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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-11736 | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 | |||||||||
![]() | Elongating Human Pol III complex Map B, unsharpened | |||||||||
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機能・相同性 | ![]() snRNA transcription by RNA polymerase III / RNA Polymerase III Chain Elongation / RNA Polymerase III Transcription Termination / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Girbig M / Misiaszek AD | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structures of human RNA polymerase III in its unbound and transcribing states. 著者: Mathias Girbig / Agata D Misiaszek / Matthias K Vorländer / Aleix Lafita / Helga Grötsch / Florence Baudin / Alex Bateman / Christoph W Müller / ![]() ![]() 要旨: RNA polymerase III (Pol III) synthesizes transfer RNAs and other short, essential RNAs. Human Pol III misregulation is linked to tumor transformation, neurodegenerative and developmental disorders, ...RNA polymerase III (Pol III) synthesizes transfer RNAs and other short, essential RNAs. Human Pol III misregulation is linked to tumor transformation, neurodegenerative and developmental disorders, and increased sensitivity to viral infections. Here, we present cryo-electron microscopy structures at 2.8 to 3.3 Å resolution of transcribing and unbound human Pol III. We observe insertion of the TFIIS-like subunit RPC10 into the polymerase funnel, providing insights into how RPC10 triggers transcription termination. Our structures resolve elements absent from Saccharomyces cerevisiae Pol III such as the winged-helix domains of RPC5 and an iron-sulfur cluster, which tethers the heterotrimer subcomplex to the core. The cancer-associated RPC7α isoform binds the polymerase clamp, potentially interfering with Pol III inhibition by tumor suppressor MAF1, which may explain why overexpressed RPC7α enhances tumor transformation. Finally, the human Pol III structure allows mapping of disease-related mutations and may contribute to the development of inhibitors that selectively target Pol III for therapeutic interventions. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 113.4 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 54.5 KB 54.5 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 11.9 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 74 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 144.7 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 11.4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | 112.9 MB 118.8 MB 98.2 MB 10.5 MB 5.5 MB 113.8 MB 113.8 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7ae1MC ![]() 7a6hC ![]() 7ae3C ![]() 7aeaC C: 同じ文献を引用 ( M: このマップから作成された原子モデル |
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類似構造データ | |
電子顕微鏡画像生データ | ![]() Data size: 3.3 TB Data #1: LZW-TIFF compressed multiframe micrographs of human RNA Pol III EC [micrographs - multiframe] Data #2: Initially picked particles of human RNA Pol III EC [picked particles - single frame - processed] Data #3: Polished particles of human RNA Pol III EC (final reconstruction) [picked particles - single frame - processed] Data #4: LZW-TIFF compressed multiframe micrographs of human RNA Pol III apo [micrographs - multiframe] Data #5: Initially picked particles of human RNA Pol III apo [picked particles - single frame - processed] Data #6: Polished particles of human RNA Pol III apo (final reconstruction) [picked particles - single frame - processed]) |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
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注釈 | Elongating Human Pol III complex Map B, unsharpened | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.05 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Elongating Human Pol III complex Map B, locally...
ファイル | emd_11736_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Elongating Human Pol III complex Map B, locally sharpened with LocalDeblur | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Elongating Human Pol III complex Map B1, from...
ファイル | emd_11736_additional_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Elongating Human Pol III complex Map B1, from RELION multi-body refinement, body_001 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Elongating Human Pol III complex Map B2, from...
ファイル | emd_11736_additional_3.map | ||||||||||||
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注釈 | Elongating Human Pol III complex Map B2, from RELION multi-body refinement, body_002 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Elongating Human Pol III complex Map B1, from...
ファイル | emd_11736_additional_4.map | ||||||||||||
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注釈 | Elongating Human Pol III complex Map B1, from RELION multi-body refinement, body_001, sharpened with Density Modification | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Elongating Human Pol III complex Map B2, from...
ファイル | emd_11736_additional_5.map | ||||||||||||
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注釈 | Elongating Human Pol III complex Map B2, from RELION multi-body refinement, body_002, sharpened with Density Modification | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_11736_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_11736_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
+全体 : Human RNA Polymerase III Elongation Complex 1
+超分子 #1: Human RNA Polymerase III Elongation Complex 1
+超分子 #2: Human RNA Polymerase
+超分子 #3: RNA, DNA
+分子 #1: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1
+分子 #2: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2
+分子 #3: DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1
+分子 #4: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9
+分子 #5: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1
+分子 #6: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2
+分子 #7: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8
+分子 #8: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
+分子 #9: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10
+分子 #10: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
+分子 #11: DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2
+分子 #12: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
+分子 #13: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5
+分子 #14: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4
+分子 #15: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3
+分子 #16: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6
+分子 #17: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC7
+分子 #18: RNA
+分子 #19: Non-template DNA
+分子 #20: Template-DNA
+分子 #21: ZINC ION
+分子 #22: IRON/SULFUR CLUSTER
+分子 #23: MAGNESIUM ION
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 2 mg/mL | ||||||||||||
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緩衝液 | pH: 7.5 構成要素:
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グリッド | モデル: Quantifoil R2/1 / 材質: COPPER / メッシュ: 200 / 前処理 - タイプ: PLASMA CLEANING / 前処理 - 時間: 30 sec. / 前処理 - 雰囲気: OTHER | ||||||||||||
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 詳細: Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s. |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | C2レンズ絞り径: 50.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 検出モード: COUNTING / 平均電子線量: 40.4 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |