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タイトルOrigin and arrangement of actin filaments for gliding motility in apicomplexan parasites revealed by cryo-electron tomography.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 14, Issue 1, Page 4800, Year 2023
掲載日2023年8月9日
著者Matthew Martinez / Shrawan Kumar Mageswaran / Amandine Guérin / William David Chen / Cameron Parker Thompson / Sabine Chavin / Dominique Soldati-Favre / Boris Striepen / Yi-Wei Chang /
PubMed 要旨The phylum Apicomplexa comprises important eukaryotic parasites that invade host tissues and cells using a unique mechanism of gliding motility. Gliding is powered by actomyosin motors that ...The phylum Apicomplexa comprises important eukaryotic parasites that invade host tissues and cells using a unique mechanism of gliding motility. Gliding is powered by actomyosin motors that translocate host-attached surface adhesins along the parasite cell body. Actin filaments (F-actin) generated by Formin1 play a central role in this critical parasitic activity. However, their subcellular origin, path and ultrastructural arrangement are poorly understood. Here we used cryo-electron tomography to image motile Cryptosporidium parvum sporozoites and reveal the cellular architecture of F-actin at nanometer-scale resolution. We demonstrate that F-actin nucleates at the apically positioned preconoidal rings and is channeled into the pellicular space between the parasite plasma membrane and the inner membrane complex in a conoid extrusion-dependent manner. Within the pellicular space, filaments on the inner membrane complex surface appear to guide the apico-basal flux of F-actin. F-actin concordantly accumulates at the basal end of the parasite. Finally, analyzing a Formin1-depleted Toxoplasma gondii mutant pinpoints the upper preconoidal ring as the conserved nucleation hub for F-actin in Cryptosporidium and Toxoplasma. Together, we provide an ultrastructural model for the life cycle of F-actin for apicomplexan gliding motility.
リンクNat Commun / PubMed:37558667 / PubMed Central
手法EM (トモグラフィー) / EM (サブトモグラム平均)
解像度30.0 - 65.0 Å
構造データ

EMDB-29753: Tomogram of an apical end of a Toxoplasma Gondii tachyzoite displaying an extruded conoid
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-29754: Cryptosporidium parvum sporozoite apical end
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-29755: Cryptosporidium parvum sporozoite basal end
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-29784: Subtomogram average of the preconoidal rings from Cryptosporidium parvum sporozoites
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 35.0 Å

EMDB-29791: Refined subtomogram average of the top preconoidal ring from Cryptosporidium parvum sporozoites
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-29801: Refined subtomogram average of the bottom preconoidal ring from Cryptosporidium parvum sporozoites
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 35.0 Å

EMDB-29808: Subtomogram average of the IMC surface filaments, top view, from Cryptosporidium parvum sporozoites
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 38.5 Å

EMDB-29809: IMC surface filament, sawtooth conformation, from Cryptosporidium parvum sporozoites
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 47.0 Å

EMDB-29810: IMC surface filament, side view, from Cryptosporidium parvum sporozoites
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 53.0 Å

EMDB-29826: Upper preconoidal ring from Toxoplasma gondii tachyzoites
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 41.0 Å

EMDB-29827: Lower preconoidal ring of Toxoplasma gondii tachyzoites
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 41.0 Å

EMDB-29832: Preconoidal rings of Toxoplasma gondii tachyzoites
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 53.0 Å

EMDB-29835: Basal IMC pore of Cryptosporidium parvum sporozoites
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 65.0 Å

EMDB-29838: Preconoidal rings of Toxoplasma gondii tachyzoites with Formin1 conditionally depleted
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 50.0 Å

EMDB-29839: Upper preconoidal ring of Toxoplasma gondii tachyzoites with Formin1 conditionally depleted
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 38.0 Å

EMDB-29840: Lower preconoidal ring from Toxoplasma gondii tachyzoites with Formin1 conditionally depleted
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 44.0 Å

由来
  • Toxoplasma gondii (トキソプラズマ)
  • Cryptosporidium parvum Iowa (小形クリプトスポリジウム)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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