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タイトルAltered antigenicity and immunogenicity of human papillomavirus virus-like particles in the presence of thimerosal.
ジャーナル・号・ページEur J Pharm Biopharm, Vol. 141, Page 221-231, Year 2019
掲載日2019年5月30日
著者Siyi Chen / Xiaofen Huang / Yike Li / Xin Wang / Huirong Pan / Zhijie Lin / Qingbing Zheng / Shaowei Li / Jun Zhang / Ningshao Xia / Qinjian Zhao /
PubMed 要旨Thimerosal has been widely used as a preservative in human vaccines for decades. Thimerosal, a thiol capping agent with ethyl mercury being the active degradant, could have impacts on the vaccine ...Thimerosal has been widely used as a preservative in human vaccines for decades. Thimerosal, a thiol capping agent with ethyl mercury being the active degradant, could have impacts on the vaccine potency due to potential thiol modification. The effects on the antigenicity and immunogenicity of human papillomavirus (HPV) virus-like particles (VLPs) in the presence of thimerosal was studied. In general, reduced binding activity was observed between HPV antigens and monoclonal antibodies (mAbs) upon thimerosal treatment, accompanied by reduced protein conformational stability. The immunogenicity of a pentavalent vaccine formulation (HPV6, HPV11, HPV16, HPV18 and hepatitis E virus) with or without thimerosal was studied in mice. The functional antibody titres, as well as the binding titres, were determined, showing a substantial decrease for vaccine formulations containing thimerosal for HPV16/18. Similarly, epitope-specific competition assays using specific and functional mAbs as tracers also showed a significant reduction in immunogenicity for HPV16/18 in the presence of thimerosal. Structural alterations in the capsid protein for HPV18 were observed with cryo-electron microscopy and 3-dimensional reconstruction in the comparative structural analysis. The results should alert scientists in formulation development field on the choice for vaccine preservatives, in particular for thiol-containing antigens.
リンクEur J Pharm Biopharm / PubMed:31154067
手法EM (単粒子)
解像度11.5 - 13.0 Å
構造データ

EMDB-9920:
The cryo-em structure of HPV18 VLP
手法: EM (単粒子) / 解像度: 11.5 Å

EMDB-9921:
The cryo-em structure of Thimerosal-treated HPV18 VLP
手法: EM (単粒子) / 解像度: 13.0 Å

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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