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- EMDB-26635: Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to I... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-26635
タイトルPseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to IF2-GDPCP (structure II-B)
マップデータ
試料
  • 複合体: Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to IF2-GDPCP (structure II-B)
    • RNA: x 5種
    • タンパク質・ペプチド: x 52種
  • リガンド: x 5種
キーワードInitiation Factor 2 / 70S ribosome (リボソーム) / cryo-EM (低温電子顕微鏡法) / translation initiation / initiator tRNA / conformational changes / RIBOSOME (リボソーム)
機能・相同性
機能・相同性情報


translational initiation / translation initiation factor activity / ribosomal small subunit biogenesis / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosomal small subunit assembly / cytosolic small ribosomal subunit / large ribosomal subunit rRNA binding / large ribosomal subunit / small ribosomal subunit / cytoplasmic translation ...translational initiation / translation initiation factor activity / ribosomal small subunit biogenesis / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosomal small subunit assembly / cytosolic small ribosomal subunit / large ribosomal subunit rRNA binding / large ribosomal subunit / small ribosomal subunit / cytoplasmic translation / 5S rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / transferase activity / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / リボソーム / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / 翻訳 (生物学) / mRNA binding / GTPase activity / GTP binding / RNA binding / metal ion binding / 細胞質基質 / 細胞質
類似検索 - 分子機能
Initiation factor 2 associated domain, bacterial / Bacterial translation initiation factor IF-2 associated region / Translation initiation factor IF-2, N-terminal / Translation initiation factor IF-2, N-terminal region / Translation initiation factor IF-2, domain II / Initiation factor 2 signature. / Translation initiation factor IF-2, bacterial-like / Translation initiation factor IF- 2, domain 3 / Translation-initiation factor 2 / Translation initiation factor IF- 2 ...Initiation factor 2 associated domain, bacterial / Bacterial translation initiation factor IF-2 associated region / Translation initiation factor IF-2, N-terminal / Translation initiation factor IF-2, N-terminal region / Translation initiation factor IF-2, domain II / Initiation factor 2 signature. / Translation initiation factor IF-2, bacterial-like / Translation initiation factor IF- 2, domain 3 / Translation-initiation factor 2 / Translation initiation factor IF- 2 / Translation initiation factor IF-2, domain 3 superfamily / Putative DNA-binding domain superfamily / Ribosomal protein L10, eubacterial, conserved site / Ribosomal protein L10 signature. / Ribosomal protein L25, long-form / Ribosomal protein L25, beta domain / Ribosomal protein L25, C-terminal / Ribosomal protein TL5, C-terminal domain / Ribosomal protein L10 / : / Ribosomal protein S21, conserved site / Ribosomal protein S21 signature. / Ribosomal protein S14, bacterial/plastid / Ribosomal protein L11, bacterial-type / Ribosomal protein L31 type A / Ribosomal protein S21 superfamily / Ribosomal protein S21 / Ribosomal protein S21 / Ribosomal protein L31 signature. / Translational (tr)-type GTP-binding domain / Elongation factor Tu GTP binding domain / Translational (tr)-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile. / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L11, conserved site / Ribosomal protein L31 superfamily / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L10-like domain superfamily / Ribosomal protein L10P / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / Ribosomal protein L10 / Ribosomal protein L11 signature. / Ribosomal protein L16 signature 1. / : / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L11, N-terminal / Ribosomal protein L9 signature. / Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L9, bacteria/chloroplast / Ribosomal protein L11, C-terminal / Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L9, C-terminal / Ribosomal protein L9, C-terminal domain / Ribosomal protein L9, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11, N-terminal domain / Ribosomal protein L11, RNA binding domain / Ribosomal L25p family / Ribosomal protein L25 / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, N-terminal / Ribosomal protein L32p, bacterial type / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9 / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein L18, bacterial-type / Ribosomal protein L19, conserved site / Ribosomal protein L19 signature. / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribosomal protein S3, bacterial-type / Ribosomal protein S6, conserved site / Ribosomal protein S6 signature. / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein S19, bacterial-type / Ribosomal protein L27, conserved site / Ribosomal protein L27 signature. / Ribosomal protein S7, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein S11, bacterial-type / Ribosomal protein S13, bacterial-type / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein S20 superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
Large ribosomal subunit protein uL22 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein bL17 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Large ribosomal subunit protein bL34 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein bL31 / Small ribosomal subunit protein bS6 / Small ribosomal subunit protein bS18 ...Large ribosomal subunit protein uL22 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein bL17 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Large ribosomal subunit protein bL34 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein bL31 / Small ribosomal subunit protein bS6 / Small ribosomal subunit protein bS18 / Large ribosomal subunit protein bL9 / Translation initiation factor IF-2 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein bL25 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Small ribosomal subunit protein bS20 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Large ribosomal subunit protein uL11 / Large ribosomal subunit protein uL10 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein bL36A / Small ribosomal subunit protein uS13 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Small ribosomal subunit protein bS16 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Large ribosomal subunit protein bL32 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Small ribosomal subunit protein bS21
類似検索 - 構成要素
生物種Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌) / Escherichia coli (大腸菌) / Bacteriophage sp. (ファージ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.6 Å
データ登録者Basu RS / Sherman MB / Gagnon MG
資金援助 米国, 2件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)R01GM136936 米国
Robert A. Welch FoundationH-2032-20200401 米国
引用ジャーナル: Nat Commun / 年: 2022
タイトル: Compact IF2 allows initiator tRNA accommodation into the P site and gates the ribosome to elongation
著者: Basu RS / Sherman MB / Gagnon MG
履歴
登録2022年4月11日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年6月22日-
マップ公開2022年6月22日-
更新2024年2月14日-
現状2024年2月14日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_26635.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_26635.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.85 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.13
最小 - 最大-0.6536322 - 1.9364831
平均 (標準偏差)-0.001728133 (±0.06257088)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ512512512
Spacing512512512
セルA=B=C: 435.2 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_26635_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to...

ファイルemd_26635_additional_1.map
注釈Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to IF2-GDPCP (structure II-B). Sharpened map.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to...

ファイルemd_26635_half_map_1.map
注釈Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to IF2-GDPCP (structure II-B). Half-map.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to...

ファイルemd_26635_half_map_2.map
注釈Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to IF2-GDPCP (structure II-B). Half-map.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to I...

全体名称: Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to IF2-GDPCP (structure II-B)
要素
  • 複合体: Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to IF2-GDPCP (structure II-B)
    • RNA: 16S Ribosomal RNA16SリボソームRNA
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S2
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S3
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S4
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S5
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S7
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S9
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S10
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S11
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S12
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S13
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S14
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S15
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S16
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S18
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S19
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S20
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S21
    • RNA: P-site initiator tRNA
    • RNA: mRNA伝令RNA
    • タンパク質・ペプチド: Translation initiation factor IF-2
    • RNA: 23S Ribosomal RNA23SリボソームRNA
    • RNA: 5S Ribosomal RNA5SリボソームRNA
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L2
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L9
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L11
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L16
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L25
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L28
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L31
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L32
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L33
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: N-FORMYLMETHIONINEN-ホルミルメチオニン
  • リガンド: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: water水

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超分子 #1: Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to I...

超分子名称: Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to IF2-GDPCP (structure II-B)
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#57
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)

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分子 #1: 16S Ribosomal RNA

分子名称: 16S Ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
分子量理論値: 497.973188 KDa
配列文字列: GAACUGAAGA GUUUGAUCAU GGCUCAGAUU GAACGCUGGC GGCAGGCCUA ACACAUGCAA GUCGAGCGGA UGAAGGGAGC UUGCUCCUG GAUUCAGCGG CGGACGGGUG AGUAAUGCCU AGGAAUCUGC CUGGUAGUGG GGGAUAACGU CCGGAAACGG G CGCUAAUA ...文字列:
GAACUGAAGA GUUUGAUCAU GGCUCAGAUU GAACGCUGGC GGCAGGCCUA ACACAUGCAA GUCGAGCGGA UGAAGGGAGC UUGCUCCUG GAUUCAGCGG CGGACGGGUG AGUAAUGCCU AGGAAUCUGC CUGGUAGUGG GGGAUAACGU CCGGAAACGG G CGCUAAUA CCGCAUACGU CCUGAGGGAG AAAGUGGGGG AUCUUCGGAC CUCACGCUAU CAGAUGAGCC UAGGUCGGAU UA GCUAGUU GGUGGGGUAA AGGCCUACCA AGGCGACGAU CCGUAACUGG UCUGAGAGGA UGAUCAGUCA CACUGGAACU GAG ACACGG UCCAGACUCC UACGGGAGGC AGCAGUGGGG AAUAUUGGAC AAUGGGCGAA AGCCUGAUCC AGCCAUGCCG CGUG UGUGA AGAAGGUCUU CGGAUUGUAA AGCACUUUAA GUUGGGAGGA AGGGCAGUAA GUUAAUACCU UGCUGUUUUG ACGUU ACCA ACAGAAUAAG CACCGGCUAA CUUCGUGCCA GCAGCC(7MG)CGG UAAUACGAAG GGUGCAAGCG UUAAUCGGAA UU ACUGGGC GUAAAGCGCG CGUAGGUGGU UCAGCAAGUU GGAUGUGAAA UCCCCGGGCU CAACCUGGGA ACUGCAUCCA AAA CUACUG AGCUAGAGUA CGGUAGAGGG UGGUGGAAUU UCCUGUGUAG CGGUGAAAUG CGUAGAUAUA GGAAGGAACA CCAG UGGCG AAGGCGACCA CCUGGACUGA UACUGACACU GAGGUGCGAA AGCGUGGGGA GCAAACAGGA UUAGAUACCC UGGUA GUCC ACGCCGUAAA CGAUGUCGAC UAGCCGUUGG GAUCCUUGAG AUCUUAGUGG CGCAGCUAAC GCGAUAAGUC GACCGC CUG GGGAGUACGG CCGCAAGGUU AAAACUCAAA UGAAUUGACG GGGGCCCGCA CAAGCGGUGG AGCAUGUGGU UUAAUUC GA A(2MG)(5MC)AACGCGA AGAACCUUAC CUGGCCUUGA CAUGCUGAGA ACUUUCCAGA GAUGGAUUGG UGCCUUCGGG AACUCAGAC ACAGGUGCUG CAUGGCUGUC GUCAGCUCGU GUCGUGAGAU GUUGGGUUAA GUCCCGUAAC GAGCGCAACC C UUGUCCUU AGUUACCAGC ACCUCGGGUG GGCACUCUAA GGAGACUGCC GGUGACAAAC CGGAGGAAGG UGGGGAUGAC GU CAAGUCA UCAUG(2MG)CCCU UACGGCCAGG GCUACACACG UGCUACAAUG GUCGGUACAA AGGGUUGCCA AGCCGCGAG GUGGAGCUAA UCCCAUAAAA CCGAUCGUAG UCCGGAUCGC AGUCUGCAAC UCGACUGCGU GAAGUCGGAA UCGCUAGUAA UCGUGAAUC AGAAUGUCAC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CG(4OC)CCGUCAC ACCAUGGGAG UGGGUUG CU CCAGAAGUAG CUAGUCUAAC CGCAAGGGGG ACGGUUACCA CGGAGUGAUU CAUGACUGGG GUGAAGUCG(UR3) AACA AGGUA GCCGUAGG(2MG)G (MA6)(MA6)CCUGCGGC UGGAUCACCU CCUUA

GENBANK: GENBANK: CP053028.1

+
分子 #22: P-site initiator tRNA

分子名称: P-site initiator tRNA / タイプ: rna / ID: 22 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 24.846902 KDa
配列文字列:
CGCGGGG(4SU)GG AGCAGCCUGG UAGCUCGUCG GG(5MC)UCAUAAC CCGAAGGUCG UCGG(5MU)(PSU)CAAA UCCG GCCCC CGCAACCA

GENBANK: GENBANK: CP009106.1

+
分子 #23: mRNA

分子名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 23 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Bacteriophage sp. (ファージ)
分子量理論値: 7.804735 KDa
配列文字列:
GGCAAGGAGG UAAAAAUGUU CUAA

+
分子 #25: 23S Ribosomal RNA

分子名称: 23S Ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 25 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
分子量理論値: 937.132125 KDa
配列文字列: GGUCAAGUGA AGAAGCGCAU ACGGUGGAUG CCUUGGCAGU CAGAGGCGAU GAAAGACGUG GUAGCCUGCG AAAAGCUUCG GGGAGUCGG CAAACAGACU UUGAUCCGGA GAUCUCUGAA UGGGGGAACC CACCUAGGAU AACCUAGGUA UCUUGUACUG A AUCCAUAG ...文字列:
GGUCAAGUGA AGAAGCGCAU ACGGUGGAUG CCUUGGCAGU CAGAGGCGAU GAAAGACGUG GUAGCCUGCG AAAAGCUUCG GGGAGUCGG CAAACAGACU UUGAUCCGGA GAUCUCUGAA UGGGGGAACC CACCUAGGAU AACCUAGGUA UCUUGUACUG A AUCCAUAG GUGCAAGAGG CGAACCAGGG GAACUGAAAC AUCUAAGUAC CCUGAGGAAA AGAAAUCAAC CGAGAUUCCC UU AGUAGUG GCGAGCGAAC GGGGAUUAGC CCUUAAGCUU CAUUGAUUUU AGCGGAACGC UCUGGAAAGU GCGGCCAUAG UGG GUGAUA GCCCCGUACG CGAAAGGAUC UUUGAAGUGA AAUCGAGUAG GACGGAGCAC GAGAAACUUU GUCUGAACAU GGGG GGACC AUCCUCCAAG GCUAAAUACU ACUGACUGAC CGAUAGUGAA CCAGUACCGU GAGGGAAAGG CGAAAAGAAC CCCGG AGAG GGGAGUGAAA UAGAACCUGA AACCGUAUGC GUACAAGCAG UGGGAGCCUA CUUGUUAGGU GACUGCGUAC CUUUUG UAU AAUGGGUCAG CGACUUAUAU UCAGUGGCAA GCUUAACCGU AUAGGGUAGG CGUAGCGAAA GCGAGUCUUA AUAGGGC GU UUAGUCGCUG GGUAUAGACC CGAAACCGGG CGAUCUAUCC AUGAGCAGGU UGAAGGUUAG GUAACACUGA CUGGAGGA C CGAACCCACU CCC(1MG)UUGAAA AGGUAGGGGA UGACUUGUGG AUCGGAGUGA AAGGCUAAUC AAGCUCGGAG AUAGC UGGU UCUCCUCGAA AGCUAUUUAG GUAGCGCCUC AUGUAUCACU CUGGGGGGUA GAGCACUGUU UCGGCUAGGG GGUCAU CCC GACUUACCAA ACCGAUGCAA ACUCCGAAUA CCCAGAAGUG CCGAGCAUGG GAGACACACG GCGGGUGCUA ACGUCCG UC GUGAAAAGGG AAACAACCCA GACCGCCAGC UAAGGUCCCA AAGUUGUGGU UAAGUGGUAA ACGAUGUGGG AAGGCUUA G ACAGCUAGGA GGUUGGCUUA GAAGCAGCCA CCCUUUAAAG AAAGCGUAAU AGCUCACUAG UCGAGUCGGC CUGCGCGGA AGAUGUAACG GGGCUCAAAC CACACACCGA AGCUGCGGGU GUCACGUAAG UGACGCGGUA GAGGAGCGUU CUGUAAGCCU GUGAAGGUG AGUUGAGAAG CUUGCUGGAG GUAUCAGAAG UGCGAAUGCU GACAUGAGUA ACGACAAUGG GUGUGAAAAA C ACCCACGC CGAAAGACCA AGGGUUCCUG CGCAACGUUA AUCGACGCAG GGUUAGUCGG UUCCUAAGGC GAGGCUGAAA AG CGUAGUC GAUGGGAAAC AGGUUAAUAU UCCUGUACUU CUGGUUACUG CGAUGGAGGG ACGGAGAAGG CUAGGCCAGC UUG GCGUUG GUUGUCCAAG UUUAAGGUGG UAGGCUGAAA UCUUAGGUAA AUCCGGGGUU UCAAGGCCGA GAGCUGAUGA CGAG UCGUC UUUUAGAUGA CGAAGUGGUU GAUGCCAUGC UUCCAAGAAA AGCUUCUAAG CUUCAGGUAA CCAGGAACCG UACCC CAAA CCGACAC(6MZ)GG UGGUCGGGUA GAGAAUACCA AGGCGCUUGA GAGAACUCGG GUGAAGGAAC UAGGCAAAAU GG CACCGUA ACUUCGGGAG AAGGUGCGCC GGCUAGGGUG AAGGAUUUAC UCCGUAAGCU CUGGCUGGUC GAAGAUACCA GGC CGCUGC GACUGUUUAU UAAAAACACA GCACUCUGCA AACACGAAAG UGGACGUAUA GGGUGUGACG CCU(2MG)CCCGGU GCCGGAAGG UUAAUUGAUG GGGUUAGCGC AAGCGAAGCU CUUGAUCGAA GCCCCGGUAA ACGGCGGCCG UAAC(UR3)AU AA CGGUCCUAAG GUAGCGAAA(5MU) UCCUUGUCGG GUAAGUUCCG AC(5MC)UGCACGA AUGGCGUAAC GAUGGCGGCG CUGUCUCCA CCCGAGACUC AGUGAAAUUG AAAUCGCUGU G(6MZ)AGAUGCAG UGUAUCCGCG GCUAGACGGA AAGACCC CG U(7MG)AACCUUUA CUGUAGCUUU GCACUGGACU UUGAGCCUGC UUGUGUAGGA UAGGUGGGAG GCUUUGAAGC GUGG ACGCC AGUUCGCGUG GAGCCAUCCU UGAAAUACCA CCCUGGCAUG CUUGAGGUUC UAACUCUGGU CCGUAAUCCG GAUCG AGGA CAGUGUAUGG UGGGCAGUUU GACUG(OMG)GGCG GUCUCCUCCU AAAGAGUAAC GGAGGAGUAC GAAGGUGCGC UC AGACCGG UCGGAAAUCG GUCGCAGAGU AUAAAGGCAA AAGCGCGCUU GACUGCGAGA CAGACACGUC GAGCAGGUAC GAA AGUAGG UCUUAGUGAU CCGGUGGUUC UGUAUGGAAG GGCCAUCGCU CAACGGAUAA AAGGUACUCC G(2MG)GGAUAACA GGCUGAUAC CGCCCAAGAG UUCAUAUCGA CGGCGGUGUU UGGCA(OMC)CUCG (2MA)UGUCGGCUC AUCACAUCCU GGG GCUGAA GCCGGUCCCA AGGGUAUGGC (OMU)GUUCGCCAU UUAAAGUGGU ACGCGAGCUG GGUUUAGAAC GUCGUGAGAC AGUUCGGUC CCUAUCUGCC GUGGACGUUU GAGAUUUGAG AGGGGCUGCU CCUAGUACGA GAGGACCGGA GUGGACGAAC C UCUGGUGU UCCGGUUGUC ACGCCAGUGG CAUUGCCGGG UAGCUAUGUU CGGAAAAGAU AACCGCUGAA AGCAUCUAAG CG GGAAACU UGCCUCAAGA UGAGAUCUCA CUGGGAACUU GAUUCCCCUG AAGGGCCGUC GAAGACUACG ACGUUGAUAG GCU GGGUGU GUAAGCGUUG UGAGGCGUUG AGCUAACCAG UACUAAUUGC CCGUGAGGCU UGACCAU

GENBANK: GENBANK: AE004091.2

+
分子 #26: 5S Ribosomal RNA

分子名称: 5S Ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 26 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
分子量理論値: 38.596898 KDa
配列文字列:
UGCUUGACGA UCAUAGAGCG UUGGAACCAC CUGAUCCCUU CCCGAACUCA GAAGUGAAAC GACGCAUCGC CGAUGGUAGU GUGGGGUCU CCCCAUGUGA GAGUAGGUCA UCGUCAAGCU C

GENBANK: GENBANK: CP053028.1

+
分子 #2: 30S ribosomal protein S2

分子名称: 30S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 27.376475 KDa
配列文字列: MSQVNMRDML KAGVHFGHQT RYWNPKMGKF IFGARNKIHI INLEKTLPMF NEALTFVERL AAGKNKILFV GTKRSAGKIV REEAARCGM PYVDHRWLGG MLTNYKTIRQ SIKRLRDLET QSQDGTFDKL TKKEALMRSR DLEKLERSLG GIKDMGGLPD A LFVIDVDH ...文字列:
MSQVNMRDML KAGVHFGHQT RYWNPKMGKF IFGARNKIHI INLEKTLPMF NEALTFVERL AAGKNKILFV GTKRSAGKIV REEAARCGM PYVDHRWLGG MLTNYKTIRQ SIKRLRDLET QSQDGTFDKL TKKEALMRSR DLEKLERSLG GIKDMGGLPD A LFVIDVDH ERIAITEANK LGIPVIGVVD TNSSPEGVDY VIPGNDDAIR AVQLYLNSMA EAVIRGKQGA ATSADEFVEE AP AESAEG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #3: 30S ribosomal protein S3

分子名称: 30S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 25.887152 KDa
配列文字列: MGQKVHPNGI RLGIVKEHTS VWYADRKNYA DYLFADLKVR EYLQDKLKSA SVSRIDIHRP AQTARITIHT ARPGIVIGKK GEDVEKLRQ DLTKQMGVPV HINIEEIRKP ELDAMLVAQS VAQQLERRVM FRRAMKRAVQ NAMRIGAKGI KIQVSGRLGG A EIARTEWY ...文字列:
MGQKVHPNGI RLGIVKEHTS VWYADRKNYA DYLFADLKVR EYLQDKLKSA SVSRIDIHRP AQTARITIHT ARPGIVIGKK GEDVEKLRQ DLTKQMGVPV HINIEEIRKP ELDAMLVAQS VAQQLERRVM FRRAMKRAVQ NAMRIGAKGI KIQVSGRLGG A EIARTEWY REGRVPLHTL RADIDYATYE AHTTYGVIGV KVWIFKGEVI GGRQEELKPV APAPRKKAAR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #4: 30S ribosomal protein S4

分子名称: 30S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 23.31867 KDa
配列文字列: MARYIGPKCK LSRREGTDLF LKSGARALDS KCKAENVPGQ HGQRRGRLSD YGLQLREKQK VRRIYGVLER QFRGYYQEAS RRKGSTGEN LLQLLECRLD NVVYRMGFGS TRSESRQLVS HKAITVNGQT VNIPSYQVKA GDVVAVREKS KNQLRIAQAL E LCGQRGRV ...文字列:
MARYIGPKCK LSRREGTDLF LKSGARALDS KCKAENVPGQ HGQRRGRLSD YGLQLREKQK VRRIYGVLER QFRGYYQEAS RRKGSTGEN LLQLLECRLD NVVYRMGFGS TRSESRQLVS HKAITVNGQT VNIPSYQVKA GDVVAVREKS KNQLRIAQAL E LCGQRGRV EWVEVDLDKK AGTFKSAPAR SDLSADINEN LIVELYSK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #5: 30S ribosomal protein S5

分子名称: 30S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 17.650391 KDa
配列文字列:
MANNEQKRDE GYIEKLVQVN RVAKTVKGGR IFAFTALTVV GDGKGRVGFG RGKAREVPAA IQKAMEAARR NMIQVDLNGT TLQYPTKSA HGASKVYMQP ASEGTGIIAG GAMRAVLEVA GVQNVLAKCY GSTNPVNVVY ATFKGLKNMQ APEAVAAKRG K SVEEIL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5

+
分子 #6: 30S ribosomal protein S6

分子名称: 30S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 16.189689 KDa
配列文字列:
MRHYEIVFLV HPDQSEQVGG MVERYTKAIE EDGGKIHRLE DWGRRQLAYA INNVHKAHYV LMNVECSAKA LAELEDNFRY NDAVIRNLV MRRDEAVTEQ SEMLKAEESR NERRERRERP NDNAEGADGD DNSDSDNADE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS6

+
分子 #7: 30S ribosomal protein S7

分子名称: 30S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 17.541514 KDa
配列文字列:
MPRRRVAAKR EVLADPKYGS QILAKFMNHV MESGKKAVAE RIVYGALDKV KERGKADPLE TFEKALDAIA PLVEVKSRRV GGATYQVPV EVRPSRRNAL AMRWLVDFAR KRGEKSMALR LAGELLDAAE GKGAAVKKRE DVHRMAEANK AFSHYRF

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #8: 30S ribosomal protein S8

分子名称: 30S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 14.190609 KDa
配列文字列:
MSMQDPLADM LTRIRNAQMA EKTVVSMPSS KLKAAVAKVL KDEGYIADFQ ISSEVKPQLS IELKYFEGKP VIEEVKRISR PGLRQYKSV EQLPKVRGGL GVSIVSTNKG VMTDRAARAA GVGGEVLCTV F

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #9: 30S ribosomal protein S9

分子名称: 30S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 14.643844 KDa
配列文字列:
MSATQNYGTG RRKTATARVF LRPGTGKISI NNRGLDQFFG RETARMVVRQ PLELTETVEK FDIFVTVVGG GVSGQAGAIR HGITRALIE YDETLRSSLR KAGYVTRDAR EVERKKVGLR KARKRPQYSK R

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #10: 30S ribosomal protein S10

分子名称: 30S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 11.786605 KDa
配列文字列:
MQNQQIRIRL KAFDHRLIDQ STQEIVETAK RTGAQVRGPI PLPTRKERFT VLISPHVNKD ARDQYEIRTH KRVLDIVQPT DKTVDALMK LDLAAGVEVQ ISLG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10

+
分子 #11: 30S ribosomal protein S11

分子名称: 30S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 13.654687 KDa
配列文字列:
MAKPAARPRK KVKKTVVDGI AHIHASFNNT IVTITDRQGN ALSWATSGGS GFRGSRKSTP FAAQVAAERA GQAALEYGLK NLDVNVKGP GPGRESAVRA LNACGYKIAS ITDVTPIPHN GCRPPKKRRV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #12: 30S ribosomal protein S12

分子名称: 30S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 13.830104 KDa
配列文字列:
MATINQLVRK PRKRMVDKSD VPALQNCPQR RGVCTRVYTT TPKKPNSALR KVCRVRLTNG FEVSSYIGGE GHNLQEHSVV LIRGGRVKD LPGVRYHTVR GSLDTSGVKD RKQGRSKYGA KRPK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #13: 30S ribosomal protein S13

分子名称: 30S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 13.292486 KDa
配列文字列:
MARIAGVNIP DNKHTVISLT YIYGVGRTTA QSICAATGVN PAAKIKDLSD EQIDQLRNEV AKITTEGDLR REINMNIKRL MDLGCYRGL RHRRGLPVRG QRTKTNARTR KGPRKPIRK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #14: 30S ribosomal protein S14

分子名称: 30S ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 11.591508 KDa
配列文字列:
MAKESMKNRE LKRQLTVAKY AKKRAELKAI IANPNSSAEE RWNAQVALQK QPRDASASRL RNRCRLTGRP HGFYRKFGLS RNKLREAAM RGDVPGLVKA SW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #15: 30S ribosomal protein S15

分子名称: 30S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 10.135661 KDa
配列文字列:
MALSVEEKAQ IVNEYKQAEG DTGSPEVQVA LLSANINKLQ DHFKANGKDH HSRRGLIRMV NQRRKLLDYL KGKDVSRYTA LIGRLGLRR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #16: 30S ribosomal protein S16

分子名称: 30S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 9.219454 KDa
配列文字列:
MVTIRLARGG SKKRPFYHLT VTNSRNARDG RFVERIGFFN PVATGGEVRL SVDQERATYW LGQGAQPSER VAQLLKDAAK ANA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS16

+
分子 #17: 30S ribosomal protein S17

分子名称: 30S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 10.10682 KDa
配列文字列:
MAEAQKTVRT LTGRVVSDKM DKTVTVLIER RVKHPIYGKY VKRSTKLHAH DESNQCRIGD LVTIRETRPL AKTKAWTLVD IVERAVEV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #18: 30S ribosomal protein S18

分子名称: 30S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 8.892394 KDa
配列文字列:
MARFFRRRKF CRFTAEGVKE IDYKDLNTLK AYVSETGKIV PSRITGTKAK YQRQLATAIK RARYLALLPY TDSHGR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS18

+
分子 #19: 30S ribosomal protein S19

分子名称: 30S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 10.382331 KDa
配列文字列:
MPRSLKKGPF IDLHLLKKVE VAVEKNDRKP IKTWSRRSMI LPHMVGLTIA VHNGRQHVPV LVNEDMVGHK LGEFAATRTY RGHAADKKA KR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #20: 30S ribosomal protein S20

分子名称: 30S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 9.942673 KDa
配列文字列:
MANTPSAKKR AKQAEKRRSH NASLRSMVRT YIKNVVKAID AKDLEKAQAA FTAAVPVIDR MADKGIIHKN KAARHKSRLS GHIKALSTA AA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS20

+
分子 #21: 30S ribosomal protein S21

分子名称: 30S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 8.508979 KDa
配列文字列:
MPAVKVKENE PFDVALRRFK RSCEKAGVLA EVRSREFYEK PTAERKRKAA AAVKRHAKKV QREQRRRERL Y

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS21

+
分子 #24: Translation initiation factor IF-2

分子名称: Translation initiation factor IF-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
分子量理論値: 91.049641 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MTQVTVKELA QVVDTPVERL LLQMRDAGLP HTSAEQVVTD SEKQALLTHL KGSHGDRASE PRKITLQRKT TTTLKVGGSK TVSVEVRKK KTYVKRSPDE IEAERQRELE EQRAAEEAER LKAEEAAARQ RAEEEARKAE EAARAKAAQE AAATAGAEPA V VADVAVAE ...文字列:
MTQVTVKELA QVVDTPVERL LLQMRDAGLP HTSAEQVVTD SEKQALLTHL KGSHGDRASE PRKITLQRKT TTTLKVGGSK TVSVEVRKK KTYVKRSPDE IEAERQRELE EQRAAEEAER LKAEEAAARQ RAEEEARKAE EAARAKAAQE AAATAGAEPA V VADVAVAE PVAKPAAVEE RKKEEPRRVP KRDEDDDRRD RKHTQHRPSV KEKEKVPAPR VAPRSTDEES DGYRRGGRGG KS KLKKRNQ HGFQNPTGPI VREVNIGETI TVAELAAQMS VKGAEVVKFM FKMGSPVTIN QVLDQETAQL VAEELGHKVK LVS ENALEE QLAESLKFEG EAVTRAPVVT VMGHVDHGKT SLLDYIRRAK VAAGEAGGIT QHIGAYHVET ERGMVTFLDT PGHA AFTAM RARGAQATDI VILVVAADDG VMPQTQEAVQ HAKAAGVPIV VAVNKIDKPE ANPDNIKNGL AALDVIPEEW GGDAP FVPV SAKLGTGVDE LLEAVLLQAE VLELKATPSA PGRGVVVESR LDKGRGPVAT VLVQDGTLRQ GDMVLVGINY GRVRAM LDE NGKPIKEAGP SIPVEILGLD GTPDAGDEMT VVADEKKARE VALFRQGKFR EVKLARAHAG KLENIFENMG QEEKKTL NI VLKADVRGSL EALQGSLSGL GNDEVQVRVV GGGVGGITES DANLALASNA VLFGFNVRAD AGARKIVEAE GLDMRYYN V IYDIIEDVKK ALTGMLGSDL RENILGIAEV RDVFRSPKFG AIAGCMVTEG MVHRNRPIRV LRDDVVIFEG ELESLRRFK DDVAEVRAGM ECGIGVKSYN DVKVGDKIEV FEKVEVARSL

UniProtKB: Translation initiation factor IF-2

+
分子 #27: 50S ribosomal protein L2

分子名称: 50S ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 29.641256 KDa
配列文字列: MAIVKCKPTS AGRRFVVKVV NQELHKGAPY APLLEKKSKS GGRNNNGRIT TRHIGGGHKQ HYRLVDFRRN KDGIPAIVER VEYDPNRTA HIALLKYADG ERRYIIAPKG VAAGDQLISG IGAPIKAGNS MPLRNIPVGS TVHGIELKPG KGAQIARSAG A SAQLVARE ...文字列:
MAIVKCKPTS AGRRFVVKVV NQELHKGAPY APLLEKKSKS GGRNNNGRIT TRHIGGGHKQ HYRLVDFRRN KDGIPAIVER VEYDPNRTA HIALLKYADG ERRYIIAPKG VAAGDQLISG IGAPIKAGNS MPLRNIPVGS TVHGIELKPG KGAQIARSAG A SAQLVARE GAYVTLRLRS GEMRKVLAEC RATLGEVSNS EHSLRSLGKA GATRWRGVRP TVRGVAMNPV DHPHGGGEGR TS AGRHPVS PWGLQTKGKK TRSNKRTDNM IVRRRK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #28: 50S ribosomal protein L3

分子名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 22.625695 KDa
配列文字列: MTIGVVGRKC GMTRIFTEEG VSIPVTVIEV EPNRVTQFKT EETDGYRAVQ VTAGERRASR VTKAQAGHFA KANVAAGRGV WEFRLGEEQ YAAGDQITVD LFQAGQMVDV TGESKGKGFA GTIKRWNFRG QDNTHGNSVS HRVPGSIGQC QTPGRVFKGK K MSGHLGAE ...文字列:
MTIGVVGRKC GMTRIFTEEG VSIPVTVIEV EPNRVTQFKT EETDGYRAVQ VTAGERRASR VTKAQAGHFA KANVAAGRGV WEFRLGEEQ YAAGDQITVD LFQAGQMVDV TGESKGKGFA GTIKRWNFRG QDNTHGNSVS HRVPGSIGQC QTPGRVFKGK K MSGHLGAE RVTVQSLEIV RVDAERNLLL VKGAVPGATG GDVIVRPAAK ARG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #29: 50S ribosomal protein L4

分子名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 21.673939 KDa
配列文字列: MQLNVNGAQA IEVSERTFGG EFNETLVHQA VVAYMAGGRQ GSKAQKTRSE VSGGGKKPWR QKGTGRARAG TIRSPIWRGG GTTFAAKPR SHEQKLNKKM YRAALRSILA ELVRLDRLVV VADFAVDAPK TKGLVAKLDT LGLKDVLIVT DGVDENLYLA A RNLAHVDV ...文字列:
MQLNVNGAQA IEVSERTFGG EFNETLVHQA VVAYMAGGRQ GSKAQKTRSE VSGGGKKPWR QKGTGRARAG TIRSPIWRGG GTTFAAKPR SHEQKLNKKM YRAALRSILA ELVRLDRLVV VADFAVDAPK TKGLVAKLDT LGLKDVLIVT DGVDENLYLA A RNLAHVDV RDVQGSDPVS LIAYDKVLVT VSAVKKFEEL LG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #30: 50S ribosomal protein L5

分子名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 20.42483 KDa
配列文字列:
MARLKEIYRK EIAPKLKEEL QLANVMEVPR VTKITLNMGL GEAVGDKKII ENAVADLEKI TGQKPVVTYA RKSIAGFKIR EGWPIGVKV TLRSDRMYEF LDRLLSISLP RVRDFRGLNA KSFDGRGNYS MGVKEQIIFP EIDYDKIDAL RGLDITLTTT A RTDDEGRA LLRAFKFPFR N

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #31: 50S ribosomal protein L6

分子名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 19.129145 KDa
配列文字列:
MSRVAKNPVK LPAGVEIKLA GQQLSIKGAK GALELKVHPS VEVIQDSGEL RFAARNGDQQ TRAMAGTTRA LVNNMVVGVS QGFERKLQL VGVGYKAQAK GQVLSLSLGF SHPVDYELPA GIVAETPSQT DILIKGIDKQ LVGQVAAEIR DFRPPEPYKG K GVRYADEV VRRKEAKKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #32: 50S ribosomal protein L9

分子名称: 50S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 15.551678 KDa
配列文字列:
MEVILLEKVA NLGNLGDKVN IKGGYARNFL LPQGKATVAT AENVAAFEAR RAELEKAAAE KKAAAEARAA QLSELVVTLG AHAGDEGKL FGSIGTRDIA EAVSAAGYPL EKAEVRLPNG ALRNTGEFDV AVHLHTDVET TLKLIIVAE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9

+
分子 #33: 50S ribosomal protein L10

分子名称: 50S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 17.657279 KDa
配列文字列:
MAIKLEDKKA IVAEVNEAAK AALSAVVADA RGVTVGAMTG LRKEAREAGV YVKVVRNTLL KRAVEGTQFD VLNDVFKGPT LIAFSNEHP GAAARIFREF AKGQDKFEIK AAAFEGQFLA ANQIDVLASL PTYDEAVSQL MSVIQGATSK LARTLAAIRD Q KEAAAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL10

+
分子 #34: 50S ribosomal protein L11

分子名称: 50S ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 14.925123 KDa
配列文字列:
MAKKIQAYIK LQVKAGQANP SPPVGPALGQ HGVNIMEFCK AFNAKTQGQE PGLPTPVIIT VYSDRSFTFE TKSTPAAVLL KKAAGITSG SARPNSQKVG TVTRAQLEEI AKTKQADLTA ADLDAAVRTI AGSARSMGLN VEGV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL11

+
分子 #35: 50S ribosomal protein L13

分子名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 16.058577 KDa
配列文字列:
MKTYTAKPET VQRDWFVVDA AGQTLGRLAT EIARRLRGKH KPEYTPHVDT GDYIVVINAE QVRVTGAKTT DKMYYHHSGF PGGIKSINF EKLIAKAPER VIETAVKGML PKNPLGRDMY RKLKVYKGAS HPHTAQQPQE LKI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #36: 50S ribosomal protein L14

分子名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 13.43591 KDa
配列文字列:
MIQTQSMLDV ADNSGARRVM CIKVLGGSHR RYAGIGDIIK VTVKEAIPRG KVKKGQVMTA VVVRTKHGVR RTDGSIIRFD GNAAVLLNN KQEPIGTRIF GPVTRELRTE KFMKIVSLAP EVL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #37: 50S ribosomal protein L15

分子名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 15.204488 KDa
配列文字列:
MQLNDLRSAP GARREKHRPG RGIGSGLGKT GGRGHKGLTS RSGGKVAPGF EGGQQPLHRR LPKFGFVSLK AMDRAEVRTS ELAKVEGDV VSLQTLKDAN LINQHVQRVK VMLSGEVGRA VTLKGIAATK GARAAIEAAG GKFED

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #38: 50S ribosomal protein L16

分子名称: 50S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 15.434229 KDa
配列文字列:
MLQPKRTKFR KQMTGHNRGL AHRGSKVSFG EYALKATSRG RLTARQIESA RRALTRHVKR GGKIWIRVFP DKPVTKKPLE VRMGKGKGG VEYWVAQIQP GKVLYEIEGV SEELAREAFA LAAAKLPLAT SFVKRTVM

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #39: 50S ribosomal protein L17

分子名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 14.5339 KDa
配列文字列:
MRHRKSGRHL SRTSAHRKAM FQNMAVSLFE HELIKTTLPK AKELRRVAEP LITLAKEDSV ANRRLAFDRT RSKAAVGKLF NDLGKRYAN RPGGYLRILK CGFRAGDNAP MAYVELVDRP VGGEVVEAAE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17

+
分子 #40: 50S ribosomal protein L18

分子名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 12.687666 KDa
配列文字列:
MSVKKETRLR RARKARLKMR ELETVRLCVY RSSQHIYAQV IAADGGKVLA SASTLDKDLR EGATGNIDAA KKVGQLVAER AKAAGVTQV AFDRSGFKYH GRVKALADAA REGGLEF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #41: 50S ribosomal protein L19

分子名称: 50S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 13.055227 KDa
配列文字列:
MTNKIIQQIE AEQMNKEIPA FAPGDTVIVQ VKVKEGDRQR LQAFEGVVIA KRNRGLNSAF TVRKISNGVG VERTFQTYSP IVDSLSVKR RGDVRKAKLY YLRALSGKAA RIKEKLV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19

+
分子 #42: 50S ribosomal protein L20

分子名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 13.397972 KDa
配列文字列:
MARVKRGVIA RRRHKKILKL AKGYYGARSR VFRVAKQAVI KAGQYAYRDR RQRKRQFRAL WIARINAGAR QNGLSYSRLI AGLKKAAIE IDRKVLADLA VNEKAAFTAI VEKAKASLA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20

+
分子 #43: 50S ribosomal protein L21

分子名称: 50S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 11.678621 KDa
配列文字列:
MYAVIVTGGK QHKVTEGEFL KVEKLDVATG EAIDFDRVLL VANGEDVKIG LPVVEGAKVT AEVVSHGRHD KVRIIKFRRR KHHMKRQGH RQWFTEIKIT GIQA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21

+
分子 #44: 50S ribosomal protein L22

分子名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
分子量理論値: 11.935996 KDa
配列文字列:
MEVAAKLSGA RISAQKARLV ADQIRGKKVG EALNLLAFSS KKAAEIMKKV LESAVANAEH NEGADVDDLK VSTVFVNEGR SLKRIMPRA KGRADRIVKR SCHITVKVAD K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #45: 50S ribosomal protein L23

分子名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 10.969714 KDa
配列文字列:
MNQERVFKVL LGPHISEKAT GLADGKSQFV FKVATDATKL EIKKAVESLF SVKVQRVTTL NVKGKTKRTA RGLGKRNDWK KAYIALQPG QDLDFATSAE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #46: 50S ribosomal protein L24

分子名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 11.494491 KDa
配列文字列:
MQKIRRDDEV IVIAGKDKGK RGKVLKVLAD DRLVVGGVNL IKRHTKPNPM LGQQGGIVEK EAPLHVSNVA IFNTETSKAD RVGFKVEDG KKIRVFKSTQ KPVQA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #47: 50S ribosomal protein L25

分子名称: 50S ribosomal protein L25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 21.994242 KDa
配列文字列: MVDFILNAQV RSDLGKGASR RLRRNAGLVP AVVYGGDKEP QSVTLELREI AKLLENEAAF SHVIALNVGG AKETVLIKAL QRHPAKGFV MHADFLRVVA DHKLTAHVPL HFINEEVAVG VKQAGGEISH TISEVEVSCL PKDLPEFIEV DMAKVELGQI V HLSDLKAP ...文字列:
MVDFILNAQV RSDLGKGASR RLRRNAGLVP AVVYGGDKEP QSVTLELREI AKLLENEAAF SHVIALNVGG AKETVLIKAL QRHPAKGFV MHADFLRVVA DHKLTAHVPL HFINEEVAVG VKQAGGEISH TISEVEVSCL PKDLPEFIEV DMAKVELGQI V HLSDLKAP KGVELVQLAH GNDLAVANIH ASRVVKEEGS EEGAAE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL25

+
分子 #48: 50S ribosomal protein L27

分子名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 9.01045 KDa
配列文字列:
MAHKKAGGST RNGRDSESKR LGVKLFGGQA VKAGNILVRQ RGTKFHAGYG VGLGKDHTLF AKVDGVVKFE TKGAFGRKYV SIVAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27

+
分子 #49: 50S ribosomal protein L28

分子名称: 50S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 9.087633 KDa
配列文字列:
MSRVCQVTGK GPVTGNNISH AHNKTRRRFL PNLQHHRFWV ESEKRFVRLR VSAKGMRIID KRGIEAVLAD LRARGEKF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28

+
分子 #50: 50S ribosomal protein L29

分子名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 7.213352 KDa
配列文字列:
MKANELREKS VEQLNEQLLG LLRDQFNLRM QKATGQLGQS HLLSQVKRDI ARVKTVLNQQ AGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #51: 50S ribosomal protein L30

分子名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 6.489644 KDa
配列文字列:
MATVKVTLVK SLNGRLANHK ACVKGLGLRR INHTVEVQDT PENRGMINKA YYLLRVEG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #52: 50S ribosomal protein L31

分子名称: 50S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 7.934208 KDa
配列文字列:
MKADIHPTYE AIEATCSCGN VIKTRSTLCK PIHLDVCSEC HPFYTGKQKV LDTGGRIDRF KQRFGVFGAT K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL31

+
分子 #53: 50S ribosomal protein L32

分子名称: 50S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 6.807571 KDa
配列文字列:
MAVQQNKKSR SARDMRRSHD ALESNALSVE KSTGEVHLRH HVSPDGFYRG RKVVDKGSDE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32

+
分子 #54: 50S ribosomal protein L33

分子名称: 50S ribosomal protein L33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 6.060142 KDa
配列文字列:
MRELIRLVSS AGTGHFYTTD KNKRTKPEKI EIKKYDPVVR QHVIYKEAKI K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33

+
分子 #55: 50S ribosomal protein L34

分子名称: 50S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 5.226309 KDa
配列文字列:
MKRTFQPSTL KRARVHGFRA RMATKNGRQV LSRRRAKGRK RLTV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34

+
分子 #56: 50S ribosomal protein L35

分子名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 7.387996 KDa
配列文字列:
MPKMKTKSGA AKRFKKTAGG LKHKHAFKSH ILTKMTTKRK RQLRGTSMLN KSDVARVERS LRLR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35

+
分子 #57: 50S ribosomal protein L36

分子名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1
分子量理論値: 4.447445 KDa
配列文字列:
MKVRASVKKL CRNCKIIRRD GIVRVICSAE PRHKQRQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36A

+
分子 #58: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 796 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #59: N-FORMYLMETHIONINE

分子名称: N-FORMYLMETHIONINE / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 1 / 式: FME
分子量理論値: 177.221 Da
Chemical component information

ChemComp-FME:
N-FORMYLMETHIONINE / N-ホルミルメチオニン / N-ホルミルメチオニン

+
分子 #60: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER

分子名称: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 1 / 式: GCP
分子量理論値: 521.208 Da
Chemical component information

ChemComp-G2P:
PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER / GMPCPP / GMP-CPP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM

+
分子 #61: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #62: water

分子名称: water / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 352 / 式: HOH
分子量理論値: 18.015 Da
Chemical component information

ChemComp-HOH:
WATER / 水

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.6
グリッドモデル: Quantifoil R2/1 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 85 % / チャンバー内温度: 295 K / 装置: LEICA EM GP

-
電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.1 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.2 µm / 倍率（公称値）: 105000
試料ステージホルダー冷却材: NITROGEN
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 8056 / 平均露光時間: 1.0 sec. / 平均電子線量: 31.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

粒子像選択選択した数: 878576
初期モデルモデルのタイプ: NONE
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 3.1.0)
最終 3次元分類ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 3.1.0)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 3.1.0)
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.6 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 3.1.0) / 使用した粒子像数: 98715

-
原子モデル構築 1

初期モデル
PDB IDChain

6spg

source_name: PDB, initial_model_type: experimental model

3jcj

source_name: PDB, initial_model_type: experimental model
精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
得られたモデル

PDB-7unw:
Pseudomonas aeruginosa 70S ribosome initiation complex bound to IF2-GDPCP (structure II-B)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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