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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-18181 | |||||||||
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タイトル | Early closed conformation of the g-tubulin ring complex | |||||||||
マップデータ | Refined map of the early closed gTuRC-MT conformation | |||||||||
試料 |
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キーワード | Microtubule (微小管) / cytoskeleton (細胞骨格) / g-tubulin ring complex / tubulin (チューブリン) / STRUCTURAL PROTEIN (タンパク質) | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 equatorial microtubule organizing center / microtubule minus-end binding / mitotic spindle microtubule / gamma-tubulin ring complex / polar microtubule / gamma-tubulin complex / meiotic spindle organization / microtubule nucleation / non-motile cilium / gamma-tubulin binding ...equatorial microtubule organizing center / microtubule minus-end binding / mitotic spindle microtubule / gamma-tubulin ring complex / polar microtubule / gamma-tubulin complex / meiotic spindle organization / microtubule nucleation / non-motile cilium / gamma-tubulin binding / 微小管形成中心 / 中心体マトリックス / cytoplasmic microtubule / cell leading edge / mitotic sister chromatid segregation / single fertilization / spindle assembly / cytoplasmic microtubule organization / Loss of Nlp from mitotic centrosomes / Loss of proteins required for interphase microtubule organization from the centrosome / Recruitment of mitotic centrosome proteins and complexes / Recruitment of NuMA to mitotic centrosomes / Anchoring of the basal body to the plasma membrane / 中心小体 / AURKA Activation by TPX2 / mitotic spindle organization / ciliary basal body / meiotic cell cycle / condensed nuclear chromosome / neuron migration / brain development / recycling endosome / structural constituent of cytoskeleton / microtubule cytoskeleton organization / 紡錘体 / spindle / microtubule cytoskeleton / Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition / apical part of cell / mitotic cell cycle / microtubule binding / protein-containing complex assembly / 微小管 / neuron projection / 中心体 / GTP binding / structural molecule activity / 核質 / 生体膜 / identical protein binding / 細胞核 / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.72 Å | |||||||||
データ登録者 | Llorca O / Serna M / Fernandez-Leiro R | |||||||||
資金援助 | スペイン, European Union, 2件
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引用 | ジャーナル: Science / 年: 2024 タイトル: Transition of human γ-tubulin ring complex into a closed conformation during microtubule nucleation. 著者: Cláudia Brito / Marina Serna / Pablo Guerra / Oscar Llorca / Thomas Surrey / 要旨: Microtubules are essential for intracellular organization and chromosome segregation. They are nucleated by the γ-tubulin ring complex (γTuRC). However, isolated vertebrate γTuRC adopts an open ...Microtubules are essential for intracellular organization and chromosome segregation. They are nucleated by the γ-tubulin ring complex (γTuRC). However, isolated vertebrate γTuRC adopts an open conformation that deviates from the microtubule structure, raising the question of the nucleation mechanism. In this study, we determined cryo-electron microscopy structures of human γTuRC bound to a nascent microtubule. Structural changes of the complex into a closed conformation ensure that γTuRC templates the 13-protofilament microtubules that exist in human cells. Closure is mediated by a latch that interacts with incorporating tubulin, making it part of the closing mechanism. Further rearrangements involve all γTuRC subunits and the removal of the actin-containing luminal bridge. Our proposed mechanism of microtubule nucleation by human γTuRC relies on large-scale structural changes that are likely the target of regulation in cells. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
添付画像 |
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-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_18181.map.gz | 242 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-18181-v30.xml emd-18181.xml | 46.9 KB 46.9 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
FSC (解像度算出) | emd_18181_fsc.xml | 15.2 KB | 表示 | FSCデータファイル |
画像 | emd_18181.png | 131 KB | ||
マスクデータ | emd_18181_msk_1.map | 303.3 MB | マスクマップ | |
Filedesc metadata | emd-18181.cif.gz | 10.2 KB | ||
その他 | emd_18181_additional_1.map.gz emd_18181_additional_2.map.gz emd_18181_additional_3.map.gz emd_18181_additional_4.map.gz emd_18181_additional_5.map.gz emd_18181_additional_6.map.gz emd_18181_additional_7.map.gz emd_18181_half_map_1.map.gz emd_18181_half_map_2.map.gz | 284 MB 269.7 MB 284 MB 8.9 MB 8.9 MB 8.9 MB 8.9 MB 242.5 MB 242.6 MB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-18181 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-18181 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 8q62MC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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「今月の分子」の関連する項目 |
-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_18181.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 303.3 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Refined map of the early closed gTuRC-MT conformation | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.36754 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
+マスク #1
+追加マップ: Refined and sharpened map of the early closed gTuRC-MT conformation
+追加マップ: Refined and sharpened map of the early closed...
+追加マップ: Refined and sharpened map of the early closed...
+追加マップ: CryoDRGN volume 6
+追加マップ: CryoDRGN volume 5
+追加マップ: CryoDRGN volume 3
+追加マップ: CryoDRGN volume 1
+ハーフマップ: Half map 1 of the refined map of...
+ハーフマップ: Half map 2 of the refined map of...
-試料の構成要素
-全体 : gamma-tubulin ring complex
全体 | 名称: gamma-tubulin ring complex |
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要素 |
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-超分子 #1: gamma-tubulin ring complex
超分子 | 名称: gamma-tubulin ring complex / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #2-#4, #1, #6 |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
-分子 #1: Tubulin gamma-1 chain
分子 | 名称: Tubulin gamma-1 chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 14 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 51.22777 KDa |
配列 | 文字列: MPREIITLQL GQCGNQIGFE FWKQLCAEHG ISPEGIVEEF ATEGTDRKDV FFYQADDEHY IPRAVLLDLE PRVIHSILNS PYAKLYNPE NIYLSEHGGG AGNNWASGFS QGEKIHEDIF DIIDREADGS DSLEGFVLCH SIAGGTGSGL GSYLLERLND R YPKKLVQT ...文字列: MPREIITLQL GQCGNQIGFE FWKQLCAEHG ISPEGIVEEF ATEGTDRKDV FFYQADDEHY IPRAVLLDLE PRVIHSILNS PYAKLYNPE NIYLSEHGGG AGNNWASGFS QGEKIHEDIF DIIDREADGS DSLEGFVLCH SIAGGTGSGL GSYLLERLND R YPKKLVQT YSVFPNQDEM SDVVVQPYNS LLTLKRLTQN ADCVVVLDNT ALNRIATDRL HIQNPSFSQI NQLVSTIMSA ST TTLRYPG YMNNDLIGLI ASLIPTPRLH FLMTGYTPLT TDQSVASVRK TTVLDVMRRL LQPKNVMVST GRDRQTNHCY IAI LNIIQG EVDPTQVHKS LQRIRERKLA NFIPWGPASI QVALSRKSPY LPSAHRVSGL MMANHTSISS LFERTCRQYD KLRK REAFL EQFRKEDMFK DNFDEMDTSR EIVQQLIDEY HAATRPDYIS WGTQEQ UniProtKB: Tubulin gamma-1 chain |
-分子 #2: Gamma-tubulin complex component 5
分子 | 名称: Gamma-tubulin complex component 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 118.467547 KDa |
配列 | 文字列: MARHGPPWSR LDAQQERDVR ELVRGVAGLQ DEADPNFQLA LNFAWSNFRF HRFLDVNSHK IEKTIEGIYE KFVIHSDLSK AASWKRLTE EFLNAPLPSI KEIKTDAHYS ILSLLLCLSD SPSNSSYVET PRNKEVEKKD DFDWGKYLME DEEMDIGPYM D TPNWSEES ...文字列: MARHGPPWSR LDAQQERDVR ELVRGVAGLQ DEADPNFQLA LNFAWSNFRF HRFLDVNSHK IEKTIEGIYE KFVIHSDLSK AASWKRLTE EFLNAPLPSI KEIKTDAHYS ILSLLLCLSD SPSNSSYVET PRNKEVEKKD DFDWGKYLME DEEMDIGPYM D TPNWSEES EEENDQQPLS REDSGIQVDR TPLEEQDQNR KLDPCISWKD EPDDRSWLEH HVVHQYWTAR PSQFPHSLHL HS NLAAVWD QHLYSSDPLY VPDDRVLVTE TQVIRETLWL LSGVKKLFIF QLIDGKVTVR NNIIVTHLTH SCLRSVLEQI AAY GQVVFR LQEFIDEVMG HSSESMLPGS GSVPKKSTEA PFRTYQAFMW ALYKYFISFK EELAEIEKCI INNDTTITLA IVVD KLAPR LSQLKVLHKV FSTGVAEVPP DTRNVVRASH LLNTLYKAIL EYDNVGEASE QTVSLLFSLW VETVRPYLQT VDEWI VHGH LWDGAREFII QRNKNVPVNH RDFWYATYTL YSVSEKTENE EKMSDNASAS SGSDQGPSSR QHTMVSFLKP VLKQII MAG KSMQLLKNLQ CAESTTCQAG ARDAERKSLY TLFLESVQSR LRHGEDSTPQ VLTEQQATKE NLMKMQSIAE SHLELDD VH DPLLAINFAR MYLEQSDFHE KFAGGDVCVD RSSESVTCQT FELTLRSCLY PHIDKQYLDC CGNLMQTLKK DYRLVEYL Q AMRNFFLMEG GDTMYDFYTS IFDKIREKET WQNVSFLNVQ LQEAVGQRYP EDSSRLSISF ENVDTAKKKL PVHILDGLT LSYKVPWPVD IVISLECQKI YNQVFLLLLQ IKWAKYSLDV LLFGELVSTA EKPRLKEGLI HEQDTVAQFG PQKEPVRQQI HRMFLLRVK LMHFVNSLHN YIMTRILHST GLEFQHQVEE AKDLDQLIKI HYRYLSTIHD RCLLREKVSF VKEAIMKVLN L ALMFADGW QAGLGTWRME SIEKMESDFK NCHMFLVTIL NKAVCRGSFP HLESLALSLM AGMEQS UniProtKB: Gamma-tubulin complex component 5 |
-分子 #3: Gamma-tubulin complex component 4
分子 | 名称: Gamma-tubulin complex component 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 76.179969 KDa |
配列 | 文字列: MIHELLLALS GYPGSIFTWN KRSGLQVSQD FPFLHPSETS VLNRLCRLGT DYIRFTEFIE QYTGHVQQQD HHPSQQGQGG LHGIYLRAF CTGLDSVLQP YRQALLDLEQ EFLGDPHLSI SHVNYFLDQF QLLFPSVMVV VEQIKSQKIH GCQILETVYK H SCGGLPPV ...文字列: MIHELLLALS GYPGSIFTWN KRSGLQVSQD FPFLHPSETS VLNRLCRLGT DYIRFTEFIE QYTGHVQQQD HHPSQQGQGG LHGIYLRAF CTGLDSVLQP YRQALLDLEQ EFLGDPHLSI SHVNYFLDQF QLLFPSVMVV VEQIKSQKIH GCQILETVYK H SCGGLPPV RSALEKILAV CHGVMYKQLS AWMLHGLLLD QHEEFFIKQG PSSGNVSAQP EEDEEDLGIG GLTGKQLREL QD LRLIEEE NMLAPSLKQF SLRVEILPSY IPVRVAEKIL FVGESVQMFE NQNVNLTRKG SILKNQEDTF AAELHRLKQQ PLF SLVDFE QVVDRIRSTV AEHLWKLMVE ESDLLGQLKI IKDFYLLGRG ELFQAFIDTA QHMLKTPPTA VTEHDVNVAF QQSA HKVLL DDDNLLPLLH LTIEYHGKEH KADATQAREG PSRETSPREA PASGWAALGL SYKVQWPLHI LFTPAVLEKY NVVFK YLLS VRRVQAELQH CWALQMQRKH LKSNQTDAIK WRLRNHMAFL VDNLQYYLQV DVLESQFSQL LHQINSTRDF ESIRLA HDH FLSNLLAQSF ILLKPVFHCL NEILDLCHSF CSLVSQNLGP LDERGAAQLS ILVKGFSRQS SLLFKILSSV RNHQINS DL AQLLLRLDYN KYYTQAGGTL GSFGM UniProtKB: Gamma-tubulin complex component 4 |
-分子 #4: Gamma-tubulin complex component 3
分子 | 名称: Gamma-tubulin complex component 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 103.710102 KDa |
配列 | 文字列: MATPDQKSPN VLLQNLCCRI LGRSEADVAQ QFQYAVRVIG SNFAPTVERD EFLVAEKIKK ELIRQRREAD AALFSELHRK LHSQGVLKN KWSILYLLLS LSEDPRRQPS KVSSYATLFA QALPRDAHST PYYYARPQTL PLSYQDRSAQ SAQSSGSVGS S GISSIGLC ...文字列: MATPDQKSPN VLLQNLCCRI LGRSEADVAQ QFQYAVRVIG SNFAPTVERD EFLVAEKIKK ELIRQRREAD AALFSELHRK LHSQGVLKN KWSILYLLLS LSEDPRRQPS KVSSYATLFA QALPRDAHST PYYYARPQTL PLSYQDRSAQ SAQSSGSVGS S GISSIGLC ALSGPAPAPQ SLLPGQSNQA PGVGDCLRQQ LGSRLAWTLT ANQPSSQATT SKGVPSAVSR NMTRSRREGD TG GTMEITE AALVRDILYV FQGIDGKNIK MNNTENCYKV EGKANLSRSL RDTAVRLSEL GWLHNKIRRY TDQRSLDRSF GLV GQSFCA ALHQELREYY RLLSVLHSQL QLEDDQGVNL GLESSLTLRR LLVWTYDPKI RLKTLAALVD HCQGRKGGEL ASAV HAYTK TGDPYMRSLV QHILSLVSHP VLSFLYRWIY DGELEDTYHE FFVASDPTVK TDRLWHDKYT LRKSMIPSFM TMDQS RKVL LIGKSINFLH QVCHDQTPTT KMIAVTKSAE SPQDAADLFT DLENAFQGKI DAAYFETSKY LLDVLNKKYS LLDHMQ AMR RYLLLGQGDF IRHLMDLLKP ELVRPATTLY QHNLTGILET AVRATNAQFD SPEILRRLDV RLLEVSPGDT GWDVFSL DY HVDGPIATVF TRECMSHYLR VFNFLWRAKR MEYILTDIRK GHMCNAKLLR NMPEFSGVLH QCHILASEMV HFIHQMQY Y ITFEVLECSW DELWNKVQQA QDLDHIIAAH EVFLDTIISR CLLDSDSRAL LNQLRAVFDQ IIELQNAQDA IYRAALEEL QRRLQFEEKK KQREIEGQWG VTAAEEEEEN KRIGEFKESI PKMCSQLRIL THFYQGIVQQ FLVLLTTSSD ESLRFLSFRL DFNEHYKAR EPRLRVSLGT RGRRSSHT UniProtKB: Gamma-tubulin complex component 3 |
-分子 #5: Gamma-tubulin complex component 2
分子 | 名称: Gamma-tubulin complex component 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 102.666953 KDa |
配列 | 文字列: MSEFRIHHDV NELLSLLRVH GGDGAEVYID LLQKNRTPYV TTTVSAHSAK VKIAEFSRTP EDFLKKYDEL KSKNTRNLDP LVYLLSKLT EDKETLQYLQ QNAKERAELA AAAVGSSTTS INVPAAASKI SMQELEELRK QLGSVATGST LQQSLELKRK M LRDKQNKK ...文字列: MSEFRIHHDV NELLSLLRVH GGDGAEVYID LLQKNRTPYV TTTVSAHSAK VKIAEFSRTP EDFLKKYDEL KSKNTRNLDP LVYLLSKLT EDKETLQYLQ QNAKERAELA AAAVGSSTTS INVPAAASKI SMQELEELRK QLGSVATGST LQQSLELKRK M LRDKQNKK NSGQHLPIFP AWVYERPALI GDFLIGAGIS TDTALPIGTL PLASQESAVV EDLLYVLVGV DGRYVSAQPL AG RQSRTFL VDPNLDLSIR ELVHRILPVA ASYSAVTRFI EEKSSFEYGQ VNHALAAAMR TLVKEHLILV SQLEQLHRQG LLS LQKLWF YIQPAMRTMD ILASLATSVD KGECLGGSTL SLLHDRSFSY TGDSQAQELC LYLTKAASAP YFEVLEKWIY RGII HDPYS EFMVEEHELR KERIQEDYND KYWDQRYTIV QQQIPSFLQK MADKILSTGK YLNVVRECGH DVTCPVAKEI IYTLK ERAY VEQIEKAFNY ASKVLLDFLM EEKELVAHLR SIKRYFLMDQ GDFFVHFMDL AEEELRKPVE DITPPRLEAL LELALR MST ANTDPFKDDL KIDLMPHDLI TQLLRVLAIE TKQEKAMAHA DPTELALSGL EAFSFDYIVK WPLSLIINRK ALTRYQM LF RHMFYCKHVE RQLCSVWISN KTAKQHSLHS AQWFAGAFTL RQRMLNFVQN IQYYMMFEVM EPTWHILEKN LKSASNID D VLGHHTGFLD TCLKDCMLTN PELLKVFSKL MSVCVMFTNC MQKFTQSMKL DGELGGQTLE HSTVLGLPAG AEERARKEL ARKHLAEHAD TVQLVSGFEA TINKFDKNFS AHLLDLLARL SIYSTSDCEH GMASVISRLD FNGFYTERLE RLSAERSQKA TPQVPVLRG PPAPAPRVAV TAQ UniProtKB: Gamma-tubulin complex component 2 |
-分子 #6: Gamma-tubulin complex component 6
分子 | 名称: Gamma-tubulin complex component 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 200.733641 KDa |
配列 | 文字列: MASITQLFDD LCEALLPAAK THLGQRSVNR KRAKRSLKKV AYNALFTNLF QDETQQLQPD MSKLPARNKI LMLSFDLRVG GLGPKADRL EELVEELEAA PCCPLLEVGS VLDLLVQLAG SGPPQVLPRK RDYFLNNKHV GRNVPYSGYD CDDLSVFEMD V QSLISREE ...文字列: MASITQLFDD LCEALLPAAK THLGQRSVNR KRAKRSLKKV AYNALFTNLF QDETQQLQPD MSKLPARNKI LMLSFDLRVG GLGPKADRL EELVEELEAA PCCPLLEVGS VLDLLVQLAG SGPPQVLPRK RDYFLNNKHV GRNVPYSGYD CDDLSVFEMD V QSLISREE CLCHSMIQET LQVMEAAPGT GLPTVGLFSF GDPCGDRFER DTRVSLFGAL VHSRTYDMDV RLGLPPVPDN AD LSGLAIK VPPSVDQWED EGFQSASNLT PDSQSEPSVT PDVDLWEAAL TYEASKRRCW ERVGCPPGHR EEPYLTEAGR DAF DKFCRL HQGELQLLAG GVLQAPQPVL VKECELVKDV LNVLIGVVSA TFSLCQPAQA FVVKRGVHVS GASPESISSL LSEV AEYGT CYTRLSHFSL QPVLDSLYSK GLVFQAFTSG LRRYLQYYRA CVLSTPPTLS LLTIGFLFKK LGRQLRYLAE LCGVG AVLP GTCGGGPRAA FPTGVKLLSY LYQEALHNCS NEHYPVLLSL LKTSCEPYTR FIHDWVYSGV FRDAYGEFMI QVNHEY LSF RDKLYWTHGY VLISKEVEDC VPVFLKHIAH DIYVCGKTIN LLKLCCPRHY LCWSDVPVPR ISVIFSLEEL KEIEKDC AV YVGRMERVAR HSSVSKEEKE LRMEIAKQEL IAHAREAASR VLSALSDRQM SERMALDARK REQFQRLKEQ FVKDQERR Q AARQEELDDD FSYARELRDR ERRLKSLEEE LERKARQALV DHYSKLSAEA ARREQKALWR IQRHRLESAR LRFLLEDEK HIQEMLKAVS EAHQPQEPPD VLLSVHPQVT SPGPEHPEGG QGCDSGSAEQ HSPAWDGWNR PGLLTPQPLK PLAVGAGGRG LQQAEGARP FSDSLSIGDF LPVGPGAEPS VQTGMVPLLE VALQTINLDL PPSAPGEAPA AASTQPSRPQ EYDFSTVLRP A VATSPAPG PLQAAECSLG SSGLQLWEDS CGKMDACGSA SRETLLPSHP PRRAALEEGS SQPTERLFGQ VSGGGLPTGD YA SEIAPTR PRWNTHGHVS DASIRVGENV SDVAPTQPRW NTHGHVSNAS ISLGESVSDV APTRPRWNIH GHVSNASIRV GEN VSDVAP TRPRWNTHGH VSNASIRVGE NVSDVAPTRP RWNTHGHVSD ASISLGESVS DMAPARPRWN THGHVSDASI SLGE SVSDM APTRPRWNTH GHVSDTSIRV GENVSDVAPI RSRCNTHGHV SDASISLGEP VSDVVSTRPR WNTHVPIPPP HMVLG ALSP EAEPNTPRPQ QSPPGHTSQS ALSLGAQSTV LDCGPRLPVE VGPSLSSPSS GCGEGSISVG ENVSDVAPTQ PWWPNT PGD SVSEELGPGR SGDTEDLSPN WPLNSQEDTA AQSSPGRGEE AEASAAEAQG GEQAYLAGLA GQYHLERYPD SYESMSE PP IAHLLRPVLP RAFAFPVDPQ VQSAADETAV QLSELLTLPV LMKRSITAPL AAHISLVNKA AVDYFFVELH LEAHYEAL R HFLLMEDGEF AQSLSDLLFE KLGAGQTPGE LLNPLVLNSV LSKALQCSLH GDTPHASNLS LALKYLPEVF APNAPDVLS CLELRYKVDW PLNIVITEGC VSKYSGVFSF LLQLKLMMWA LKDVCFHLKR TALLSHMAGS VQFRQLQLFK HEMQHFVKVI QGYIANQIL HVTWCEFRAR LATVGDLEEI QRAHAEYLHK AVFRGLLTEK AAPVMNVIHS IFSLVLKFRS QLISQAWGPP G GPRGAEHP NFALMQQSYN TFKYYSHFLF KVVTKLVNRG YQPHLEDFLL RINFNNYYQD A UniProtKB: Gamma-tubulin complex component 6 |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-試料調製
緩衝液 | pH: 6.9 |
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グリッド | モデル: Quantifoil R2/1 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 45 sec. / 前処理 - 雰囲気: AIR / 詳細: 15 mA |
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 90 % / チャンバー内温度: 310 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | C2レンズ絞り径: 50.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス(公称値): 2.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm / 倍率(公称値): 130000 |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 46276 / 平均露光時間: 1.3 sec. / 平均電子線量: 46.276 e/Å2 |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |