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- EMDB-22679: Structure of outer-arm dynein bound to microtubule doublet in mic... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-22679
タイトルStructure of outer-arm dynein bound to microtubule doublet in microtubule binding state 2 (MTBS-2)
マップデータ
試料
  • 複合体: Outer-arm dynein bound to microtubule doublet in microtubule binding state 2 (MTBS-2)
    • タンパク質・ペプチド: x 18種
  • リガンド: x 3種
機能・相同性
機能・相同性情報


outer dynein arm / outer dynein arm assembly / dynein light chain binding / cilium movement / dynein heavy chain binding / axonemal dynein complex / dynein complex / minus-end-directed microtubule motor activity / cytoplasmic dynein complex / dynein light intermediate chain binding ...outer dynein arm / outer dynein arm assembly / dynein light chain binding / cilium movement / dynein heavy chain binding / axonemal dynein complex / dynein complex / minus-end-directed microtubule motor activity / cytoplasmic dynein complex / dynein light intermediate chain binding / 繊毛 / dynein intermediate chain binding / microtubule-based movement / alpha-tubulin binding / microtubule-based process / 微小管 / calcium ion binding / ATP hydrolysis activity / ATP binding / 細胞質
類似検索 - 分子機能
Dynein light chain Tctex-1 like / Tctex-1-like superfamily / Tctex-1 family / Dynein light chain type 1 / Dynein light chain, type 1/2 / Dynein light chain superfamily / Dynein light chain type 1 / Dynein heavy chain, AAA 5 extension domain / Dynein heavy chain AAA lid domain / Roadblock/LAMTOR2 domain ...Dynein light chain Tctex-1 like / Tctex-1-like superfamily / Tctex-1 family / Dynein light chain type 1 / Dynein light chain, type 1/2 / Dynein light chain superfamily / Dynein light chain type 1 / Dynein heavy chain, AAA 5 extension domain / Dynein heavy chain AAA lid domain / Roadblock/LAMTOR2 domain / Roadblock/LC7 domain / Roadblock/LC7 domain / Dynein heavy chain 3, AAA+ lid domain / AAA+ lid domain / Dynein heavy chain, C-terminal domain / Dynein heavy chain, C-terminal domain, barrel region / Dynein heavy chain C-terminal domain / Leucine rich repeat 4 / Leucine Rich repeats (2 copies) / P-loop containing dynein motor region / Dynein heavy chain, tail / Dynein heavy chain, N-terminal region 1 / Dynein heavy chain / Dynein heavy chain region D6 P-loop domain / Dynein heavy chain, linker / Dynein heavy chain, AAA module D4 / Dynein heavy chain, coiled coil stalk / Dynein heavy chain, hydrolytic ATP-binding dynein motor region / Dynein heavy chain, ATP-binding dynein motor region / Dynein heavy chain AAA lid domain / Dynein heavy chain AAA lid domain superfamily / Dynein heavy chain, domain 2, N-terminal / Dynein heavy chain, linker, subdomain 3 / Dynein heavy chain, AAA1 domain, small subdomain / Dynein heavy chain region D6 P-loop domain / Dynein heavy chain, N-terminal region 2 / Hydrolytic ATP binding site of dynein motor region / Microtubule-binding stalk of dynein motor / P-loop containing dynein motor region D4 / ATP-binding dynein motor region / Dynein heavy chain AAA lid domain / EFハンド / Leucine-rich repeat, SDS22-like subfamily / チオレドキシン / Leucine-rich repeat profile. / Thioredoxin domain / ロイシンリッチリピート / EF-hand domain pair / Leucine-rich repeat domain superfamily / EF-hand, calcium binding motif / EF-Hand 1, calcium-binding site / EF-hand calcium-binding domain. / EF-hand calcium-binding domain profile. / EF-hand domain / EF-hand domain pair / Thioredoxin-like superfamily / Trp-Asp (WD) repeats profile. / Trp-Asp (WD) repeats circular profile. / WD domain, G-beta repeat / WD40リピート / WD40リピート / WD40-repeat-containing domain superfamily / WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily / ATPases associated with a variety of cellular activities / AAA+ ATPase domain / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
類似検索 - ドメイン・相同性
チオレドキシン / Dynein light chain tctex-type 1 protein / Dynein intermediate chain 2 / Outer arm dynein beta heavy chain / Dynein light chain roadblock-type 2 protein / Dynein light chain / Dynein light chain / Dynein light chain / Dynein light chain / Dynein light chain 4A ...チオレドキシン / Dynein light chain tctex-type 1 protein / Dynein intermediate chain 2 / Outer arm dynein beta heavy chain / Dynein light chain roadblock-type 2 protein / Dynein light chain / Dynein light chain / Dynein light chain / Dynein light chain / Dynein light chain 4A / Dynein light chain 2A / Dynein light chain 1 / Dynein heavy chain, outer arm protein / Dynein light chain roadblock-type 2 protein / Dynein light chain / Flagellar outer dynein arm intermediate protein, putative / Dynein light chain
類似検索 - 構成要素
生物種Tetrahymena thermophila (真核生物)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.5 Å
データ登録者Rao Q / Zhang K
引用ジャーナル: Nat Struct Mol Biol / 年: 2021
タイトル: Structures of outer-arm dynein array on microtubule doublet reveal a motor coordination mechanism.
著者: Qinhui Rao / Long Han / Yue Wang / Pengxin Chai / Yin-Wei Kuo / Renbin Yang / Fangheng Hu / Yuchen Yang / Jonathon Howard / Kai Zhang /
要旨: Thousands of outer-arm dyneins (OADs) are arrayed in the axoneme to drive a rhythmic ciliary beat. Coordination among multiple OADs is essential for generating mechanical forces to bend microtubule ...Thousands of outer-arm dyneins (OADs) are arrayed in the axoneme to drive a rhythmic ciliary beat. Coordination among multiple OADs is essential for generating mechanical forces to bend microtubule doublets (MTDs). Using electron microscopy, we determined high-resolution structures of Tetrahymena thermophila OAD arrays bound to MTDs in two different states. OAD preferentially binds to MTD protofilaments with a pattern resembling the native tracks for its distinct microtubule-binding domains. Upon MTD binding, free OADs are induced to adopt a stable parallel conformation, primed for array formation. Extensive tail-to-head (TTH) interactions between OADs are observed, which need to be broken for ATP turnover by the dynein motor. We propose that OADs in an array sequentially hydrolyze ATP to slide the MTDs. ATP hydrolysis in turn relaxes the TTH interfaces to effect free nucleotide cycles of downstream OADs. These findings lead to a model explaining how conformational changes in the axoneme produce coordinated action of dyneins.
履歴
登録2020年9月16日-
ヘッダ(付随情報) 公開2021年9月29日-
マップ公開2021年9月29日-
更新2021年10月20日-
現状2021年10月20日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.7
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  • 原子モデル: PDB-7k5b
  • 表面レベル: 0.7
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  • 単純化した表面モデル + あてはめた原子モデル
  • 原子モデルPDB-7k5b
  • Jmolによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_22679.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_22679.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 193.9 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.333 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.7 / ムービー #1: 0.7
最小 - 最大0.0 - 8.594368
平均 (標準偏差)0.028575433 (±0.18947779)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ370396347
Spacing396370347
セルA: 527.86786 Å / B: 493.20984 Å / C: 462.55084 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.3331.3331.333
M x/y/z396370347
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z527.868493.210462.551
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ256256256
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS396370347
D min/max/mean0.0008.5940.029

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Outer-arm dynein bound to microtubule doublet in microtubule bind...

全体名称: Outer-arm dynein bound to microtubule doublet in microtubule binding state 2 (MTBS-2)
要素
  • 複合体: Outer-arm dynein bound to microtubule doublet in microtubule binding state 2 (MTBS-2)
    • タンパク質・ペプチド: Dynein heavy chain, outer arm protein
    • タンパク質・ペプチド: Outer arm dynein beta heavy chain
    • タンパク質・ペプチド: gamma heavy chainΓ
    • タンパク質・ペプチド: Dynein intermediate chain 2
    • タンパク質・ペプチド: Flagellar outer dynein arm intermediate protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chain roadblock-type 2 protein
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chain roadblock-type 2 protein
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chainダイニン
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chainダイニン
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chainダイニン
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chainダイニン
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chainダイニン
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chainダイニン
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chain tctex-type 1 protein
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chain 2A
    • タンパク質・ペプチド: Thioredoxinチオレドキシン
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chain 1
    • タンパク質・ペプチド: Dynein light chain 4A
  • リガンド: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
  • リガンド: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
  • リガンド: MAGNESIUM ION

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超分子 #1: Outer-arm dynein bound to microtubule doublet in microtubule bind...

超分子名称: Outer-arm dynein bound to microtubule doublet in microtubule binding state 2 (MTBS-2)
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#18
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)

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分子 #1: Dynein heavy chain, outer arm protein

分子名称: Dynein heavy chain, outer arm protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 533.780188 KDa
配列文字列: KYSKRIAWMK TTICDSLQLK DMIVEESFQY EKNKNLLEQF LSGEGLNKIF AYYQVQEQAQ NDDIKDTGAQ DPVLFFTTGD LEKIQDKAV WFLRITNPAD DKKKASQQDG NDNDIIFGEI TPNTVPMLNA LMESVYSRQI DHIITEKIQF WGVAEEEQVL E FQQHSNKF ...文字列:
KYSKRIAWMK TTICDSLQLK DMIVEESFQY EKNKNLLEQF LSGEGLNKIF AYYQVQEQAQ NDDIKDTGAQ DPVLFFTTGD LEKIQDKAV WFLRITNPAD DKKKASQQDG NDNDIIFGEI TPNTVPMLNA LMESVYSRQI DHIITEKIQF WGVAEEEQVL E FQQHSNKF SSEVREAINL MSPGTEHFKL DYEAISGLSE SEKMQHYEMK FNEWINLISS QLNDDSEVRK DEKDAGPATE LI YWRSRMQ KITNWSEQLK SKDFQIVKAS LQRHKNHDNQ RPRGDESLSK LMMEYNRLDL LLTDKLNEAK DNVKYLTTLE KFI EPLYNG TPQQIIDTLP ALMNAIKMIH TIARFYNTTD KMTGLFIKIT NQMIKNCKDR ILNKKDNGDN PSLYKMIWEQ DPAE LIEVL GSCIKLYCEY KKCYNDTKEK VADMPKGKTF DFSDAQIFGK FDTFVRRLQK LIEIFSNIQQ FNALAKHNLE GMDVL TNKF KKIIDDFKKK GHNLLDTANN KFDRDWVEFN VEISHLDGEL QNFIDNNFNR FRNIEYSLKL LHKFQSTIKR DSLKHN LTS RYNAILHNYA TELDTIQRVF QDQKSNPPLV RNMPPEAGKI IWARHLFQKI TGPINIFPEN VINSTEIRRY YGSYNTL GK QLTIYEMWFY QDWVNKIEQS KAALQATLIV RHDENKKLYV NFDLEIMQLI REAKCLDRQG IEIPESARII LLQEDKFK T YYNELLYALK EYERINSKIK PICKNLLLPH IEDLDLKLRP GMVTLTWTSM NIESYLYYVH QGLKKLEQLI INVNDIIEN RIENNLKTVS KVVLVHLPQD TKPLSLDSFV QLQEEYINSK TDFLTSKNVE VERAVDDLLQ TIMLYPLDPH VDPVLPEETK RIKRYYFWY FYQALLNSTQ NSLNAMKYRV CGKKIPGANT LQNLKPFFQV EVQLNGDKVT LNPSLQEIQK SINRAATAVL R CSKHLYNW DQQNKDSTDK ATFYDMIACD KEIVKVILLL TGSIQGTKNK VNEFLSGFTK FEWLCKESIQ ESIKKFSKNG PT LQNYEDQ LKKFSQIEEE IEKIVPTYKI GAMELMTHNI CTSLSTWAKE WKLQYSQDLH KRARQLLDSL TEQTKMLSTK LSK PVKDID SLGYVMETLE QIRKEQAEID MKFNPVQEMY SLLDNYLPGG ITDKDEMDAR SLLRRNWDIL IQQAEIKGKE YQHK QAIYL KELKQSIKDF TNQVSIFRRD YEKNGPMVEG ISPAEAMERL RRFEDEYDVK YQMYKINARG ENLFGLQNQK YPELE KTDA EIKNLNKLYN LYDSVIKNIQ QFKEKSWQDV SKDDLAKMEE DAGKYGEQCS RLPKDLKEWQ AYRDLKNYID SLREQL PLI ISLKKPSIMP RHWEKIKEIT NTKLNYENPD QFYIEEIMGA KLLDFREDIE DITESADKQL KIRTGLDEIN LYWNDMQ FQ FGIWGKRDVP CMLNGLIVGT ILERLEEDQL QLSTFNSQRH VTPFKAEVEN LIRTFSDVND TLDMWVKVQK LWTSLEPV F TGGDIARQMP LQAKQFQGID KNWMKIMEKA VETKKVIPCC QNDMLKDFLP DLNRKLEDCQ KMLEAYLEGK RKKFPRFYF VSNPTLLKIL SQGSEPTSIQ EDFEKLFDAI TKVTFESAKD KKNPALKQIT QIQQVIGRNE ENISLTGYYV KCEGNIEDWL KKLEQNMQQ TLKDIASAAA QQVFQVGLKE FVSSQASQIA LLGLQILWTS KVNEGLERLS RNERNAMDIK RNEIKEHMNI L SSMCLEDL NGAVERTKVE TLVTIQVHQK DISMDLKCKD 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IFKGILTCKK DTINDAPKSM KIK PELFLV GLWRHEAERV LADKLVNNKD KDTVMGYIQE VSLESFSQIE NEILEKYSSE KTFLFCDFLR PDVINEDGII EEEA PKIYE AIDSLTELRK RCNFLLSFYN DRNPSKKMPL VLFDDALKHL LRISRIIRQP RSSGLLVGVG GSGKQSLTRL AGFIG KNLI QQIIVTKTYS DKDLKEDIKK GFDDAGHLGK QVTFLMTDSE VKKEEFLEYI NMVLSTGEIP NLLAKDEREV WLGDIS QAY CKEKNLGNID PPQSELWTYF VDRVRDNFHI MLCFSPVGQK FRERARKFPA LFNECTIDWF LPWPEEALVS VAETFIK NF DKLDTKEETK QELMKHMGNV HLMVNEICDE YYQKMRRQVY VTPKSFLSYL NSYKTLYIEK YDELDQQEES FKIGLNKI Q EATITINQME ISLKEEEIQL NEATEKTNQL LANLDKESKK ANQKGEEVAA TNKQCEIQAE QISKEKEEAE RELEAALPA LRRAQEAVDS IESKDIVELK ANKKPLDIIK YIMNAVLVFF KARLIPIQIE ERVFNKKEGK AVLFLKESYD ESGIQTLGDM NFMKKLKEF EKDSINEETI ELLEPYLNQS EDWFNDTFAT KASKAAAGIL KWAFAIYEYH QKSKIVKPKR IQVAIAEGRQ A IALKELEK AREDLAQIQA YIKNLKDVYT KQMEEKNELE MKAAKTKKKI NTARTLITSL SGEKDRWGKG AQDISDQKRK LV GNVSLST AFISYCGPFN AEYRNKLAQQ RFVVDMKKRG VPVTPGLELT SFLIDDATIG EWNLQGLPKD DLSIQNGIMV TNS ARYPLF IDPQGQGQNW IRNKLSASII PERCITTLSH PKFKDMFLKY CMESGLTLIV ENIENEVDPM MDPVLERQII VKGK TQFVN VAGTEMELSK EFKLFMTCRL ANPSFSPELS AKTTIIDFTV TQSGLEQQLL GKVISKEQKA LEDSLNQLLA DVNQN QKDL QRLDKNLLER LINSQGNLLD DTELMDVLNN TKTQAKEVAA KLIDAEIKTK EINEKREQYR PVAIRGSAIY FTMIEV SLV NWMYNSSLEQ FLKLFIESID LSEKAQLPSN RVKNIISFLT FHVYRYVNRG LFEKDKITFI LMMAFKILTT AGTISSG DV SLFLKSGDAL DIKSERQKQI SYLEDNQWLN ILALSKHTFS GQTLPFFKEL PDLISRSENQ WRNWIDKNDP ENFPIPDF A ESINQEKEIG SFISLCLVRS LRNDRTLIAT QNFISNVLGK EFTDPISYPI EGIWQESSNM DPVLFLLSAG ADPTSSIDE LAKKKKKFPC EKVSMGEGQE RVARQVIMKG FVEGGWVILQ NCHLGLKFME EIETLVSPIN QIHEDFRLWI TCEQHPKFPL GLLQKTLKV TNEPPKGLKA GLYKTFTTII TQEFIDKVDH SNWRSLIFTI CFLHSIVIER KKFGPLGWCV PYEYNYSDLE A SLLYIEKY LTNLMSTPQP NSHNLPISMN VVRYMICEVQ YGGRITDDLD RELFITYGET YLKDGIFGND YFFYDIMVDG SG QKFKYRI PQNPSAELIK YQEYIAKVPT VDNPEVFGLH SNADLTFRLK ESKEMINTVM ETRPKDSSVG GGKTREEIVQ DKA KDMLKN LPPDYNDVEV RELVSKLGGP NPKTSTERGM TVPLNIFLYQ EVTRMQRVIG LVRKTLQDTI LAIDGQIIMT PEIL EAINA IYDAKVPNSW LYDPSGAEIS WLLPNLGSWS TSLSDRNKQL NDWLRSGQRP ILFWLTGFFN PQGFLTGMKQ EVTRN HKKG DGKGGEAWSL DDVVYSTTVK EREKEKDIEQ PPAEGVYIKG LYLEGCKWSK NGLDDSDPKK IFADLPILHV SAINKK KTN EQDRMSNTYL CPVYKYPKRT DKYLIFRVGL PCEGSNNPSH WKLRGVALLC ST

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分子 #2: Outer arm dynein beta heavy chain

分子名称: Outer arm dynein beta heavy chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 529.207188 KDa
配列文字列: MGDHSQKDSP EDFIINRLSQ ALGIQKEKIK KSLETAQDDK GEVTNKDEFQ GFIQQDNSTN ILWVSGQSEK CTFYYGQLPP IDKFKKKGI AVIKLGLHKL TNENVAKDVV VVEITNNLLE HLNSVFNEIM SPVMQNPLNQ QGWTDLVAKD LMEKFNNYVA Q VYVLLGQI ...文字列:
MGDHSQKDSP EDFIINRLSQ ALGIQKEKIK KSLETAQDDK GEVTNKDEFQ GFIQQDNSTN ILWVSGQSEK CTFYYGQLPP IDKFKKKGI AVIKLGLHKL TNENVAKDVV VVEITNNLLE HLNSVFNEIM SPVMQNPLNQ QGWTDLVAKD LMEKFNNYVA Q VYVLLGQI KGKTMLPLPS HKLTSSDTTP DKDKAHVFEG SIITWTKQIK NVLKLEPEQL LKYGNDPGPL AEIEFWQNKR DN LNLIDSQ LKSVEVQNIL HFLDNNKSTY TTPFTKLQAE VKKARLEANE NYRYLFTLKD LFSKLQESQP SDFPTLYELF IPI MHTILL IYNKSKTYNQ PPRLVVLIRE ICNAIISNAQ AFVDKDTIFS LIDSKETTEA CDKLQVTLDV CSKFKDAYFE YKAK AGGNW KLTSNALFVR LDSFLERCQD ILHLTNTIVQ FNKLEKIELG GTKGKTLTES IAQIFKEFEE AVQAFTSVSY DIMNI AEKK FDDDFYEFRS KIKELERRLA SVITQGFDDY DTIYGRFKLL DNFEGLLTRP IIADELEKKH IVLLEMYKQD LKQVQS IFL EGKQFVDSMH ENAPLFLNMP PIAGALTWCK SLRDRIQEPI EKLAQLGQGI TEREEYKDVQ KLYTSITKSI KDYEDQK IL SWEKEVEDSS QDKLKQTLLC KDENDLIKVN FDPSLVRLLK EVKYFLLLRL EVPTTAKDIY TKAETYRTQI VALDMIVD N YNHIKTCLLP VEEPLVKKKI QDMEEEVKPG IEEIRWKSTN IDQFISKSKS IVDQLFETVN KMKDSLQKIH KSLANFNVK IIERKNRPMS PDDYDQFLKA IFSNKLTIVK DNGNQIQKLV KEVLDAVKAD KKQNSWKNYN DYVNVIVIEG ISTAIQTALL HLNEQINPV FIKRNDISPL FDIRLELGQS GIQFDPEIGE SSNQLTVRNT IRNWINDFFN IAGTIQRLDT TMPGDFLQEI R SFFEIKQC LAMITQNLEW IENECNQFRA RFDTYSYLWT EDEQISFNRF LDENEPKDED GKGGDDDEGE NTEKQNPLLK GC RAKIPNL DLFDEKITHL KAIQQEISRI KTPEDISWLR INLQPMKTAL DARVTRWIRV YTDFLVNQFR TTQKNLLDFI EKT KDGIKK NPADHENLHD KKLLMSVMKV ISDVKDVEPR REGIITRMKE MVTKLKKHNV PITEKGTDDP LQQIDNANSN FIEI YGRVF KVKADIIPLQ AEETQNIKRD LDIFMKEVES FRKEFMQKLP FDYTESMGYE NINNAYDTIM VYYHKLTAIE GRALE YNNL EKAFELQKSN YKQLKDCMND LKNLKTMWDA IALIHFQYND WKTKPWRQIK ADILLDTNKT LGTQIKNLPK EIRNFK GYN VIVEKVKNMG TVLPLVSALH SEFMEDRHWS QLKQITGTVF DHNSLSFYFE DILALNLYKY ENTVNEIVDV AQKEAKI EK KLKNIEQWWS KQVFEFTEYK ETKTFASLDN MMEVLDQHSL DLMGMKSQGK YVEFFYDRVE DWREKLGRVD VVVNEWLK V QKNWKILYNI FLLSEDIRMQ LPEDTKVFEG VDKEFKDMMS EVSANPSVVE ACTIERRDVL VGWSQAIKKC EKALNDYLE QKKKSFPRFY FLSNQSLLTI LSNGQNAPKV CEYLGDCFDG LKTLTFEPPA NPAETSKVGI GMISKDDEKV PFSSKFICEG AVEHWLLNL EFRMRETLQE ILEGAKNTAD LWDSGDKPRE EWVEGYNAQI ALLTTTIVWT EDVGRAFEDL AGGSETAMKE C QKLIEVRL ENLIKKVRGD LHILERWKII NIITIDVHSR DVVEKFVIQK VSEAESFAWL SQLKFYWENK PDSDMHLRQT LR FPWEKDK NKNKCIIRIV DWFRFYSYEY IGNAIRLVIT PLTDRCYITL TQALNLTMGG APAGPAGTGK TETTKDLGRA IGI PVMVFN CSDQMNKDSM AQIFMGLSQS GAWGCFDEFN RISIEVLSVV STQVKCVLDA LKEKKTKFSF VEEGEIQLQD TVGF FITMN PGYAGRTELP ENLKALFRSC AMVVPDLALI CENMLMSEGF TMARVLSRKF VSLYMLSREL LSKQKHYDWG LRAVK SVLR QAGKLKRGDP DMPEDPLLMR ALRDFNMPKI VTDDKVIFRR LIGDLFPKLD PPTKQNPELK KIVQDTTKKD MGLVAE ELF VTKVVQLAEI LEVRHCCFVI GPPGSGKTCV WKTLIKSYIN SGEDAEYDTL NPKAVTSDEL FGAYTKTKEW KNGVIAV IM KNQVKNEEKY KATHMHKWSV LDGDIDPEWI ESLNTVMDDN KVLTLVSNDR IFLTPQMRLI FEISNLRNAT PATVSRAG V LFINETDIGW MPYMNSWLER SQINILKQQK EMANMPEYPV IDDVAKSVFY RCFQSYFEQN IDVHDKNRVR HICPMVDIA MIQTICTILD ALLIQHLPKL KQMKEEDEKQ ALEAFFIFAG LWAIGGPVGG GQDDSKDMKE FNTVWKGAAK VKFPEQGLCY DYYYDINEN KWNTWKVEDY LPNDQPLFSK IYVATIHTTR LRYMIDIHLQ RRKPILFIGS AGTGKTAVVR DYLNSTRPEQ V SHKTINFS SFTDSLALQK NIESMVEKKN GRNYGSATNK VLICFIDDFN MPYVDKYGTQ SPIQLLRLIL DYGSIFNREQ LE ERKFLQD LLFFGCLNQK SGSFTVDLRL QRNFSVFSMY TPSSDVIKTI FGSILNAHLS TIDDKAQKMA FKLVEATYFT FDK ILKNTT AFAPSAKRFH YQFNFRELAR VCEGICRTTP GQYSGGDQGK LVRLWAHEMK RTFEDRFIAN EHVEFFRRYL TEAI SKCIG EFPETENPIA EPLIFTGFVA AHQGLDQQYT QCTIPVLKRV LDDKLEEYNE VKAQMNLVLF QQAMEHVSRI CRILD MPGN NALLVGVGGS GKQSLCRLST FINGFEIDQL VVTASFTIND LRNNLQEIYK KIAKPNSIAR VFMITDSQIK EEQFLI PIN DMLNSGWIFD LFPKEDMDSL VSGVRNEAKG EGVDVNNLTA LTSYFLDKIR KNLKVVLCFS PVGDTMRIRS RKFPGII NN TSIDWFHPWP HEALIDVAFR FLEEIEFPTE EIRQSISLNM AKVHSSIDTA NEKFLKLERR YNYTTPKSFL ELIDFYKK L LTEKRETIQR QIQRYEMGLN ILAETQNKVQ GLQEELKVKM VEVNKQREET DILIEKVGKE SALAEEEQTI ANAEEEKTN VAAAEAEKIS KEATEALAEA LPALRSAEAA VDCLKKPHVT EMKNLGSPPA GVIVTARVVL ILFNQGITLN DPDEKVWKKA VTFMNNPQA FIDKVKSFDG ENIEPNIIEQ SNKIIQDPSK KFNEKDMAGQ SYAASKLCAW AVNIVTFNKI FKQVKPLQDA Q KQANEILE EKKKELAIVK QRVAELNARV NSLKRQLEEA EARKMIVEQD AARCQSRLSA AENLVNGLAG ENKRWTQNVK FL KENIKSM IGDSLLASAF VSYIGAFSAK LRLELWKNTW LPDIIEKGIP ITEGIEPLKI LTTEAIKSKW KNEGLPADPM SLE NAAIIT ACARWPLIID PQLQGSTWIR GKQGENLTTI SLSQPKWLGA LTSSISSGRA VLIEGIQQEI DATLDPLLQR 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GFILEGARWD YQLGQLEESK PKEMFSVLPV TYCKAIPLPP EGKEDKSLYQ CPVYKTEDRG NTYVFT AQL KTRFPPRKWI LAGVAIIMDV EGVSD

+
分子 #3: gamma heavy chain

分子名称: gamma heavy chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 450.623219 KDa
配列文字列: PLVWTQLKQT GTTQPTARSG HTIITVGKTH IMFGGLDNDK NNYKDGKIAP NNQVFTLKLT QNNCEWRQIA CQGDVPLPRC YHASCAISA DKMLVFGGSY TSNLRFNDTY ILKTTSYQWS KPANQISGGE PKNAESKIGA PQPRYGHSAT FFEGKVYIFG G HGGINYQR ...文字列:
PLVWTQLKQT GTTQPTARSG HTIITVGKTH IMFGGLDNDK NNYKDGKIAP NNQVFTLKLT QNNCEWRQIA CQGDVPLPRC YHASCAISA DKMLVFGGSY TSNLRFNDTY ILKTTSYQWS KPANQISGGE PKNAESKIGA PQPRYGHSAT FFEGKVYIFG G HGGINYQR LAFNDLYVLE TENFEWTRLE PKGNPPDPRG GHSAAMMANK PQLMIFGGWS FTSQYSNIMI YDIEKDEWVD PE IAHEIPK WNLSGIMAPS IPSWKYFIFG GSVGSFEEGG NRTNSRFVDD SFVLDIDTLS WSSINLEADE TSKAVCKPRP RES ASIFYD SGESRAIVFG GWANNWLNDL WALNVSTITG PPIFSIKPAL GPLTGKTKVL IEGDGFKDTQ NISVKFSGGK LEKE VNGTF VNEKEISCET PTFDYPRSVE VTVCMNKGDY TITKSAFTYN TKADKTIAYG PGLLTENLIG VQTTIVIQAR NGSDE FVVT IRNPAKIKKE EEVKEGDKAN TKNTIKEDEE EEGEDEEENK KKKEAEKNDL TGSAVMNYIS KQLKDIQEFI ENTKEN IEI RNKNISELIN VMINLEKVRV KNDDDVLTLD TVEEMLNFLK KKKDSDIKKC KKLQEEWKNL AKMAQAVKKD IQNPVKT ES DKTKENIKKF EEITLKEYAN SLKKESFFIY KTGVSESFKR IGEVKQKVDE FEVQLNQYED FARIGSKKLM EQIRTDVS S VEKLWVRIEI SEKTMDEYKK MKWGSINSMD MEDEIKKLRK ALTDLRGIDK RSNAFIGITE ELKKWATFLP LLGELKDPS MNSEDGRHWK KLKDLVKKEF DVSQELMLEI IWDLKLFDYK DGIEEITDQA KQELKMEKAL KKIIDFWRDI EFELVQHKNT DIHTLKMSE ENFETLEDHQ LQINNMLLSK YVAYFEKEVE KWKYDLGSVY DVVQLLLEVQ KTWSFLENLF EVKRELPNES A QFVGIDKD MKEIMQKGCD IKNCLKFCTI EGMLKRLENI QAQLKVCEKA LNEFLDSKRR AFPRFYFVSV NDLLDILSNG NS PAKINRH MSKIFQAIDN LQLKEDSSGG RPTLKMISCV GTEEVDFSSP RLLQGKVESY LKDVIDTMIG TLKSVANSSF KNF QSMTRK EWLKSDPSQI TLLVNNIIWS KAVEDCFLKL QSGDINAMKL FLDESIKQLT ELIGMVQGDL SKPLRQKIMC LITI DTHSR DVVHRLINEH VRKAEEFQWQ SQLKFYWVDN DAKIKIADAR FVYNYEYLGN GPRLVITPLT DRIYVTATQA LHLKM GCAP AGPAGTGKTE TTKDLANALA KACYVFNCSS EMNYESMGNI YKGLASSGCW GCFDEFNRLL PEVLSVCSVQ FKAVTD AIK QNVERFIIEG DEISLDPTCG VFITMNPGYL GRAELPEGLK ALFRPITVVV PDLELICENM LMAEGFIEAK ILAKKFV TL YMLCRDLLSK QLHYDWGLRA IKSVLVVAGG FKRSEPEIAE QALLMRALRD FNIPKIAFQD LYVFHGLLGD LFPGINIK P KKDLDFEKII TDVCIENKLD PDPEFVLKVV QLSELLAIRH CVFVMGPPGA GKSTTWKILA KAQDKTNKKT TLIDIDPKV VSTKDFYGYN LPSKEWKDGL FSKMLRSLAE QPDTNPKWIC LDGDLDANWI ESMNSVMDDN KILTLANNER IPLKPHMRAL FEIRDLRFA TPATVSRAGI LYISDEVGYQ WRSYVKSWIK QEFSQDQEMS KNLDTLFGKY VPDTLDHIKK HCRFLVPVSP I SQVISICK SLQTLLKGDV KNLEYLFVYA LIWAIGGALA EKDSIDYRKD FSTWWKGAWK TAVKFPSKGT IFDYYVDQSG DS SKFVEWS KRLENKEFDP QVETMGNITV NTIETLATTE FIKSYLMVKH PSLLIGNSGC GKTQLAKGIL KEIVQAKPEN YAY QLINFN YYTDSTYLQG QIEQTLEKKA GRQYGPPGKV QLIYFIDDLN MPQLDAYDTQ TAIALLRQLA DYGHFYDVSK LALK DIINT QVLAAMNPSA GSFFVNPRYQ RHFWTISIPF PDNESLSLIY ITFLNGHLKR FKSTIQEYSN IIVRASLMLH QAVTQ NFRK TAINFHYEFN LRHMSNVFQG LLLSDPNKFT EPDKLIKLWI HECERTYGDR LVSTDNLKTY KENIFDIVKK SFSKFN FSR YFGNNPENLI YCNFIAGINS DRFYDQMPNN EMEKHISEAL KEYNDNNAFM GLVLFEDAMK HVCRICRIVL PSSGHAL LV GVGGSGKQSL SKLASFIMGY TTFSITISAT YSMVDLRNDL QQLYFKCGPK EEGILFLFTE GQITNERFLV YINDLLSS G EIAELYTLDE KEAMINQVRA KVKGEGKPDT RENCWNWFID QVKKNLHMAI CFSPVGDMRR RARQFPALVN CTVIDWFQP WPYEALFNVA KSFLEPVDLG DDKVREAVVK FMPFSFTLVN DLGLKLLEQE RRYAYTTPKS FLELISLFTN MLAQKRESLE RNKERYETG LVKLKETAEQ VAIIEVEVKE KQVEAEAKKK EADAFAEVVG REKDKVEKEN SKATIEADKC GLIKQNVEAQ K SSTQQDLD AAQPLVEQAK SALNSISKKD FQQAKSFASP PAGVPEVFAA TIYLLAGYFN EAIEIDKNKK PKDVSWKSSL KL MKSPEEF MEKLLNFKDV VDANQVANVN IVKNQYLNMP SFTPEQMASK SAAAKGICSW VVNIVKYYDV IQDVEPKRKA LKE ATEQLE EATVKLNEVE EVVRKLNEEL NKLKAENDKA IAERNAAISE AERCARRLNL AQRLVTALSS ENERWGKSII QLED QLKLM VGDVLVASSF VSYSGPFNKK FRNIMINQNF MKFMKEHTIP MSPDPNPIKI LTDESTIALW NKQKLPSDSV SIENG TILT NSARYPLMID PQLQGITWIR EKEKANNLKI LRLGSKNINR DLELSIENGY SAIIENMNER IDAILMPIIA RSFIKR GKN KIIKFAGKDL ILHPNFKLFL HTKLSNPHYP PEIQAEAALI NFTVTEAGLG DQLLSLVVAR ERPDLAKMKI ELITQQN DF KIKLKDLEDE LLYKLANAKG DILDDIELIE NLEYSKKLSV EIAEKVAAAK ITEAKINETS ENYRPAASRG ALFYFLLS D LSKVHSFYKY SLESFIVVIN RAIDAISENK IYGKTTMMSP RSLKKRVDEL IESLTYTAYQ TTRRGLFESH KLIVAAMLC LRVLLRSEEL NSDEVDHLII GKVDVNPTPM PDALKSFLND NIWAACKALE TIHQFQGFCQ SLETDVLQWK KWYSEEKAET ADLPKAFKE LSKFHRLLLL RALRPDRLPS ALSQFVHDKM GERYIEQPPF NIFETFQETS KTVPIFFVLF PGVDPTPDVE R VAATFDVS ANNGRFINIS MGQGQEDRAK KALFDCAQKG HWIMLQNVHL MQSWLYGLNG LEGFLESVFA SPKTHPNFRV FI SSEPPNV LLPLMQIIPE SILQGSLKIA NEAPQYLKAN LRRAYNKFDQ EFLDKCDKKP TEFKSCLFAL CFFHSLMLGR KKF GTQGWS RVYNFNDGDL TICADVLYNY LSKYDQVPWD DLRYIFGEIM YGGHITDDWD RRTNRTYLKV LIRSELLQQN FNLA PQFKS PDPSKFDYEA YRKYIEEKLP IESPQMFGMH PNAEIGYLTQ TCDQVFNTIL EVQGGSSGGG ASKKDDGVMV TLTDF KTRC PHDFNMLLIE EKVKEKTPYI VVCLQECERM NGLLKEIKTS LEDLRLGLTG ALNMTDAMES LQQSLSFNKV PDTWEK KAY FSKKPLSSWF ADLIERNIQL QEWCKELVTP TSLCISYLFN PMSYLTAIMQ FTARAQGLPL DGITIQTNVT AMKGPED VV NPAENGAYIH GLFLEGAAWE IGGQGQDGYL IEQKPKELHP KMPVINAVAV PLDKKKKNGQ YDCPTYVTSA RGQTFVFT A NLNMESDDSD PNKWILSGTC MLMSDD

+
分子 #4: Dynein intermediate chain 2

分子名称: Dynein intermediate chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 69.51482 KDa
配列文字列: LTAQELNEDM PSKMLEPKNP QAPKNITVYD YYTRKFKTDE LVDQMIVHFS MDGDYIWKES NEYKTQEEIR DTKKALIKEA MRKQESEEP GANHDEEAIK QTLRNKFNYN TRECQTINPS IRERGVSTEP PPSDTICGNI TQWEIFDAYY AEIMKDHQIE N KKKKEVDQ ...文字列:
LTAQELNEDM PSKMLEPKNP QAPKNITVYD YYTRKFKTDE LVDQMIVHFS MDGDYIWKES NEYKTQEEIR DTKKALIKEA MRKQESEEP GANHDEEAIK QTLRNKFNYN TRECQTINPS IRERGVSTEP PPSDTICGNI TQWEIFDAYY AEIMKDHQIE N KKKKEVDQ DKKQDQSMYS TSFKRCCKIM ERMVVQNDQE DKYHDYRYYW SQGDNLEAGK NEGHLLPIWR FSNEKQRKKN VT SICWNPL YPDLFAVSLG SYDFTKQRMG LICLYSLKNT THPEYAFNCE AGVMCLDFHP KSAALLAVGL YDGTVLVYDI RNK HKKPIY QSTVRNQKHT DPVWQVKWNP DTSKNYNFYS ISSDGRVMNW ILMKNKLEPE EVILLRLVGK NEEESTLIGL ACGL CFDFN KFEPHIFLVG TEEGKIHKCS RAYSGQYQET YNGHLLAVYK VKWNNFHPRT FISASADWTV RIWDSKYTSQ IICFD LSMM VVDAVWAPYS STVFACATMD KVQVYDLNVD KLNKLAEQKI VKQPKLTNLS FNYKDPILLV GDSHGGVTLV KLSPNL CKS GPEIKQTEDK KAMEEFKNVK IEDYEREKME NL

+
分子 #5: Flagellar outer dynein arm intermediate protein, putative

分子名称: Flagellar outer dynein arm intermediate protein, putative
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 63.702582 KDa
配列文字列: KEFNNPINFQ DTETRYGGIQ NQVVNINQYV QRNPNFIDLD NIAELSEHSV NTERVKTGDR GMSHKEGGWP GNVDPNEAQE TGRFKKRIE KDTSFPQAVK DLKEGVEKCI YQNNQIDLLE EYFEGETSEH VVENLSSKTL MLFKDEKEIC KRSVSEISWH P EGPTKVAV ...文字列:
KEFNNPINFQ DTETRYGGIQ NQVVNINQYV QRNPNFIDLD NIAELSEHSV NTERVKTGDR GMSHKEGGWP GNVDPNEAQE TGRFKKRIE KDTSFPQAVK DLKEGVEKCI YQNNQIDLLE EYFEGETSEH VVENLSSKTL MLFKDEKEIC KRSVSEISWH P EGPTKVAV SYAIMRFQQM PEKMPTQAYV WDLLNPNSPE IKLMSPSAVT NISYNQKIPD QIGGGCYNGL LAVWDGRKGE NP IMISPVE NSHYEPVTHF HWLMSKTGSE CVTTSTDGKV MWWDTRKFEA GPVEKLNIIE GLGENEEIIG GTALEYNVEA GPS KFLIGT ESGSILTANK KLKKPVEITT RYGLDQGRHL GPVYSINRSN QNPKYFLSVG DWSCKIWVED LKTPIIRTKY HGSY LSDGC WSPTRSGAFF LVRRDGWMDV WDYYYRQNEI AFSHKVSDSP LTCIKINQTG GAYHNSGKLC AIGDQDGTVT ILELC DSLY TMQPKEKDII NEMFEREYRK EKNLETIKKQ QELAKRQVQK DMGSQKEKWE KKKLEMIETA EASFHENLAK NPV

+
分子 #6: Dynein light chain roadblock-type 2 protein

分子名称: Dynein light chain roadblock-type 2 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 14.193171 KDa
配列文字列:
NADDQLKQLS ALEGANGYVI FNESGIPLKR HEKSISHEKA VHIAALVSDL WNVSKKVIQR DLKTPENDIE VIRLRTKHSY EYIITQSGD FTMLAIQLCG KAIEEAKKAA AAAAAAAVVQ EENKEKEKK

+
分子 #7: Dynein light chain roadblock-type 2 protein

分子名称: Dynein light chain roadblock-type 2 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 17.470111 KDa
配列文字列:
IYKTSKEIQK SDQRIIQQRV ENSIINNQIY QKSLKRKTSK RKVRHQANKK NFQKEMSEVE DTLNRIKTHK TVLGYLIVNS EGGVVRGAF KDEEESKNIA NSIPLLTKKA RSVVRDLDPT NDLVFLRIQT KLNEIMVAPD DEFSLIVIQT KG

+
分子 #8: Dynein light chain

分子名称: Dynein light chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 10.649161 KDa
配列文字列:
SHLDKVQPVI KNSDMSVEMQ KEVEEVAKKA IDYCNTDKEI ATFIKDDFRS RYHGTWHCIV GRNFGSFVTF ERSYYIYLYV GQLAILLFK TG

+
分子 #9: Dynein light chain

分子名称: Dynein light chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 11.830534 KDa
配列文字列:
KAVTDMDINE LRKLMIGKAI INSSDMQGDL LQEAQDVIQS GIENNSAPVL NIEAACKYIK ENLDKKFGPT WQCIIGEGYA YDVTVQNNT LLFMFYNGNL AVLIFKS

+
分子 #10: Dynein light chain

分子名称: Dynein light chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 11.435072 KDa
配列文字列:
QQYKTFMGAR VLWPPECADD ILEGAIRETQ DALKKFEIAR EGQKIAEHLK KYMDDHFDPY WHVFFGKNFG CQAVHNKNRF IYFYIEKTA FLMYQT

+
分子 #11: Dynein light chain

分子名称: Dynein light chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 10.670071 KDa
配列文字列:
HANEQIIDMP ENSEMKSMKN DAFSQAKFAV ENYKFENKIS SHIKKFFDEK YGPNWHCVVG KHFNAYVSYD SKNFIFFYEG QLAILLYRK G

+
分子 #12: Dynein light chain

分子名称: Dynein light chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 12.516457 KDa
配列文字列:
MSDSDSDEGR VVEEPLPPHI IRFNDMAQHL LKKVIRQADV LIKENPQGLE KDIALNLVKF VKSQPEFKIG DGEWQCIIGK NFGCSLTFD ANVLAFFDLL PSRKSILLFK SG

+
分子 #13: Dynein light chain

分子名称: Dynein light chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 10.453167 KDa
配列文字列:
MNHEPEVKAT DMEEDMIKRV KEIAINAVKE YKQEKQIAHY IKYEFDKIDG YGWNCIVGRN FGSHIIHQTK KYIFFKINEL CLLLWKA

+
分子 #14: Dynein light chain tctex-type 1 protein

分子名称: Dynein light chain tctex-type 1 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 12.856455 KDa
配列文字列:
TDKEYISEEV QKAIDDSVKQ VFGIKDDSSQ VTITYNKDKV NLWTQQIIDY TIRGLNKLGK HFKYCVTAIL QQTNHAGISV QITAYQDTA TDGSLIQCYE INDIYAIVSV FAMAV

+
分子 #15: Dynein light chain 2A

分子名称: Dynein light chain 2A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 14.117313 KDa
配列文字列:
RKREASLITL NYIKNRFYPS KIQKIIKELF EDRLKGVEYD PNNANQLSER LVLELREKIK RGKVPRYKIG VQVVFGEIKG QGLRIASKC LWDVQNDNYA SYTYTSEKVY CTGIVFGCYF E

+
分子 #16: Thioredoxin

分子名称: Thioredoxin / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 12.987904 KDa
配列文字列:
TTTVTSEDHF MTFYNENNKK LIVVDVYPGW SGPCTAMYPT YNQLMISIDD FEKRIDILLL DQDKLVTYKN DKFHATCQPK FLFISEGKI IDEVLGTNIP VFIEKVNKYI PLS

+
分子 #17: Dynein light chain 1

分子名称: Dynein light chain 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 21.705334 KDa
配列文字列: AKGTTCQKAI VNWEAANPGK NPSEAEEIKL IFQIPPIEKM DGPVLNTLTK CKKLSLSSNS IDKMISLNML RNLEILSLSR NVIKKISGL EDIGGTLRQL WLSYNFIEKL DGLNNCSVLQ TLYIGNNRIK NWEELDKLKD LPELENVLFY GNPIYEQVKE D PKLIVLKK ...文字列:
AKGTTCQKAI VNWEAANPGK NPSEAEEIKL IFQIPPIEKM DGPVLNTLTK CKKLSLSSNS IDKMISLNML RNLEILSLSR NVIKKISGL EDIGGTLRQL WLSYNFIEKL DGLNNCSVLQ TLYIGNNRIK NWEELDKLKD LPELENVLFY GNPIYEQVKE D PKLIVLKK LPTLKNVDGM IIDDSVLEKV KQIA

+
分子 #18: Dynein light chain 4A

分子名称: Dynein light chain 4A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 16.803703 KDa
配列文字列:
MASEVMNLSE EDIQFCQKAF SDYDEDGLGA IKVSDLKLAL ENIGCSLSEN DLFKMISEVD EKNTGLIKFS DFLNIYYKQK YANLGDDDQ DLVDAFVAMG GNADTTGSVD ANRLIQIVKE EFEMTIDIVG LIREIDKDGS GEIEYEEFKL L

+
分子 #19: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 19 / コピー数: 6 / 式: ADP
分子量理論値: 427.201 Da
Chemical component information

ChemComp-ADP:
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子*YM / アデノシン二リン酸

+
分子 #20: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 20 / コピー数: 3 / 式: ATP
分子量理論値: 507.181 Da
Chemical component information

ChemComp-ATP:
ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子*YM / アデノシン三リン酸

+
分子 #21: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 21 / コピー数: 9 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態filament

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試料調製

緩衝液pH: 7.4
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k)
平均電子線量: 53.3 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.5 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 76936

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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