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タイトルHuman anti-N1 monoclonal antibodies elicited by pandemic H1N1 virus infection broadly inhibit HxN1 viruses in vitro and in vivo.
ジャーナル・号・ページImmunity, Vol. 56, Issue 8, Page 1927-11938.e8, Year 2023
掲載日2023年8月8日
著者Lena Hansen / Meagan McMahon / Hannah L Turner / Xueyong Zhu / Jackson S Turner / Gabriel Ozorowski / Daniel Stadlbauer / Juha Vahokoski / Aaron J Schmitz / Amena A Rizk / Wafaa B Alsoussi / Shirin Strohmeier / Wenli Yu / José Alberto Choreño-Parra / Luis Jiménez-Alvarez / Alfredo Cruz-Lagunas / Joaquín Zúñiga / Philip A Mudd / Rebecca J Cox / Ian A Wilson / Andrew B Ward / Ali H Ellebedy / Florian Krammer /
PubMed 要旨Neuraminidase (NA) is one of the two influenza virus surface glycoproteins, and antibodies that target it are an independent correlate of protection. However, our current understanding of NA ...Neuraminidase (NA) is one of the two influenza virus surface glycoproteins, and antibodies that target it are an independent correlate of protection. However, our current understanding of NA antigenicity is incomplete. Here, we describe human monoclonal antibodies (mAbs) from a patient with a pandemic H1N1 virus infection in 2009. Two mAbs exhibited broad reactivity and inhibited NA enzyme activity of seasonal H1N1 viruses circulating before and after 2009, as well as viruses with avian or swine N1s. The mAbs provided robust protection from lethal challenge with human H1N1 and avian H5N1 viruses in mice, and both target an epitope on the lateral face of NA. In summary, we identified two broadly protective NA antibodies that share a novel epitope, inhibited NA activity, and provide protection against virus challenge in mice. Our work reaffirms that NA should be included as a target in future broadly protective or universal influenza virus vaccines.
リンクImmunity / PubMed:37506693 / PubMed Central
手法EM (単粒子) / X線回折
解像度2.2 - 3.1 Å
構造データ

27920

8e6j

EMDB-27920, PDB-8e6j:
3H03 Fab in complex with influenza virus neuraminidase from A/Brevig Mission/1/1918 (H1N1)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.7 Å

27921

8e6k

EMDB-27921, PDB-8e6k:
2H08 Fab in complex with influenza virus neuraminidase from A/Brevig Mission/1/1918 (H1N1)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

PDB-8eqa:
Crystal structure of human anti-N1 neuraminidase 2H08 Fab
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.55 Å

PDB-8eqc:
Crystal structure of human anti-N1 neuraminidase 3H03 Fab
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.2 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン / N-アセチルグルコサミン

ChemComp-ZN:
Unknown entry

ChemComp-HOH:
WATER / 水

ChemComp-PO4:
PHOSPHATE ION / ホスファ-ト / リン酸塩

由来
  • influenza a virus (a/brevig mission/1/1918(h1n1)) (A型インフルエンザウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードVIRAL PROTEIN (ウイルスタンパク質) / influenza (インフルエンザ) / monoclonal antibody (モノクローナル抗体) / H1N1 (H1N1亜型) / cross-reactive antibody / IMMUNE SYSTEM (免疫系) / antibody (抗体) / neuraminidase (ノイラミニダーゼ) / broad protection / pandemic (パンデミック)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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