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- EMDB-4242: Human cap-dependent 48S pre-initiation complex -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4242
タイトルHuman cap-dependent 48S pre-initiation complex
マップデータhuman 48S pre-initiation complex, reconstituted in the presence of capped mRNA, eIF4B and eIF4F, displaying eIF2 ternary complex, eIF3 and eIF4B
試料
  • 複合体: human cap-dependent 48S translation pre-initiation complex
    • 複合体: human cap-dependent 48S translation pre-initiation complex
      • タンパク質・ペプチド: x 46種
      • RNA: x 2種
    • 複合体: mRNA伝令RNA
      • RNA: x 1種
    • 複合体: Eukaryotic translation initiation factor 4B
      • タンパク質・ペプチド: x 1種
  • リガンド: x 1種
機能・相同性
機能・相同性情報


positive regulation of mRNA binding / viral translational termination-reinitiation / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3e / methionyl-initiator methionine tRNA binding / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m / Response of EIF2AK1 (HRI) to heme deficiency / Activation of the mRNA upon binding of the cap-binding complex and eIFs, and subsequent binding to 43S / Recycling of eIF2:GDP / eukaryotic translation initiation factor 2 complex / PERK regulates gene expression ...positive regulation of mRNA binding / viral translational termination-reinitiation / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3e / methionyl-initiator methionine tRNA binding / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m / Response of EIF2AK1 (HRI) to heme deficiency / Activation of the mRNA upon binding of the cap-binding complex and eIFs, and subsequent binding to 43S / Recycling of eIF2:GDP / eukaryotic translation initiation factor 2 complex / PERK regulates gene expression / eukaryotic translation initiation factor 3 complex / eukaryotic translation initiation factor 4F complex / Z-decay: degradation of maternal mRNAs by zygotically expressed factors / eukaryotic 43S preinitiation complex / protein-synthesizing GTPase / cytoplasmic translational initiation / translation factor activity, RNA binding / formation of translation preinitiation complex / formation of cytoplasmic translation initiation complex / Deadenylation of mRNA / positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis / negative regulation of endoplasmic reticulum unfolded protein response / oxidized pyrimidine DNA binding / response to TNF agonist / positive regulation of base-excision repair / protein tyrosine kinase inhibitor activity / eukaryotic 48S preinitiation complex / positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage / positive regulation of gastrulation / IRE1-RACK1-PP2A complex / positive regulation of endodeoxyribonuclease activity / positive regulation of Golgi to plasma membrane protein transport / TNFR1-mediated ceramide production / M-decay: degradation of maternal mRNAs by maternally stored factors / laminin receptor activity / negative regulation of DNA repair / negative regulation of RNA splicing / negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to hydrogen peroxide / oxidized purine DNA binding / supercoiled DNA binding / neural crest cell differentiation / NF-kappaB complex / ubiquitin-like protein conjugating enzyme binding / regulation of establishment of cell polarity / negative regulation of phagocytosis / regulation of translational initiation / Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex / rRNA modification in the nucleus and cytosol / erythrocyte homeostasis / cytoplasmic side of rough endoplasmic reticulum membrane / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / 顔料 / protein kinase A binding / Ribosomal scanning and start codon recognition / negative regulation of ubiquitin protein ligase activity / ion channel inhibitor activity / Translation initiation complex formation / positive regulation of mitochondrial depolarization / negative regulation of Wnt signaling pathway / positive regulation of T cell receptor signaling pathway / positive regulation of activated T cell proliferation / regulation of cell division / ヒドロキシル化 / iron-sulfur cluster binding / BH3 domain binding / mTORC1-mediated signalling / SARS-CoV-1 modulates host translation machinery / Peptide chain elongation / positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator / Selenocysteine synthesis / cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process / positive regulation of signal transduction by p53 class mediator / Formation of a pool of free 40S subunits / ubiquitin ligase inhibitor activity / positive regulation of cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity / Eukaryotic Translation Termination / phagocytic cup / Response of EIF2AK4 (GCN2) to amino acid deficiency / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / Viral mRNA Translation / Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) / GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit / MTOR / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol / regulation of translational fidelity / spindle assembly / negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / ribosomal small subunit export from nucleus / Nuclear events stimulated by ALK signaling in cancer / laminin binding / Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) / translation regulator activity / Amplification of signal from unattached kinetochores via a MAD2 inhibitory signal / positive regulation of cell cycle / negative regulation of smoothened signaling pathway / signaling adaptor activity / stress granule assembly / negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation / positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway
類似検索 - 分子機能
Eukaryotic translation initiation factor 4B / Translation initiation factor 3 complex subunit L / RNA polymerase I-associated factor PAF67 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M / eIF3 subunit M, C-terminal helix domain / eIF3 subunit M, C-terminal helix / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, C-terminal / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, N-terminal / eIF3 subunit 6 N terminal domain ...Eukaryotic translation initiation factor 4B / Translation initiation factor 3 complex subunit L / RNA polymerase I-associated factor PAF67 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M / eIF3 subunit M, C-terminal helix domain / eIF3 subunit M, C-terminal helix / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, C-terminal / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, N-terminal / eIF3 subunit 6 N terminal domain / eIF3 subunit 6 N terminal domain / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K / Translation initiation factor 3, subunit 12, N-terminal, eukaryotic / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M eIF3m/COP9 signalosome complex subunit 7 COPS7 / Initiation factor eIF2 gamma, domain 2 / Initiation factor eIF2 gamma, GTP-binding domain / Initiation factor eIF2 gamma, C-terminal / Initiation factor eIF2 gamma, C terminal / 40S ribosomal protein SA / 40S ribosomal protein SA, C-terminal domain / CSN8/PSMD8/EIF3K / CSN8/PSMD8/EIF3K family / 40S ribosomal protein SA C-terminus / motif in proteasome subunits, Int-6, Nip-1 and TRIP-15 / PCI domain / Proteasome component (PCI) domain / PCI domain profile. / Ubiquitin-like protein FUBI / Translation elongation factor EF1A/initiation factor IF2gamma, C-terminal / Ribosomal protein S2, eukaryotic / : / Ribosomal protein S8e subdomain, eukaryotes / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S12e / Ribosomal protein S8e, conserved site / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / 40S ribosomal protein S4 C-terminus / Ribosomal protein S4e, N-terminal / Ribosomal protein S23, eukaryotic/archaeal / 40S Ribosomal protein S10 / S27a-like superfamily / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S8e / Ribosomal protein S4, KOW domain / Ribosomal protein S4e / Ribosomal protein S4e, central region / Ribosomal protein S4e, central domain superfamily / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / RS4NT (NUC023) domain / : / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S30 / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal family S4e / Ribosomal protein S7e signature. / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal protein S27e signature. / Ribosomal protein S4e signature. / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein S8e signature. / Ribosomal protein S17e / Ribosomal protein S17e-like superfamily / Ribosomal S17 / Ribosomal protein S6, eukaryotic / 40S ribosomal protein S1/3, eukaryotes / Ribosomal S24e conserved site / Ribosomal protein S24e signature. / 40S ribosomal protein S11, N-terminal / Ribosomal_S17 N-terminal / Ribosomal protein S7e / Ribosomal protein S7e / Translation elongation factor EFTu-like, domain 2 / Ribosomal protein S27, zinc-binding domain superfamily / Ribosomal protein S24e / Ribosomal protein S24e / Ribosomal protein S6/S6e/A/B/2, conserved site / Ribosomal protein S6e signature. / Ribosomal protein S27 / Ribosomal protein S27 / Ribosomal protein S17, archaeal/eukaryotic / Ribosomal protein S3Ae / Ribosomal protein S28e conserved site / Ribosomal S3Ae family / Ribosomal protein S28e signature. / Ribosomal S3Ae family / Ribosomal protein S28e / Ribosomal protein S28e
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein eS17 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Eukaryotic translation initiation factor 4B / Small ribosomal subunit protein eS12 / Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 / Small ribosomal subunit protein eS27 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein eS10 ...Small ribosomal subunit protein eS17 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Eukaryotic translation initiation factor 4B / Small ribosomal subunit protein eS12 / Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 / Small ribosomal subunit protein eS27 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein eS10 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein eS1 / Small ribosomal subunit protein eS7 / Small ribosomal subunit protein eS8 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Small ribosomal subunit protein eS4, X isoform / Small ribosomal subunit protein eS6 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Small ribosomal subunit protein eS24 / Small ribosomal subunit protein eS25 / Small ribosomal subunit protein eS28 / Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト) / Human (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 6.3 Å
データ登録者Schaffitzel C
引用ジャーナル: Nucleic Acids Res / 年: 2018
タイトル: Structure of a human cap-dependent 48S translation pre-initiation complex.
著者: Boris Eliseev / Lahari Yeramala / Alexander Leitner / Manikandan Karuppasamy / Etienne Raimondeau / Karine Huard / Elena Alkalaeva / Ruedi Aebersold / Christiane Schaffitzel /
要旨: Eukaryotic translation initiation is tightly regulated, requiring a set of conserved initiation factors (eIFs). Translation of a capped mRNA depends on the trimeric eIF4F complex and eIF4B to load ...Eukaryotic translation initiation is tightly regulated, requiring a set of conserved initiation factors (eIFs). Translation of a capped mRNA depends on the trimeric eIF4F complex and eIF4B to load the mRNA onto the 43S pre-initiation complex comprising 40S and initiation factors 1, 1A, 2, 3 and 5 as well as initiator-tRNA. Binding of the mRNA is followed by mRNA scanning in the 48S pre-initiation complex, until a start codon is recognised. Here, we use a reconstituted system to prepare human 48S complexes assembled on capped mRNA in the presence of eIF4B and eIF4F. The highly purified h-48S complexes are used for cross-linking/mass spectrometry, revealing the protein interaction network in this complex. We report the electron cryo-microscopy structure of the h-48S complex at 6.3 Å resolution. While the majority of eIF4B and eIF4F appear to be flexible with respect to the ribosome, additional density is detected at the entrance of the 40S mRNA channel which we attribute to the RNA-recognition motif of eIF4B. The eight core subunits of eIF3 are bound at the 40S solvent-exposed side, as well as the subunits eIF3d, eIF3b and eIF3i. elF2 and initiator-tRNA bound to the start codon are present at the 40S intersubunit side. This cryo-EM structure represents a molecular snap-shot revealing the h-48S complex following start codon recognition.
履歴
登録2017年12月31日-
ヘッダ(付随情報) 公開2018年3月14日-
マップ公開2018年3月14日-
更新2018年10月3日-
現状2018年10月3日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
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  • 原子モデル: PDB-6fec
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4242.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4242.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 34.3 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈human 48S pre-initiation complex, reconstituted in the presence of capped mRNA, eIF4B and eIF4F, displaying eIF2 ternary complex, eIF3 and eIF4B
ボクセルのサイズX=Y=Z: 2.5 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.05 / ムービー #1: 0.08
最小 - 最大-0.32222414 - 0.5438056
平均 (標準偏差)-0.000108246015 (±0.027071523)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ208208208
Spacing208208208
セルA=B=C: 520.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z2.52.52.5
M x/y/z208208208
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z520.000520.000520.000
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS208208208
D min/max/mean-0.3220.544-0.000

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : human cap-dependent 48S translation pre-initiation complex

全体名称: human cap-dependent 48S translation pre-initiation complex
要素
  • 複合体: human cap-dependent 48S translation pre-initiation complex
    • 複合体: human cap-dependent 48S translation pre-initiation complex
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit AEIF3
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit CEIF3
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit EEIF3
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit FEIF3
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit HEIF3
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit KEIF3
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit LEIF3
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit MEIF3
      • タンパク質・ペプチド: EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT DEIF3
      • RNA: 18S ribosomal RNA
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S16
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4, X isoformリボソーム
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18
      • RNA: Transfer RNA (75-MER)
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S23
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S19
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S5
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15a
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
      • タンパク質・ペプチド: EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 BETA SUBUNIT (eIF2-Beta)
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein SAリボソームタンパク質SA
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S20
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3a
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S14
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28
      • タンパク質・ペプチド: Receptor of activated protein C kinase 1
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
      • タンパク質・ペプチド: Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S12
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S10
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit BEIF3
    • 複合体: mRNA伝令RNA
      • RNA: Messenger RNA (26-MER)
    • 複合体: Eukaryotic translation initiation factor 4B
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 4B
  • リガンド: water水

+
超分子 #1: human cap-dependent 48S translation pre-initiation complex

超分子名称: human cap-dependent 48S translation pre-initiation complex
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#50
分子量理論値: 2.0 MDa

+
超分子 #2: human cap-dependent 48S translation pre-initiation complex

超分子名称: human cap-dependent 48S translation pre-initiation complex
タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#10, #12-#48, #50
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
超分子 #3: mRNA

超分子名称: mRNA / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #11
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #4: Eukaryotic translation initiation factor 4B

超分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 4B / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #49
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ)

+
分子 #1: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A
タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 164.902656 KDa
配列文字列: MPAYFQRPEN ALKRANEFLE VGKKQPALDV LYDVMKSKKH RTWQKIHEPI MLKYLELCVD LRKSHLAKEG LYQYKNICQQ VNIKSLEDV VRAYLKLAEE KTEAAKEESQ QMVLDIEDLD NIQTPESVLL SAVSGEDTQD RTDRLLLTPW VKFLWESYRQ C LDLLRNNS ...文字列:
MPAYFQRPEN ALKRANEFLE VGKKQPALDV LYDVMKSKKH RTWQKIHEPI MLKYLELCVD LRKSHLAKEG LYQYKNICQQ VNIKSLEDV VRAYLKLAEE KTEAAKEESQ QMVLDIEDLD NIQTPESVLL SAVSGEDTQD RTDRLLLTPW VKFLWESYRQ C LDLLRNNS RVERLYHDIA QQAFKFCLQY TRKAEFRKLC DNLRMHLSQI QRHHNQSTAI NLNNPESQSM HLETRLVQLD SA ISMELWQ EAFKAVEDIH GLFSLSKKPP KPQLMANYYN KVSTVFWKSG NALFHASTLH RLYHLSREMR KNLTQDEMQR MST RVLLAT LSIPITPERT DIARLLDMDG IIVEKQRRLA TLLGLQAPPT RIGLINDMVR FNVLQYVVPE VKDLYNWLEV EFNP LKLCE RVTKVLNWVR EQPEKEPELQ QYVPQLQSNT ILRLLQQVAQ IYQSIEFSRL TSLVPFVDAF QLERAIVDAA RHCDL QVRI DHTSRTLSFG SDLNYATRED APIGPHLQSM PSEQIRNQLT AMSSVLAKAL EVIKPAHILQ EKEEQHQLAV TAYLKN SRK EHQRILARRQ TIEERKERLE SLNIQREKEE LEQREAELQK VRKAEEERLR QEAKEREKER ILQEHEQIKK KTVRERL EQ IKKTELGAKA FKDIDIEDLE ELDPDFIMAK QVEQLEKEKK ELQERLKNQE KKIDYFERAK RLEEIPLIKS AYEEQRIK D MDLWEQQEEE RITTMQLERE KALEHKNRMS RMLEDRDLFV MRLKAARQSV YEEKLKQFEE RLAEERHNRL EERKRQRKE ERRITYYREK EEEEQRRAEE QMLKEREERE RAERAKREEE LREYQERVKK LEEVERKKRQ RELEIEERER RREEERRLGE DPLSRRDSR WGDRDSEGTW RKGPEADSEW RRGPPEKEWR RGEGRDDERS HRRDEERPRR VGDDEDRESS LRPDDDRTLR R GMEDDRGP RRGPDEERFS RRGLEDERPS WRSTDDDRPP RRIGEEDRGS WRHAEDDRPP RRGLDDDRGS WRTADEDRGP RR MMDEDRG PRRGGADDER PSWRSADDDR GPRRGIDDDR GPRRGLDDDR GPWRNADDDR IPRRGADDDR GPWRNMDDDR MSR RADDDR ISRRGEDSRP GPWRPFVKPG GWREKEKARE ESWGPPRESR PPEEREWERE RDRDNPDREE NDKDPERERD RERD GDREE RFRRPRDEGG WRRGPAEEAS SWRDSSRRDD RDRDDRRRER DDRRDLRDRR DLRDDRDRRG PPLRSERDEV SSWRR ADDR KDDRAEERDP PRRVPPPVLS RDRDRDRDRD RDRDRERERE REREGEKEKT SWRAEKDRES LRRTKNETDE DGWTTV RR

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分子 #2: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C
タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 97.923547 KDa
配列文字列: MKIRDVTKCL EEFELLGKAY GKAKSIVDKE GVPRFYIRIL ADLEDYLNEL WEDKEGKKKM NKNNAKALST LRQKIRKYNR DFESHITNY KQNPEQSADE DAEKNEEDSE GSSDEDEDED GVSAAAFLKK KAEAPSGESR KFLKKMEDED EDSEDSEDDE E WDTGSTSS ...文字列:
MKIRDVTKCL EEFELLGKAY GKAKSIVDKE GVPRFYIRIL ADLEDYLNEL WEDKEGKKKM NKNNAKALST LRQKIRKYNR DFESHITNY KQNPEQSADE DAEKNEEDSE GSSDEDEDED GVSAAAFLKK KAEAPSGESR KFLKKMEDED EDSEDSEDDE E WDTGSTSS DSDSEEEEGK QTALASRFLK KAPTTEEDKK AAEKKREDKA KKKHDRKSKR LDEEEEDNEG GEWERVRGGV PL VKEKPKM FAKGTEITHA VVIKKLNEIL QARGKKGTDR AAQIELLQLL VQIASENNLG EGVIVKIKFN IIASLYDYNP NLA TYMKPE MWQKCLDCIN ELMDILFANP NIFVGENILE ESENLQNVDQ PLRVRGCILT LVERMDEEFT KIMQNTDPHS QEYV EHLKD EAQVCAIIER VQRYLEEKGT TEEICRVYLR RILHTYYKFD YKAHQRQLTP PEGSSKSEQD QAENEGEDSA VLMER LCKY IYAKDRTDRI RTCAILCHIY HHYLHSRWYQ ARDLMLMSHL QDNIQHADPP VQILYNRTMV QLGICAFRQG LTKDAH NAL LDIQSSGRAK ELLGQGLLLR SLQERNQEQE KVERRRQVPF HLHINLELLE CVYLVSAMLL EIPYMAAHES DARRRMI SK QFHHQLRVGE RQPLLGPPES MREHVVAASK AMKMGDWKTC HSFIINEKMN GKVWDLFPEA DKVRTMLVRK IQEESLRT Y LFTYSSVYDS ISMETLSDMF ELDLPTVHSI ISKMIINEEL MASLDQPTQT VVMHRTEPTA QQNLALQLAE KLGSLVENN ERVFDHKQGT YGGYFRDQKD GYRKNEGYMR RGGYRQQQSQ TAY

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分子 #3: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 52.281633 KDa
配列文字列: MAEYDLTTRI AHFLDRHLVF PLLEFLSVKE IYNEKELLQG KLDLLSDTNM VDFAMDVYKN LYSDDIPHAL REKRTTVVAQ LKQLQAETE PIVKMFEDPE TTRQMQSTRD GRMLFDYLAD KHGFRQEYLD TLYRYAKFQY ECGNYSGAAE YLYFFRVLVP A TDRNALSS ...文字列:
MAEYDLTTRI AHFLDRHLVF PLLEFLSVKE IYNEKELLQG KLDLLSDTNM VDFAMDVYKN LYSDDIPHAL REKRTTVVAQ LKQLQAETE PIVKMFEDPE TTRQMQSTRD GRMLFDYLAD KHGFRQEYLD TLYRYAKFQY ECGNYSGAAE YLYFFRVLVP A TDRNALSS LWGKLASEIL MQNWDAAMED LTRLKETIDN NSVSSPLQSL QQRTWLIHWS LFVFFNHPKG RDNIIDLFLY QP QYLNAIQ TMCPHILRYL TTAVITNKDV RKRRQVLKDL VKVIQQESYT YKDPITEFVE CLYVNFDFDG AQKKLRECES VLV NDFFLV ACLEDFIENA RLFIFETFCR IHQCISINML ADKLNMTPEE AERWIVNLIR NARLDAKIDS KLGHVVMGNN AVSP YQQVI EKTKSLSFRS QMLAMNIEKK LNQNSRSEAP NWATQDSGFY

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分子 #4: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ubiquitinyl hydrolase 1
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 37.84673 KDa
配列文字列: MATPAVSASA PPATPAATPA AAAAPASAPA AAPAPTPAPA PAAAPAAGAA PAAAADPAAA AAAAGTGQTP ASAQAPAQTS APSLPGPAL PGPFPGGRVV RLHPVILASI VDSYERRNEG AARVIGTLLG TVDKHSVEVT NCFSVPHNES EDEVAVDMEF A KNMYELHK ...文字列:
MATPAVSASA PPATPAATPA AAAAPASAPA AAPAPTPAPA PAAAPAAGAA PAAAADPAAA AAAAGTGQTP ASAQAPAQTS APSLPGPAL PGPFPGGRVV RLHPVILASI VDSYERRNEG AARVIGTLLG TVDKHSVEVT NCFSVPHNES EDEVAVDMEF A KNMYELHK KVSPNELILG WYATGHDITE HSVLIHEYYS REAPNPIHLT VDTSLQNGRM SIKAYVSTSM GVPGRTMGVM FT PLTVKYA YYDTERIGVD LIMKTCFSPN RVIGLSSDLQ QVGGASARIQ DALSTVLQYA EDVLSGKVSA DNTVGRFLMS LVN QVPKIV PDDFETMLNS NINDLLMVTY LANLTQSQIA LNEKLVNL

+
分子 #5: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 39.952281 KDa
配列文字列: MASRKEGTGS GGTSSSSATG VVGKGKGKGG SGDSAVKQVQ IDGLVVLKII KHYQEEGQGT EVVQGVLLGL VVEDRLEITN CFPFPQHTE DDADFDEVQY QMEMMRSLRH VNIDHLHVGW YQSTYYGSFV TRALLDSQFS YQHAIEESVV LIYDPIKTAQ G SLSLKAYR ...文字列:
MASRKEGTGS GGTSSSSATG VVGKGKGKGG SGDSAVKQVQ IDGLVVLKII KHYQEEGQGT EVVQGVLLGL VVEDRLEITN CFPFPQHTE DDADFDEVQY QMEMMRSLRH VNIDHLHVGW YQSTYYGSFV TRALLDSQFS YQHAIEESVV LIYDPIKTAQ G SLSLKAYR LTPKLMEVCK EKDFSPEALK KANITFEHMF EEVPIVIKNS HLINVLMWEL EKKSAVADKH ELLSLASSNH LG KNLQLLM DRVDEMSQDI VKYNTYMRNT SKQQQQKHQY QQRRQQENMQ RQSRGEPPLP EEDLSKLFKP PQPPARMDSL LIA GQINTY CQNIKEFTAQ NLGKLFMAQA LQEYNN

+
分子 #6: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 25.129709 KDa
配列文字列: MAMFEQMRAN VGKLLKGIDR YNPENLATLE RYVETQAKEN AYDLEANLAV LKLYQFNPAF FQTTVTAQIL LKALTNLPHT DFTLCKCMI DQAHQEERPI RQILYLGDLL ETCHFQAFWQ ALDENMDLLE GITGFEDSVR KFICHVVGIT YQHIDRWLLA E MLGDLTDS ...文字列:
MAMFEQMRAN VGKLLKGIDR YNPENLATLE RYVETQAKEN AYDLEANLAV LKLYQFNPAF FQTTVTAQIL LKALTNLPHT DFTLCKCMI DQAHQEERPI RQILYLGDLL ETCHFQAFWQ ALDENMDLLE GITGFEDSVR KFICHVVGIT YQHIDRWLLA E MLGDLTDS QLKMWMSKYG WSADESGQIF ICSQEESIKP KNIVEKIDFD SVSSIMASSQ

+
分子 #7: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 66.804766 KDa
配列文字列: MSYPADDYES EAVYDPYAYP SDYDMHTGDP KQDLAYERQY EQQTYQVIPE VIRNFIQYFH KTVSDLIDQK VYELQASRVS SDVIDQKVY EIQDIYENSW TKLTERFFKN TPWPEAETIA PQVGNDAVFL ILYKELYYRH IYAKVSGGPS LAQRFESYYN Y CNLFNYIL ...文字列:
MSYPADDYES EAVYDPYAYP SDYDMHTGDP KQDLAYERQY EQQTYQVIPE VIRNFIQYFH KTVSDLIDQK VYELQASRVS SDVIDQKVY EIQDIYENSW TKLTERFFKN TPWPEAETIA PQVGNDAVFL ILYKELYYRH IYAKVSGGPS LAQRFESYYN Y CNLFNYIL NADGPAPLEL PNQWLWDIID EFIYQFQSFS QYRCKTAKKS EEEIDFLRSN PKIWNVHSVL NVLHSLVDKS NI NRQLEVY TSGGDPESVA GEYGRHSLYK MLGYFSLVGL LRLHSLLGDY YQAIKVLENI ELNKKSMYSR VPECQVTTYY YVG FAYLMM RRYQDAIRVF ANILLYIQRT KSMFQRTTYK YEMINKQNEQ MHALLAIALT MYPMRIDESI HLQLREKYGD KMLR MQKGD PQVYEELFSY SCPKFLSPVV PNYDSVHPNY HKEPFLQQLK VFSDEVQQQA QLSTIRSFLK LYTTMPVAKL AGFLD LTEQ EFRIQLLVFK HKMKNLVWTS GISALDGEFQ SASEVDFYID KDMIHIADTK VARRYGDFFI RQIHKFEELN RTLKKM GQR P

+
分子 #8: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M
タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 42.555832 KDa
配列文字列: MSVPAFIDIS EEDQAAELRA YLKSKGAEIS EENSEGGLHV DLAQIIEACD VCLKEDDKDV ESVMNSVVSL LLILEPDKQE ALIESLCEK LVKFREGERP SLRLQLLSNL FHGMDKNTPV RYTVYCSLIK VAASCGAIQY IPTELDQVRK WISDWNLTTE K KHTLLRLL ...文字列:
MSVPAFIDIS EEDQAAELRA YLKSKGAEIS EENSEGGLHV DLAQIIEACD VCLKEDDKDV ESVMNSVVSL LLILEPDKQE ALIESLCEK LVKFREGERP SLRLQLLSNL FHGMDKNTPV RYTVYCSLIK VAASCGAIQY IPTELDQVRK WISDWNLTTE K KHTLLRLL YEALVDCKKS DAASKVMVEL LGSYTEDNAS QARVDAHRCI VRALKDPNAF LFDHLLTLKP VKFLEGELIH DL LTIFVSA KLASYVKFYQ NNKDFIDSLG LLHEQNMAKM RLLTFMGMAV ENKEISFDTM QQELQIGADD VEAFVIDAVR TKM VYCKID QTQRKVVVSH STHRTFGKQQ WQQLYDTLNA WKQNLNKVKN SLLSLSDT

+
分子 #9: EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT D

分子名称: EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT D
タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 42.203555 KDa
配列文字列: GSSVTVRPDW VTIEEMDFPR LSKLTLPGVK EGEDVLCCGA VEYYDKSYDR VNVKNEKPLQ RIDRIFHTVT TTDDPVIRKL SKTEGNVYA TDAILATIMC CTRSNYSWDI VIEKIGNKLF FDKRDNTEFD LLTVNETSVE PPQDDGNSLN SPRNLALEAT F INHNFSQQ ...文字列:
GSSVTVRPDW VTIEEMDFPR LSKLTLPGVK EGEDVLCCGA VEYYDKSYDR VNVKNEKPLQ RIDRIFHTVT TTDDPVIRKL SKTEGNVYA TDAILATIMC CTRSNYSWDI VIEKIGNKLF FDKRDNTEFD LLTVNETSVE PPQDDGNSLN SPRNLALEAT F INHNFSQQ VLKSNEPRYK FDEPNPFISE EEEGEVASVA YRYRKWDLNN GITLIARCEH DAVMQGPNNE TQFLTIKALN EW DSKLANG VEWRRKLDTQ RGAVLANELR NNACKLAKWT VQALLAGSDQ LKFGYVSRAS VRDSSKHVIL ETQQYKPNEF ATQ INLNMD NAWGILRCII DICMNQKDGK YLIMKDPNKP MIRLYDIPDN TF

+
分子 #12: 40S ribosomal protein S11

分子名称: 40S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 18.468826 KDa
配列文字列:
MADIQTERAY QKQPTIFQNK KRVLLGETGK EKLPRYYKNI GLGFKTPKEA IEGTYIDKKC PFTGNVSIRG RILSGVVTKM KMQRTIVIR RDYLHYIRKY NRFEKRHKNM SVHLSPCFRD VQIGDIVTVG ECRPLSKTVR FNVLKVTKAA GTKKQFQKF

+
分子 #13: 40S ribosomal protein S16

分子名称: 40S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 15.975753 KDa
配列文字列:
PLQSVQVFGR KKTATAVAHC KRGNGLIKVN GRPLEMIEPR TLQYKLLEPV LLLGKERFAG VDIRVRVKGG GHVAQIYAIR QSISKALVA YYQKYVDEAS KKEIKDILIQ YDRTLLVADP RRCESKKFGG PGARARYQKS YR

+
分子 #14: 40S ribosomal protein S4, X isoform

分子名称: 40S ribosomal protein S4, X isoform / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 29.65892 KDa
配列文字列: MARGPKKHLK RVAAPKHWML DKLTSVFAPR PSTGPHKLRE CLPLIIFLRN KLKYALTGDE VKKICMQRFI KIDGKVRADI TYPAGFMDV ISIDKTGENF RLIYDTKGRF AVHRITPEEA KYKLCKVRKI FVGTKGIPHL VTHDARTIRY PDPLIKMNDT I QIDLETGK ...文字列:
MARGPKKHLK RVAAPKHWML DKLTSVFAPR PSTGPHKLRE CLPLIIFLRN KLKYALTGDE VKKICMQRFI KIDGKVRADI TYPAGFMDV ISIDKTGENF RLIYDTKGRF AVHRITPEEA KYKLCKVRKI FVGTKGIPHL VTHDARTIRY PDPLIKMNDT I QIDLETGK ITDFIKFDTG NLCMVTGGAN LGRIGVITNR ERHPGSFDVV HVKDANGNSF ATRLSNIFVI GKGNKPWISL PR GKGIRLT IAEERDKRLA AKQSSG

+
分子 #15: 40S ribosomal protein S29

分子名称: 40S ribosomal protein S29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 6.364426 KDa
配列文字列:
QQLYWSHPRK FGQGSRSCRV CSNRHGLIRK YGLNMCRQCF RQYAKDIGFI KLD

+
分子 #16: 40S ribosomal protein S9

分子名称: 40S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 21.266166 KDa
配列文字列:
WVCRKTYVTP RRPFEKSRLD QELKLIGEYG LRNKREVWRV KFTLAKIRKA ARELLTLDEK DPRRLFEGNA LLRRLVRIGV LDEGKMKLD YILGLKIEDF LERRLQTQVF KLGLAKSIHH ARVLIRQRHI RVRKQVVNIP SFIVRLDSQK HIDFSLRSPY G GGRPGRVK RKNAKKGQGG AGAG

+
分子 #17: 40S ribosomal protein S18

分子名称: 40S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 16.170774 KDa
配列文字列:
PEKFQHILRV LNTNIDGRRK IAFAITAIKG VGRRYAHVVL RKADIDLTKR AGELTEDEVE RVITIMQNPR QYKIPDWFLN RQKDVKDGK YSQVLANGLD NKLREDLERL KKIRAHRGLR HFWGLRVRGQ HTKTTGRR

+
分子 #19: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 30.633297 KDa
配列文字列: CRFYQHKFPE VEDVVMVNVR SIAEMGAYVS LLEYNNIEGM ILLSELSRRR IRSINKLIRI GRNECVVVIR VDKEKGYIDL SKRRVSPEE AIKCEDKFTK SKTVYSILRH VAEVLEYTKD EQLESLFQRT AWVFDDKYKR PGYGAYDAFK HAVSDPSILD S LDLNEDER ...文字列:
CRFYQHKFPE VEDVVMVNVR SIAEMGAYVS LLEYNNIEGM ILLSELSRRR IRSINKLIRI GRNECVVVIR VDKEKGYIDL SKRRVSPEE AIKCEDKFTK SKTVYSILRH VAEVLEYTKD EQLESLFQRT AWVFDDKYKR PGYGAYDAFK HAVSDPSILD S LDLNEDER EVLINNINRR LTPQAVKIRA DIEVACYGYE GIDAVKEALR AGLNCSTETM PIKINLIAPP RYVMTTTTLE RT EGLSVLN QAMAVIKEKI EEKRGVFNV

+
分子 #20: 40S ribosomal protein S23

分子名称: 40S ribosomal protein S23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 15.757587 KDa
配列文字列:
MGKCRGLRTA RKLRSHRRDQ KWHDKQYKKA HLGTALKANP FGGASHAKGI VLEKVGVEAK QPNSAIRKCV RVQLIKNGKK ITAFVPNDG CLNFIEENDE VLVAGFGRKG HAVGDIPGVR FKVVKVANVS LLALYKGKKE RPR

+
分子 #21: 40S ribosomal protein S19

分子名称: 40S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 15.812286 KDa
配列文字列:
VTVKDVNQQE FVRALAAFLK KSGKLKVPEW VDTVKLAKHK ELAPYDENWF YTRAASTARH LYLRGGAGVG SMTKIYGGRQ RNGVMPSHF SRGSKSVARR VLQALEGLKM VEKDQDWGRK LTPQGQRDLD RIAGQVAAAK KK

+
分子 #22: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 45.862441 KDa
配列文字列: QATINIGTIG HVAHGKSTVV KAISGVHTVR FKNELERNIT IKLGYANAKI YKLDDPSCPR PECYRSCGSS TPDEFPTDIP GTKGNFKLV RHVSFVDCPG HDILMATMLN GAAVMDAALL LIAGNESCPQ PQTSEHLAAI EIMKLKHILI LQNKIDLVKE S QAKEQYEQ ...文字列:
QATINIGTIG HVAHGKSTVV KAISGVHTVR FKNELERNIT IKLGYANAKI YKLDDPSCPR PECYRSCGSS TPDEFPTDIP GTKGNFKLV RHVSFVDCPG HDILMATMLN GAAVMDAALL LIAGNESCPQ PQTSEHLAAI EIMKLKHILI LQNKIDLVKE S QAKEQYEQ ILAFVQGTVA EGAPIIPISA QLKYNIEVVC EYIVKKIPVP PRDFTSEPRL IVIRSFDVNK PGCEVDDLKG GV AGGSILK GVLKVGQEIE VRPGIVSKDS EGKLMCKPIF SKIVSLFAEH NDLQYAAPGG LIGVGTKIDP TLCRADRMVG QVL GAVGAL PEIFTELEIS YFLLRRLLGV RTEGDKKAAK VQKLSKNEVL MVNIGSLSTG GRVSAVKADL GKIVLTNPVC TEVG EKIAL SRRVEKHWRL IGWGQIR

+
分子 #23: 40S ribosomal protein S5

分子名称: 40S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 21.525941 KDa
配列文字列: TPDIKLFGKW STDDVQINDI SLQDYIAVKE KYAKYLPHSA GRYAAKRFRK AQCPIVERLT NSMMMHGRNN GKKLMTVRIV KHAFEIIHL LTGENPLQVL VNAIINSGPR EDSTRIGRAG TVRRQAVDVS PLRRVNQAIW LLCTGAREAA FRNIKTIAEC L ADELINAA ...文字列:
TPDIKLFGKW STDDVQINDI SLQDYIAVKE KYAKYLPHSA GRYAAKRFRK AQCPIVERLT NSMMMHGRNN GKKLMTVRIV KHAFEIIHL LTGENPLQVL VNAIINSGPR EDSTRIGRAG TVRRQAVDVS PLRRVNQAIW LLCTGAREAA FRNIKTIAEC L ADELINAA KGSSNSYAIK KKDELERVAK SNR

+
分子 #24: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 6.741048 KDa
配列文字列:
KVHGSLARVG KVRGQTLKVA KQEKKKKRTG RAKRRMQYNR RFVNVVPTFG KKKGPNANS

+
分子 #25: 40S ribosomal protein S25

分子名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 8.526119 KDa
配列文字列:
RDKLNNLVLF DKATYDKLCK EVPNYKLITP AVVSERLKIR GSLARAALQE LLSKGLIKLV SKHRAQVIYT RNTKG

+
分子 #26: 40S ribosomal protein S7

分子名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 21.716387 KDa
配列文字列: SAKIVKPNGE KPDEFESGIS QALLELEMNS DLKAQLRELN ITAAKEIEVG GGRKAIIIFV PVPQLKSFQK IQVRLVRELE KKFSGKHVV FIAQRRILPK PTRKSRTKNK QKRPRSRTLT AVHDAILEDL VFPSEIVGKR IRVKLDGSRL IKVHLDKAQQ N NVEHKVET ...文字列:
SAKIVKPNGE KPDEFESGIS QALLELEMNS DLKAQLRELN ITAAKEIEVG GGRKAIIIFV PVPQLKSFQK IQVRLVRELE KKFSGKHVV FIAQRRILPK PTRKSRTKNK QKRPRSRTLT AVHDAILEDL VFPSEIVGKR IRVKLDGSRL IKVHLDKAQQ N NVEHKVET FSGVYKKLTG KDVNFEFPEF QL

+
分子 #27: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 9.480186 KDa
配列文字列:
MPLAKDLLHP SPEEEKRKHK KKRLVQSPNS YFMDVKCPGC YKITTVFSHA QTVVLCVGCS TVLCQPTGGK ARLTEGCSFR RKQH

+
分子 #28: 40S ribosomal protein S13

分子名称: 40S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 17.128191 KDa
配列文字列:
GRMHAPGKGL SQSALPYRRS VPTWLKLTSD DVKEQIYKLA KKGLTPSQIG VILRDSHGVA QVRFVTGNKI LRILKSKGLA PDLPEDLYH LIKKAVAVRK HLERNRKDKD AKFRLILIES RIHRLARYYK TKRVLPPNWK YESSTASALV A

+
分子 #29: 40S ribosomal protein S15a

分子名称: 40S ribosomal protein S15a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 14.734357 KDa
配列文字列:
VRMNVLADAL KSINNAEKRG KRQVLIRPCS KVIVRFLTVM MKHGYIGEFE IIDDHRAGKI VVNLTGRLNK CGVISPRFDV QLKDLEKWQ NNLLPSRQFG FIVLTTSAGI MDHEEARRKH TGGKILGFFF

+
分子 #30: 40S ribosomal protein S21

分子名称: 40S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 8.896102 KDa
配列文字列:
MQSNAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIPMNVAEVD KVTGRFNGQS KTYAICGAIR RMGESDDSIL RLAKSHGIVS QN

+
分子 #31: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 24.814285 KDa
配列文字列: GKAGDKEWLP VTKLGRLVKD MKIKSLEEIY LFSLPIKESE IIDFFLGAAL KDKVLKIMPV QKQTQAGQRT RFKAFVAIGD YNGHVGLGM KCSKEVATAI RGAIILAKLS IVPVRRGYWG NKIGKPHTVR CKVTGRCGSV LVRLIPAPRG TGIISAPVPK K LLLMAGID ...文字列:
GKAGDKEWLP VTKLGRLVKD MKIKSLEEIY LFSLPIKESE IIDFFLGAAL KDKVLKIMPV QKQTQAGQRT RFKAFVAIGD YNGHVGLGM KCSKEVATAI RGAIILAKLS IVPVRRGYWG NKIGKPHTVR CKVTGRCGSV LVRLIPAPRG TGIISAPVPK K LLLMAGID DCYTSAGGCT ATLGNFAKAT FDAISKTYSY LTPDLWKETV FTKSPYQEFT DHLVKTHT

+
分子 #32: EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 BETA SUBUNIT (eIF2-Beta)

分子名称: EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 BETA SUBUNIT (eIF2-Beta)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 2.103416 KDa
配列文字列:
SEKEYVEMLD RLYSKLP

+
分子 #33: 40S ribosomal protein S17

分子名称: 40S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 14.578988 KDa
配列文字列:
MGRVRTKTVK KAARVIIEKY YTRLGNDFHT NKRVCEEIAI IPSKKLRNKI AGYVTHLMKR IQRGPVRGIS IKLQEEERER RDNYVPEVS ALDQEIIEVD PDTKEMLKLL DFGSLSNLQV TQPTVGM

+
分子 #34: 40S ribosomal protein SA

分子名称: 40S ribosomal protein SA / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 23.360791 KDa
配列文字列: SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQAAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH ...文字列:
SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQAAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH SVGLMWWMLA REVLRMRGTI SREHPWEVMP DLYFYRDPEE

+
分子 #35: 40S ribosomal protein S3

分子名称: 40S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 25.158535 KDa
配列文字列: MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV ...文字列:
MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV DTAVRHVLLR QGVLGIKVKI MLPWDPSGKI GPKKPLPDHV SIVEPKDEIL PTTPISEQK

+
分子 #36: 40S ribosomal protein S20

分子名称: 40S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 11.76589 KDa
配列文字列:
AIHRIRITLT SRNVKSLEKV CADLIRGAKE KNLKVKGPVR MPTKTLRITT RKTPCGEGSK TWDRFQMRIH KRLIDLHSPS EIVKQITSI SIEPGVEVEV TIADA

+
分子 #37: 40S ribosomal protein S3a

分子名称: 40S ribosomal protein S3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 24.944408 KDa
配列文字列: KKVVDPFSKK DWYDVKAPAM FNIRNIGKTL VTRTQGTKIA SDGLKGRVFE VSLADLQNDE VAFRKFKLIT EDVQGKNCLT NFHGMDLTR DKMCSMVKKW QTMIEAHVDV KTTDGYLLHL FCVGFTKKCN NQIRKTSYAQ HQQVRQIRKK MMEIMTREVQ T NDLKEVVN ...文字列:
KKVVDPFSKK DWYDVKAPAM FNIRNIGKTL VTRTQGTKIA SDGLKGRVFE VSLADLQNDE VAFRKFKLIT EDVQGKNCLT NFHGMDLTR DKMCSMVKKW QTMIEAHVDV KTTDGYLLHL FCVGFTKKCN NQIRKTSYAQ HQQVRQIRKK MMEIMTREVQ T NDLKEVVN KLIPDSIGKD IEKACQSIYP LHDVFVRKVK MLKKPKFELG KLMELHG

+
分子 #38: 40S ribosomal protein S14

分子名称: 40S ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 14.544659 KDa
配列文字列:
SLGPQVAEGE NVFGVCHIFA SFNDTFVHVT DLSGKETICR VTGGMKVKAD RDESSPYAAM LAAQDVAQRC KELGITALHI KLRATGGNR TKTPGPGAQS ALRALARSGM KIGRIEDVTP IPSDSTRRKG GRRGRRL

+
分子 #39: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 11.315428 KDa
配列文字列:
TKKRRNNGRA KKGRGHVQPI RCTNCACCVP KDKAIKKFVI RNIVEAAAVR DISEVSVFDA YVLPKLYVKL HYCVSCAIHS KVVRNRSRE ARKDRTPPPR

+
分子 #40: 40S ribosomal protein S28

分子名称: 40S ribosomal protein S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 7.263394 KDa
配列文字列:
RVQPIKLARV TKVLGRTGSQ GQCTQVRVEF MDDTSRSIIR NVKGPVREGD VLTLLESERE ARRL

+
分子 #41: Receptor of activated protein C kinase 1

分子名称: Receptor of activated protein C kinase 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 34.669113 KDa
配列文字列: TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG ...文字列:
TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG WDKLVKVWNL ANCKLKTNHI GHTGYLNTVT VSPDGSLCAS GGKDGQAMLW DLNEGKHLYT LDGGDIINAL CF SPNRYWL CAATGPSIKI WDLEGKIIVD ELKQEVISTS SKAEPPQCTS LAWSADGQTL FAGYTDNLVR VWQVTI

+
分子 #42: 40S ribosomal protein S15

分子名称: 40S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 15.151948 KDa
配列文字列:
VEQKKKRTFR KFTYRGVDLD QLLDMSYEQL MQLYSARQRR RLSRGLRRKQ HSLLKRLRKA KKEAPPMEKP EVVKTHLRDM IILPEMVGS MVGVYNGKTF NQVEIKPEMI GHYLGEFSIT YKPVKHGR

+
分子 #43: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 23.902871 KDa
配列文字列: GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVGVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG ...文字列:
GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVGVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG KLLACIASRP GQCGRADGYV LEGKELEFYL RKIKARKG

+
分子 #44: Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a

分子名称: Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 8.358903 KDa
配列文字列:
KKSYTTPKKN KHKRKKVKLA VLKYYKVDEN GKISRLRREC PSDECGAGVF MASHFDRHYC GKCCLTYCFN K

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分子 #45: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 27.471535 KDa
配列文字列: MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK ...文字列:
MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK PRTKAPKIQR LVTPRVLQHK RRRIALKKQR TKKNKEEAAE YAKLLAKRMK EAKEKRQEQI AKRRRLSSL

+
分子 #46: 40S ribosomal protein S12

分子名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 13.766122 KDa
配列文字列:
GGVMDVNTAL QEVLKTALIH DGLARGIREA AKALDKRQAH LCVLASNCDE PMYVKLVEAL CAEHQINLIK VDDNKKLGEW VGLCKIDRE GKPRKVVGCS CVVVKDYGKE SQAKDVIEEY FKCKK

+
分子 #47: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 15.18897 KDa
配列文字列:
DTVTIRTRKF MTNRLLQRKQ MVIDVLHPGK ATVPKTEIQE KLAKMYKTTP DVIFVFGFRT HFGGGKTTGF GMIYDSLDYA KKNEPKHRL ARHGLYEKKK TSRKQRKERK NRMKKVRGTA KANVGAGKKP KE

+
分子 #48: 40S ribosomal protein S10

分子名称: 40S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 11.773953 KDa
配列文字列:
MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHMP KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSRGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DYLHLPPEI VPATLRRSR

+
分子 #49: Eukaryotic translation initiation factor 4B

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 4B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 72.32482 KDa
組換発現生物種: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ)
配列文字列: MSYYHHHHHH DYDIPTTENL YPQGAMAASA KKKNKKGKTI SLTDFLAEDG GTGGGSTYVS KPVSWADETD DLEGDVSTTW HSNDDDVYR APPIDRSILP TAPRAAREPN IDRSRLPKSP PYTAFLGNLP YDVTEESIKE FFRGLNISAV RLPREPSNPE R LKGFGYAE ...文字列:
MSYYHHHHHH DYDIPTTENL YPQGAMAASA KKKNKKGKTI SLTDFLAEDG GTGGGSTYVS KPVSWADETD DLEGDVSTTW HSNDDDVYR APPIDRSILP TAPRAAREPN IDRSRLPKSP PYTAFLGNLP YDVTEESIKE FFRGLNISAV RLPREPSNPE R LKGFGYAE FEDLDSLLSA LSLNEESLGN RRIRVDVADQ AQDKDRDDRS FGRDRNRDSD KTDTDWRARP ATDSFDDYPP RR GDDSFGD KYRDRYDSDR YRDGYRDGYR DGPRRDMDRY GGRDRYDDRG SRDYDRGYDS RIGSGRRAFG SGYRRDDDYR GGG DRYEDR YDRRDDRSWS SRDDYSRDDY RRDDRGPPQR PKLNLKPRST PKEDDSSAST SQSTRAASIF GGAKPVDTAA RERE VEERL QKEQEKLQRQ LDEPKLERRP RERHPSWRSE ETQERERSRT GSESSQTGTS TTSSRNARRR ESEKSLENET LNKEE DCHS PTSKPPKPDQ PLKVMPAPPP KENAWVKRSS NPPARSQSSD TEQQSPTSGG GKVAPAQPSE EGPGRKDENK VDGMNA PKG QTGNSSRGPG DGGNRDHWKE SDRKDGKKDQ DSRSAPEPKK PEENPASKFS SASKYAALSV DGEDENEGED YAE

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分子 #50: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B
タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 124.402336 KDa
配列文字列: MLGAVKMEGH ESSDWNSYYA DTQEAYSSVP VSNMNSGLGS MNSMNTYMTM NTMTTSGNMT PASFNMSYAN PGLGAGLSPG AVAGMPAGS AGAMNSMTAA GVTAMGTALS PGGMGAMGAQ PAASMNGLGP YAAAMNPCMS PMAYAPSNLG RSRAGGGGDA K TFKRSYPH ...文字列:
MLGAVKMEGH ESSDWNSYYA DTQEAYSSVP VSNMNSGLGS MNSMNTYMTM NTMTTSGNMT PASFNMSYAN PGLGAGLSPG AVAGMPAGS AGAMNSMTAA GVTAMGTALS PGGMGAMGAQ PAASMNGLGP YAAAMNPCMS PMAYAPSNLG RSRAGGGGDA K TFKRSYPH AKPPYSYISL ITMAIQQAPS KMLTLSEIYQ WIMDLFPYYR QNQQRWQNSI RHSLSFNDCF LKVPRSPDKP GK GSFWTLH PDSGNMFENG CYLRRQKRFK CEKQLALKEA GAPGAGAGGK KAAAVGAQAS QAQLGEVAGP APDTPAGTES PHS SASPCQ EHKRVALGEL KGSAAGAALS PPEPAPSPGQ QQQQQPGAEP PPEEEPPRPA GAEDAAAEAA AEAGPEPDVR AEPA EAQEA ASSPAEPPAT LPAEQGEAPR EQARDEPAPA SEAEGSAAEA EPRAVENGDA DEPSFSDPED FVDDVSEEEL LGDVL KDRP QEADGIDSVI VVDNVPQVGP DRLEKLKNVI HKIFSKFGKI TNDFYPEEDG KTKGYIFLEY ASPAHAVDAV KNADGY KLD KQHTFRVNLF TDFDKYMTIS DEWDIPEKQP FKDLGNLRYW LEEAECRDQY SVIFESGDRT SIFWNDVKDP VSIEERA RW TETYVRWSPK GTYLATFHQR GIALWGGEKF KQIQRFSHQG VQLIDFSPCE RYLVTFSPLM DTQDDPQAII IWDILTGH K KRGFHCESSA HWPIFKWSHD GKFFARMTLD TLSIYETPSM GLLDKKSLKI SGIKDFSWSP GGNIIAFWVP EDKDIPARV TLMQLPSRQE IRVRNLFNVV DCKLHWQKNG DYLCVKVDRT PKGTQGVVTN FEIFRMREKQ VPVDVVEMKE TIIAFAWEPN GSKFAVLHG EAPRISVSFY HVKSNGKIEL SKMFDKQQAN TIFWSPQGQF VVLAGLRSMN GALAFVDTSD CTVMNIAEHY M ASDVEWDP TGRYVVTSVS WWSHKVDNAY WLWTFQGRLL QKNNKDRFCQ LLWRPRPPTL LSQEQIKQIK KDLKKYSKIF EQ KDRLSQS KASKELVERR RAMMEDFRKY GKAAQELYVG QKNERLELRG GVDTDELDSN VDDWEEETIE FFVTEEVIPL GSQ E

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分子 #10: 18S ribosomal RNA

分子名称: 18S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 10 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 572.789812 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GCUCCUCUCC UACUUGGAUA ACUGUGGUAA U UCUAGAGC ...文字列:
UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GCUCCUCUCC UACUUGGAUA ACUGUGGUAA U UCUAGAGC UAAUACAUGC CGACGGCGCU GACUCCCUUU GUGUGGGAUG CGUGCAUUUA UCAGAUCAAA ACCAACCCGG UC AGCGGCG GCGGCUUUGG UGACUCUAGA UAACCUCGGG CCGAUCGCAG CCCUCCGUGG CGGCGACGAC CCAUUCGAAC GUC UGCCCU AUCAACUUUC GAUGGUAGUC GCCGUGCCUA CCAUGGUGAC CACGGGUGAC GGGGAAUCAG GGUUCGAUUC CGGA GAGGG AGCCUGAGAA ACGGCUACCA CAUCCAAGGA AGGCAGCAGG CGCGCAAAUU ACCCACUCCC GACCCGGGGA GGUAG UGAC GAAAAAUAAC AAUACAGGAC UCUUUCGAGG CCCUGUAAUU GGAAUGAGUC CACUUUAAAU CCUUUAACGA GGAUCC AUU GGAGGGCAAG UCUGGUCGCA GCAGCCGCGG UAAUUCCAGC UCCAAUAGCG UAUAUUAAAG UUGCUGCAGU UAAAAAG CU CGUAGUUGGA UCUUGAGGGC CCGCCCCUCG GCGCCCCCUC GAUGUGUCCC GCGGGGCCCG AAGCGUUUAC UUUGAAAA A AUUAGAGUGU UCAAAGCAGG CCCGAGCCGC CUGGAUACCG CAGCUAGGAA UAAUGGAAUA GGACCGCGGU UCUAUUUUG UUGGUUUUCG GAACUGAGGC CAUGAUUAAG AGGGACGGCC GGGGGCAUUC GUAUUGCGCC GCUAGAGGUG AAAUUCUUGG ACCGGCGCA AGACGGACCA GAGCGAAAGC AUUUGCCAAG AAUGUUUUCA UUAAUCAAGA ACGAAAGUCG GAGGUUCGAA G ACGAUCAG AUACCGUCGU AGUUCCGACC AUAAACGAUG CCGACUGGCG AUGCGGCGGC GUUAUUCCCA UGACCCGCCG GG CAGCUUC CGGGAAACCA AAGUCUUUGG GUUCCGGGGG GAGUAUGGUU GCAAAGCUGA AACUUAAAGG AAUUGACGGA AGG GCACCA CCAGGAGUGG AGCCUGCGGC UUAAUUUGAC UCAACACGGG AAACCUCACC CGGCCCGGAC ACGGACAGGA UUGA CAGAU UGAUAGCUCU UUCUCGAUUC UGUGGGUGGU GGUGCAUGGC CGUUCUUAGU UGGUGGAGCG AUUUGUCUGG UUAAU UCCG AUAACGAACG AGACUCUGGC AUGCUAACUA GUUACGCGAC CCCCGAGCGG UCGGCGUCCC CCAACUUCUU AGAGGG ACA AGUGGCGUUC AGCCACCCGA GAUUGAGCAA UAACAGGUCU GUGAUGCCCU UAGAUGUCGG GGCUGCACGC GCGCUAC AC UGACUGGCUC AGCGUGUGCC UACCCUACGC CGGCAGGCGC GGGUAACCCG UUGAACCCCA UUCGUGAUGG GGAUCGGG G AUUGCAAUUA UUCCCCAUGA ACGAGGAAUU CCCAGUAAGU GCGGGUCAUA AGCUUGCGUU GAUUAAGUCC CUGCCCUUU GUACACACCG CCCGUCGCUA CUACCGAUUG GAUGGUUUAG UGAGGCCCUC GGAUCGGCCC GCCGGGGUCG GCCCACGGCC CUGGCGGAG CGCUGAGAAG ACGGUCGAAC UUGACUAUCU AGAGGAAGUA AAAGUCGUAA CAAGGUUUCC GUAGGUGAAC C UGCGGAAG GAUCAUUA

+
分子 #11: Messenger RNA (26-MER)

分子名称: Messenger RNA (26-MER) / タイプ: rna / ID: 11 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 8.238953 KDa
配列文字列:
CAGACACCAU GGUGCACCUG ACUCCU

+
分子 #18: Transfer RNA (75-MER)

分子名称: Transfer RNA (75-MER) / タイプ: rna / ID: 18 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 24.23151 KDa
配列文字列:
AGCAGAGUGG CGCAGCGGAA GCGUGCUGGG CCCAUAACCC AGAGGUCGAU GGAUCGAAAC CAUCCUCUGC UACCA

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分子 #51: water

分子名称: water / タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 415 / 式: HOH
分子量理論値: 18.015 Da
Chemical component information

ChemComp-HOH:
WATER / 水

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
詳細: 20 mM Tris HCl, 50 mM KOAc, 2.5 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.25 mM spermidine 0.25 mM GMPPNP
グリッドモデル: Quantifoil R2/2
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / 最大 デフォーカス（公称値）: 4.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.5 µm / 倍率（公称値）: 112000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
検出モード: INTEGRATING / 平均電子線量: 30.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

CTF補正ソフトウェア - 名称: CTFFIND (ver. 4)
初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

3019

初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
最終 3次元分類ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / アルゴリズム: BACK PROJECTION / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 6.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4) / 使用した粒子像数: 50604

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原子モデル構築 1

精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
当てはまり具合の基準: Cross-correlation coefficient
得られたモデル

PDB-6fec:
Human cap-dependent 48S pre-initiation complex

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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