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タイトルThe PfRCR complex bridges malaria parasite and erythrocyte during invasion.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 625, Issue 7995, Page 578-584, Year 2024
掲載日2023年12月20日
著者Brendan Farrell / Nawsad Alam / Melissa N Hart / Abhishek Jamwal / Robert J Ragotte / Hannah Walters-Morgan / Simon J Draper / Ellen Knuepfer / Matthew K Higgins /
PubMed 要旨The symptoms of malaria occur during the blood stage of infection, when parasites invade and replicate within human erythrocytes. The PfPCRCR complex, containing PfRH5 (refs. ), PfCyRPA, PfRIPR, ...The symptoms of malaria occur during the blood stage of infection, when parasites invade and replicate within human erythrocytes. The PfPCRCR complex, containing PfRH5 (refs. ), PfCyRPA, PfRIPR, PfCSS and PfPTRAMP, is essential for erythrocyte invasion by the deadliest human malaria parasite, Plasmodium falciparum. Invasion can be prevented by antibodies or nanobodies against each of these conserved proteins, making them the leading blood-stage malaria vaccine candidates. However, little is known about how PfPCRCR functions during invasion. Here we present the structure of the PfRCR complex, containing PfRH5, PfCyRPA and PfRIPR, determined by cryogenic-electron microscopy. We test the hypothesis that PfRH5 opens to insert into the membrane, instead showing that a rigid, disulfide-locked PfRH5 can mediate efficient erythrocyte invasion. We show, through modelling and an erythrocyte-binding assay, that PfCyRPA-binding antibodies neutralize invasion through a steric mechanism. We determine the structure of PfRIPR, showing that it consists of an ordered, multidomain core flexibly linked to an elongated tail. We also show that the elongated tail of PfRIPR, which is the target of growth-neutralizing antibodies, binds to the PfCSS-PfPTRAMP complex on the parasite membrane. A modular PfRIPR is therefore linked to the merozoite membrane through an elongated tail, and its structured core presents PfCyRPA and PfRH5 to interact with erythrocyte receptors. This provides fresh insight into the molecular mechanism of erythrocyte invasion and opens the way to new approaches in rational vaccine design.
リンクNature / PubMed:38123677 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.89 - 3.95 Å
構造データ

16569

8cdd

EMDB-16569, PDB-8cdd:
PfRH5-PfCyRPA-PfRIPR complex from Plasmodium falciparum bound to antibody Cy.003
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

16570

8cde

EMDB-16570, PDB-8cde:
PfCyRPA-PfRIPR complex from Plasmodium falciparum bound to antibody Cy.003
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-16635: PfCyRPA-PfRIPR complex from Plasmodium falciparum bound to antibody Cy.003 - maps for local refinement on PfRIPR
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.33 Å

EMDB-16636: PfCyRPA-PfRIPR complex from Plasmodium falciparum bound to antibody Cy.003 consensus maps
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.02 Å

EMDB-16637: PfRH5-PfCyRPA-PfRIPR complex from Plasmodium falciparum bound to antibody Cy.003 - consensus map
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.89 Å

EMDB-16638: PfRH5-PfCyRPA-PfRIPR complex from Plasmodium falciparum bound to antibody Cy.003 - local refinement on PfRH5
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.89 Å

EMDB-16639: PfRH5-PfCyRPA-PfRIPR complex from Plasmodium falciparum bound to antibody Cy.003 - local refinement on PfRIPR
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.31 Å

EMDB-16640: PfRH5-PfCyRPA-PfRIPR complex from Plasmodium falciparum bound to antibody Cy.003 - map with additional PfRIPR tail density
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.95 Å

由来
  • plasmodium falciparum 3d7 (マラリア病原虫)
  • gallus gallus (ニワトリ)
キーワードCELL ADHESION (細胞接着) / Plasmodium falciparum / erythrocyte-invasion / PfRCR / blood stage malaria vaccine

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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