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タイトルRhoptry secretion system structure and priming in Plasmodium falciparum revealed using in situ cryo-electron tomography.
ジャーナル・号・ページNat Microbiol, Vol. 7, Issue 8, Page 1230-1238, Year 2022
掲載日2022年7月11日
著者Matthew Martinez / William David Chen / Marta Mendonça Cova / Petra Molnár / Shrawan Kumar Mageswaran / Amandine Guérin / Audrey R Odom John / Maryse Lebrun / Yi-Wei Chang /
PubMed 要旨Apicomplexan parasites secrete contents of the rhoptries, club-shaped organelles in the apical region, into host cells to permit their invasion and establishment of infection. The rhoptry secretory ...Apicomplexan parasites secrete contents of the rhoptries, club-shaped organelles in the apical region, into host cells to permit their invasion and establishment of infection. The rhoptry secretory apparatus (RSA), which is critical for rhoptry secretion, was recently discovered in Toxoplasma and Cryptosporidium. It is unknown whether a similar molecular machinery exists in the malaria parasite Plasmodium. In this study, we use in situ cryo-electron tomography to investigate the rhoptry secretion system in P. falciparum merozoites. We identify the presence of an RSA at the cell apex and a morphologically distinct apical vesicle docking the tips of the two rhoptries to the RSA. We also discover two additional rhoptry organizations that lack the apical vesicle. Using subtomogram averaging, we reveal different conformations of the RSA structure corresponding to different rhoptry organizations. Our results highlight previously unknown steps in the process of rhoptry secretion and indicate a regulatory role for the conserved apical vesicle in host invasion by apicomplexan parasites.
リンクNat Microbiol / PubMed:35817892 / PubMed Central
手法EM (サブトモグラム平均) / EM (トモグラフィー)
解像度43.0 - 50.0 Å
構造データ

EMDB-26670: Rhoptry secretory apparatus of Plasmodium falciparum with an associated apical vesicle
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 43.0 Å

EMDB-26671: Rhoptry secretory apparatus of Plasmodium falciparum with an associated rhoptry tip from a non-fused rhoptry pair
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 50.0 Å

EMDB-26672: Rhoptry secretory apparatus of Plasmodium falciparum with an associated rhoptry tip from a fused rhoptry pair
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 50.0 Å

EMDB-26745: Plasmodium falciparum merozoite with two rhoptries and an associated apical vesicle
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-26746: Plasmodium falciparum merozoite with two rhoptries that lack an apical vesicle
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-26747: Plasmodium falciparum merozoite with a fused rhoptry pair
手法: EM (トモグラフィー)

由来
  • Plasmodium falciparum 3D7 (マラリア病原虫)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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