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タイトルPosttranslational Modifications Mediate the Structural Diversity of Tauopathy Strains.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 180, Issue 4, Page 633-644.e12, Year 2020
掲載日2020年2月20日
著者Tamta Arakhamia / Christina E Lee / Yari Carlomagno / Duc M Duong / Sean R Kundinger / Kevin Wang / Dewight Williams / Michael DeTure / Dennis W Dickson / Casey N Cook / Nicholas T Seyfried / Leonard Petrucelli / Anthony W P Fitzpatrick /
PubMed 要旨Tau aggregation into insoluble filaments is the defining pathological hallmark of tauopathies. However, it is not known what controls the formation and templated seeding of strain-specific structures ...Tau aggregation into insoluble filaments is the defining pathological hallmark of tauopathies. However, it is not known what controls the formation and templated seeding of strain-specific structures associated with individual tauopathies. Here, we use cryo-electron microscopy (cryo-EM) to determine the structures of tau filaments from corticobasal degeneration (CBD) human brain tissue. Cryo-EM and mass spectrometry of tau filaments from CBD reveal that this conformer is heavily decorated with posttranslational modifications (PTMs), enabling us to map PTMs directly onto the structures. By comparing the structures and PTMs of tau filaments from CBD and Alzheimer's disease, it is found that ubiquitination of tau can mediate inter-protofilament interfaces. We propose a structure-based model in which cross-talk between PTMs influences tau filament structure, contributing to the structural diversity of tauopathy strains. Our approach establishes a framework for further elucidating the relationship between the structures of polymorphic fibrils, including their PTMs, and neurodegenerative disease.
リンクCell / PubMed:32032505 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度3.3 - 4.3 Å
構造データ

21200

6vh7

EMDB-21200, PDB-6vh7:
Doublet Tau Fibril from Corticobasal Degeneration Human Brain Tissue
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.8 Å

21201

6vha

EMDB-21201, PDB-6vha:
Singlet Tau Fibril from Corticobasal Degeneration Human Brain Tissue
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 4.3 Å

21207

6vhl

EMDB-21207, PDB-6vhl:
Paired Helical Filament from Alzheimer's Disease Human Brain Tissue
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.3 Å

PDB-6vi3:
Straight Filament from Alzheimer's Disease Human Brain Tissue
手法: ELECTRON MICROSCOPY / 解像度: 3.3 Å

化合物

ChemComp-GLY:
GLYCINE / グリシン / グリシン

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードPROTEIN FIBRIL / Pathological amyloid fibril / cross-beta fold / parallel beta-sheets / Pathological amyloid fibril cross-beta fold parallel beta-sheets

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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