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タイトルHighly conserved protective epitopes on influenza B viruses.
ジャーナル・号・ページScience, Vol. 337, Issue 6100, Page 1343-1348, Year 2012
掲載日2012年9月14日
著者Cyrille Dreyfus / Nick S Laursen / Ted Kwaks / David Zuijdgeest / Reza Khayat / Damian C Ekiert / Jeong Hyun Lee / Zoltan Metlagel / Miriam V Bujny / Mandy Jongeneelen / Remko van der Vlugt / Mohammed Lamrani / Hans J W M Korse / Eric Geelen / Özcan Sahin / Martijn Sieuwerts / Just P J Brakenhoff / Ronald Vogels / Olive T W Li / Leo L M Poon / Malik Peiris / Wouter Koudstaal / Andrew B Ward / Ian A Wilson / Jaap Goudsmit / Robert H E Friesen /
PubMed 要旨Identification of broadly neutralizing antibodies against influenza A viruses has raised hopes for the development of monoclonal antibody-based immunotherapy and "universal" vaccines for influenza. ...Identification of broadly neutralizing antibodies against influenza A viruses has raised hopes for the development of monoclonal antibody-based immunotherapy and "universal" vaccines for influenza. However, a substantial part of the annual flu burden is caused by two cocirculating, antigenically distinct lineages of influenza B viruses. Here, we report human monoclonal antibodies, CR8033, CR8071, and CR9114, that protect mice against lethal challenge from both lineages. Antibodies CR8033 and CR8071 recognize distinct conserved epitopes in the head region of the influenza B hemagglutinin (HA), whereas CR9114 binds a conserved epitope in the HA stem and protects against lethal challenge with influenza A and B viruses. These antibodies may inform on development of monoclonal antibody-based treatments and a universal flu vaccine for all influenza A and B viruses.
リンクScience / PubMed:22878502 / PubMed Central
手法EM (単粒子) / X線回折
解像度1.71 - 19.0 Å
構造データ

EMDB-2143:
Highly Conserved Protective Epitopes on Influenza B Viruses
手法: EM (単粒子) / 解像度: 15.0 Å

EMDB-2144:
Highly Conserved Protective Epitopes on Influenza B Viruses
手法: EM (単粒子) / 解像度: 17.0 Å

EMDB-2145:
Electron microscopy of Influenza hemagglutinin (Malaysia/2506/2004) in complex with neutralizing antibody (Fab CR8071
手法: EM (単粒子) / 解像度: 19.0 Å

EMDB-2146:
Electron microscopy of Influenza hemagglutinin (Malaysia/2506/2004) in complex with neutralizing antibody (Fab CR9114
手法: EM (単粒子) / 解像度: 18.0 Å

EMDB-2147:
Electron microscopy of Influenza hemagglutinin (South Carolina/1/1918 (H1N1)) in complex with neutralizing antibody (Fab CR9114)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 18.0 Å

EMDB-2148:
Electron microscopy of Influenza hemagglutinin (Hong Kong/1/1968 (H3N2)) in complex with neutralizing antibody (Fab CR9114)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 17.0 Å

EMDB-2149:
Electron microscopy of Influenza hemagglutinin (Wisconsin/1/1966 (H9N2)) in complex with neutralizing antibody (Fab CR9114)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 14.8 Å

EMDB-2150:
Electron microscopy of Influenza hemagglutinin (Netherlands/219/2003 (H7N7)) in complex with neutralizing antibody (Fab CR9114)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 17.5 Å

PDB-4fqh:
Crystal Structure of Fab CR9114
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.05 Å

PDB-4fqi:
Crystal Structure of Fab CR9114 in Complex with a H5N1 influenza virus hemagglutinin
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.71 Å

PDB-4fqj:
Influenza B/Florida/4/2006 hemagglutinin Fab CR8071 complex
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.5 Å

PDB-4fqk:
Influenza B/Brisbane/60/2008 hemagglutinin Fab CR8059 complex
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 5.65 Å

PDB-4fql:
Influenza B HA Antibody (Fab) CR8033
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.898 Å

PDB-4fqm:
Structure of B/Brisbane/60/2008 Influenza Hemagglutinin
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.45 Å

PDB-4fqv:
Crystal structure of broadly neutralizing antibody CR9114 bound to H7 influenza hemagglutinin
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 5.75 Å

PDB-4fqy:
Crystal structure of broadly neutralizing antibody CR9114 bound to H3 influenza hemagglutinin
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 5.253 Å

化合物

ChemComp-EDO:
1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル / エチレングリコール

ChemComp-NO3:
NITRATE ION / 硝酸塩

ChemComp-HOH:
WATER /

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン / N-アセチルグルコサミン

ChemComp-GOL:
GLYCEROL / グリセロ-ル / グリセリン

由来
  • Influenza B virus (B/Florida/4/2006) (B型インフルエンザウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
  • Influenza B virus (B/Malaysia/2506/2004) (B型インフルエンザウイルス)
  • Influenza A virus (A/South Carolina/1/1918(H1N1)) (A型インフルエンザウイルス)
  • Influenza A virus (A/Hong Kong/1/1968(H3N2)) (A型インフルエンザウイルス)
  • Influenza A virus (A/turkey/Wisconsin/1/1966(H9N2)) (A型インフルエンザウイルス)
  • Influenza A virus (A/Netherlands/219/2003(H7N7)) (A型インフルエンザウイルス)
  • influenza a virus (A型インフルエンザウイルス)
  • influenza b virus (B型インフルエンザウイルス)
キーワードIMMUNE SYSTEM (免疫系) / neutralizing antibodies (中和抗体) / antibody affinity / antigens (抗原) / epitope (エピトープ) / glycosylation (グリコシル化) / hemagglutinin glycoproteins / immunoglobulin Fab fragment / influenza virus (オルトミクソウイルス科) / influenza vaccines (インフルエンザワクチン) / membrane fusion / VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM (ウイルス性) / epitopes (エピトープ) / immunoglobulin Fab fragments / H5N1 subtype / avian flu (鳥インフルエンザ) / envelope protein (エンベロープ (ウイルス)) / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex (ウイルス性) / monoclonal (単クローン性) / immunoglobulin (抗体) / antibody (抗体) / Fab fragment / viral (ウイルス性) / Influenza B virus (B型インフルエンザウイルス) / VIRAL PROTEIN (ウイルスタンパク質) / Hemagglutinin (ヘマグルチニン) / viral fusion protein / virus attachment and entry / immune recognition (免疫系)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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