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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||||||||
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タイトル | AtSLAC1 in open state | |||||||||||||||
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![]() | Stomatal closure / ![]() ![]() | |||||||||||||||
機能・相同性 | ![]() response to humidity / stomatal closure / regulation of stomatal opening / inorganic anion transport / voltage-gated monoatomic anion channel activity / regulation of stomatal closure / stomatal movement / response to ozone / intracellular monoatomic ion homeostasis / organic anion transport ...response to humidity / stomatal closure / regulation of stomatal opening / inorganic anion transport / voltage-gated monoatomic anion channel activity / regulation of stomatal closure / stomatal movement / response to ozone / intracellular monoatomic ion homeostasis / organic anion transport / response to carbon dioxide / monoatomic anion transmembrane transporter activity / response to abscisic acid / multicellular organismal-level water homeostasis / monoatomic anion transport / abscisic acid-activated signaling pathway / response to light stimulus / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||||||||
![]() | Lee Y / Lee S | |||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structures of the plant anion channel SLAC1 from Arabidopsis thaliana suggest a combined activation model. 著者: Yeongmok Lee / Hyeon Seong Jeong / Seoyeon Jung / Junmo Hwang / Chi Truc Han Le / Sung-Hoon Jun / Eun Jo Du / KyeongJin Kang / Beom-Gi Kim / Hyun-Ho Lim / Sangho Lee / ![]() 要旨: The anion channel SLAC1 functions as a crucial effector in the ABA signaling, leading to stomata closure. SLAC1 is activated by phosphorylation in its intracellular domains. Both a binding-activation ...The anion channel SLAC1 functions as a crucial effector in the ABA signaling, leading to stomata closure. SLAC1 is activated by phosphorylation in its intracellular domains. Both a binding-activation model and an inhibition-release model for activation have been proposed based on only the closed structures of SLAC1, rendering the structure-based activation mechanism controversial. Here we report cryo-EM structures of Arabidopsis SLAC1 WT and its phosphomimetic mutants in open and closed states. Comparison of the open structure with the closed ones reveals the structural basis for opening of the conductance pore. Multiple phosphorylation of an intracellular domain (ICD) causes dissociation of ICD from the transmembrane domain. A conserved, positively-charged sequence motif in the intracellular loop 2 (ICL2) seems to be capable of sensing of the negatively charged phosphorylated ICD. Interactions between ICL2 and ICD drive drastic conformational changes, thereby widening the pore. From our results we propose that SLAC1 operates by a mechanism combining the binding-activation and inhibition-release models. | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 2 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 19 KB 19 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 12.8 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 42.2 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 216 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 6.7 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 200.2 MB 200.2 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.84 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_35920_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_35920_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Trimer of open state AtSLAC1 with sfGFP tag in GDN and CHS micelle
全体 | 名称: Trimer of open state AtSLAC1 with sfGFP tag in GDN and CHS micelle |
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要素 |
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-超分子 #1: Trimer of open state AtSLAC1 with sfGFP tag in GDN and CHS micelle
超分子 | 名称: Trimer of open state AtSLAC1 with sfGFP tag in GDN and CHS micelle タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 280 KDa |
-分子 #1: Guard cell S-type anion channel SLAC1,Green fluorescent protein
分子 | 名称: Guard cell S-type anion channel SLAC1,Green fluorescent protein タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 93.862953 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MERKQSNAHS TFADINEVED EAEQELQQQE NNNNKRFSGN RGPNRGKQRP FRGFSRQVSL ETGFSVLNRE SRERDDKKSL PRSGRSFGG FESGGIINGG DGRKTDFSMF RTKSTLSKQK SLLPSIIRER DIENSLRTED GETKDDSINE NVSAGRYFAA L RGPELDEV ...文字列: MERKQSNAHS TFADINEVED EAEQELQQQE NNNNKRFSGN RGPNRGKQRP FRGFSRQVSL ETGFSVLNRE SRERDDKKSL PRSGRSFGG FESGGIINGG DGRKTDFSMF RTKSTLSKQK SLLPSIIRER DIENSLRTED GETKDDSINE NVSAGRYFAA L RGPELDEV KDNEDILLPK EEQWPFLLRF PIGCFGICLG LSSQAVLWLA LAKSPATNFL HITPLINLVV WLFSLVVLVS VS FTYILKC IFYFEAVKRE YFHPVRVNFF FAPWVVCMFL AISVPPMFSP NRKYLHPAIW CVFMGPYFFL ELKIYGQWLS GGK RRLCKV ANPSSHLSVV GNFVGAILAS KVGWDEVAKF LWAVGFAHYL VVFVTLYQRL PTSEALPKEL HPVYSMFIAA PSAA SIAWN TIYGQFDGCS RTCFFIALFL YISLVARINF FTGFKFSVAW WSYTFPMTTA SVATIKYAEA VPGYPSRALA LTLSF ISTA MVCVLFVSTL LHAFVWQTLF PNDLAIAITK RKLTREKKPF KRAYDLKRWT KQALAKKISA EKDFEAEEES HHGSEN LYF QSMSKGEELF TGVVPILVEL DGDVNGHKFS VRGEGEGDAT NGKLTLKFIC TTGKLPVPWP TLVTTLTYGV QCFSRYP DH MKRHDFFKSA MPEGYVQERT ISFKDDGTYK TRAEVKFEGD TLVNRIELKG IDFKEDGNIL GHKLEYNFNS HNVYITAD K QKNGIKANFK IRHNVEDGSV QLADHYQQNT PIGDGPVLLP DNHYLSTQSV LSKDPNEKRD HMVLLEFVTA AGITHGMDE LYKYPYDVPD YAGGGSHHHH HHHHHH UniProtKB: Guard cell S-type anion channel SLAC1, ![]() |
-分子 #2: CHOLESTEROL HEMISUCCINATE
分子 | 名称: CHOLESTEROL HEMISUCCINATE / タイプ: ligand / ID: 2 / コピー数: 3 / 式: Y01 |
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分子量 | 理論値: 486.726 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-Y01: |
-分子 #3: CHLORIDE ION
分子 | 名称: CHLORIDE ION / タイプ: ligand / ID: 3 / コピー数: 6 / 式: CL |
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分子量 | 理論値: 35.453 Da |
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 1.0 mg/mL | ||||||||||||||||||
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緩衝液 | pH: 7 構成要素:
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グリッド | モデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: GOLD / メッシュ: 300 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY ARRAY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 60 sec. / 前処理 - 雰囲気: AIR | ||||||||||||||||||
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK III |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS TALOS |
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電子線 | 加速電圧: 200 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() 最大 デフォーカス(公称値): 1.9000000000000001 µm 最小 デフォーカス(公称値): 0.7000000000000001 µm |
特殊光学系 | エネルギーフィルター - 名称: GIF Bioquantum |
試料ステージ | ホルダー冷却材: NITROGEN |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |