1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 17.64257 KDa
配列文字列: EPLLVVAAFY ILFFTVIIYV RLDFSITKDP AAEARMKVAC ITEQVLTLVN KRIGLYRHFD ETINRYKQSR DVSTLNSGKK SLETEHKAL TSEIASLQSR LKTEGSDLCD KVSEMQKLDA QVKELVLKSA VEAERLV(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
EPLLVVAAFY ILFFTVIIYV RLDFSITKDP AAEARMKVAC ITEQVLTLVN KRIGLYRHFD ETINRYKQSR DVSTLNSGKK SLETEHKAL TSEIASLQSR LKTEGSDLCD KVSEMQKLDA QVKELVLKSA VEAERLV(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #52: TMEM258

分子名称: TMEM258 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 5.124308 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #53: Oligosaccharyltransferase complex subunit OSTC

分子名称: Oligosaccharyltransferase complex subunit OSTC / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 13.375942 KDa
配列文字列:
AMTVYALVVV SYFLITGGII YDVIVEPPSV GSMTDEHGHQ RPVAFLAYRV NGQYIMEGLA SSFLFTMGGL GFIILDRSNA PNIPKLNRF LLLFIGFVCV LLSFFMARVF MRMKLPGYLM G

+
分子 #54: OST4

分子名称: OST4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 3.809582 KDa
配列文字列:
MITDVQLAIF ANMLGVSLFL LVVLYHYVAV NNPK

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分子 #55: Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase su...

分子名称: Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A
タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 79.64225 KDa
配列文字列: MTKLGFLRLS YEKQDTLLKL LILSMAAVLS FSTRLFAVLR FESVIHEFDP YFNYRTTRFL AEEGFYKFHN WFDDRAWYPL GRIIGGTLY PGLMITSAAI YHVLHFFHIT IDIRNVCVFL APLFSSFTTI VTYHLTKELK DAGAGLLAAA MIAVVPGYIS R SVAGSYDN ...文字列:
MTKLGFLRLS YEKQDTLLKL LILSMAAVLS FSTRLFAVLR FESVIHEFDP YFNYRTTRFL AEEGFYKFHN WFDDRAWYPL GRIIGGTLY PGLMITSAAI YHVLHFFHIT IDIRNVCVFL APLFSSFTTI VTYHLTKELK DAGAGLLAAA MIAVVPGYIS R SVAGSYDN EGIAIFCMLL TYYMWIKAVK TGSIYWAAKC ALAYFYMVSS WGGYVFLINL IPLHVLVLML TGRFSHRIYV AY CTVYCLG TILSMQISFV GFQPVLSSEH MAAFGVFGLC QIHAFVDYLR SKLNPQQFEV LFRSVISLVG FVLLTVGALL MLT GKISPW TGRFYSLLDP SYAKNNIPII ASVSEHQPTT WSSYYFDLQL LVFMFPVGLY YCFSNLSDAR IFIIMYGVTS MYFS AVMVR LMLVLAPVMC ILSGIGVSQV LSTYMKNLDI SRPDKKSKKQ QDSTYPIKNE VASGMILVMA FFLITYTFHS TWVTS EAYS SPSIVLSARG GDGSRIIFDD FREAYYWLRH NTPEDAKVMS WWDYGYQITA MANRTILVDN NTWNNTHISR VGQAMA STE EKAYEIMREL DVSYVLVIFG GLTGYSSDDI NKFLWMVRIG GSTDTGKHIK EHDYYTPTGE FRVDREGSPV LLNCLMY KM CYYRFGQVYT EAKRPPGFDR VRNAEIGNKD FELDVLEEAY TTEHWLVRIY KVKD

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分子 #56: DAD1

分子名称: DAD1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 8.273189 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
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分子 #57: OST48

分子名称: OST48 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 2.145636 KDa
配列文字列:
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分子 #58: RPN2

分子名称: RPN2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Dog (イヌ)
分子量理論値: 6.826406 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
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分子 #45: 28S rRNA

分子名称: 28S rRNA / タイプ: rna / ID: 45 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 1.1865795 MDa
配列文字列: CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAG AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGACA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ...文字列:
CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAG AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGACA UGUGGCGUAC G GAAGACCC GCUCCCCGGC GCCGCUCGUG GGGGGCCCAA GUCCUUCUGA UCGAGGCCCA GCCCGUGGAC GGUGUGAGGC CG GUAGCGG CCCCCGGCGC GCCGGGCCCG GGUCUUCCCG GAGUCGGGUU GCUUGGGAAU GCAGCCCAAA GCGGGUGGUA AAC UCCAUC UAAGGCUAAA UACCGGCACG AGACCGAUAG UCAACAAGUA CCGUAAGGGA AAGUUGAAAA GAACUUUGAA GAGA GAGUU CAAGAGGGCG UGAAACCGUU AAGAGGUAAA CGGGUGGGGU CCGCGCAGUC CGCCCGGAGG AUUCAACCCG GCGGC GGGU CCGGCCGUGU CGGCGGCCCG GCGGAUCUUU CCCGCGCGGG GGACCGUCCC CCGACCGGCG ACCGGCCGCC GCCGGG CGC AUUUCCACCG CGGCGGUGCG CCGCGACCGG CUCCGGGACG GCUGGGAAGG CCCGGCGGGG AAGGUGGCUC GGCCGAG UG UUACAGCCCC CCCGGCAGCA GCACUCGCCG AAUCCCGGGG CCGAGGGAGC GAGACCCGUC GCCGCGCUCU CCCCCCUC C CGGCGCCGCC GGGGGGGGCC GGGCCACCCC UCCCACGGCG CGACCGCUCG GGGCGGACUG UCCCCAGUGC GCCCCGGGC GGGUCGCGCC GUCGGGCCCG GGGGAGGGGC CACGCGCGCG UCCCCCGAAG AGGGGGACGG CGGAGCGAGC GCACGGGGUC GGCGGCGAC GUCGGCUACC CACCCGACCC GUCUUGAAAC ACGGACCAAG GAGUCUAACA CGUGCGCGAG UCGGGGGCUC G CACGAAAG CCGCCGUGGC GCAAUGAAGG UGAAGGCCGG CGCGCUCGCC GGCCGAGGUG GGAUCCCGAG GCCUCUCCAG UC CGCCGAG GGCGCACCAC CGGCCCGUCU CGCCCGCCGC GCCGGGGAGG UGGAGCACGA GCGCACGUGU UAGGACCCGA AAG AUGGUG AACUAUGCCU GGGCAGGGCG AAGCCAGAGG AAACUCUGGU GGAGGUCCGU AGCGGUCCUG ACGUGCAAAU CGGU CGUCC GACCUGGGUA UAGGGGCGAA AGACUAAUCG AACCAUCUAG UAGCUGGUUC CCUCCGAAGU UUCCCUCAGG AUAGC UGGC GCUCUCGCAC ACGCAGUUUU AUCCGGUAAA GCGAAUGAUU AGAGGUCUUG GGGCCGAAAC GAUCUCAACC UAUUCU CAA ACUUUAAAUG GGUAAGAAGC CCGGCUCGCU GGCGUGAGCC GGGCGUGGAA UGGAGUGCCU AGUGGGCCAC UUUUGGU AA GCAGAACUGG CGCUGCGGGA UGAACCGAAC GCCGGGUUAA GGCGCCCGAU GCCGACGCUC AUCAGACCCC AGAAAAGG U GUUGGUUGAU AUAGACAGCA GGACGGUGGC CAUGGAAGUC GGAAUCCGCU AAGGAGUGUG UAACAACUCA CCUGCCGAA UCAACUAGCC CUGAAAAUGG AUGGCGCUGG AGCGUCGGGC CCAUACCCGG CCGUCGCCGG CAGUCGAGAG UGGACGGGAG CGGCGGGGG CGGCGCGCGC GCGCGCCCGC CCCCGGAGCC CCGCGGACGC UACGCCGCGA CGAGUAGGAG GGCCGCUGCG G UGAGCCUU GAAGCCUAGG GCGCGGGCCC GGGUGGAGCC GCCGCAGGUG CAGAUCUUGG UGGUAGUAGC AAAUAUUCAA AC GAGAACU UUGAAGGCCG AAGUGGAGAA GGGUUCCAUG UGAACAGCAG UUGAACAUGG GUCAGUCGGU CCUGAGAGAU GGG CGAGCG CCGUUCCGAA GGGACGGGCG AUGGCCUCCG UUGCCCUCGG CCGAUCGAAA GGGAGUCGGG UUCAGAUCCC CGAA UCCGG AGUGGCGGAG AUGGGCGCCG CGAGGCGUCC AGUGCGGUAA CGCGACCGAU CCCGGAGAAG CCGGCGGGAG CCCCG GGGA GAGUUCUCUU UUCUUUGUGA AGGGCAGGGC GCCCUGGAAU GGGUUCGCCC CGAGAGAGGG GCCCGUGCCU UGGAAA GCG UCGCGGUUCC GGCGGCGUCC GGUGAGCUCU CGCUGGCCCU UGAAAAUCCG GGGGAGAGGG UGUAAAUCUC GCGCCGG GC CGUACCCAUA UCCGCAGCAG GUCUCCAAGG UGAACAGCCU CUGGCAUGUU GGAACAAUGU AGGUAAGGGA AGUCGGCA A GCCGGAUCCG UAACUUCGGG AUAAGGAUUG GCUCUAAGGG CUGGGUCGGU CGUCGGCCGG CGCCUAGCAG CCGACUUAG AACUGGUGCG GACCAGGGGA AUCCGACUGU UUAAUUAAAA CAAAGCAUCG CGAAGGCCCG CGGCGGGUGU UGACGCGAUG UGAUUUCUG CCCAGUGCUC UGAAUGUCAA AGUGAAGAAA UUCAAUGAAG CGCGGGUAAA CGGCGGGAGU AACUAUGACU C UCUUAAGG UAGCCAAAUG CCUCGUCAUC UAAUUAGUGA CGCGCAUGAA UGGAUGAACG AGAUUCCCAC UGUCCCUACC UA CUAUCCA GCGAAACCAC AGCCAAGGGA ACGGGCUUGG CGGAAUCAGC GGGGAAAGAA GACCCUGUUG AGCUUGACUC UAG UCUGGC ACGGUGAAGA GACAUGUUUU UUCACUGACC CGGUGAGGCG GGGGGGCGAG CCCCGAGGGG CUCUCGCUUC UGGC GCCAA GCGCCCGGCC GCGCGCCGGC CGGGCGCGAC CCGCUCCGGG GACAGUGCCA GGUGGGGAGU UUGACUGGGG CGGUA CACC UGUCAAACGG UAACGCAGGU GUCCUAAGGC GAGCUCAGGG AGGACAGAAA CCUCCCGUGG AGCAGAAGGG CAAAAG CUC GCUUGAUCUU GAUUUUCAGU ACGAAUACAG ACCGUGAAAG CGGGGCCUCA CGAUCCUUCU GACCUUUUGG GUUUUAA GC AGGAGGUGUC AGAAAAGUUA CCACAGGGAU AACUGGCUUG UGGCGGCCAA GCGUUCAUAG CGACGUCGCU UUUUGAUC C UUCGAUGUCG GCUCUUCCUA UCAUUGUGAA GCAGAAUUCA CCAAGCGUUG GAUUGUUCAC CCACUAAUAG GGAACGUGA GCUGGGUUUA GACCGUCGUG AGACAGGUUA GUUUUACCCU ACUGAUGAUG UGUUGUUGCC AUGGUAAUCC UGCUCAGUAC GAGAGGAAC CGCAGGUUCA GACAUUUGGU GUAUGUGCUU GGCUGAGGAG CCAAUGGGGC GAAGCUACCA UCUGUGGGAU U AUGACUGA ACGCCUCUAA GUCAGAAUCC CGCCCAGGCG GAACGAUACG GCAGCGCCGC GGAGCCUCGG UUGGCCUCGG AU AGCCGGU CCCCCGCGGG GUCCGGUGCG GAGUGCCCUU CGUCCUGGGA AACGGGGCGC GGCCGGAGAG GCGGCCGCCC CCU CGCCCG UCACGCACGC CGUUCGUGGG GAACCUGGCG CUAAACCAUU CGUAGACGAC CUGCUUCUGG GUCGGGGUUU CGUA CGUAG CAGAGCAGCU CCCUCGCUGC GAUCUAUUGA AAGUCAGCCC UCGACACAAG GGUUUGU

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分子 #46: 5S ribosomal RNA

分子名称: 5S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 46 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 38.691914 KDa
配列文字列:
GUCUACGGCC AUACCACCCU GAACGCGCCC GAUCUCGUCU GAUCUCGGAA GCUAAGCAGG GUCGGGCCUG GUUAGUACUU GGAUGGGAG ACCGCCUGGG AAUACCGGGU GCUGUAGGCU U

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分子 #47: 5.8S ribosomal RNA

分子名称: 5.8S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 47 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 50.143648 KDa
配列文字列:
CGACUCUUAG CGGUGGAUCA CUCGGCUCGU GCGUCGAUGA AGAACGCAGC UAGCUGCGAG AAUUAAUGUG AAUUGCAGGA CACAUUGAU CAUCGACACU UCGAACGCAC UUGCGGCCCC GGGUUCCUCC CGGGGCUACG CCUGUCUGAG CGUCGCU

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分子 #60: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 159 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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分子 #61: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 5 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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分子 #62: [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,...

分子名称: [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid
タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 1 / 式: 9UB
分子量理論値: 651.663 Da
Chemical component information

ChemComp-9UB:
[(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.4
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k)
平均電子線量: 28.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期 角度割当タイプ: OTHER / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.1)
最終 角度割当タイプ: OTHER / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.1)
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 90895

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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