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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-3620 | |||||||||
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タイトル | Microtubule-bound MKLP2 motor domain in the presence of ADP | |||||||||
![]() | Microtubule-bound MKLP2 motor domain in the presence of ADP | |||||||||
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![]() | Kinesin Mitosis Microtubules / ![]() | |||||||||
機能・相同性 | ![]() Mitotic Telophase/Cytokinesis / Microtubule-dependent trafficking of connexons from Golgi to the plasma membrane / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Atherton J / Yu IM | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: The divergent mitotic kinesin MKLP2 exhibits atypical structure and mechanochemistry. 著者: Joseph Atherton / I-Mei Yu / Alexander Cook / Joseph M Muretta / Agnel Joseph / Jennifer Major / Yannick Sourigues / Jeffrey Clause / Maya Topf / Steven S Rosenfeld / Anne Houdusse / Carolyn A Moores / ![]() ![]() ![]() 要旨: MKLP2, a kinesin-6, has critical roles during the metaphase-anaphase transition and cytokinesis. Its motor domain contains conserved nucleotide binding motifs, but is divergent in sequence (~35% ...MKLP2, a kinesin-6, has critical roles during the metaphase-anaphase transition and cytokinesis. Its motor domain contains conserved nucleotide binding motifs, but is divergent in sequence (~35% identity) and size (~40% larger) compared to other kinesins. Using cryo-electron microscopy and biophysical assays, we have undertaken a mechanochemical dissection of the microtubule-bound MKLP2 motor domain during its ATPase cycle, and show that many facets of its mechanism are distinct from other kinesins. While the MKLP2 neck-linker is directed towards the microtubule plus-end in an ATP-like state, it does not fully dock along the motor domain. Furthermore, the footprint of the MKLP2 motor domain on the MT surface is altered compared to motile kinesins, and enhanced by kinesin-6-specific sequences. The conformation of the highly extended loop6 insertion characteristic of kinesin-6s is nucleotide-independent and does not contact the MT surface. Our results emphasize the role of family-specific insertions in modulating kinesin motor function. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 3.2 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 15 KB 15 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 181.2 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 6.6 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
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注釈 | Microtubule-bound MKLP2 motor domain in the presence of ADP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.53 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
+全体 : Complex of 14pf microtubule with bound MKLP2 motor domain in the ...
+超分子 #1: Complex of 14pf microtubule with bound MKLP2 motor domain in the ...
+超分子 #2: Kinesin-like protein KIF20A
+超分子 #3: Tubulin alpha and beta chains
+分子 #1: Kinesin-like protein KIF20A
+分子 #2: Tubulin alpha chain
+分子 #3: Tubulin beta-2B chain
+分子 #4: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
+分子 #5: MAGNESIUM ION
+分子 #6: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
+分子 #7: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
+分子 #8: TAXOL
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | filament |
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試料調製
緩衝液 | pH: 6.8 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI POLARA 300 |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: DIRECT ELECTRON DE-20 (5k x 3k) 検出モード: INTEGRATING / 平均電子線量: 25.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Tecnai Polara / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: PDB ENTRY |
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初期 角度割当 | タイプ: PROJECTION MATCHING |
最終 角度割当 | タイプ: PROJECTION MATCHING |
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 5.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF 詳細: Gold-standard FSCtrue using noise substitution test (Chen et al., 2014) 使用した粒子像数: 9842 |