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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of the 48-nm repeat doublet microtubule from mouse sperm | |||||||||
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![]() | doublet microtubule / ![]() | |||||||||
機能・相同性 | ![]() male germ-line stem cell population maintenance / sperm flagellum assembly / outer dense fiber / axonemal A tubule inner sheath / manchette assembly / outer acrosomal membrane / axonemal B tubule inner sheath / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Zhou LN / Gui M / Wu JP | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structures of sperm flagellar doublet microtubules expand the genetic spectrum of male infertility. 著者: Lunni Zhou / Haobin Liu / Siyu Liu / Xiaoyu Yang / Yue Dong / Yun Pan / Zhuang Xiao / Beihong Zheng / Yan Sun / Pengyu Huang / Xixi Zhang / Jin Hu / Rui Sun / Shan Feng / Yi Zhu / Mingxi Liu ...著者: Lunni Zhou / Haobin Liu / Siyu Liu / Xiaoyu Yang / Yue Dong / Yun Pan / Zhuang Xiao / Beihong Zheng / Yan Sun / Pengyu Huang / Xixi Zhang / Jin Hu / Rui Sun / Shan Feng / Yi Zhu / Mingxi Liu / Miao Gui / Jianping Wu / ![]() 要旨: Sperm motility is crucial for successful fertilization. Highly decorated doublet microtubules (DMTs) form the sperm tail skeleton, which propels the movement of spermatozoa. Using cryo-electron ...Sperm motility is crucial for successful fertilization. Highly decorated doublet microtubules (DMTs) form the sperm tail skeleton, which propels the movement of spermatozoa. Using cryo-electron microscopy (cryo-EM) and artificial intelligence (AI)-based modeling, we determined the structures of mouse and human sperm DMTs and built an atomic model of the 48-nm repeat of the mouse sperm DMT. Our analysis revealed 47 DMT-associated proteins, including 45 microtubule inner proteins (MIPs). We identified 10 sperm-specific MIPs, including seven classes of Tektin5 in the lumen of the A tubule and FAM166 family members that bind the intra-tubulin interfaces. Interestingly, the human sperm DMT lacks some MIPs compared with the mouse sperm DMT. We also discovered variants in 10 distinct MIPs associated with a subtype of asthenozoospermia characterized by impaired sperm motility without evident morphological abnormalities. Our study highlights the conservation and tissue/species specificity of DMTs and expands the genetic spectrum of male infertility. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 325.1 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 76 KB 76 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 153.3 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8iyjMC C: 同じ文献を引用 ( M: このマップから作成された原子モデル |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.087 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
+全体 : Mouse sperm DMT
+超分子 #1: Mouse sperm DMT
+分子 #1: Cilia- and flagella-associated protein 95
+分子 #2: EF-hand domain-containing family member B
+分子 #3: Cilia- and flagella-associated protein 53
+分子 #4: Nucleoside diphosphate kinase 7
+分子 #5: Cilia- and flagella-associated protein 107
+分子 #6: Cilia- and flagella-associated protein 141
+分子 #7: Tektin-1
+分子 #8: Tubulin alpha-3 chain
+分子 #9: Tubulin beta-4B chain
+分子 #10: Meiosis-specific nuclear structural protein 1
+分子 #11: Tektin-2
+分子 #12: Tektin-3
+分子 #13: Sperm-associated antigen 8
+分子 #14: Tektin-4
+分子 #15: Cilia- and flagella-associated protein 161
+分子 #16: Piercer of microtubule wall 2 protein
+分子 #17: Protein FAM166A
+分子 #18: Cilia- and flagella-associated protein 68
+分子 #19: Cilia and flagella-associated protein 77
+分子 #20: Family with sequence similarity 183, member B
+分子 #21: Cilia- and flagella-associated protein 90
+分子 #22: Protein FAM166C
+分子 #23: RIB43A-like with coiled-coils protein 1
+分子 #24: Dual specificity phosphatase 21
+分子 #25: EF-hand domain-containing protein 1
+分子 #26: Testis expressed 49
+分子 #27: Testis-expressed sequence 37 protein
+分子 #28: Tektin bundle-interacting protein 1
+分子 #29: RIB43A-like with coiled-coils protein 2
+分子 #30: Tektin-5
+分子 #31: EF-hand domain-containing family member C2
+分子 #32: Spermatid-specific manchette-related protein 1
+分子 #33: Protein phosphatase 1 regulatory subunit 32
+分子 #34: Testis-specific serine/threonine-protein kinase 6
+分子 #35: Cilia- and flagella-associated protein 20
+分子 #36: Outer dense fiber protein 3
+分子 #37: Parkin coregulated gene protein homolog
+分子 #38: Testis, prostate and placenta-expressed protein
+分子 #39: Cilia- and flagella-associated protein 45
+分子 #40: Uncharacterized protein C10orf82 homolog
+分子 #41: Coiled-coil domain-containing protein 105
+分子 #42: Cilia- and flagella-associated protein 52
+分子 #43: Enkurin
+分子 #44: Testis-expressed protein 43
+分子 #45: Protein Flattop
+分子 #46: EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6
+分子 #47: Cilia- and flagella-associated protein 210
+分子 #48: Cilia- and flagella-associated protein 276
+分子 #49: Piercer of microtubule wall 1 protein
+分子 #50: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
+分子 #51: MAGNESIUM ION
+分子 #52: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | filament |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 実像数: 25135 / 平均露光時間: 2.56 sec. / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: EMDB MAP EMDB ID: |
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初期 角度割当 | タイプ: NOT APPLICABLE |
最終 角度割当 | タイプ: NOT APPLICABLE |
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.5 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 95290 |