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検索結果

検索 (著者・登録者: lye & d)の結果全47件を表示しています

EMDB-29423:
Structure of Escherichia coli CedA in complex with transcription initiation complex
手法: 単粒子 / : Liu M, Vassyliev N, Nudler E

PDB-8ftd:
Structure of Escherichia coli CedA in complex with transcription initiation complex
手法: 単粒子 / : Liu M, Vassyliev N, Nudler E

EMDB-41111:
Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1
手法: 単粒子 / : Abini-Agbomson S, Armache KJ

PDB-8t9h:
Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1
手法: 単粒子 / : Abini-Agbomson S, Armache KJ

EMDB-41109:
Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1
手法: 単粒子 / : Abini-Agbomson S, Armache KJ

EMDB-41113:
Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1
手法: 単粒子 / : Abini-Agbomson S, Armache KJ

EMDB-41259:
Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1
手法: 単粒子 / : Abini-Agbomson S, Armache KJ

EMDB-41272:
Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1
手法: 単粒子 / : Abini-Agbomson S, Armache KJ

PDB-8t9f:
Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1
手法: 単粒子 / : Abini-Agbomson S, Armache KJ

PDB-8thu:
Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1
手法: 単粒子 / : Abini-Agbomson S, Armache KJ

EMDB-33650:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7
手法: 単粒子 / : Chia WN, Tan CW, Tan AWK, Young B, Starr TN, Lopez E, Fibriansah G, Barr J, Cheng S, Yeoh AYY, Yap WC, Lim BL, Ng TS, Sia WR, Zhu F, Chen S, Zhang J, Greaney AJ, Chen M, Au GG, Paradkar P, Peiris M, Chung AW, Bloom JD, Lye D, Lok SM, Wang LF

EMDB-33651:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7 (focused refinement on Fab-RBD interface)
手法: 単粒子 / : Chia WN, Tan CW, Tan AWK, Young B, Starr TN, Lopez E, Fibriansah G, Barr J, Cheng S, Yeoh AYY, Yap WC, Lim BL, Ng TS, Sia WR, Zhu F, Chen S, Zhang J, Greaney AJ, Chen M, Au GG, Paradkar P, Peiris M, Chung AW, Bloom JD, Lye D, Lok SM, Wang LF

PDB-7y71:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7
手法: 単粒子 / : Chia WN, Tan CW, Tan AWK, Young B, Starr TN, Lopez E, Fibriansah G, Barr J, Cheng S, Yeoh AYY, Yap WC, Lim BL, Ng TS, Sia WR, Zhu F, Chen S, Zhang J, Greaney AJ, Chen M, Au GG, Paradkar P, Peiris M, Chung AW, Bloom JD, Lye D, Lok SM, Wang LF

PDB-7y72:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7 (focused refinement on Fab-RBD interface)
手法: 単粒子 / : Chia WN, Tan CW, Tan AWK, Young B, Starr TN, Lopez E, Fibriansah G, Barr J, Cheng S, Yeoh AYY, Yap WC, Lim BL, Ng TS, Sia WR, Zhu F, Chen S, Zhang J, Greaney AJ, Chen M, Au GG, Paradkar P, Peiris M, Chung AW, Bloom JD, Lye D, Lok SM, Wang LF

EMDB-26427:
Structure of recombinantly assembled A53E alpha-synuclein fibrils
手法: らせん対称 / : Zhou K, Zhou H

PDB-7uak:
Structure of recombinantly assembled A53E alpha-synuclein fibrils
手法: らせん対称 / : Zhou K, Zhou H

EMDB-13474:
CryoEM structure of Rotavirus NSP2
手法: 単粒子 / : Bravo JPK, Borodavka A

EMDB-13475:
NSP2 RNP Complex focused 3D class with substrate density
手法: 単粒子 / : Bravo JPK, Borodavka A

EMDB-13476:
NSP2 RNP complex
手法: 単粒子 / : Bravo JPK, Borodavka A

PDB-7pko:
CryoEM structure of Rotavirus NSP2
手法: 単粒子 / : Bravo JPK, Borodavka A

PDB-7pkp:
NSP2 RNP complex
手法: 単粒子 / : Bravo JPK, Borodavka A

EMDB-23529:
Structure of the Marseillevirus nucleosome
手法: 単粒子 / : Valencia-Sanchez MI, Abini-Agbomson S, Armache KJ

EMDB-23530:
Marseillevirus heterotrimeric (hexameric) nucleosome
手法: 単粒子 / : Valencia-Sanchez MI, Abini-Agbomson S, Armache KJ

PDB-7lv8:
Structure of the Marseillevirus nucleosome
手法: 単粒子 / : Valencia-Sanchez MI, Abini-Agbomson S, Armache KJ

PDB-7lv9:
Marseillevirus heterotrimeric (hexameric) nucleosome
手法: 単粒子 / : Valencia-Sanchez MI, Abini-Agbomson S, Armache KJ

EMDB-22137:
Complex of SARS-CoV-2 receptor binding domain with the Fab fragments of two neutralizing antibodies
手法: 単粒子 / : Franklin MC, Saotome K, Romero Hernandez A, Zhou Y

PDB-6xdg:
Complex of SARS-CoV-2 receptor binding domain with the Fab fragments of two neutralizing antibodies
手法: 単粒子 / : Franklin MC, Saotome K, Romero Hernandez A, Zhou Y

EMDB-0191:
OBP chaperonin in the ADP-bound state
手法: 単粒子 / : Stanishneva-Konovalova TB, Sokolova OS

EMDB-0204:
OBP chaperonin in the nucleotide-free state
手法: 単粒子 / : Stanishneva-Konovalova TB, Pichkur EB, Sokolova OS

EMDB-0208:
OBP chaperonin in the ATPgammaS-bound state
手法: 単粒子 / : Stanishneva-Konovalova TB, Sokolova OS

PDB-6hdd:
OBP chaperonin in the nucleotide-free state
手法: 単粒子 / : Semenyuk PI, Stanishneva-Konovalova TB, Sokolova OS

EMDB-7774:
3.9A Cryo-EM structure of murine antibody bound at a novel epitope of respiratory syncytial virus fusion protein
手法: 単粒子 / : Xie Q, Wang Z, Chen X, Ni F, Ma J, Wang Q

PDB-6cxc:
3.9A Cryo-EM structure of murine antibody bound at a novel epitope of respiratory syncytial virus fusion protein
手法: 単粒子 / : Xie Q, Wang Z, Chen X, Ni F, Ma J, Wang Q

EMDB-0652:
Structural basis of Dot1L stimulation by histone H2B lysine 120 ubiquitination. 3.5A reconstruction of Dot1L on H2BK120Ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Valencia-Sanchez MI, De Ioannes P, Wang M, Vasilyev N, Chen R, Nudler E, Armache JP, Armache KJ

EMDB-0653:
Structural basis of Dot1L stimulation by histone H2B lysine 120 ubiquitination. 4.6A reconstruction of Dot1L on H2BK120Ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Valencia-Sanchez MI, De Ioannes P, Wang M, Vasilyev N, Chen R, Nudler E, Armache JP, Armache KJ

EMDB-0654:
Structural basis of Dot1L stimulation by histone H2B lysine 120 ubiquitination. 5.2A reconstruction of Dot1L on H2BK120Ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Valencia-Sanchez MI, De Ioannes P, Wang M, Vasilyev N, Chen R, Nudler E, Armache JP, Armache KJ

EMDB-0655:
Structural basis of Dot1L stimulation by histone H2B lysine 120 ubiquitination. 4.9A reconstruction of Dot1L on unmodified nucleosome
手法: 単粒子 / : Valencia-Sanchez MI, De Ioannes P, Wang M, Vasilyev N, Chen R, Nudler E, Armache JP, Armache KJ

PDB-6o96:
Dot1L bound to the H2BK120 Ubiquitinated nucleosome
手法: 単粒子 / : Valencia-Sanchez MI, De Ioannes PE, Miao W, Vasilyev N, Chen R, Nudler E, Armache JP, Armache KJ

EMDB-7014:
Structure of 30S ribosomal subunit and RNA polymerase complex in non-rotated state
手法: 単粒子 / : Demo G, Rasouly A

EMDB-7015:
Structure of 30S ribosomal subunit and RNA polymerase complex in rotated state
手法: 単粒子 / : Demo G, Rasouly A

EMDB-7016:
Structure of 30S (S1 depleted) ribosomal subunit and RNA polymerase complex
手法: 単粒子 / : Demo G, Rasouly A

PDB-6awb:
Structure of 30S ribosomal subunit and RNA polymerase complex in non-rotated state
手法: 単粒子 / : Demo G, Rasouly A, Vasilyev N, Loveland AB, Diaz-Avalos R, Grigorieff N, Nudler E, Korostelev AA

PDB-6awc:
Structure of 30S ribosomal subunit and RNA polymerase complex in rotated state
手法: 単粒子 / : Demo G, Rasouly A, Vasilyev N, Loveland AB, Diaz-Avalos R, Grigorieff N, Nudler E, Korostelev AA

PDB-6awd:
Structure of 30S (S1 depleted) ribosomal subunit and RNA polymerase complex
手法: 単粒子 / : Demo G, Rasouly A, Vasilyev N, Loveland AB, Diaz-Avalos R, Grigorieff N, Nudler E, Korostelev AA

EMDB-2360:
Electron cryo-EM of full-length Thermus thermophilus DNA gyrase
手法: 単粒子 / : Papillon J, Menetret JF, Batisse C, Helye R, Schultz P, Potier P, Lamour V

EMDB-2361:
Electron cryo-EM of the full-length Thermus thermophilus DNA gyrase in complex with a 155bp DNA and ciprofloxacin
手法: 単粒子 / : Papillon J, Menetret JF, Batisse C, Helye R, Schultz P, Potier N, Lamour V

PDB-1at9:
STRUCTURE OF BACTERIORHODOPSIN AT 3.0 ANGSTROM DETERMINED BY ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
手法: 電子線結晶学 / : Kimura Y, Vassylyev DG, Miyazawa A, Kidera A, Matsushima M, Mitsuoka K, Murata K, Hirai T, Fujiyoshi Y

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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