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- EMDB-28581: Structure of mitochondrial complex I from Drosophila melanogaster... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-28581
タイトルStructure of mitochondrial complex I from Drosophila melanogaster, Flexible-class 1
マップデータ
試料
  • 複合体: mitochondrial complex I from the thoracic muscles of D. melanogasterNADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
    • タンパク質・ペプチド: x 42種
  • リガンド: x 10種
機能・相同性
機能・相同性情報


Mitochondrial protein import / Glyoxylate metabolism and glycine degradation / Respiratory electron transport / Complex I biogenesis / Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation / RHOG GTPase cycle / deoxynucleoside kinase activity / Mitochondrial protein degradation / NADHデヒドロゲナーゼ / regulation of terminal button organization ...Mitochondrial protein import / Glyoxylate metabolism and glycine degradation / Respiratory electron transport / Complex I biogenesis / Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation / RHOG GTPase cycle / deoxynucleoside kinase activity / Mitochondrial protein degradation / NADHデヒドロゲナーゼ / regulation of terminal button organization / Neutrophil degranulation / protein lipoylation / ubiquinone-6 biosynthetic process / 細胞呼吸 / NADH dehydrogenase activity / NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型) / mitochondrial ATP synthesis coupled electron transport / mitochondrial respiratory chain complex I / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / respirasome / acyl binding / electron transport coupled proton transport / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / acyl carrier activity / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / 細胞呼吸 / respiratory electron transport chain / reactive oxygen species metabolic process / response to reactive oxygen species / determination of adult lifespan / ミトコンドリア / ミトコンドリア / transmembrane transport / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / NAD binding / FMN binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / response to oxidative stress / oxidoreductase activity / ミトコンドリアマトリックス / protein-containing complex binding / ミトコンドリア / metal ion binding / 細胞質
類似検索 - 分子機能
NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 / MNLL subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 10 / Soluble ligand binding domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit ...NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 / MNLL subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 10 / Soluble ligand binding domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit / SLBB domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, metazoa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, animal type / NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B14.5a (Complex I-B14.5a) / NADH dehydrogenase 1 beta subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2, NDUC2 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NDUFB4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit b14.5b (NDUFC2) / NADH-ubiquinone oxidoreductase B15 subunit (NDUFB4) / NADH dehydrogenase 1, beta subcomplex, subunit 6 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB6/B17 subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase chain 4, N-terminal / NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain 2 / NADH dehydrogenase subunit 2, C-terminal / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, amino terminus / NADH dehydrogenase subunit 2 C-terminus / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8 / GRIM-19 / NADH-ubiquinone oxidoreductase ASHI subunit (CI-ASHI or NDUFB8) / GRIM-19 protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 5 C-terminus / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NDUFA6, LYR domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFS5-15kDa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, NDUB7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit (NDUFB7) / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial / NDUFB9, LYR domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, iron-sulphur subunit 5 / ETC complex I subunit conserved region / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 8 / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit G, C-terminal / Deoxynucleoside kinase domain / デオキシヌクレオシドキナーゼ / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature. / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit / NADH-quinone oxidoreductase, chain I / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D/H / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 49kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 49 Kd subunit signature. / NADH-quinone oxidoreductase, subunit D / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 49 Kd subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 3. / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 2. / NADH dehydrogenase, subunit C / NADH ubiquinone oxidoreductase, F subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 30 Kd subunit signature. / Complex 1 LYR protein domain / 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 1. / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/K / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6 / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6 / Complex 1 protein (LYR family) / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 75kDa subunit, conserved site / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminal / NADH-quinone oxidoreductase, chain 5-like / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit superfamily / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 30 Kd subunit / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus / NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region / NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 51 Kd subunit signature 1. / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/Mnh complex subunit C1-like / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 3 superfamily / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 24 Kd subunit signature.
類似検索 - ドメイン・相同性
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial ...NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / GH23780p / GEO11417p1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial / Acyl carrier protein, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial / GM23292p / Complex I-49kD / NADH dehydrogenase (ubiquinone) 23 kDa subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 39 kDa subunit, isoform A / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 13 kDa B subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 24 kDa subunit, isoform A / LD31474p / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / RH45008p / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
類似検索 - 構成要素
生物種Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ) / fruit fly (キイロショウジョウバエ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.3 Å
データ登録者Padavannil A / Letts JA
資金援助 米国, 1件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)GM137929 米国
引用ジャーナル: Elife / 年: 2023
タイトル: Resting mitochondrial complex I from adopts a helix-locked state.
著者: Abhilash Padavannil / Anjaneyulu Murari / Shauna-Kay Rhooms / Edward Owusu-Ansah / James A Letts /
要旨: Respiratory complex I is a proton-pumping oxidoreductase key to bioenergetic metabolism. Biochemical studies have found a divide in the behavior of complex I in metazoans that aligns with the ...Respiratory complex I is a proton-pumping oxidoreductase key to bioenergetic metabolism. Biochemical studies have found a divide in the behavior of complex I in metazoans that aligns with the evolutionary split between Protostomia and Deuterostomia. Complex I from Deuterostomia including mammals can adopt a biochemically defined off-pathway 'deactive' state, whereas complex I from Protostomia cannot. The presence of off-pathway states complicates the interpretation of structural results and has led to considerable mechanistic debate. Here, we report the structure of mitochondrial complex I from the thoracic muscles of the model protostome . We show that although complex I (-CI) does not have a NEM-sensitive deactive state, it does show slow activation kinetics indicative of an off-pathway resting state. The resting-state structure of -CI from the thoracic muscle reveals multiple conformations. We identify a helix-locked state in which an N-terminal α-helix on the NDUFS4 subunit wedges between the peripheral and membrane arms. Comparison of the -CI structure and conformational states to those observed in bacteria, yeast, and mammals provides insight into the roles of subunits across organisms, explains why the -CI off-pathway resting state is NEM insensitive, and raises questions regarding current mechanistic models of complex I turnover.
履歴
登録2022年10月15日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年3月29日-
マップ公開2023年3月29日-
更新2023年4月5日-
現状2023年4月5日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_28581.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_28581.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.88 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.6
最小 - 最大-2.0644338 - 6.016722
平均 (標準偏差)0.0013250788 (±0.094477884)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ512512512
Spacing512512512
セルA=B=C: 450.56 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_28581_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_28581_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : mitochondrial complex I from the thoracic muscles of D. melanogaster

全体名称: mitochondrial complex I from the thoracic muscles of D. melanogasterNADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
要素
  • 複合体: mitochondrial complex I from the thoracic muscles of D. melanogasterNADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 24 kDa subunit, isoform A
    • タンパク質・ペプチド: LD31474p
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase (ubiquinone) 23 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 39 kDa subunit, isoform A
    • タンパク質・ペプチド: GEO11417p1
    • タンパク質・ペプチド: Complex I-49kD
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 13 kDa B subunit
    • タンパク質・ペプチド: RH45008p
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER鉄・硫黄クラスター
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
  • リガンド: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
  • リガンド: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
  • リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
  • リガンド: FLAVIN MONONUCLEOTIDEフラビンモノヌクレオチド
  • リガンド: 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

+
超分子 #1: mitochondrial complex I from the thoracic muscles of D. melanogaster

超分子名称: mitochondrial complex I from the thoracic muscles of D. melanogaster
タイプ: complex / ID: 1 / キメラ: Yes / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#42
由来(天然)生物種: Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ)

+
分子 #1: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 16.848254 KDa
配列文字列:
MAKFLGINRL TKLFQMVREA GGLKQAYLKL YRNDDLKIGT LVGIDKYGNK YFENPYYFYG RNRWIEFAPH VNMDYDGSMI PAEWYGWMH YKTDLPPIRD GCRPKYKWIA DHSENLSGTK EAYYPYSTTP NKVEAWEPKA KKQ

+
分子 #2: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 14.383414 KDa
配列文字列:
MASKQLVNNL SKLGLPRQNW MSPLASVRHS SCRGDIEKVT HTGQVFDKED YRNARFVNAK RYVNENWGIK LIEEVPPKEC TERVVFCDG GDGPLGHPKV YINLDKPGNH ICGYCGLRFV KKDDHHH

+
分子 #3: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 78.72425 KDa
配列文字列: MIRAPLVKAL GALGSPTHQM ASRAVRTSAM VAQTPAKAPE KIEVFVDDIP VQVVPGTTVL QAAAQIGVEI PRFCYHERLA VAGNCRMCL VEVEKSPKPV AACAMPVMKG WRIKTNSDLT RKAREGVMEF LLMNHPLDCP ICDQGGECDL QDQAMAFGSD R SRFTDINY ...文字列:
MIRAPLVKAL GALGSPTHQM ASRAVRTSAM VAQTPAKAPE KIEVFVDDIP VQVVPGTTVL QAAAQIGVEI PRFCYHERLA VAGNCRMCL VEVEKSPKPV AACAMPVMKG WRIKTNSDLT RKAREGVMEF LLMNHPLDCP ICDQGGECDL QDQAMAFGSD R SRFTDINY TGKRAVEDKD IGPLVKTIMT RCIHCTRCVR FASEIAGVDD LGTTGRGNDM QIGTYVEKLF LTELSGNVID LC PVGALTN KPYSFVARPW EIRKVSSIDV LDAVGSNIVV STRTNEVLRI LPRENEDVNE EWLADKSRFA CDGLKRQRLV APM VRMPNG ELQAVEWEGA LIAVAKAIKA AGGQIAGISG QLADLEAQVA LKDLLNRLGS EVVATEQGFI AGGTDNRANY LLNS TIAGL EEADAVLLVG TNPRYEAPLV NTRLRKAYVH NELQIASIGP KIDLSYDHEN LGADAALVKD VCSGAHAFSK VLEGA KKPA IIIGADLLER ADGAAIHATV AEYCKKLKKP NWNPFNVLQT NAAQVGALDV GYKAGAQTAV KAQPKVLFLL NADAGK VTR EQLPKDCFVV YIGSHGDNGA SIADAVLPGA AYTEKQGIYV NTEGRPQQTL PGVSPPGMAR EDWKILRALS EVVGKPL PY DNLDELRNRL EDVAPHLTRL GQLEPAGDAG AAGTISKSIG GGAIDIKLKE LRDYFMTDAI SRASPTMAKC ISAVNKQQ R ENEAKQSVAI

+
分子 #4: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 30.013244 KDa
配列文字列: MAALIRNLGA RAAVAALSAK HVVPAAGSTA LRMASTTPVE PKKADKPTVR QPDAVARSHL SDFGRYVAEC LPKYVQKVQL TAGDELEVL IAPEGVVPVL QFLKDHHQAQ FTNLVDIAGV DVPCRKNRFE VVYNLLSLRY NSRIRVKTYT DELTPLDSAC E VHKAANWY ...文字列:
MAALIRNLGA RAAVAALSAK HVVPAAGSTA LRMASTTPVE PKKADKPTVR QPDAVARSHL SDFGRYVAEC LPKYVQKVQL TAGDELEVL IAPEGVVPVL QFLKDHHQAQ FTNLVDIAGV DVPCRKNRFE VVYNLLSLRY NSRIRVKTYT DELTPLDSAC E VHKAANWY EREIWDMYGV FFANHPDLRR ILTDYGFEGH PQRRDFPLSG YVELRYDDEK KRVVCEPLEL AQEFRKFDLS AP WEQFPNF RNANPPAEVV PPQAPAKK

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分子 #5: NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 24 kDa subunit, isoform A

分子名称: NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 24 kDa subunit, isoform A
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 26.814693 KDa
配列文字列: MLTNCASKTL AAVRANIRAI ATSSARASDN LFVHRDTPED NPNIPFEFTA ENKKRVEAIL SIYPEGHKRG AMIPLLDLAQ RQYGWLPIS AMHKVAEILQ LPNMRVYEVA TFYTMFMRKP TGKYHIQVCT TTPCWLRGSD DILETCKKQL GIGVGDTTKD R KFTISEVE ...文字列:
MLTNCASKTL AAVRANIRAI ATSSARASDN LFVHRDTPED NPNIPFEFTA ENKKRVEAIL SIYPEGHKRG AMIPLLDLAQ RQYGWLPIS AMHKVAEILQ LPNMRVYEVA TFYTMFMRKP TGKYHIQVCT TTPCWLRGSD DILETCKKQL GIGVGDTTKD R KFTISEVE CLGACVNAPM VAINDDYYED LTSKDMQDIL NDLKADKISP PGPRNGRFAS EPKGEPTSLS EEPKGPGFGL QA GL

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分子 #6: LD31474p

分子名称: LD31474p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 24.622855 KDa
配列文字列: MLRSAMMSST LSRALQKATQ TPNASISALP ALNLALVRQQ QTLPVAEVAQ NLPKKGYSPF GTKQSSVAEW SLARLDDLLN WGRKGSIWP LTFGLACCAV EMMHIAAPRY DMDRYGVVFR ASPRQADVII VAGTLTNKMA PALRKVYDQM PEPRWVISMG S CANGGGYY ...文字列:
MLRSAMMSST LSRALQKATQ TPNASISALP ALNLALVRQQ QTLPVAEVAQ NLPKKGYSPF GTKQSSVAEW SLARLDDLLN WGRKGSIWP LTFGLACCAV EMMHIAAPRY DMDRYGVVFR ASPRQADVII VAGTLTNKMA PALRKVYDQM PEPRWVISMG S CANGGGYY HYSYSVVRGC DRIIPVDIYV PGCPPTAEAL MYGVLQLQKK VKRMKTLQMW YRK

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分子 #7: NADH dehydrogenase (ubiquinone) 23 kDa subunit

分子名称: NADH dehydrogenase (ubiquinone) 23 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 24.60998 KDa
配列文字列: MSLTMRIFTA SRNGQRLFGS HGARLLAAQR AEPKDIVEVP KGYVYVNNKE LSMEFADITD RAASTMFFGE LLRGFAVTLA HIFKEPATI NYPFEKGPLS PRFRGEHALR RYPSGEERCI ACKLCEAICP AQAITIEAEE RADGSRRTTR YDIDMTKCIY C GFCQEACP ...文字列:
MSLTMRIFTA SRNGQRLFGS HGARLLAAQR AEPKDIVEVP KGYVYVNNKE LSMEFADITD RAASTMFFGE LLRGFAVTLA HIFKEPATI NYPFEKGPLS PRFRGEHALR RYPSGEERCI ACKLCEAICP AQAITIEAEE RADGSRRTTR YDIDMTKCIY C GFCQEACP VDAIVEGPNF EFSTETHEEL LYNKEKLLCN GDKWESEIAS NLQADHLYR

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分子 #8: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 13.572529 KDa
配列文字列:
MFSIIFIALL ILLITTIVMF LASILSKKAL IDREKSSPFE CGFDPKSSSR LPFSLRFFLI TIIFLIFDVE IALILPMIII MKYSNIMIW TITSIIFILI LLIGLYHEWN QGMLNWSN

+
分子 #9: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 36.38352 KDa
配列文字列: MFYMEFILSL IGSLLLIICV LVSVAFLTLL ERKVLGYIQI RKGPNKVGLM GIPQPFCDAI KLFTKEQTYP LLSNYLSYYI SPIFSLFLS LFVWMCMPFF VKLYSFNLGG LFFLCCTSLG VYTVMVAGWS SNSNYALLGG LRAVAQTISY EVSLALILLS F IFLIGSYN ...文字列:
MFYMEFILSL IGSLLLIICV LVSVAFLTLL ERKVLGYIQI RKGPNKVGLM GIPQPFCDAI KLFTKEQTYP LLSNYLSYYI SPIFSLFLS LFVWMCMPFF VKLYSFNLGG LFFLCCTSLG VYTVMVAGWS SNSNYALLGG LRAVAQTISY EVSLALILLS F IFLIGSYN MIYFFFYQVY MWFLIILFPM ALVWVSISLA ETNRTPFDFA EGESELVSGF NVEYSSGGFA LIFMAEYASI LF MSMLFCV IFLGCDVFNL LFYMKLTFIS FVFIWVRGTL PRFRYDKLMY LAWKCFLSFS LNYLLFFIGF KILLFSLL

+
分子 #10: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 51.383047 KDa
配列文字列: MLKIIFFLLF LIPFCFINNM YWMVQIMMFF ISFIFLLMNN FMNYWSEISY FLGCDMLSYG LILLSLWICS LMLLASEMIN KHNNYKNLF LLNIIILLLL LILTFSSMSL FMFYLFFESS LIPTLFLILG WGYQPERLQA GLYLLFYTLL VSLPMLIGIF Y VMNKIGSM ...文字列:
MLKIIFFLLF LIPFCFINNM YWMVQIMMFF ISFIFLLMNN FMNYWSEISY FLGCDMLSYG LILLSLWICS LMLLASEMIN KHNNYKNLF LLNIIILLLL LILTFSSMSL FMFYLFFESS LIPTLFLILG WGYQPERLQA GLYLLFYTLL VSLPMLIGIF Y VMNKIGSM NFYLMNNFMF NYDLLYFCLL CAFLVKMPMF LVHLWLPKAH VEAPVSGSMI LAGIMLKLGG YGMLRVISFL QL MNLKYSF VWISISLVGG VLVSLVCLRQ TDLKALIAYS SVAHMGIVLS GLLTMTYWGL CGSYTLMIAH GLCSSGLFCL ANV SYERLG SRSMLINKGL LNFMPSMTLW WFLLSSANMA APPTLNLLGE ISLLNSIVSW SWISMILLSF LSFFSAAYTL YLYS FSQHG KLFSGVYSFS SGKIREYLLM LLHWLPLNLL ILKSESFMLW L

+
分子 #11: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 65.777867 KDa
配列文字列: MKYLSICSIS FVNLISMSLS CFLLSLYFLL NDMIYFIEWE LVSLNSMSIV MTFLFDWMSL LFMSFVLMIS SLVIFYSKEY MMNDNHINR FIMLVLMFVL SMMLLIISPN LISILLGWDG LGLVSYCLVI YFQNIKSYNA GMLTALSNRI GDVALLLSIA W MLNYGSWN ...文字列:
MKYLSICSIS FVNLISMSLS CFLLSLYFLL NDMIYFIEWE LVSLNSMSIV MTFLFDWMSL LFMSFVLMIS SLVIFYSKEY MMNDNHINR FIMLVLMFVL SMMLLIISPN LISILLGWDG LGLVSYCLVI YFQNIKSYNA GMLTALSNRI GDVALLLSIA W MLNYGSWN YIFYLEIMQN EFEMLMIGSL VMLAAMTKSA QIPFSSWLPA AMAAPTPVSA LVHSSTLVTA GVYLLIRFNI IL STSWLGQ LMLLLSGLTM FMAGLGANFE FDLKKIIALS TLSQLGLMMS ILSMGFLKLA MFHLLTHALF KALLFMCAGA IIH NMNNSQ DIRLMGGLSI HMPLTSACFN VSNLALCGMP FLAGFYSKDM ILEIVSISNV NMFSFFLYYF STGLTVSYSF RLVY YSMTG DLNCGSLNML NDESWIMLRG MMGLLIMSII GGSMLNWLIF PFPYMICLPI YMKLLTLFVC IVGGLFGYLI SLSNL FFLN KSLFMYNLST FLGSMWFMPY ISTYGMIFYP LNYGQLVVKS FDQGWSEYFG GQHLYQKLSM YSKTLFLMHN NSLKIY LLL FVFWILILLI LLFL

+
分子 #12: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 19.87342 KDa
配列文字列:
MVITNNTTLP EESELNVQEL NLSSAALRAG AFHLGKQCEQ ANNEFMLCRQ ELDDPRACLA EGKAVTSCAL DFFRKVKKTC HEEFTQYAT CLDKSSGTMA FSHCRKTQGV FDKCIKDNFD WDRPSYGYFS RAKVIQSARE APKKEEKVSY PDATPGLPED Y PKPPAKYG SRFHWLE

+
分子 #13: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 14.878194 KDa
配列文字列:
MWFEILPGAV IITTLLSVPI YAMYGLDKLM IGNAFRRNMD ERFSRVMYQR DFRLTDNPYK MNGLEQIPDE EVKKEEKDPN EDSDDPAIV KKREKERKLR EKQLKKEEKL REKQLKEEEK QKKN

+
分子 #14: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 17.773566 KDa
配列文字列:
MATAVPHCPP KQDLPPPGGY KKIPFARVPP KSYFTGFTTI GTYVVVTAVG LGIYYLTAKK VKRDEIEMRS AQNVIFPILV AERDREFLR QLRRNRDEEA ELMKNVPGWE VGTWYGEPVF KTLPEDTLVT PIFKEFYAHS DWKSYAKRAH LKLWS

+
分子 #15: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 12.015969 KDa
配列文字列:
MSLTPFLRLP LTDLTGCLIN HQTYDKCGKF EMKMMECFEA YGLERGKREC ADLISDFQEC VGMQKQLMRF HAMRNERYKQ WLKGERKGQ EFFADPPRVD AY

+
分子 #16: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 18.433131 KDa
配列文字列:
MSLLRSKYYD HPDGEDAFGK IVATNKYAVS AGVAWSMFDV LTLSKPQGYL PTLGRFAYNT GPLMGMATAF TLTTLVATNA RGKDDKINY LIGGFAAGGV FGAWKHNHVA GLCAGLFLGI AGVIKKMSIE QGWEFFPNTP IKQYGGLNIA GNDWTIMADP P KNWTTEKP KE

+
分子 #17: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 18.946418 KDa
配列文字列:
MPEPRSPMAS FAESVLNVID GPITWFRESI VEPNQQKQNW YHQRFRRVPT IDQCYTDDAV CRFEADQQFR RDRMVDNEIV NILRQRFED CTLYEAPDHM VKCRPLMDQY EKATENWFIK YGDLGGYANA KTAYMKQKHR LIWERRHGPV GSGMKEEAAH

+
分子 #18: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 19.025879 KDa
配列文字列:
MVAGGASETG GVKPMVIAGR MVRERERLIG MSPEERAWRK QWLKDQELHH GPRKVPALEL ELNNPIKRFY RAPLDKVCNV LEPVLGFQR AYTVRFWTGK ALLALTGIYA GAYYFKYNQN DWTRKGGWRV IHSRKQCVPG DEGYPKVSDR SAPSDYAARG F NESPLKA

+
分子 #19: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 13.157016 KDa
配列文字列:
MVLSNEEQEF IKRKHEATLK LRQEFLKQSS NPYRHATGEG GTVFDAGLAR FQAMRVSNYE HFKPTGKSFR TGLFAVVLPI ALYAWALKA ERDGREEKYR TGQVAYKDRQ FKFI

+
分子 #20: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 13.905104 KDa
配列文字列:
MGNALTHYMK PDVMPGPDVV PTFDPLLGFK SRKERVMIAT QEEMESAKLP LEFRDYCAHL AIAYQACRSD TFPFVYKCAH QKHEYLTCE YEDYVLRMKE FERERRLLER QKRLNKAA

+
分子 #21: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 22.065145 KDa
配列文字列:
MVGWSRLLSP AAKFASYRAV LQEPACRNAL HQQLRRMGGD HGHHQMIIKP SRFQWDKFKD LLHFYVMLGV IPVTALVLYA NIFVGPAQL AEIPEGYEPK HWEYEKHPIS RFISRYILNS DQQNYEKSLH YLYEENEKAQ IRLLEDEVRR KMSERNDYQA Y YYRPSVAK YHRISKEAAD ELEALRGD

+
分子 #22: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 17.416799 KDa
配列文字列:
MAQVPLAIVS HKRQVCSLYK RALRNLESWY DRRNVYRYRA VQLRARFDEN RSKDLGEGIR LLACGQRELF ETRHFQPRNF ANSAGGCAF EREVIPPDWV LDYWHPLEKA QYPEYFAKRE QRKKEFVTWW EKQYGKPDPK DLGHH

+
分子 #23: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mit...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 16.988021 KDa
配列文字列:
MSALFRLTNR AVALQRSLVA NQAAVVRAIN TSPKKDETIT APTSLTTEDF ANPSPKNWQS YGFDYKDQVE DRKATKSTFF VTVTLCLVW GSFYWAYLPD TQFRNWAQRE GFLELRRREL AGVDLVSPNY VDPASITLPS DEDLGDTEII I

+
分子 #24: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 20.229873 KDa
配列文字列:
MSAFVKTVCL AQKLCAANPV VARQAIRSMA GWNKDYKPGP YPQTEKERLA AAKKYYLLPE EYKPYADDGL GYGDYPKLGY GLGVEAKDS YYPWDYPEHK RNQHEPISAD HDLYSEDRWS QAEPPRYSNA YYFACFLGVM SGCLALYYWL DDKKMYRPVA A KQYPSPGV KHYTFEK

+
分子 #25: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 12.113603 KDa
配列文字列:
MGGHHGEPYT VPHASTYKVE SVPQLVEVKE ALGRQGLKDP WLRNEVWRYE PKAFGTHRSR LNTFLFRGLG VGFCAFLATV AVEYALGIG KGQGGHGHGH GHEEHGDKGH H

+
分子 #26: Acyl carrier protein, mitochondrial

分子名称: Acyl carrier protein, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 17.257992 KDa
配列文字列:
MSFTQIARSC SRLAATLAPR RVASGILIQS QASRMMHRIA VPSMTSQLSQ ECRGRWQTQL VRKYSAKPPL SLKLINERVL LVLKLYDKI DPSKLNVESH FINDLGLDSL DHVEVIMAME DEFGFEIPDS DAEKLLKPAD IIKYVADKED VYE

+
分子 #27: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 12.925802 KDa
配列文字列:
MSAVNDPLEL LTNKGTHEPS FLSPIWNPIA CGVAGVGAAI FINWGFRKPV FSGIQKHIAF GAIGVGAGAY FDQKRNEYLA KRDAVLRHY IELHPDDFPV KERKTYGQVL ESWVPVR

+
分子 #28: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 6.232307 KDa
配列文字列:
MVLGLDKRAL WGALPLLGFA IGHFLDKKET ERMTMFRDKS ALYGRPAGSE GKAPSW

+
分子 #29: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 20.710354 KDa
配列文字列:
MSALRQVMCR STASLQLYQA NRAAAARWAS TATDGGPLDP KTALARPEEL EQRNKLSGKI TVPTAVNLSP ISGVPEEHIR ERRVRIHIP PKNAMQSGTD NVNTWQIEFD NRERWENPLM GWASSGDPLS NMNVQFGSPE EAITFCERNG WRWYVDGAAK P KKERVKNY GINFAWNKRT RVSTK

+
分子 #30: NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 39 kDa subunit, isoform A

分子名称: NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 39 kDa subunit, isoform A
タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADHデヒドロゲナーゼ
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 46.891699 KDa
配列文字列: MAAIVLTRNL QLAKHHGSGV VGVLCLRGYS AAAAPPEDGP RPLKTTNPAA MKRGTGGRSS FNGIVATVFG ATGFVGRYVC NKLGKSGTQ MILPYRGDDS DVIRLKVTGD LGQVLFHFYN LEDPASIRDA VKHSNVVINL VGRDFETKNF KFKDVHVNGA E RIARIARE ...文字列:
MAAIVLTRNL QLAKHHGSGV VGVLCLRGYS AAAAPPEDGP RPLKTTNPAA MKRGTGGRSS FNGIVATVFG ATGFVGRYVC NKLGKSGTQ MILPYRGDDS DVIRLKVTGD LGQVLFHFYN LEDPASIRDA VKHSNVVINL VGRDFETKNF KFKDVHVNGA E RIARIARE AGVERLIHLS SLNVEANPKD LYVKGGSEWL KSKYEGELRV RDAFPNATII RPADIYGSED RFLRYYAHIW RR QFRSMPL WHKGEKTVKQ PVYVSDVAQA IINAAKDPDS AGRIYQAVGP KRYQLSELVD WFHRLMRKDQ KRWGYMRYDM RWD PTFLLK AKLNSFICPG TPIGGLHPAR IEREAVTDKV LTGVPTLEDL GVTLTTMEQQ VPWELRPYRA ALYYDAELGE FETP SPPKC IEARDELRLF A

+
分子 #31: GEO11417p1

分子名称: GEO11417p1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 10.758288 KDa
配列文字列:
MSFALRLGSS IGCFHRTILG RDIIQRKSHV VSYRNGPPPH SKATKIGALT VGGAMWWWVI WHLWHEPDHI TGEFDYPNSR KWSNTELGV PKDGF

+
分子 #32: Complex I-49kD

分子名称: Complex I-49kD / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 52.985953 KDa
配列文字列: MANIMRRTLI PGLSHLRLRP QLVAAGSAAL TSQETRRGAA KWYPDPEFMK QFSGPVMYPD EVTSLWTVPP WNSKVTPVEK SVRNLTLNF GPQHPAAHGV LRLVLELDGE TVMRADPHIG LLHRGTEKLI EYKTYTQALP YFDRLDYVSM MCNEQCYSLA V EKLLNIDV ...文字列:
MANIMRRTLI PGLSHLRLRP QLVAAGSAAL TSQETRRGAA KWYPDPEFMK QFSGPVMYPD EVTSLWTVPP WNSKVTPVEK SVRNLTLNF GPQHPAAHGV LRLVLELDGE TVMRADPHIG LLHRGTEKLI EYKTYTQALP YFDRLDYVSM MCNEQCYSLA V EKLLNIDV PLRAKYIRTL FAEITRILNH IMAVGTHALD VGALTPFFWL FEEREKMMEF YERVSGARMH AAYIRPGGVS LD MPLGLMD DIYEFASKFA ERLDEVEDVL TTNRIWVQRT EDIGIVTAEE ALNYGFSGVM LRGSGIKWDL RKQQPYDAYN LVN FDVPIG TKGDCYDRYL CRVEEMRQSL RIIDQCLNQM PAGEIKTDDA KVAPPSRSEM KTSMEALIHH FKLFTQGYQV PPGA TYTAI EAPKGEFGVY LISDGSSRPY RCKIKAPGFA HLAALEKIGK QHMLADVVAI IGTLDVVFGE IDR

+
分子 #33: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 2.315846 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #34: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 51.898652 KDa
配列文字列: MAAIVRFNLL TKPQIVATLP ASLHVQRFQS TQAPPPGTPP PQTKTKFGPL ADEDRIFTNL YGRHDWRLKG ALKRGDWYKT KEIVLKGAD WIVNEIKTSG LRGRGGAGFP SGMKWSFMNK PGDGRPKYLV VNADEGEPGT CKDREIMRHD PHKLVEGCLI A GRAMGAQA ...文字列:
MAAIVRFNLL TKPQIVATLP ASLHVQRFQS TQAPPPGTPP PQTKTKFGPL ADEDRIFTNL YGRHDWRLKG ALKRGDWYKT KEIVLKGAD WIVNEIKTSG LRGRGGAGFP SGMKWSFMNK PGDGRPKYLV VNADEGEPGT CKDREIMRHD PHKLVEGCLI A GRAMGAQA AYIYIRGEFY NEASNMQLAI AEAYQAGLIG KNACGTGYDF DVFMHRGAGA YICGEETALI ESLEGKQGKP RL KPPFPAD VGVFGCPTTV TNVETVAVAP TICRRGGVWF ASFGRTRNSG TKLFNISGHV NRPCTVEEEM SIPLKELIER HCG GVTGGW DNLLGVIPGG SSTPIIPKNV CDDVIMDFDG LIAAQTSLGT AAIIVMDKST DVIKAIARLI SFYKHESCGQ CTPC REGIG WMNKIMTRFV KGDAQPAEID MLWEISKQIE GHTICALGDG AAWPVQGLIR HFRPEIEKRM QLHAKRVSN

+
分子 #35: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 39.839887 KDa
配列文字列: MFNNSSKILF ITIMIIGTLI TVTSNSWLGA WMGLEINLLS FIPLLSDNNN LMSTEASLKY FLTQVLASTV LLFSSILLML KNNMNNEIN ESFTSMIIMS ALLLKSGAAP FHFWFPNMME GLTWMNALML MTWQKIAPLM LISYLNIKYL LLISVILSVI I GAIGGLNQ ...文字列:
MFNNSSKILF ITIMIIGTLI TVTSNSWLGA WMGLEINLLS FIPLLSDNNN LMSTEASLKY FLTQVLASTV LLFSSILLML KNNMNNEIN ESFTSMIIMS ALLLKSGAAP FHFWFPNMME GLTWMNALML MTWQKIAPLM LISYLNIKYL LLISVILSVI I GAIGGLNQ TSLRKLMAFS SINHLGWMLS SLMISESIWL IYFFFYSFLS FVLTFMFNIF KLFHLNQLFS WFVNSKILKF TL FMNFLSL GGLPPFLGFL PKWLVIQQLT LCNQYFMLTL MMMSTLITLF FYLRICYSAF MMNYFENNWI MKMNMNSINY NMY MIMTFF SIFGLFLISL FYFMF

+
分子 #36: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 11.363853 KDa
配列文字列:
MIMILYWSLP MILFILGLFC FVSNRKHLLS MLLSLEFIVL MLFFMLFIYL NMLNYESYFS MMFLTFSVCE GALGLSILVS MIRTHGNDY FQSFSIM

+
分子 #37: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 20.083594 KDa
配列文字列:
MIQLMLYSLI ITTSIIFLNM IHPLALGLTL LIQTIFVCLL TGLMTKSFWY SYILFLIFLG GMLVLFIYVT SLASNEMFNL SMKLTLFSS LILIFMLILS FIMDKTSSSL FLMNNDMQSI INMNSYFMEN SLSLNKLYNF PTNFITILLM NYLLITLIVI V KITKLFKG PIRMMS

+
分子 #38: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 11.562093 KDa
配列文字列:
MSALRRDVSP LIQRIRAFLL GREHNLALRF EDGLADRTQP QPEIPDGPSH LLSANYYCQR DGRREVLPPI DLVEQQKQLA AEGEAAKAP SSKLPTPGKV YAWD

+
分子 #39: NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 13 kDa B subunit

分子名称: NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 13 kDa B subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADHデヒドロゲナーゼ
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 13.808102 KDa
配列文字列:
MAKIIKASTG LTGLAVSTNP HHTLSALYGK ILRAVSKMPQ DASYRKYTEQ LVKQRADSVA QHKDITALEK AVGCGQVEEL IVQAENELI LARKMLGWKP WEKLVQAAPA KQWDWPPAQI MEPKV

+
分子 #40: RH45008p

分子名称: RH45008p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 8.412455 KDa
配列文字列:
MSASAARGST SLLKRAWNEI PDIVGGSALA LAGIVMATIG VANYYAKDGD NRRYKLGYVV YRHDDPRALK VRNDEDD

+
分子 #41: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 14.921432 KDa
配列文字列:
MAGREAVKRA VQQVRPILSV DREEARKRAL NLYKAWYRQI PYIVMDYDIP MTVEQCRDKL REEFVKHRNV TDIRVIDMLV IKGQMELKE SVEIWKQKGH IMRYWKESQD PKPTDFLSKF IQGVN

+
分子 #42: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mi...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: fruit fly (キイロショウジョウバエ)
分子量理論値: 46.955477 KDa
配列文字列: MTAVFRVGLV RLVSRATQSP NLLQAQTNAL PAAFQQRCSI SGKTMRGGPR VPKAAPYPYK TKKYSVFNAI FDKTSKRFDE NSKVICVEG PIAAGKSKFA KELAEELDME YYPAVDLDLI YINSYGYDMR KLDPQLPPSC RSYDVRNFCL DPSHDLAAQF Q IRMYMLRY ...文字列:
MTAVFRVGLV RLVSRATQSP NLLQAQTNAL PAAFQQRCSI SGKTMRGGPR VPKAAPYPYK TKKYSVFNAI FDKTSKRFDE NSKVICVEG PIAAGKSKFA KELAEELDME YYPAVDLDLI YINSYGYDMR KLDPQLPPSC RSYDVRNFCL DPSHDLAAQF Q IRMYMLRY SQYIDALQHV LSTGQGVVLE RSPYSDFVFM EAMFRQGYLS RGARSVYNEL RQNTIGELLK PHLVIYLDLP VD AVKKQIK ARNVDYEVQS KVFSDAYLSD LEQLYKQQYL KDISTHAELL IYDWTAGGET EVVVEDIERI DFNQFEADIH NKK MLDWRF PLEAEWCEAR IKYCHEKPDL MNYFNVPRFD VPELVRSADD GKVWRDVWFN APGMKYRPGY NADMGDEGLL TKTK IGINQ GI

+
分子 #43: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 43 / コピー数: 8 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM / Cardiolipin

+
分子 #44: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 44 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #45: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 45 / コピー数: 6 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄 / 鉄・硫黄クラスター

+
分子 #46: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 2 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / 鉄・硫黄クラスター

+
分子 #47: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 14 / 式: PC1
分子量理論値: 790.145 Da
Chemical component information

ChemComp-PC1:
1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / リン脂質*YM / ホスファチジルコリン

+
分子 #48: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine

分子名称: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 13 / 式: 3PE
分子量理論値: 748.065 Da
Chemical component information

ChemComp-3PE:
1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / DSPE / リン脂質*YM / ホスファチジルエタノールアミン

+
分子 #49: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-b...

分子名称: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 2 / 式: ZMP
分子量理論値: 568.704 Da
Chemical component information

ChemComp-ZMP:
S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate

+
分子 #50: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

分子名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 1 / 式: NDP
分子量理論値: 745.421 Da
Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / NADPH / ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸

+
分子 #51: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

分子名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 1 / 式: FMN
分子量理論値: 456.344 Da
Chemical component information

ChemComp-FMN:
FLAVIN MONONUCLEOTIDE / FMN / フラビンモノヌクレオチド

+
分子 #52: 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 52 / コピー数: 1 / 式: DGT
分子量理論値: 507.181 Da
Chemical component information

ChemComp-DGT:
2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / dGTP / デオキシグアノシン三リン酸

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実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.7
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡TFS GLACIOS
電子線加速電圧: 200 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 60.0 e/Å2

-
画像解析

初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 293389
FSC曲線 (解像度の算出)

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原子モデル構築 1

精密化プロトコル: OTHER
得られたモデル

PDB-8esw:
Structure of mitochondrial complex I from Drosophila melanogaster, Flexible-class 1

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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