ChemComp-BGI: (2S)-{[(2S,3S,4S)-2-amino-4-hydroxy-4-(5-hydroxypyridin-2-yl)-3-m...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: BGI
• 名称: 名称: (2S)-{[(2S,3S,4S)-2-amino-4-hydroxy-4-(5-hydroxypyridin-2-yl)-3-methylbutanoyl]amino}[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]acetic acid (non-preferred name); 別称: Nikkomycin Z / 日化辞名称: ニッコマイシンZ
• ウィキペディア: ウィキペディア - Nikkomycin: Nikkomycins are a group of antifungal medications. They work by interfering with the building of the fungal cell wall which results in the fungal cell breaking open...
• コメント: 薬剤, 抗真菌剤*YM

Chemical information

組成

組成式: C₂₀H₂₅N₅O₁₀ / 原子数: 60 / 化学式量: 495.44 / 形式電荷: 0

その他

7stn

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: BGI / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 7STN

履歴

作成	2021年11月15日
公開	2022年7月13日

• 外部リンク: UniChem / BindingDB / Brenda / ChEBI / ChEMBL / DrugBank / NMRShiftDB / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: Oc1ccc(nc1)C(O)C(C)C(N)C(=O)NC(C1OC(N2C=CC(=O)NC2=O)C(O)C1O)C(=O)O
• CACTVS 3.385: C[CH]([CH](N)C(=O)N[CH]([CH]1O[CH]([CH](O)[CH]1O)N2C=CC(=O)NC2=O)C(O)=O)[CH](O)c3ccc(O)cn3
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CC(C(c1ccc(cn1)O)O)C(C(=O)NC(C2C(C(C(O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)C(=O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: C[C@@H]([C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1O)N2C=CC(=O)NC2=O)C(O)=O)[C@H](O)c3ccc(O)cn3
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: C[C@H]([C@@H](c1ccc(cn1)O)O)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)C(=O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C20H25N5O10/c1-7(13(28)9-3-2-8(26)6-22-9)11(21)17(31)24-12(19(32)33)16-14(29)15(30)18(35-16)25-5-4-10(27)23-20(25)34/h2-7,11-16,18,26,28-30H,21H2,1H3,(H,24,31)(H,32,33)(H,23,27,34)/t7-,11-,12-,13-,14-,15+,16+,18+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: WWJFFVUVFNBJTN-VHDFTHOZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2S)-{[(2S,3S,4S)-2-amino-4-hydroxy-4-(5-hydroxypyridin-2-yl)-3-methylbutanoyl]amino}[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]acetic acid (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: (2~{S})-2-[[(2~{S},3~{S},4~{S})-2-azanyl-3-methyl-4-oxidanyl-4-(5-oxidanylpyridin-2-yl)butanoyl]amino]-2-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]ethanoic acid

PDBエントリ

全4件を表示しています

PDB-7stn:
Chitin Synthase 2 from Candida albicans bound to Nikkomycin Z

PDB-7wjo:
CryoEM structure of chitin synthase 1 from Phytophthora sojae complexed with nikkomycin Z

PDB-7xs6:
structure of a membrane-integrated glycosyltransferase with inhibitor

PDB-8k3x:
S. cerevisiae Chs1 in complex with Nikkomycin Z