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- EMDB-31498: PSI-NDH supercomplex of Barley -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-31498
タイトルPSI-NDH supercomplex of Barley
マップデータ
試料
  • 複合体: PSI-NDH supercomplex of Barley
    • タンパク質・ペプチド: x 42種
  • リガンド: x 12種
機能・相同性
機能・相同性情報


NADH dehydrogenase complex (plastoquinone) assembly / photosynthesis, light harvesting / チラコイド / トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う / chloroplast thylakoid lumen / photosynthesis, light harvesting in photosystem I / photosystem II oxygen evolving complex / photosystem I reaction center / : / 光化学系I ...NADH dehydrogenase complex (plastoquinone) assembly / photosynthesis, light harvesting / チラコイド / トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う / chloroplast thylakoid lumen / photosynthesis, light harvesting in photosystem I / photosystem II oxygen evolving complex / photosystem I reaction center / : / 光化学系I / chloroplast envelope / 光化学系I / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H, quinone or similar compound as acceptor / 光化学系II / photosynthetic electron transport in photosystem I / extrinsic component of membrane / chlorophyll binding / photosynthesis, light reaction / iron-sulfur cluster binding / chloroplast thylakoid membrane / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / response to light stimulus / quinone binding / defense response to fungus / ATP synthesis coupled electron transport / catalytic activity / 光合成 / 葉緑体 / プロリルイソメラーゼ / peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity / ミトコンドリア / NAD binding / フォールディング / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / carbohydrate binding / response to oxidative stress / membrane => GO:0016020 / electron transfer activity / carbohydrate metabolic process / oxidoreductase activity / iron ion binding / calcium ion binding / magnesium ion binding / metal ion binding
類似検索 - 分子機能
Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 5, chloroplastic / 4Fe-4S dicluster domain / : / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chloroplast chain 5, C-terminal / NADH-dehyrogenase subunit F, TMs, (complex I) C-terminus / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L / NAD(P)H-quinone oxidoreductase, subunit N / NADH-quinone oxidoreductase chain 4 / Cyanobacterial and plastid NDH-1 subunit M ...Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 5, chloroplastic / 4Fe-4S dicluster domain / : / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chloroplast chain 5, C-terminal / NADH-dehyrogenase subunit F, TMs, (complex I) C-terminus / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L / NAD(P)H-quinone oxidoreductase, subunit N / NADH-quinone oxidoreductase chain 4 / Cyanobacterial and plastid NDH-1 subunit M / NADH dehydrogenase transmembrane subunit / NADH-quinone oxidoreductase cyanobacterial subunit N / Oxygen-evolving enhancer protein 3 / Oxygen evolving enhancer protein 3 / NADH-plastoquinone oxidoreductase, subunit I / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2, N-terminal / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 N-terminal / PsbQ-like domain superfamily / Photosystem I PsaH, reaction centre subunit VI / Photosystem I reaction centre subunit VI / Photosystem I reaction center subunit psaK, plant / Photosystem I reaction center subunit V/PsaK, plant / Photosystem I PsaG/PsaK domain, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, bacterial/plastid / Photosystem I reaction centre subunit PsaK superfamily / Photosystem I psaG and psaK proteins signature. / NAD(P)H-quinone oxidoreductase, subunit N/subunit 2 / Photosystem I reaction center subunit V/PsaK / Photosystem I psaG / psaK / Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI / Photosystem I, reaction centre subunit XI / Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI superfamily / Photosystem I reaction centre subunit XI / Photosystem I reaction centre subunit VIII / Photosystem I reaction centre subunit VIII / Photosystem I reaction centre subunit VIII superfamily / Photosystem I PsaF, reaction centre subunit III / Photosystem I PsaF, reaction centre subunit III superfamily / Photosystem I reaction centre subunit III / Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista / Photosystem I PsaJ, reaction centre subunit IX / Photosystem I PsaD / Chlorophyll A-B binding protein / Photosystem I PsaJ, reaction centre subunit IX superfamily / Photosystem I, reaction centre subunit PsaD superfamily / Chlorophyll A-B binding protein / Photosystem I reaction centre subunit IX / PsaJ / PsaD / Photosystem I PsaE, reaction centre subunit IV / Photosystem I reaction centre subunit IV / PsaE / Photosystem I protein PsaC / Photosystem I PsaA / Photosystem I PsaB / Photosystem I PsaA/PsaB, conserved site / Photosystem I psaA and psaB proteins signature. / Photosystem I PsaA/PsaB / Photosystem I PsaA/PsaB superfamily / Photosystem I psaA/psaB protein / Electron transport accessory-like domain superfamily / Glycoside hydrolase-type carbohydrate-binding / 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature. / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit / NADH-quinone oxidoreductase, chain I / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D/H / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 49kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 49 Kd subunit signature. / NADH-quinone oxidoreductase, subunit D / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 49 Kd subunit / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ / NADH dehydrogenase, subunit C / NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5 subgroup / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 30 Kd subunit signature. / NADH-quinone oxidoreductase, chain M/4 / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, conserved site / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase signature. / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/K / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6 / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminal / NADH-quinone oxidoreductase, chain 5-like / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit superfamily / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 30 Kd subunit / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/Mnh complex subunit C1-like / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 3 superfamily / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site / Respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1 signature 1. / Respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1 signature 2. / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain profile. / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1/F420H2 oxidoreductase subunit H / NADHデヒドロゲナーゼ / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain / Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD / NADH:ubiquinone oxidoreductase
類似検索 - ドメイン・相同性
NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I, chloroplastic / Uncharacterized protein / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 6, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic / プロリルイソメラーゼ / タンパク質構造予測 / タンパク質構造予測 / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / NAD(P)H dehydrogenase subunit M ...NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I, chloroplastic / Uncharacterized protein / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 6, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic / プロリルイソメラーゼ / タンパク質構造予測 / タンパク質構造予測 / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / NAD(P)H dehydrogenase subunit M / タンパク質構造予測 / タンパク質構造予測 / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / タンパク質構造予測 / タンパク質構造予測 / Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic / Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic / Photosystem I reaction center subunit VI, chloroplastic / Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic / Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic / Photosystem I reaction center subunit psaK, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J, chloroplastic / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / Photosystem I iron-sulfur center / Photosystem I reaction center subunit VIII / Photosystem I reaction center subunit IX / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic / Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H, chloroplastic / Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 / NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic
類似検索 - 構成要素
生物種Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.5 Å
データ登録者Wang WD / Shen L / Tang K / Han GY / Shen JR / Zhang X
資金援助 中国, 1件
OrganizationGrant number国
Chinese Academy of SciencesQYZDY-SSW-SMC003 中国
引用
ジャーナル: Science / 年: 2015
タイトル: Photosynthesis. Structural basis for energy transfer pathways in the plant PSI-LHCI supercomplex.
著者: Xiaochun Qin / Michihiro Suga / Tingyun Kuang / Jian-Ren Shen /
要旨: Photosynthesis converts solar energy to chemical energy by means of two large pigment-protein complexes: photosystem I (PSI) and photosystem II (PSII). In higher plants, the PSI core is surrounded by ...Photosynthesis converts solar energy to chemical energy by means of two large pigment-protein complexes: photosystem I (PSI) and photosystem II (PSII). In higher plants, the PSI core is surrounded by a large light-harvesting complex I (LHCI) that captures sunlight and transfers the excitation energy to the core with extremely high efficiency. We report the structure of PSI-LHCI, a 600-kilodalton membrane protein supercomplex, from Pisum sativum (pea) at a resolution of 2.8 angstroms. The structure reveals the detailed arrangement of pigments and other cofactors—especially within LHCI—as well as numerous specific interactions between the PSI core and LHCI. These results provide a firm structural basis for our understanding on the energy transfer and photoprotection mechanisms within the PSI-LHCI supercomplex.
#2: ジャーナル: Nat Commun / 年: 2020
タイトル: Structural basis for electron transport mechanism of complex I-like photosynthetic NAD(P)H dehydrogenase.
著者: Pan X / Cao D / Xie F / Xu F / Su X / Mi H / Zhang X / Li M
履歴
登録2021年7月4日-
ヘッダ(付随情報) 公開2021年12月22日-
マップ公開2021年12月22日-
更新2022年2月9日-
現状2022年2月9日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 6
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 原子モデル: PDB-7f9o
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_31498.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_31498.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 325 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.307 Å
密度
表面レベル登録者による: 4.3 / ムービー #1: 6
最小 - 最大-13.195261 - 32.846535
平均 (標準偏差)-2.1663856e-12 (±1.0)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderZYX
Origin000
サイズ440440440
Spacing440440440
セルA=B=C: 575.08 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.3071.3071.307
M x/y/z440440440
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z575.080575.080575.080
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ440440440
MAP C/R/S321
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS440440440
D min/max/mean-13.19532.847-0.000

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : PSI-NDH supercomplex of Barley

全体名称: PSI-NDH supercomplex of Barley
要素
  • 複合体: PSI-NDH supercomplex of Barley
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1光化学系I
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2光化学系I
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I iron-sulfur center光化学系I
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic光化学系I
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic光化学系I
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic光化学系I
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit VI, chloroplastic光化学系I
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit VIII光化学系I
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit IX光化学系I
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit psaK, chloroplastic光化学系I
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic光化学系I
    • タンパク質・ペプチド: Chlorophyll a-b binding protein Lhca1
    • タンパク質・ペプチド: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Chlorophyll a-b binding protein Lhca5
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 5
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 6, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit N, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Unidentified stromal protein
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L1
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L2
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L2
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L4
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L5
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B1
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B2
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B3
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B4
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B5
    • タンパク質・ペプチド: Chlorophyll a-b binding protein Lhca4
    • タンパク質・ペプチド: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
  • リガンド: CHLOROPHYLL A ISOMER
  • リガンド: CHLOROPHYLL Aクロロフィルa
  • リガンド: PHYLLOQUINONEフィロキノン
  • リガンド: 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
  • リガンド: BETA-CAROTENEΒ-カロテン
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER鉄・硫黄クラスター
  • リガンド: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
  • リガンド: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
  • リガンド: (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL
  • リガンド: CHLOROPHYLL B
  • リガンド: (3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL
  • リガンド: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL

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超分子 #1: PSI-NDH supercomplex of Barley

超分子名称: PSI-NDH supercomplex of Barley / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#42
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)

+
分子 #1: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

分子名称: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: 光化学系I
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 83.217219 KDa
配列文字列: MIIRSPEPEV KIVVDRDPVK TSFEEWARPG HFSRTLAKGP DTTTWIWNLH ADAHDFDSHT GDLEEISRKV FSAHFGQLSI IFLWLSGMY FHGARFSNYE AWLSDPTHIG PSAQVVWPIV GQEILNGDVG GGFRGIQITS GFFQLWRASG ITSELQLYCT A IGALVFAA ...文字列:
MIIRSPEPEV KIVVDRDPVK TSFEEWARPG HFSRTLAKGP DTTTWIWNLH ADAHDFDSHT GDLEEISRKV FSAHFGQLSI IFLWLSGMY FHGARFSNYE AWLSDPTHIG PSAQVVWPIV GQEILNGDVG GGFRGIQITS GFFQLWRASG ITSELQLYCT A IGALVFAA LMLFAGWFHY HKAAPKLAWF QDVESMLNHH LAGLLGLGSL SWAGHQIHVS LPINQFLDAG VDPKEIPLPH EF ILNRDLL AQLYPSFAEG ATPFFTLNWS KYAEFLTFRG GLDPVTGGLW LTDIAHHHLA IAILFLIAGH MYRTNWGIGH GLK DILEAH KGPFTGQGHK GLYEILTTSW HAQLSLNLAM LGSTTIVVAH HMYSMPPYPY LATDYGTQLS LFTHHMWIGG FLIV GAAAH AAIFMVRDYD PTTRYNDLLD RVLRHRDAII SHLNWVCIFL GFHSFGLYIH NDTMSALGRP QDMFSDTAIQ LQPIF AQWV QNIHATAPGV TAPGATTSTS LTWGGGELVA VGGKVALLPI PLGTADFLVH HIHAFTIHVT VLILLKGVLF ARSSRL IPD KANLGFRFPC DGPGRGGTCQ VSAWDHVFLG LFWMYNAISV VIFHFSWKMQ SDVWGTISDQ GVVTHITGGN FAQSSIT IN GWLRDFLWAQ ASQVIQSYGS SLSAYGLFFL GAHFVWAFSL MFLFSGRGYW QELIESIVWA HNKLKVAPAT QPRALSII Q GRAVGVTHYL LGGIATTWAF FLARIIAVG

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分子 #2: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

分子名称: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: 光化学系I
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 82.693914 KDa
配列文字列: MELRFPRFSQ GLAQDPTTRR IWFGIATAHD FESHDDITEE RLYQNIFASH FGQLAIIFLW TSGNLFHVAW QGNFESWIQD PLHVRPIAH AIWDPHFGQP AVEAFTRGGA AGPVNIAYSG VYQWWYTIGL RTNEDLYTGA LFLLFLSTLS LIASWLHLQP K WKPSLSWF ...文字列:
MELRFPRFSQ GLAQDPTTRR IWFGIATAHD FESHDDITEE RLYQNIFASH FGQLAIIFLW TSGNLFHVAW QGNFESWIQD PLHVRPIAH AIWDPHFGQP AVEAFTRGGA AGPVNIAYSG VYQWWYTIGL RTNEDLYTGA LFLLFLSTLS LIASWLHLQP K WKPSLSWF KNAESRLNHH LSGLFGVSSL AWTGHLVHVA IPASRGEYVR WNNFLDVLPY PQGLGPLLTG QWNLYAQNPD SS NHLFGTA QGAGTAILTL LGGFHPQTQS LWLTDMAHHH LAIAFIFLIA GHMYRTNFGI GHSIKDLLEA HTPPGGRLGR GHK GLYDTI NNSIHFQLGL ALASLGVITS LVAQHMYSLP PYAFIAQDFT TQAALYTHHQ YIAGFIMTGA FAHGAIFFIR DYNP EQNED NVLARMLDHK EAIISHLSWA SLFLGFHTLG LYVHNDVMLA FGTPEKQILI EPIFAQWIQS AHGKTTYGFD ILLSS TNGP AFNAGRSLWL PGWLNAVNEN SNSLFLTIGP GDFLVHHAIA LGLHTTTLIL VKGALDARGS KLMPDKKDFG YSFPCD GPG RGGTCDISAW DAFYLAVFWM LNTIGWVTFY WHWKHITLWQ GNVSQFNESS TYLMGWLRDY LWLNSSQLIN GYNPFGM NS LSVWAWMFLF GHLVWATGFM FLISWRGYWQ ELIETLAWAH ERTPLANLIR WRDKPVALSI VQARLVGLAH FSVGYIFT Y AAFLIASTSG KFG

+
分子 #3: Photosystem I iron-sulfur center

分子名称: Photosystem I iron-sulfur center / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: 光化学系I
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 8.909345 KDa
配列文字列:
MSHSVKIYDT CIGCTQCVRA CPTDVLEMIP WDGCKAKQIA SAPRTEDCVG CKRCESACPT DFLSVRVYLG PETTRSMALS Y

+
分子 #4: Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 21.958137 KDa
配列文字列: MAMATQASAA TRHLITAAWS PSAKPRPATL AMPSSARGPA PLFAAAPDTP APAAPPAEPA PAGFVPPQLD PSTPSPIFGG STGGLLRKA QVEEFYVITW TSPKEQVFEM PTGGAAIMRE GPNLLKLARK EQCLALGNRL RSKYKIAYQF YRVFPNGEVQ Y LHPKDGVY ...文字列:
MAMATQASAA TRHLITAAWS PSAKPRPATL AMPSSARGPA PLFAAAPDTP APAAPPAEPA PAGFVPPQLD PSTPSPIFGG STGGLLRKA QVEEFYVITW TSPKEQVFEM PTGGAAIMRE GPNLLKLARK EQCLALGNRL RSKYKIAYQF YRVFPNGEVQ Y LHPKDGVY PEKVNAGRQG VGQNFRSIGK NVSPIEVKFT GKNSFDI

+
分子 #5: Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 15.476541 KDa
配列文字列:
MASTNMASAT SRFMLAAGIP SGANGGVSSR VSFLPSNRLG LKLVARAEEP TAAAPAEPAP AADEKPEAAV ATKEPAKAKP PPRGPKRGT KVKILRRESY WYNGTGSVVT VDQDPNTRYP VVVRFAKVNY AGVSTNNYAL DEIKEVAA

+
分子 #6: Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 24.866574 KDa
配列文字列: MAALAASIAT STAFAAKPRL SRPPARLSVS CSASSGDNNN STATPSLSAS IKTFSAALAL SSVLLSSAAT SPPPAAADIA GLTPCKESK AFAKREKQSV KKLNSSLKKY APDSAPALAI QATIDKTKRR FENYGKFGLL CGSDGLPHLI VSGDQRHWGE F ITPGVLFL ...文字列:
MAALAASIAT STAFAAKPRL SRPPARLSVS CSASSGDNNN STATPSLSAS IKTFSAALAL SSVLLSSAAT SPPPAAADIA GLTPCKESK AFAKREKQSV KKLNSSLKKY APDSAPALAI QATIDKTKRR FENYGKFGLL CGSDGLPHLI VSGDQRHWGE F ITPGVLFL YIAGWIGWVG RSYLIAVSGE KKPAMREIII DVELAARIIP RGFIWPVAAY RELINGDLVV DDADIGY

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分子 #7: Photosystem I reaction center subunit VI, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit VI, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 14.900113 KDa
配列文字列:
MASLVAVQPA AVKGLSGSSI SGRKLAVRPS SAAVSRSTRR ARGAAVVAKY GEKSVYFDLD DIANTTGQWD LYGSDAPSPY NGLQSKFFN TFAAPFTKRG LLLKFLLIGG GSLVAYVSAS ASPDLLPIKK GPQLPPTPGP RGKI

+
分子 #8: Photosystem I reaction center subunit VIII

分子名称: Photosystem I reaction center subunit VIII / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 4.010949 KDa
配列文字列:
MTDLNLPSIF VPLVGLVFPA IAMTSLFLYV QKKKIV

+
分子 #9: Photosystem I reaction center subunit IX

分子名称: Photosystem I reaction center subunit IX / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 4.74762 KDa
配列文字列:
MRDIKTYLSV APVLSTLWFG ALAGLLIEIN RLFPDALSFP FF

+
分子 #10: Photosystem I reaction center subunit psaK, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit psaK, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 13.742934 KDa
配列文字列:
MASQLSAMTS VPQFHGLRTY SSPRSMATLP SLRRRRSQGI RCDYIGSSTN LIMVTTTTLM LFAGRFGLAP SANRKATAGL KLEARESGL QTGDPAGFTL ADTLACGAVG HIMGVGIVLG LKNTGVLDQI IG

+
分子 #11: Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 22.22973 KDa
配列文字列: MATAYAPPMA SQVMKSGLAC SKPRGMSGAS LTRRPRFVVK AVKSDKPTYQ VVQPINGDPF IGSLETPVTS SPLVAWYLSN LPAYRTAVS PLLRGIEVGL AHGYLLVGPF ALTGPLRNTP VHGQAGTLGA IGLVSILSVC LTMYGVASFN EGEPSTAPVL T LTGRKKEA ...文字列:
MATAYAPPMA SQVMKSGLAC SKPRGMSGAS LTRRPRFVVK AVKSDKPTYQ VVQPINGDPF IGSLETPVTS SPLVAWYLSN LPAYRTAVS PLLRGIEVGL AHGYLLVGPF ALTGPLRNTP VHGQAGTLGA IGLVSILSVC LTMYGVASFN EGEPSTAPVL T LTGRKKEA DKLQTAEGWS QFTGGFFFGG VSGAVWAYFL LYVLDLPYFF K

+
分子 #12: Chlorophyll a-b binding protein Lhca1

分子名称: Chlorophyll a-b binding protein Lhca1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 26.691438 KDa
配列文字列: MAMASSSGLR SCSAVGVPSL LAPSSRSGRS GLPFCAYATT SGRVTMSAEW FPGQPRPAHL DGSSPGDFGF DPLGLATVPE NFERFKESE IYHCRWAMLC VPGVLVPEAL GLGNWVKAQE WAALPDGQAT YLGNPVPWGN LPTILAIEFL AIAFAEQQRT M EKDPEKKK ...文字列:
MAMASSSGLR SCSAVGVPSL LAPSSRSGRS GLPFCAYATT SGRVTMSAEW FPGQPRPAHL DGSSPGDFGF DPLGLATVPE NFERFKESE IYHCRWAMLC VPGVLVPEAL GLGNWVKAQE WAALPDGQAT YLGNPVPWGN LPTILAIEFL AIAFAEQQRT M EKDPEKKK YPGGAFDPLG FSKDPAKFEE LKLKEIKNGR LAMLAFVGFC VQQSAYPGTG PLENLATHLA DPWHNNIGDI VI PRNIYGP

+
分子 #13: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

分子名称: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 27.320039 KDa
配列文字列: MALVSSSSAT AVAALPSNGL AGARTSFLGA AGKAAASRTS FAVRAAAPER PIWFPGSTPP PWLDGSLPGD FGFDPWGLGS DPESLRWNV QAELVHCRWA MLGAAGIFIP ELLTKIGILN TPSWYTAGEQ EYFTDTTTLF IVELILIGWA EGRRWADIIK P GCVNTDPI ...文字列:
MALVSSSSAT AVAALPSNGL AGARTSFLGA AGKAAASRTS FAVRAAAPER PIWFPGSTPP PWLDGSLPGD FGFDPWGLGS DPESLRWNV QAELVHCRWA MLGAAGIFIP ELLTKIGILN TPSWYTAGEQ EYFTDTTTLF IVELILIGWA EGRRWADIIK P GCVNTDPI FPNNKLTGTD VGYPGGLWFD PLGYGTGSPE KLKELRTKEI KNGRLAMLAV MGAWFQAEYT GTGPIDNLFA HL ADPGHAT IFRAFAPK

+
分子 #14: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

分子名称: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 29.374547 KDa
配列文字列: MAAQGLLSGR QLLGRPLQSS FSRSSSSRKS PFVVRASSSP PAKQNDNRQL WFASKQSLTY LDGTLPGDFG FDPLGLSDPE GTGGFIEPR WLAYGEIFNG RTAMMGVVGM IAPEALGKVG LVPPETAIPW FQAGAIPPAG TYQYWADPYT LFVFEMALIG F AEHRRLQD ...文字列:
MAAQGLLSGR QLLGRPLQSS FSRSSSSRKS PFVVRASSSP PAKQNDNRQL WFASKQSLTY LDGTLPGDFG FDPLGLSDPE GTGGFIEPR WLAYGEIFNG RTAMMGVVGM IAPEALGKVG LVPPETAIPW FQAGAIPPAG TYQYWADPYT LFVFEMALIG F AEHRRLQD WYNPGSMGKQ YFLGLEKYLG GSGDPAYPGG PIFNPLGFGT KSEKEMKELK LKEIKNGRLA MLAFLGMSLQ AI FTGVGPF QNLLDHLSDP VNNNILTSLK FH

+
分子 #15: Chlorophyll a-b binding protein Lhca5

分子名称: Chlorophyll a-b binding protein Lhca5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 27.618691 KDa
配列文字列: MALAANAHGR VCTLSSRPPA PFSSRSTVAM PGHHSESPRA RFAVRAIAER ATWLPGLDPP AYLDGTLPGD YGFDPLGLGE QPEDLKWYV QAELVHCRFA MAGVAGILGT DLIRVSGIGN LPVWFEAGAT KFDFANTTAL FFVQLLLMGF VETKRYMDFV S PGSQAKEG ...文字列:
MALAANAHGR VCTLSSRPPA PFSSRSTVAM PGHHSESPRA RFAVRAIAER ATWLPGLDPP AYLDGTLPGD YGFDPLGLGE QPEDLKWYV QAELVHCRFA MAGVAGILGT DLIRVSGIGN LPVWFEAGAT KFDFANTTAL FFVQLLLMGF VETKRYMDFV S PGSQAKEG TFLGIEASLE GLQPGYPGGP LFNPMGLAKD IENANEVKLK EIKNGRLAMV AMLGFIVQAS VTHAGPIDNL LT HLSDPFN KNIIHALTLS

+
分子 #16: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 38.544336 KDa
配列文字列: SKLELLKEVY GLISILPILT LLLGITIEVL VIVWLEREIS ASIQQRIGPE YAGPLGLLQA IADGTKLLFK EDILPSRGDI SLFSIGPSI AVISVLLSFL VIPLGYHFVL ADLSIGVFLW IAISSIAPIG LLMAGYSSNN KYSFLGGLRA AAQSISYEIP L TFCVLAIS ...文字列:
SKLELLKEVY GLISILPILT LLLGITIEVL VIVWLEREIS ASIQQRIGPE YAGPLGLLQA IADGTKLLFK EDILPSRGDI SLFSIGPSI AVISVLLSFL VIPLGYHFVL ADLSIGVFLW IAISSIAPIG LLMAGYSSNN KYSFLGGLRA AAQSISYEIP L TFCVLAIS LLSNSLSTVD IVEAQSKYGF FGWNIWRQPI GFLVFLISSL AECERLPFDL PEAEEELVAG YQTEYSGIKY GL FYLVSYL NLLVSSLFVT VLYLGGWNFS IPYISFFDFF QMNKAVGILE MTMGIFITLT KAYLFLFISI TIRWTLPRMR MDQ LLNLGW KFLLPISLGN LLLTTSFQLV

+
分子 #17: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 53.45232 KDa
配列文字列: NGSFIFPECI LIFGLILLLM IDSTSDQKDR PWFYFISSTS LVISITALLF RWREEPIISF SGNFQTNNFN EIFQFLILLC STLCIPLSV EYIECTEMAI TEFLLFVLTA TLGGMFLCGA NDLITIFVAP ECFSLCSYLL SGYTKRDLRS NEATMKYLLM G GASSSILV ...文字列:
NGSFIFPECI LIFGLILLLM IDSTSDQKDR PWFYFISSTS LVISITALLF RWREEPIISF SGNFQTNNFN EIFQFLILLC STLCIPLSV EYIECTEMAI TEFLLFVLTA TLGGMFLCGA NDLITIFVAP ECFSLCSYLL SGYTKRDLRS NEATMKYLLM G GASSSILV HGFSWLYGSS GGEIELQEIV NGLINTQMYN SPGISIALIS ITVGLGFKLS PAPFHQWTPD VYEGSPTPVV AF LSVTSKV AASASATRIL DIPFYFSSNE WHLLLEILAI LSMILGNLLA ITQTSMKRML AYSSIGQIGY VIIGIIVGDS NDG YASMIT YMLFYISMNL GTFACIVLFG LRTGTDNIRD YAGLYMKDPF LALSLALCLL SLGGLPPLAG FFGKLYLFWC GWQA GLYFL VSIGLLTSVL SIYYYLKIIK LLMTGRNQEI TPYVRNYRRS PLRSNNSIEL SMTVCVIAST IPGISMNPIL AIAQD TLF

+
分子 #18: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 13.299608 KDa
配列文字列:
LHEYDIFWTF LIIASLIPIL AFSISGLLAP VSEGPEKLSS YESGIEPMGG AWVQFRIRYY MFALVFVVFD VETVFLYPWA MSFDVLGVS VFIEALIFVL ILVVGLVYAW RKGALEWS

+
分子 #19: NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 56.222781 KDa
配列文字列: SYFPWLTILV VLPIFAGSLI FFLPHKGNKI VRWYTISICL LEFLLMTYAF CYHFQLEDPL IQLKEDYKWI DVFDFHWRLG IDGLSLGSI LLTGFITTLA TLAAWPITRN SRLFYFLMLA MYSGQIGLFS SRDLLLFFIM WELELIPVYL LLSMWGGKRR L YSATKFIL ...文字列:
SYFPWLTILV VLPIFAGSLI FFLPHKGNKI VRWYTISICL LEFLLMTYAF CYHFQLEDPL IQLKEDYKWI DVFDFHWRLG IDGLSLGSI LLTGFITTLA TLAAWPITRN SRLFYFLMLA MYSGQIGLFS SRDLLLFFIM WELELIPVYL LLSMWGGKRR L YSATKFIL YTAGGSIFFL IGVLGMGLYG SNEPGLDLER LINQSYPATL EILLYFGFLI AYAVKLPIIP LHTWLPDTHG EA HYSTCML LAGILLKMGA YGLIRINMEL LPHAHYLFSP WLVIIGAIQI IYAASTSLGQ RNFKKRIAYS SVSHMGFIII GIG SITNIG LNGAILQILS HGFIGATLFF LAGTASDRMR LVYLEELGGI SIPMPKIFTM FSSFSMASLA LPGMSGFVAE LVVF FGLIT SPKFLLMPKA LITFVMAIGM ILTPIYLLSM LRQMFYGYKL FNVPNANFVD SGPRELFILI CIFLPVIGIG IYPDF VLSL SVDRVEALLS NYYPK

+
分子 #20: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 11.19919 KDa
配列文字列:
MMFEHVLFLS VYLFSIGIYG LITSRNMVRA LICLELILNS INLNLVTFSD LFDSRQLKGD IFAIFVIALA AAEAAIGLSI LSSIHRNRK STRINQSNLL N

+
分子 #21: NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 5

分子名称: NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 87.55293 KDa
配列文字列: MKNSSIFSYS FYLFFQKEIR VGLVNRKQFY RKIEVKIAIS FLMEHTYQYA WVIPLLPLPV IMSMGFGLIL IPTATKNLRR IWAFPSVLL LSIAMVFSVQ LSIQQINGSS IYQYLWSWTV NNDFSLEFGY LIDPLTSIML ILITTVGILV LIYSDGYMSH D EGYLRFFV ...文字列:
MKNSSIFSYS FYLFFQKEIR VGLVNRKQFY RKIEVKIAIS FLMEHTYQYA WVIPLLPLPV IMSMGFGLIL IPTATKNLRR IWAFPSVLL LSIAMVFSVQ LSIQQINGSS IYQYLWSWTV NNDFSLEFGY LIDPLTSIML ILITTVGILV LIYSDGYMSH D EGYLRFFV YISFFNTSML GLVTSSNLIQ IYFFWELVGM CSYLLIGFWF TRPIAASACQ KAFVTNRVGD FGLLLGILGF FW ITGSLEF RDLFQIANNW IPNNGINSLL TTLCAFLLFL GAVAKSAQFP LHVWLPDAME GPTPISALIH AATMVAAGIF LLA RLLPLF ISLPLIMSFI SLVGTITLFL GATLALAQRD IKRSLAYSTM SQLGYMMLAL GIGSYQAALF HLITHAYSKA LLFL GSGSV IHSMEPLVGY SPDKSQNMVL MGGLRKYIPI TRTTFLWGTL SLCGIPPLAC FWSKDEILSN SWLYSPFFGI IASFT AGLT AFYMFRIYLL TFGGYLRVHF QNYSSTKESS LYSISLWGKR IPKGVNRDFV LSTTKSGVSF FSQNIPKIQG NTRNRI GSF TTSFGAKNTF AYPHETGNTM LFPLLILLLF TLFIGFIGIS FDNGGMDNGI AELTILSKWL TPSKNFTQES SNSFVNS YE FITNAISSVT LAIFGLFIAY IFYGSAYSFF QNLDLINSFV KRNPKKEFLD QVKKNIYSWS YNRGYIDIFY TRVFTLGI R GLTELTEFFD KGVIDGITNG VGLASFCIGE EIKYVGGGRI SSYLFFFLCY VSVFLF

+
分子 #22: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 6, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 6, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 19.587109 KDa
配列文字列:
MDLPGPIHEI LMLFGEFILL LGGLGVVLLT NPIYSAFSLG LVLVCISLFY FLLNSYFVAV AQLLIYVGAI NVLIIFAVMF VNGSEWSKD KNYWTIGDGF TSLVCITFVF SLMTTIPDTS WYGILWTTRS NQIVEQGLIN NVQQIGIHLA TDFYLPFELI S IILLVSLI GAITMARQ

+
分子 #23: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 44.563441 KDa
配列文字列: MIVNMGPQHP SMHGVLRLIV TLDGEDVIDC EPILGYLHRG MEKIAENRTI IQYLPYVTRW DYLATMFTEA ITVNAPEFLE NIQIPQRAS YIRVIMLELS RIASHLLWLG PFMADLGAQT PFFYIFRERE LIYDLFEAAT GMRMMHNYFR IGGVAADLPY G WIDKCLDF ...文字列:
MIVNMGPQHP SMHGVLRLIV TLDGEDVIDC EPILGYLHRG MEKIAENRTI IQYLPYVTRW DYLATMFTEA ITVNAPEFLE NIQIPQRAS YIRVIMLELS RIASHLLWLG PFMADLGAQT PFFYIFRERE LIYDLFEAAT GMRMMHNYFR IGGVAADLPY G WIDKCLDF CDYFLRGVVE YQQLITQNPI FLERVEGVGF ISGEEAVNWG LSGPMLRASG IQWDLRKVDP YESYNQFDWK VQ WQKEGDS LARYLVRVGE MSESIKIIQQ AIEKIPGGPY ENLEVRRFKK EKNSEWNDFE YKFLGKKPSP NFELSRQELY VRV EAPKGE LGIYLVGDDS LFPWRWKIRP PGFINLQILP QLVKKMKLAD IMTILGSIDI IMGEVDR

+
分子 #24: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 19.271131 KDa
配列文字列:
PMVTGFMSYG QQTIRATRYI GQSFITTLSH TNRLPITIHY PYEKSITPER FRGRIHFEFD KCIACEVCVR VCPIDLPVVD WRFEKDIKR KQLLNYSIDF GVCIFCGNCV EYCPTSCLSM TEEYELSTYD RHELNYNQIA LSRLPISIMG DYTIQTIRNS S ESKIN

+
分子 #25: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 18.733178 KDa
配列文字列:
MQQGWLSNWL VKHEVVHRSL GFDHRGIETL QIKAGDWDSI AVILYVYGYN YLRSQCAYDV APGGSLASVY HLTRIQYGID NPEEVCIKV FAQKDNPRIP SVFWIWRSAD FQERESYDMV GISYDNHPRL KRILMPESWI GWPLRKDYIT PNFYEIQDAH

+
分子 #26: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 27.568764 KDa
配列文字列: MVLTEYLDKK KEGKDSIETV MNLIEFPLLD QTSSNSVIST TLNDLSNWSR LSSLWPLLYG TSCCFIEFAS LIGSRFDFDR YGLVPRSSP RQADLILTAG TVTMKMAPSL VRLYEQMPEP KYVIAMGACT ITGGMFSTDS YSTVRGVDKL IPVDVYLPGC P PKPEAVID ...文字列:
MVLTEYLDKK KEGKDSIETV MNLIEFPLLD QTSSNSVIST TLNDLSNWSR LSSLWPLLYG TSCCFIEFAS LIGSRFDFDR YGLVPRSSP RQADLILTAG TVTMKMAPSL VRLYEQMPEP KYVIAMGACT ITGGMFSTDS YSTVRGVDKL IPVDVYLPGC P PKPEAVID ALTKLRKKIS REIVEDRTLS QNKKRCFTTS HKLYVRRSTH TGTYEQELLY QSPSTLDISS ETFLKSKSPV PS YKLVN

+
分子 #27: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 22.240281 KDa
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MEITASWRFL PVASSLPPAL LLARRQASCP WSLQQPAISK SRILCRLHDK PFPTAQSSQL QKLASVLQCG AIWAAVQAPA ALATVSGEE DIDILGILPP VAAIAFFYLF VAPPIIMNWM RLRWFKRKFI ETYLQFMFTY LFFPGLMLWA PFVNFRKFPR D KTMKYPWS KPKEGTPLFK DRYPQIDSFK EKYF

+
分子 #28: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 24.051049 KDa
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MATAAASSLL SPASKFALQS RRSSPKTAPR SVRFLPVRAQ QQVKEEEPAA TVPPPQEEGQ ATTAAAAKGP AQSLPRQPRA ESKNMGREY GSQWLSCTTR HVRIYAAYID PETNAFDQTQ TDKLTLMLDP TEEFVWTDET CQMVYNEFQD LVDHYEGAPL S EYTLRLIG SDLEHYIRKL LYDGEIKYNM RSRVLNFSMG KPRVKFNSSQ IPDVK

+
分子 #29: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit N, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit N, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 25.928014 KDa
配列文字列: MWSGAAAAVA ARSVSPPLHA PTSLTGRRGA GRPSTVSVRA GGGLMDFVGG DLVKPDLGRW LDDVEKHKAL AIYPPHEGGY EGRYLNRLR YQGYYFLDLS ARGLGDPEST LTKIHPVCPP SLGRQPVARW YFPPEVDYRL SLLHPDAKGL IVWVYEAKVS F RLSLAALT ...文字列:
MWSGAAAAVA ARSVSPPLHA PTSLTGRRGA GRPSTVSVRA GGGLMDFVGG DLVKPDLGRW LDDVEKHKAL AIYPPHEGGY EGRYLNRLR YQGYYFLDLS ARGLGDPEST LTKIHPVCPP SLGRQPVARW YFPPEVDYRL SLLHPDAKGL IVWVYEAKVS F RLSLAALT LNFLIVFPCS FRLQVLSKAE LQFLAMLPDL RPKVRVIAEC GNWRKFIWKP LKQISGLEPD PDAEE

+
分子 #30: Unidentified stromal protein

分子名称: Unidentified stromal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 5.209413 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #31: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L1

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 17.835777 KDa
配列文字列:
NYRSYVDAND GYSYLYPADW RDFDFLGHDS AFKDRNVQLQ SVRVAFIPTQ KTDIRDLGPM DEAIFNLVNE VYAAPNQIPT IYEMQERTV DGRNYWTFEY DLEAPGYGVS AFATIAIGNG RYYTLIVTAN ERRWSRLRNK LKVVADSFKI SDLNA

+
分子 #32: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L2

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 23.946465 KDa
配列文字列: MATLVKHLIL CSSTTTSSSA TPSPSNRRPP SSPDGADKRA HLTQSSTRRL AVAASTAMVA TAALSARRPA APPPAMAAEA AAVRLPVPP GTVPRWGTRS YVRERFFEPG LTTEEAAARI RQTAEGMRTL RPMLETMSWK YVLFYVRLKS KYLDLDLTTA M AGVPEPRR ...文字列:
MATLVKHLIL CSSTTTSSSA TPSPSNRRPP SSPDGADKRA HLTQSSTRRL AVAASTAMVA TAALSARRPA APPPAMAAEA AAVRLPVPP GTVPRWGTRS YVRERFFEPG LTTEEAAARI RQTAEGMRTL RPMLETMSWK YVLFYVRLKS KYLDLDLTTA M AGVPEPRR PEYVLVANEL VDNMTEFDRF VRTPKVYESY LYYEKTLKSL DDVAEFLG

+
分子 #33: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L2

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 24.733996 KDa
配列文字列: MASTYLSSFQ AAAAATSGGA STRPRPRPRP RVVTCHTSEP SGRRSACLSL GLGLATAAVL HTTPARAIAD GDEEPEPANN GWWLTEFPL PVPKIRNKEI NNGETGTRSF VKNGIYMADI GPSFAAHAYR VRSSAFDLLA LEDLLGKEAS NYVNKYLRLK A TFIYYDFD ...文字列:
MASTYLSSFQ AAAAATSGGA STRPRPRPRP RVVTCHTSEP SGRRSACLSL GLGLATAAVL HTTPARAIAD GDEEPEPANN GWWLTEFPL PVPKIRNKEI NNGETGTRSF VKNGIYMADI GPSFAAHAYR VRSSAFDLLA LEDLLGKEAS NYVNKYLRLK A TFIYYDFD KLITAADPDA KPPLLDLANR LFDSFEKLQA AVTTKDDTDI GSCYADTKLI LQEVMTRMA

+
分子 #34: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L4

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 13.95436 KDa
配列文字列:
ARAALELHRS LCPLLVSPRE LEFLQVRDPS FCSVSMVVTQ IHYTARFPDG TVFDSSYKRG RPLTMRIGAG KILRGLQQGI GGGGGVTPM LVGGKRKLMI PPILAYGPEP AGCFSEAVFA QAEMNFCALA A

+
分子 #35: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L5

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 25.818414 KDa
配列文字列: MAAATSSFAT LAVARPAAAA QRALLAAKAP SSALSLRGVG RVASPALSVS LQTRARFVAS ASAEPYAPEL QSKVTNKVYF DINIGNPVG KNVGRIVIGL YGDDVPQTVE NFRALCTGEK GFGYKGSSFH RVIKDFMIQG GDFDKGNGTG GKSIYGRTFK D ENFQLVHT ...文字列:
MAAATSSFAT LAVARPAAAA QRALLAAKAP SSALSLRGVG RVASPALSVS LQTRARFVAS ASAEPYAPEL QSKVTNKVYF DINIGNPVG KNVGRIVIGL YGDDVPQTVE NFRALCTGEK GFGYKGSSFH RVIKDFMIQG GDFDKGNGTG GKSIYGRTFK D ENFQLVHT GPGVLSMANA GPNTNGSQFF ICTVKTPWLD GRHVVFGQVL EGMDIVRMIE SSETDRGDRP KKKVVISECG EL PVV

+
分子 #36: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B1

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 51.675945 KDa
配列文字列: MQTPTMPTPM AARPTSTMAT KLPAPSATPR QCHLLPGRRV AGLARASSKK RNPWLDPFDD GPDEEFDYTG VYSGGKQEED PRPPEDAEN PYGFLRFPMG YMPELDSLAS KVRGDVRRVC CVVSGGVYEN VLFFPVVQML KDRYPGVLVD VVASARGKQV Y EMCKNVRY ...文字列:
MQTPTMPTPM AARPTSTMAT KLPAPSATPR QCHLLPGRRV AGLARASSKK RNPWLDPFDD GPDEEFDYTG VYSGGKQEED PRPPEDAEN PYGFLRFPMG YMPELDSLAS KVRGDVRRVC CVVSGGVYEN VLFFPVVQML KDRYPGVLVD VVASARGKQV Y EMCKNVRY ANVYDPDDEW PEPAEYTHQL GVMKNRYYDM VLSTKLAGTG HALFLFMSSA REKVGYVYPN VNGAGAGLFL TE MFKPATT NLADGGYNMY QDMLEWLGRP AKGVPQQPIP PLRVSISKKL RAVVEDKYNR AGVEKGKYVV IHGIESDSVA NMK SRGDDD CLLPLELWAE IAKEISSGGN GLRPLFVMPH ERHREEIEEI VGEETAYLFI TTPGQLTCLI NDSAGVVATN TAAV QLANA RDKPCVALFS SKEKARLFLP YVEERKSCTV VASATGKLAG IDIEAVKKAV KDLEPAPSFA LAQT

+
分子 #37: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B2

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 38.079977 KDa
配列文字列: MAAASFLPLH LPASPRPATV AARAASGVAS MVPAQASQLE EAFGRKGLRF GTDATGAPTA ELSVRNGSSL QLRLNDGLVT SYRPKVSWE GGDGCRELLH TVVGAGAGAV RGGVGLVLNE AASSSSSSSP LLGASEWSVA DVDSDSYDAV QVELGCVASK L EVSYVVTL ...文字列:
MAAASFLPLH LPASPRPATV AARAASGVAS MVPAQASQLE EAFGRKGLRF GTDATGAPTA ELSVRNGSSL QLRLNDGLVT SYRPKVSWE GGDGCRELLH TVVGAGAGAV RGGVGLVLNE AASSSSSSSP LLGASEWSVA DVDSDSYDAV QVELGCVASK L EVSYVVTL YPLSMATAVI VKNNGARPVE LTAAVLSHIK FDKRRGTAVE GLRGCPYCSH PPPASGFALL TPAEAMKREE SG WFGGGGG EEPRQGAWTV EENLYTILKK KVSRVYAAPP EERKKRIYNT APSKFTTIDQ SSGLGFRLVR MGFEDMYLGS PGG MYDKFG NDYFLCTGPA SILVPVVVGP GEEWRGAQVI EHDNL

+
分子 #38: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B3

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 13.313331 KDa
配列文字列:
FAFVSPRLLP DGTPDVHYRT ACGGQKLRDI MLDAYIDLYG PYDKLLLNCS GGGECGTCIV EVVEGGEMLS PKNEVEKEKL KRKPKSWRL ACQATVGNPD STGQMVIQQL PEWKVHKWDK

+
分子 #39: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B4

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 9.75681 KDa
配列文字列:
NQRDWVVTKS IWHLSDTAIK SFYTFYAMFT VWGVCFFASM KASMADPFYD SEHYRGQGGD GTVHWYYDRQ EDIEATARGD LLR

+
分子 #40: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B5

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 18.146125 KDa
配列文字列:
GPLTEIEPDL QEDPIDKWRT NGVSPEDFVY GVYDGHHTYD EGQEKKGFWE DVSEWYQEAE PPQGFQALIS WSFPPAVILG MAFDVPGEY LYIGAAIFIV VFCIIEMDKP DKPHNFEPEI YMMERSKRDK LIADYNSMDI WDFNEKYGEL WDFTVN

+
分子 #41: Chlorophyll a-b binding protein Lhca4

分子名称: Chlorophyll a-b binding protein Lhca4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 21.97685 KDa
配列文字列: KGSWLPGLQS PAYLDGSLAG DNGFDPLALA EDPEDLRWFV QAELVNGRWA MLGVAGMLIP EVLTKAGLLN APEWYDAGKE TYFASSSTL FVIEFILFHY VEIRRWQDIK NPGSVNQDPI FKSYSLPPHE CGYPGSVFNP LNFAPTLENK EKELANGRLA M LAFLGFLV ...文字列:
KGSWLPGLQS PAYLDGSLAG DNGFDPLALA EDPEDLRWFV QAELVNGRWA MLGVAGMLIP EVLTKAGLLN APEWYDAGKE TYFASSSTL FVIEFILFHY VEIRRWQDIK NPGSVNQDPI FKSYSLPPHE CGYPGSVFNP LNFAPTLENK EKELANGRLA M LAFLGFLV QHNVTGKGPF ENLQQHLADP WHNTIIQTI

+
分子 #42: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

分子名称: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Hordeum vulgare subsp. spontaneum (オオムギ)
分子量理論値: 23.90416 KDa
配列文字列: TVCEPLGPDR PVWFPGTAPP PWLDGSLPGD FGFDPLGFGS EPESLRWFAQ AELMHGRWAM LAVAGILIPE ILQKWGFMEE FSWYTAGER EYFADPWTLF VTQMALMGWV EGRRWMDYLN PGSVDIEPRF PNRKNPTPDV GYPGGLWFDW GNWGRGSPEP V MVLRTKEI ...文字列:
TVCEPLGPDR PVWFPGTAPP PWLDGSLPGD FGFDPLGFGS EPESLRWFAQ AELMHGRWAM LAVAGILIPE ILQKWGFMEE FSWYTAGER EYFADPWTLF VTQMALMGWV EGRRWMDYLN PGSVDIEPRF PNRKNPTPDV GYPGGLWFDW GNWGRGSPEP V MVLRTKEI KNGRLAMLAF VGFWFQVVYT GQGPLDNLFA HLADPGHCNI FSA

+
分子 #43: CHLOROPHYLL A ISOMER

分子名称: CHLOROPHYLL A ISOMER / タイプ: ligand / ID: 43 / コピー数: 2 / 式: CL0
分子量理論値: 893.489 Da
Chemical component information

ChemComp-CL0:
CHLOROPHYLL A ISOMER / クロロフィルa

+
分子 #44: CHLOROPHYLL A

分子名称: CHLOROPHYLL A / タイプ: ligand / ID: 44 / コピー数: 273 / 式: CLA
分子量理論値: 893.489 Da
Chemical component information

ChemComp-CLA:
CHLOROPHYLL A / クロロフィルa

+
分子 #45: PHYLLOQUINONE

分子名称: PHYLLOQUINONE / タイプ: ligand / ID: 45 / コピー数: 4 / 式: PQN
分子量理論値: 450.696 Da
Chemical component information

ChemComp-PQN:
PHYLLOQUINONE / フィロキノン / フィロキノン

+
分子 #46: 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE

分子名称: 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 11 / 式: LHG
分子量理論値: 722.97 Da
Chemical component information

ChemComp-LHG:
1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE / ジパルミトイルホスファチジルグリセロ-ル / リン脂質*YM / Phosphatidylglycerol

+
分子 #47: BETA-CAROTENE

分子名称: BETA-CAROTENE / タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 51 / 式: BCR
分子量理論値: 536.873 Da
Chemical component information

ChemComp-BCR:
BETA-CAROTENE / β-カロチン / Β-カロテン

+
分子 #48: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 7 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄 / 鉄・硫黄クラスター

+
分子 #49: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)

分子名称: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 4 / 式: DGD
分子量理論値: 949.299 Da
Chemical component information

ChemComp-DGD:
DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)

+
分子 #50: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE

分子名称: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE / タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 7 / 式: LMG
分子量理論値: 787.158 Da
Chemical component information

ChemComp-LMG:
1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE

+
分子 #51: (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL

分子名称: (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL
タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 12 / 式: LUT
分子量理論値: 568.871 Da
Chemical component information

ChemComp-LUT:
(3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL / ルテイン

+
分子 #52: CHLOROPHYLL B

分子名称: CHLOROPHYLL B / タイプ: ligand / ID: 52 / コピー数: 23 / 式: CHL
分子量理論値: 907.472 Da
Chemical component information

ChemComp-CHL:
CHLOROPHYLL B / Chlorophyll b

+
分子 #53: (3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BE...

分子名称: (3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL
タイプ: ligand / ID: 53 / コピー数: 4 / 式: XAT
分子量理論値: 600.87 Da
Chemical component information

ChemComp-XAT:
(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL / 13-cis-ビオラキサンチン / ビオラキサンチン

+
分子 #54: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL

分子名称: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
タイプ: ligand / ID: 54 / コピー数: 2 / 式: SQD
分子量理論値: 795.116 Da
Chemical component information

ChemComp-SQD:
1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL / (2S)-1-O,2-O-ジパルミトイル-3-O-(6-スルホ-6-デオキシ-α-D-グルコピラノシル)グリセロ-ル

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 %

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: SUPER-RESOLUTION / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.5 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 103844

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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